More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0469 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0469  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 128 aa  258  3e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5518  putative transcriptional regulatory protein  60 
 
 		 124 aa  152  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3135  PadR family transcriptional regulator  60.48 
 
 		 148 aa  147  3e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3189  transcriptional regulator, putative  61.67 
 
 		 146 aa  147  5e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0929776  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3172  PadR family transcriptional regulator  61.67 
 
 		 174 aa  147  6e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.767015  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1879  PadR family transcriptional regulator  61.67 
 
 		 174 aa  147  6e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1430  transcriptional regulatory protein  62.39 
 
 		 154 aa  147  7e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.240046  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2730  PadR family transcriptional regulator  60.66 
 
 		 154 aa  146  7e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.42105  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0897  PadR family transcriptional regulator  60.66 
 
 		 154 aa  146  8e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2016  transcriptional regulator, putative  61.67 
 
 		 171 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3282  transcriptional regulator, HxlR family  57.14 
 
 		 125 aa  135  2e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2523  transcriptional regulator  56.25 
 
 		 135 aa  130  5e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3391  transcriptional regulator, HxlR family  52.17 
 
 		 125 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0313  HxlR family transcriptional regulator  56.25 
 
 		 121 aa  128  3e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.250935  normal  0.451658 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3423  transcriptional regulator, HxlR family  49.59 
 
 		 127 aa  127  7.000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.201208  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0042  transcriptional regulator, HxlR family  54.39 
 
 		 132 aa  126  9.000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2865  HxlR family transcriptional regulator  52.68 
 
 		 146 aa  124  6e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.17139 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3513  HxlR family transcriptional regulator  52.1 
 
 		 125 aa  121  4e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000897234  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4262  transcriptional regulator, HxlR family  51.75 
 
 		 144 aa  119  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.388354  normal  0.116604 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9338  transcriptional regulator, HxlR family  53.51 
 
 		 132 aa  119  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.785405 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3743  transcriptional regulator, HxlR family  49.56 
 
 		 151 aa  118  3e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.680438  normal  0.0400276 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2706  putative transcriptional regulator  47.54 
 
 		 133 aa  118  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.370277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5290  transcriptional regulator, HxlR family  50.91 
 
 		 127 aa  117  3.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0287  transcriptional regulator, HxlR family  48.67 
 
 		 129 aa  116  9e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2669  transcriptional regulator, HxlR family  49.57 
 
 		 130 aa  115  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3919  transcriptional regulator, HxlR family  45.61 
 
 		 131 aa  112  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.972554  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3552  HxlR family transcriptional regulator  53.92 
 
 		 125 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.640344 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1615  putative transcriptional regulatory protein  42.86 
 
 		 144 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0735023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0026  transcriptional regulator, HxlR family  46.43 
 
 		 153 aa  111  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8738  putative transcriptional regulator  47.9 
 
 		 137 aa  110  8.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2295  transcriptional regulator, HxlR family  47.27 
 
 		 134 aa  110  8.000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4705  transcriptional regulator, HxlR family  47.75 
 
 		 148 aa  110  9e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.979262  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0523  HxlR family transcriptional regulator  46.09 
 
 		 135 aa  109  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2843  putative transcriptional regulator  45.63 
 
 		 133 aa  107  5e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0861419  normal  0.0924063 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1728  HxlR family transcriptional regulator  45.63 
 
 		 135 aa  107  5e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1620  putative transcriptional regulator  45.63 
 
 		 133 aa  107  5e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0324  transcriptional regulator protein-like protein  45.61 
 
 		 272 aa  107  8.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3592  HxlR family transcriptional regulator  46.85 
 
 		 124 aa  106  9.000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.501771 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4845  HxlR family transcriptional regulator  49.04 
 
 		 108 aa  105  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.686423  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7868  HxlR family transcriptional regulator  45.69 
 
 		 121 aa  105  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4243  transcriptional regulator, HxlR family  47.22 
 
 		 122 aa  104  3e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.216775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1367  HxlR family transcriptional regulator  44.35 
 
 		 126 aa  104  3e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00269622 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0552  transcriptional regulator, HxlR family  42.86 
 
 		 128 aa  104  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.328618  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0246  putative transcriptional regulator  49.04 
 
 		 160 aa  104  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2619  putative transcriptional regulator  42.61 
 
 		 164 aa  105  3e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.329844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3289  transcriptional regulator, HxlR family  42.86 
 
 		 144 aa  104  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0688006  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0208  hypothetical protein  43.36 
 
 		 144 aa  104  4e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4392  transcriptional regulator, HxlR family  44.44 
 
 		 163 aa  104  4e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.201066 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2243  putative transcriptional regulator  41.32 
 
 		 150 aa  103  6e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.58782  normal  0.248871 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0618  HxlR family transcriptional regulator  50 
 
 		 157 aa  103  7e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.953045  hitchhiker  0.00866972 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0103  transcriptional regulator, HxlR family  40.87 
 
 		 125 aa  103  8e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.917179  normal  0.669443 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4151  HxlR family transcriptional regulator  42.61 
 
 		 134 aa  103  8e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0106  transcriptional regulator, HxlR family  40.87 
 
 		 125 aa  103  8e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2400  HxlR family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 137 aa  103  8e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.956461  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4289  transcriptional regulator, HxlR family  41.88 
 
 		 144 aa  103  9e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4023  helix-turn-helix HxlR type  43.52 
 
 		 163 aa  103  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.259288  normal  0.513403 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4769  HxlR family transcriptional regulator  51.56 
 
 		 147 aa  103  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2608  transcriptional regulator, HxlR family  44.55 
 
 		 175 aa  103  1e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4233  transcriptional regulator, HxlR family  41.03 
 
 		 128 aa  102  2e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3128  transcriptional regulator, HxlR family  42.34 
 
 		 130 aa  101  3e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27270  predicted transcriptional regulator  45.22 
 
 		 154 aa  101  3e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0592087  normal  0.288834 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2977  transcriptional regulator, HxlR family  43.12 
 
 		 170 aa  101  4e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.369685  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2195  transcriptional regulator, HxlR family  43.64 
 
 		 136 aa  101  4e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4812  HxlR family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 180 aa  100  5e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.14161 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2510  transcriptional regulator, HxlR family  45.37 
 
 		 138 aa  100  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0500  hypothetical protein  42.98 
 
 		 126 aa  100  8e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0163  HxlR family transcriptional regulator  44.25 
 
 		 144 aa  100  8e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.379253  hitchhiker  0.00857335 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4293  HxlR family transcriptional regulator  52.94 
 
 		 121 aa  100  8e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0476  hypothetical protein  42.98 
 
 		 126 aa  100  9e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3369  hypothetical protein  52.69 
 
 		 111 aa  100  9e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0346683  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0278  putative transcriptional regulator  46.36 
 
 		 128 aa  100  9e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.640242  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1455  transcriptional regulator, HxlR family  41.12 
 
 		 146 aa  100  9e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.250685  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0615  transcriptional regulator protein-like protein  46.73 
 
 		 168 aa  99.4  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2138  hypothetical protein  46.43 
 
 		 125 aa  99.4  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.30336  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1021  putative transcriptional regulator  50.49 
 
 		 128 aa  99.8  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.247516 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4646  transcriptional regulator, HxlR family  46.39 
 
 		 136 aa  100  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.103859  normal  0.28367 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2385  transcriptional regulator, HxlR family  47.52 
 
 		 135 aa  99.4  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4513  transcriptional regulator, HxlR family  41.07 
 
 		 133 aa  99  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.558457  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0184  HxlR family transcriptional regulator  41.59 
 
 		 144 aa  99  2e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2312  hypothetical protein  38.66 
 
 		 154 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.866672 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2871  HxlR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 141 aa  99.4  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.30961 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5256  HxlR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 135 aa  99  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.86161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5429  transcriptional regulator, HxlR family  43.75 
 
 		 149 aa  98.6  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1296  HxlR family transcriptional regulator  42.45 
 
 		 159 aa  99.4  2e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0218186  normal  0.682914 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0446  transcriptional regulator, HxlR family  46.53 
 
 		 135 aa  99  2e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3327  transcriptional regulator, HxlR family  41.03 
 
 		 126 aa  99  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000038683 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2508  hypothetical protein  38.84 
 
 		 142 aa  98.2  3e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.261635  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4610  transcriptional regulator, HxlR family  41.44 
 
 		 144 aa  98.2  3e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2667  transcriptional regulator, HxlR family  39.34 
 
 		 132 aa  97.8  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.196875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6638  transcriptional regulator, HxlR family  47.06 
 
 		 134 aa  97.8  4e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2765  transcriptional regulator, HxlR family  43.52 
 
 		 138 aa  98.2  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.340614  normal  0.683768 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6178  transcriptional regulator, HxlR family  41.03 
 
 		 135 aa  97.4  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0462511 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5768  transcriptional regulator, HxlR family  48.46 
 
 		 148 aa  97.1  7e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.610006 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5545  HxlR family transcriptional regulator  53.26 
 
 		 128 aa  97.1  8e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.691894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3630  HxlR family transcriptional regulator  53.26 
 
 		 128 aa  97.1  8e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4737  HxlR family transcriptional regulator  53.26 
 
 		 128 aa  97.1  8e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00638725 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2876  transcriptional regulator, HxlR family  38.74 
 
 		 133 aa  97.1  8e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0266  helix-turn-helix HxlR type  43.69 
 
 		 130 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.661813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1440  HxlR family transcriptional regulator  39.64 
 
 		 146 aa  96.3  1e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3220  transcriptional regulator, HxlR family  40.78 
 
 		 131 aa  96.3  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>