More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B1097 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B1097  putative transcriptional regulator  100 
 
 
130 aa  268  2e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0145861 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2765  transcriptional regulator, HxlR family  78.07 
 
 
125 aa  182  1.0000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.307556  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2370  putative transcriptional regulator  59.82 
 
 
121 aa  140  5e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.132848  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2693  putative transcriptional regulator  57.55 
 
 
235 aa  127  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.863177 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1097  transcriptional regulator, HxlR family  60 
 
 
112 aa  124  5e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4975  HxlR family transcriptional regulator  51.52 
 
 
112 aa  113  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5063  HxlR family transcriptional regulator  51.52 
 
 
112 aa  113  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5356  HxlR family transcriptional regulator  51.52 
 
 
112 aa  113  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3785  transcriptional regulator, HxlR family  45.95 
 
 
118 aa  107  5e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.139955  normal  0.719008 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4332  transcriptional regulator, HxlR family  51.46 
 
 
121 aa  106  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.101336 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0013  HxlR family transcriptional regulator  53.12 
 
 
126 aa  104  4e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3059  HxlR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
124 aa  103  5e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23135  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3133  hypothetical protein  41.6 
 
 
126 aa  102  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.441436  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0851  transcriptional regulator, HxlR family  48.51 
 
 
116 aa  102  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.973222 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3120  transcriptional regulator  41.6 
 
 
126 aa  102  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.118143  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3027  transcriptional regulator  41.6 
 
 
126 aa  102  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.710275  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3379  hypothetical protein  41.6 
 
 
126 aa  102  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3354  hypothetical protein  41.6 
 
 
126 aa  102  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3357  hypothetical protein  43.59 
 
 
129 aa  102  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221434  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1899  hypothetical protein  41.6 
 
 
126 aa  102  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3332  hypothetical protein  41.6 
 
 
126 aa  101  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1684  transcriptional regulator, HxlR family  50 
 
 
119 aa  101  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1702  transcriptional regulator, HxlR family  50 
 
 
115 aa  101  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.371682  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5072  transcriptional regulator, HxlR family  44.66 
 
 
117 aa  100  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.550945 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0379  transcriptional regulator  45.1 
 
 
115 aa  100  6e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0341948  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2547  transcriptional regulator, MarR family  50.55 
 
 
112 aa  100  9e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1489  transcriptional regulator, HxlR family  50.55 
 
 
130 aa  99.8  1e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.657133  normal  0.735424 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0290  transcriptional regulator protein-like protein  49.49 
 
 
154 aa  99.4  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2778  transcriptional regulator  50.55 
 
 
112 aa  99.4  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000060346 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0252  transcriptional regulator, HxlR family  44.55 
 
 
118 aa  99  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2387  HxlR family transcriptional regulator  50.55 
 
 
115 aa  98.6  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.157796  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0456  transcriptional regulator, HxlR family  48.48 
 
 
149 aa  97.4  5e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.208849  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1352  putative transcriptional regulator  44.04 
 
 
155 aa  96.7  9e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000297864  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2974  transcriptional regulator, HxlR family  47.66 
 
 
160 aa  96.7  9e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.607542 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0933  transcriptional regulator, HxlR family  48.86 
 
 
108 aa  95.9  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.973186 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1292  transcriptional regulator, HxlR family  50 
 
 
129 aa  96.3  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.109042  normal  0.938313 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5212  hypothetical protein  50 
 
 
114 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3293  putative transcriptional regulator  48.96 
 
 
119 aa  95.5  2e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0763403 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01970  transcriptional regulator  48.94 
 
 
140 aa  95.9  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3895  HxlR family transcriptional regulator  43.59 
 
 
120 aa  95.9  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000755308  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4895  HxlR family transcriptional regulator  50 
 
 
115 aa  95.5  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2802  transcriptional regulator, HxlR family  43.12 
 
 
127 aa  95.1  2e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1564  HxlR family transcriptional regulator  47.52 
 
 
119 aa  95.9  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0663317  normal  0.0831873 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5208  hypothetical protein  50 
 
 
114 aa  95.1  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4933  hypothetical protein  48.94 
 
 
114 aa  95.1  3e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4774  transciprtional regulator  48.94 
 
 
114 aa  95.1  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4794  transciprtional regulator  48.94 
 
 
114 aa  95.1  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5311  hypothetical protein  48.94 
 
 
114 aa  95.1  3e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0036  hypothetical protein  50 
 
 
114 aa  95.1  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000638982 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3069  transcriptional regulator, HxlR family  48.31 
 
 
137 aa  95.1  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0845928  normal  0.988142 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3484  MarR family transcriptional regulator  48.39 
 
 
109 aa  94.7  3e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.816245  normal  0.77191 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5225  hypothetical protein  48.94 
 
 
114 aa  95.1  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5176  hypothetical protein  48.94 
 
 
114 aa  95.1  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0230101 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4104  transcriptional regulator, HxlR family  46.23 
 
 
119 aa  95.1  3e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.533713  normal  0.821475 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2224  transcriptional regulator, HxlR family  47.25 
 
 
124 aa  94.7  4e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.647927  normal  0.782754 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2595  transcriptional regulator  47.25 
 
 
124 aa  94.7  4e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3564  HxlR family transcriptional regulator  49.48 
 
 
140 aa  94.7  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1819  hypothetical protein  45.65 
 
 
107 aa  94.4  4e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.100816 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3435  hypothetical protein  50.54 
 
 
114 aa  94.4  5e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0703  transcriptional regulator, HxlR family  46.6 
 
 
134 aa  94  7e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.383651  normal  0.144185 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02250  predicted transcriptional regulator  44.95 
 
 
110 aa  93.2  9e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3442  transcriptional regulator, HxlR family  42.16 
 
 
119 aa  93.6  9e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000021737  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1081  HxlR family transcriptional regulator  48.35 
 
 
125 aa  93.2  1e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.124143  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3110  MarR family transcriptional regulator  49.46 
 
 
114 aa  92.8  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1352  transcriptional regulator, HxlR family  44.34 
 
 
112 aa  92.8  1e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000111257  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1834  hypothetical protein  49.46 
 
 
114 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.118626  normal  0.386956 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1063  transcriptional regulator  43.62 
 
 
110 aa  92.4  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0576989  hitchhiker  0.000107529 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1617  transcriptional regulator, HxlR family  39.45 
 
 
117 aa  92.4  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.19292 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3203  hypothetical protein  48.39 
 
 
114 aa  91.7  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.135519  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3427  hypothetical protein  48.94 
 
 
108 aa  91.7  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0862  transcriptional regulator, HxlR family  47.83 
 
 
119 aa  91.7  3e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273669  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3457  hypothetical protein  48.39 
 
 
114 aa  91.7  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0015  transcriptional regulator, HxlR family  44.79 
 
 
107 aa  92  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1166  HxlR family transcriptional regulator  40.54 
 
 
131 aa  91.3  4e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.329867 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1776  putative transcriptional regulator  41.12 
 
 
134 aa  91.3  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3439  hypothetical protein  48.94 
 
 
108 aa  91.3  4e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6156  transcriptional regulator protein-like protein  42.86 
 
 
125 aa  91.3  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.747118  hitchhiker  0.000536988 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4102  transcriptional regulator, HxlR family  46.88 
 
 
118 aa  90.9  5e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00149147 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3438  hypothetical protein  44.57 
 
 
107 aa  90.9  5e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.166485  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3114  MarR family transcriptional regulator  48.94 
 
 
108 aa  90.9  5e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.448387  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3455  hypothetical protein  44.57 
 
 
107 aa  90.9  6e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.365377  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3441  hypothetical protein  48.31 
 
 
107 aa  90.5  7e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3223  hypothetical protein  48.31 
 
 
107 aa  90.5  7e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.246071  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3200  MarR family transcriptional regulator  48.31 
 
 
107 aa  90.5  7e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0287258  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3129  MarR family transcriptional regulator  44.57 
 
 
115 aa  90.5  7e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.576671  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0952  HxlR family transcriptional regulator  44.44 
 
 
117 aa  90.5  7e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.473433  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3115  MarR family transcriptional regulator  45.36 
 
 
114 aa  90.5  8e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.451528  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9284  transcriptional regulator (MarR family protein)  50.59 
 
 
122 aa  90.1  8e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3428  hypothetical protein  46.74 
 
 
107 aa  90.1  8e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.157748  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2973  transcriptional regulator, HxlR family  47 
 
 
116 aa  90.1  9e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.116721  normal  0.457372 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5039  putative transcriptional regulatory protein  44.12 
 
 
125 aa  90.1  9e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3208  hypothetical protein  47.87 
 
 
108 aa  89.7  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3209  hypothetical protein  45.36 
 
 
113 aa  89.4  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3186  MarR family transcriptional regulator  47.87 
 
 
108 aa  89.7  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5625  HxlR family transcriptional regulator  45.56 
 
 
126 aa  89.4  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.229377  normal  0.277837 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3440  hypothetical protein  45.36 
 
 
113 aa  89.4  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3461  hypothetical protein  47.87 
 
 
108 aa  89.7  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.692347  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3462  hypothetical protein  45.36 
 
 
113 aa  89.4  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.457433  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3119  HxlR family transcriptional regulator  45.65 
 
 
107 aa  89.7  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0144533  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0808  HxlR family transcriptional regulator  46.53 
 
 
159 aa  89.4  1e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.40472  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>