More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_4975 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_4975  HxlR family transcriptional regulator  100 
 
 
112 aa  233  7e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5063  HxlR family transcriptional regulator  100 
 
 
112 aa  233  7e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5356  HxlR family transcriptional regulator  100 
 
 
112 aa  233  7e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3785  transcriptional regulator, HxlR family  58.59 
 
 
118 aa  129  1.0000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.139955  normal  0.719008 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3564  HxlR family transcriptional regulator  56.48 
 
 
140 aa  125  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0290  transcriptional regulator protein-like protein  57.58 
 
 
154 aa  122  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4332  transcriptional regulator, HxlR family  56.36 
 
 
121 aa  122  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.101336 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3293  putative transcriptional regulator  55.77 
 
 
119 aa  121  3e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0763403 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2765  transcriptional regulator, HxlR family  52.53 
 
 
125 aa  121  4e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.307556  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5072  transcriptional regulator, HxlR family  52.94 
 
 
117 aa  120  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.550945 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4104  transcriptional regulator, HxlR family  54.29 
 
 
119 aa  114  3e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.533713  normal  0.821475 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1097  putative transcriptional regulator  51.52 
 
 
130 aa  113  6.9999999999999995e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0145861 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2370  putative transcriptional regulator  51.46 
 
 
121 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.132848  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0013  HxlR family transcriptional regulator  52.04 
 
 
126 aa  109  1.0000000000000001e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2974  transcriptional regulator, HxlR family  52.63 
 
 
160 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.607542 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0178  hypothetical protein  50 
 
 
114 aa  108  3e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0933  transcriptional regulator, HxlR family  48.45 
 
 
108 aa  108  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.973186 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01970  transcriptional regulator  49.04 
 
 
140 aa  107  7.000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3059  HxlR family transcriptional regulator  43.93 
 
 
124 aa  106  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23135  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1097  transcriptional regulator, HxlR family  48.42 
 
 
112 aa  106  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3133  hypothetical protein  42.59 
 
 
126 aa  105  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.441436  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3120  transcriptional regulator  42.59 
 
 
126 aa  105  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.118143  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3357  hypothetical protein  42.59 
 
 
129 aa  105  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221434  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3027  transcriptional regulator  42.59 
 
 
126 aa  105  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.710275  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1899  hypothetical protein  42.59 
 
 
126 aa  105  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3379  hypothetical protein  42.59 
 
 
126 aa  105  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3354  hypothetical protein  42.59 
 
 
126 aa  105  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0851  transcriptional regulator, HxlR family  53.54 
 
 
116 aa  105  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.973222 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3332  hypothetical protein  42.59 
 
 
126 aa  105  3e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1063  transcriptional regulator  44.79 
 
 
110 aa  103  7e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0576989  hitchhiker  0.000107529 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1377  MarR family transcriptional regulator  44.55 
 
 
122 aa  103  8e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0808  HxlR family transcriptional regulator  53.19 
 
 
159 aa  103  8e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.40472  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5362  putative transcriptional regulator  50 
 
 
116 aa  102  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.675608  normal  0.452434 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2595  transcriptional regulator  44.9 
 
 
124 aa  102  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2224  transcriptional regulator, HxlR family  44.9 
 
 
124 aa  102  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.647927  normal  0.782754 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1541  putative transcriptional regulator  45.63 
 
 
121 aa  101  3e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000091847  normal  0.207791 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2693  putative transcriptional regulator  52.22 
 
 
235 aa  101  4e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.863177 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2973  transcriptional regulator, HxlR family  52.04 
 
 
116 aa  100  5e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.116721  normal  0.457372 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6156  transcriptional regulator protein-like protein  46.6 
 
 
125 aa  99.8  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.747118  hitchhiker  0.000536988 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1564  HxlR family transcriptional regulator  43.27 
 
 
119 aa  99.4  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0663317  normal  0.0831873 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4812  HxlR family transcriptional regulator  46.23 
 
 
180 aa  99.8  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.14161 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3895  HxlR family transcriptional regulator  44.23 
 
 
120 aa  99  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000755308  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1489  transcriptional regulator, HxlR family  43.62 
 
 
130 aa  98.2  3e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.657133  normal  0.735424 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0882  transcriptional regulator, HxlR family protein  50.53 
 
 
118 aa  98.2  3e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1109  HxlR family transcriptional regulator  46.88 
 
 
116 aa  98.2  4e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.116925  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5429  transcriptional regulator, HxlR family  43.93 
 
 
149 aa  97.8  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1702  transcriptional regulator, HxlR family  43.14 
 
 
115 aa  97.4  6e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.371682  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1684  transcriptional regulator, HxlR family  44.79 
 
 
119 aa  97.1  7e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1081  HxlR family transcriptional regulator  42.11 
 
 
125 aa  96.7  9e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.124143  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1143  MarR family transcriptional regulator  40.82 
 
 
120 aa  96.7  9e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.553828  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0703  transcriptional regulator, HxlR family  46.24 
 
 
134 aa  96.7  1e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.383651  normal  0.144185 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1088  MarR family transcriptional regulator  44.44 
 
 
116 aa  96.7  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0252  transcriptional regulator, HxlR family  42.11 
 
 
118 aa  96.3  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0373  putative transcriptional regulator  43.14 
 
 
123 aa  95.1  3e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0376009  normal  0.449269 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1097  transcriptional regulator, HxlR family  45.26 
 
 
134 aa  94.7  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.199182  normal  0.222478 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0379  transcriptional regulator  45.36 
 
 
115 aa  94.4  4e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0341948  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1617  transcriptional regulator, HxlR family  41 
 
 
117 aa  94.7  4e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.19292 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5518  putative transcriptional regulatory protein  50.54 
 
 
124 aa  94.7  4e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263293  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4933  hypothetical protein  43.56 
 
 
114 aa  94.4  5e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4774  transciprtional regulator  43.56 
 
 
114 aa  94.4  5e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4794  transciprtional regulator  43.56 
 
 
114 aa  94.4  5e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5225  hypothetical protein  43.56 
 
 
114 aa  94.4  5e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5311  hypothetical protein  43.56 
 
 
114 aa  94.4  5e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5176  hypothetical protein  43.56 
 
 
114 aa  94.4  5e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0230101 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5039  putative transcriptional regulatory protein  43.62 
 
 
125 aa  94  6e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2765  transcriptional regulator, HxlR family  45.19 
 
 
138 aa  94  7e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.340614  normal  0.683768 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1319  transcriptional regulator  48.94 
 
 
118 aa  93.6  8e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2802  transcriptional regulator, HxlR family  42.27 
 
 
127 aa  93.2  1e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2650  transcriptional regulator, HxlR family  41.12 
 
 
130 aa  92.8  1e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.116917  normal  0.771114 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5989  transcriptional regulator, HxlR family  44.79 
 
 
133 aa  93.2  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1776  putative transcriptional regulator  46.74 
 
 
134 aa  92.8  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0015  transcriptional regulator, HxlR family  42.86 
 
 
107 aa  93.2  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0313  HxlR family transcriptional regulator  48.89 
 
 
121 aa  93.2  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.250935  normal  0.451658 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0456  transcriptional regulator, HxlR family  42.72 
 
 
149 aa  92.4  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.208849  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2871  HxlR family transcriptional regulator  40.57 
 
 
141 aa  92.4  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.30961 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0952  HxlR family transcriptional regulator  43.3 
 
 
117 aa  92  3e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.473433  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1834  hypothetical protein  43.88 
 
 
114 aa  91.7  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.118626  normal  0.386956 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4399  hypothetical protein  40.95 
 
 
124 aa  91.7  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4217  hypothetical protein  40.95 
 
 
124 aa  91.7  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4055  transcriptional regulator  40.95 
 
 
124 aa  91.7  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.396916  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3110  MarR family transcriptional regulator  43.88 
 
 
114 aa  92  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3114  MarR family transcriptional regulator  43.56 
 
 
108 aa  91.7  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.448387  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4065  transcriptional regulator  40.95 
 
 
124 aa  91.7  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.966493  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4340  hypothetical protein  40.95 
 
 
124 aa  91.7  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.43956e-24 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4543  hypothetical protein  40.95 
 
 
124 aa  91.7  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.719807  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2245  transcriptional regulator, HxlR family  41.18 
 
 
128 aa  91.7  3e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4451  hypothetical protein  40.95 
 
 
124 aa  91.7  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000232165  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3435  hypothetical protein  43.88 
 
 
114 aa  91.7  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3439  hypothetical protein  43.56 
 
 
108 aa  91.7  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4895  HxlR family transcriptional regulator  42.57 
 
 
115 aa  92  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3442  transcriptional regulator, HxlR family  42.86 
 
 
119 aa  91.3  4e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000021737  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3208  hypothetical protein  42.57 
 
 
108 aa  91.3  4e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3186  MarR family transcriptional regulator  42.57 
 
 
108 aa  91.3  4e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0799  hypothetical protein  40.95 
 
 
124 aa  91.3  4e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000413922  hitchhiker  1.6907100000000001e-18 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1352  putative transcriptional regulator  42.55 
 
 
155 aa  91.3  4e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000297864  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3461  hypothetical protein  42.57 
 
 
108 aa  91.3  4e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.692347  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1698  putative transcriptional regulator  50 
 
 
113 aa  91.3  4e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.171254  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5212  hypothetical protein  42.57 
 
 
114 aa  91.3  4e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0948  transcriptional regulator, HxlR family  47.83 
 
 
151 aa  91.3  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4437  hypothetical protein  40.95 
 
 
124 aa  91.3  4e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000169623  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>