More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5518 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_5518  putative transcriptional regulatory protein  100 
 
 		 124 aa  249  8.000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263293  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0042  transcriptional regulator, HxlR family  64.29 
 
 		 132 aa  154  4e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3189  transcriptional regulator, putative  59.02 
 
 		 146 aa  150  4e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0929776  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3135  PadR family transcriptional regulator  58.54 
 
 		 148 aa  150  4e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2016  transcriptional regulator, putative  61.02 
 
 		 171 aa  149  1e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0897  PadR family transcriptional regulator  61.02 
 
 		 154 aa  149  1e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2730  PadR family transcriptional regulator  60.17 
 
 		 154 aa  149  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.42105  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3172  PadR family transcriptional regulator  60.17 
 
 		 174 aa  149  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.767015  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1879  PadR family transcriptional regulator  60.17 
 
 		 174 aa  149  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1430  transcriptional regulatory protein  59.5 
 
 		 154 aa  148  3e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.240046  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2523  transcriptional regulator  59.32 
 
 		 135 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3282  transcriptional regulator, HxlR family  54.84 
 
 		 125 aa  145  2.0000000000000003e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0469  putative transcriptional regulator  60 
 
 		 128 aa  142  2e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3391  transcriptional regulator, HxlR family  58.62 
 
 		 125 aa  141  3e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3423  transcriptional regulator, HxlR family  53.78 
 
 		 127 aa  136  1e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.201208  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2865  HxlR family transcriptional regulator  55.46 
 
 		 146 aa  135  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.17139 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0313  HxlR family transcriptional regulator  59.29 
 
 		 121 aa  134  4e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.250935  normal  0.451658 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3513  HxlR family transcriptional regulator  53.78 
 
 		 125 aa  134  4e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000897234  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0287  transcriptional regulator, HxlR family  50.43 
 
 		 129 aa  125  2.0000000000000002e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0523  HxlR family transcriptional regulator  47.9 
 
 		 135 aa  122  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4262  transcriptional regulator, HxlR family  45 
 
 		 144 aa  119  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.388354  normal  0.116604 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4705  transcriptional regulator, HxlR family  48.25 
 
 		 148 aa  119  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.979262  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1615  putative transcriptional regulatory protein  50 
 
 		 144 aa  119  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0735023  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2295  transcriptional regulator, HxlR family  48.15 
 
 		 134 aa  118  3e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4243  transcriptional regulator, HxlR family  48.18 
 
 		 122 aa  117  6e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.216775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3919  transcriptional regulator, HxlR family  47.79 
 
 		 131 aa  116  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.972554  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3552  HxlR family transcriptional regulator  55.56 
 
 		 125 aa  116  9.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.640344 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2243  putative transcriptional regulator  48.62 
 
 		 150 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.58782  normal  0.248871 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2400  HxlR family transcriptional regulator  50 
 
 		 137 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.956461  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6638  transcriptional regulator, HxlR family  50 
 
 		 134 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5290  transcriptional regulator, HxlR family  42.37 
 
 		 127 aa  114  3.9999999999999997e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1776  putative transcriptional regulator  46.77 
 
 		 134 aa  114  6e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0324  transcriptional regulator protein-like protein  50.46 
 
 		 272 aa  113  7.999999999999999e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4845  HxlR family transcriptional regulator  49.04 
 
 		 108 aa  112  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.686423  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7868  HxlR family transcriptional regulator  41.32 
 
 		 121 aa  112  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3128  transcriptional regulator, HxlR family  45.61 
 
 		 130 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0026  transcriptional regulator, HxlR family  46.43 
 
 		 153 aa  111  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3743  transcriptional regulator, HxlR family  48.62 
 
 		 151 aa  111  3e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.680438  normal  0.0400276 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1296  HxlR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 159 aa  111  4.0000000000000004e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0218186  normal  0.682914 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4812  HxlR family transcriptional regulator  49.55 
 
 		 180 aa  110  5e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.14161 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9338  transcriptional regulator, HxlR family  44.83 
 
 		 132 aa  109  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.785405 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2669  transcriptional regulator, HxlR family  47.01 
 
 		 130 aa  109  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0246  putative transcriptional regulator  50 
 
 		 160 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0446  transcriptional regulator, HxlR family  48.51 
 
 		 135 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3025  HxlR family transcriptional regulator  50 
 
 		 131 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.29638  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0163  HxlR family transcriptional regulator  46.22 
 
 		 144 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.379253  hitchhiker  0.00857335 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3592  HxlR family transcriptional regulator  42.48 
 
 		 124 aa  108  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.501771 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4610  transcriptional regulator, HxlR family  48.7 
 
 		 144 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0552  transcriptional regulator, HxlR family  45.76 
 
 		 128 aa  109  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.328618  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2706  putative transcriptional regulator  42.73 
 
 		 133 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.370277  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4289  transcriptional regulator, HxlR family  46.34 
 
 		 144 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2843  putative transcriptional regulator  47.22 
 
 		 133 aa  108  3e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0861419  normal  0.0924063 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1367  HxlR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 126 aa  108  3e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00269622 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1620  putative transcriptional regulator  47.22 
 
 		 133 aa  108  3e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1728  HxlR family transcriptional regulator  47.22 
 
 		 135 aa  108  4.0000000000000004e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3327  transcriptional regulator, HxlR family  39.83 
 
 		 126 aa  107  4.0000000000000004e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000038683 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1440  HxlR family transcriptional regulator  46.9 
 
 		 146 aa  107  5e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04084  predicted transcriptional regulator  45.45 
 
 		 126 aa  107  6e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.552706  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3781  transcriptional regulator, HxlR family  45.45 
 
 		 126 aa  107  6e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5729  putative transcriptional regulator  45.45 
 
 		 126 aa  107  6e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0786413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3794  HxlR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 126 aa  107  6e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.437038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4782  putative transcriptional regulator  45.45 
 
 		 126 aa  107  6e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0423531  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4753  putative transcriptional regulator  45.45 
 
 		 126 aa  107  6e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2619  putative transcriptional regulator  43.24 
 
 		 164 aa  107  6e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.329844  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04047  hypothetical protein  45.45 
 
 		 126 aa  107  6e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.725315  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4465  putative transcriptional regulator  45.45 
 
 		 126 aa  107  6e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.49178  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2608  transcriptional regulator, HxlR family  40.18 
 
 		 175 aa  107  8.000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2508  hypothetical protein  39.84 
 
 		 142 aa  106  9.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.261635  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0621  HxlR family transcriptional regulator  43.36 
 
 		 140 aa  106  9.000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4691  putative transcriptional regulator  44.55 
 
 		 126 aa  106  1e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2650  transcriptional regulator, HxlR family  47.12 
 
 		 130 aa  105  1e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.116917  normal  0.771114 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2439  HxlR family transcriptional regulator  42.74 
 
 		 130 aa  106  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.520251  normal  0.274126 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4513  transcriptional regulator, HxlR family  43.7 
 
 		 133 aa  105  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.558457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4392  transcriptional regulator, HxlR family  46.79 
 
 		 163 aa  105  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.201066 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4040  HxlR family transcriptional regulator  46.23 
 
 		 137 aa  105  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.232895  normal  0.0486648 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2312  hypothetical protein  39.67 
 
 		 154 aa  105  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.866672 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3621  HxlR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 148 aa  105  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.18218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0615  transcriptional regulator protein-like protein  48.11 
 
 		 168 aa  105  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0384  HxlR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 128 aa  105  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2871  HxlR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 141 aa  104  3e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.30961 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4706  transcriptional regulator, HxlR family  48.08 
 
 		 143 aa  104  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0222658  normal  0.87312 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2977  transcriptional regulator, HxlR family  43.93 
 
 		 170 aa  104  5e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.369685  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1179  HxlR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 137 aa  104  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.795487 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2385  transcriptional regulator, HxlR family  46.6 
 
 		 135 aa  104  5e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8738  putative transcriptional regulator  43.64 
 
 		 137 aa  104  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4023  helix-turn-helix HxlR type  45.87 
 
 		 163 aa  104  5e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.259288  normal  0.513403 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2876  transcriptional regulator, HxlR family  43.36 
 
 		 133 aa  103  6e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4817  HxlR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 133 aa  103  7e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.85164  normal  0.139481 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2036  helix-turn-helix HxlR type  38.52 
 
 		 135 aa  103  7e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1997  transcriptional regulator, HxlR family  44.86 
 
 		 135 aa  103  8e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.271973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2311  transcriptional regulator, HxlR family  38.52 
 
 		 135 aa  103  9e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.255383  normal  0.225568 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2749  HxlR family transcriptional regulator  46.79 
 
 		 126 aa  103  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.556736 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0103  transcriptional regulator, HxlR family  40.17 
 
 		 125 aa  103  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.917179  normal  0.669443 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0106  transcriptional regulator, HxlR family  40.17 
 
 		 125 aa  103  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4151  HxlR family transcriptional regulator  41.23 
 
 		 134 aa  103  1e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3220  transcriptional regulator, HxlR family  39.67 
 
 		 131 aa  102  2e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0208  hypothetical protein  42.11 
 
 		 144 aa  102  2e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2765  transcriptional regulator, HxlR family  40.17 
 
 		 138 aa  102  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.340614  normal  0.683768 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5256  HxlR family transcriptional regulator  45.87 
 
 		 135 aa  102  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.86161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0006  HxlR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 137 aa  102  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000703871 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>