More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3513 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_3513  HxlR family transcriptional regulator  100 
 
 		 125 aa  255  1e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000897234  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7868  HxlR family transcriptional regulator  55.56 
 
 		 121 aa  145  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2865  HxlR family transcriptional regulator  58.77 
 
 		 146 aa  141  3e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.17139 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0313  HxlR family transcriptional regulator  55.26 
 
 		 121 aa  138  3e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.250935  normal  0.451658 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0042  transcriptional regulator, HxlR family  57.52 
 
 		 132 aa  136  1e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3189  transcriptional regulator, putative  54.55 
 
 		 146 aa  135  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0929776  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5518  putative transcriptional regulatory protein  53.78 
 
 		 124 aa  134  4e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3135  PadR family transcriptional regulator  56.03 
 
 		 148 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4262  transcriptional regulator, HxlR family  52.1 
 
 		 144 aa  132  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.388354  normal  0.116604 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1430  transcriptional regulatory protein  55.56 
 
 		 154 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.240046  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2730  PadR family transcriptional regulator  56.14 
 
 		 154 aa  130  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.42105  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3172  PadR family transcriptional regulator  56.14 
 
 		 174 aa  130  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.767015  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1879  PadR family transcriptional regulator  56.14 
 
 		 174 aa  130  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0897  PadR family transcriptional regulator  56.14 
 
 		 154 aa  130  5e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2016  transcriptional regulator, putative  56.14 
 
 		 171 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3282  transcriptional regulator, HxlR family  52.21 
 
 		 125 aa  130  7.999999999999999e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4151  HxlR family transcriptional regulator  50.89 
 
 		 134 aa  129  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9338  transcriptional regulator, HxlR family  53.45 
 
 		 132 aa  128  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.785405 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0287  transcriptional regulator, HxlR family  55.65 
 
 		 129 aa  128  3e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3391  transcriptional regulator, HxlR family  51.28 
 
 		 125 aa  127  5.0000000000000004e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0246  putative transcriptional regulator  50.85 
 
 		 160 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3423  transcriptional regulator, HxlR family  46.67 
 
 		 127 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.201208  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4812  HxlR family transcriptional regulator  49.15 
 
 		 180 aa  123  7e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.14161 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5256  HxlR family transcriptional regulator  52.34 
 
 		 135 aa  121  3e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.86161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2650  transcriptional regulator, HxlR family  52.38 
 
 		 130 aa  121  3e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.116917  normal  0.771114 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4243  transcriptional regulator, HxlR family  46.85 
 
 		 122 aa  120  4e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.216775  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3552  HxlR family transcriptional regulator  59 
 
 		 125 aa  120  5e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.640344 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0615  transcriptional regulator protein-like protein  50.86 
 
 		 168 aa  120  5e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1242  hypothetical protein  51.85 
 
 		 159 aa  120  6e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2036  helix-turn-helix HxlR type  50 
 
 		 135 aa  120  7e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2311  transcriptional regulator, HxlR family  50 
 
 		 135 aa  120  9e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.255383  normal  0.225568 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0500  hypothetical protein  49.56 
 
 		 126 aa  119  9.999999999999999e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0476  hypothetical protein  49.56 
 
 		 126 aa  119  9.999999999999999e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1997  transcriptional regulator, HxlR family  51.46 
 
 		 135 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.271973  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4233  transcriptional regulator, HxlR family  45.61 
 
 		 128 aa  119  9.999999999999999e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4164  HxlR family transcriptional regulator  57.43 
 
 		 122 aa  119  1.9999999999999998e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.596618  normal  0.514488 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2523  transcriptional regulator  50.43 
 
 		 135 aa  118  3e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0006  HxlR family transcriptional regulator  49.15 
 
 		 137 aa  118  3e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000703871 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4732  transcriptional regulator, HxlR family  51.4 
 
 		 128 aa  117  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2243  putative transcriptional regulator  47.01 
 
 		 150 aa  117  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.58782  normal  0.248871 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0324  transcriptional regulator protein-like protein  49.19 
 
 		 272 aa  117  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8738  putative transcriptional regulator  49.07 
 
 		 137 aa  117  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5625  HxlR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 126 aa  117  4.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.229377  normal  0.277837 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1615  putative transcriptional regulatory protein  49.17 
 
 		 144 aa  117  4.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0735023  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04084  predicted transcriptional regulator  47.41 
 
 		 126 aa  117  7e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.552706  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3781  transcriptional regulator, HxlR family  47.41 
 
 		 126 aa  117  7e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4753  putative transcriptional regulator  47.41 
 
 		 126 aa  117  7e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5729  putative transcriptional regulator  47.41 
 
 		 126 aa  117  7e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0786413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4782  putative transcriptional regulator  47.41 
 
 		 126 aa  117  7e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0423531  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3794  HxlR family transcriptional regulator  47.41 
 
 		 126 aa  117  7e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.437038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4465  putative transcriptional regulator  47.41 
 
 		 126 aa  117  7e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.49178  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04047  hypothetical protein  47.41 
 
 		 126 aa  117  7e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.725315  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5429  transcriptional regulator, HxlR family  49.12 
 
 		 149 aa  116  7.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1440  HxlR family transcriptional regulator  50 
 
 		 146 aa  116  9e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3025  HxlR family transcriptional regulator  50.93 
 
 		 131 aa  116  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.29638  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3743  transcriptional regulator, HxlR family  48.28 
 
 		 151 aa  115  9.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.680438  normal  0.0400276 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4610  transcriptional regulator, HxlR family  45.83 
 
 		 144 aa  116  9.999999999999999e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4691  putative transcriptional regulator  46.55 
 
 		 126 aa  115  9.999999999999999e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4513  transcriptional regulator, HxlR family  47.37 
 
 		 133 aa  115  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.558457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0446  transcriptional regulator, HxlR family  48.62 
 
 		 135 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2876  transcriptional regulator, HxlR family  49.52 
 
 		 133 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0324  transcriptional regulator, HxlR family  39.67 
 
 		 130 aa  115  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.948926  normal  0.0884753 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4289  transcriptional regulator, HxlR family  46.09 
 
 		 144 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2138  hypothetical protein  50.86 
 
 		 125 aa  115  3e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.30336  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0469  putative transcriptional regulator  52.1 
 
 		 128 aa  114  3.9999999999999997e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0802  transcriptional regulator, HxlR family  54.64 
 
 		 106 aa  114  3.9999999999999997e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0464121  normal  0.73342 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2667  transcriptional regulator, HxlR family  47.83 
 
 		 132 aa  114  6e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.196875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0384  HxlR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 128 aa  114  6e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1367  HxlR family transcriptional regulator  51.46 
 
 		 126 aa  113  7.999999999999999e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00269622 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2400  HxlR family transcriptional regulator  50.47 
 
 		 137 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.956461  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1825  transcriptional regulator, HxlR family  45.76 
 
 		 119 aa  112  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3289  transcriptional regulator, HxlR family  43.97 
 
 		 144 aa  113  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0688006  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0879  transcriptional regulator, HxlR family  44.04 
 
 		 126 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.40376  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3369  hypothetical protein  52.38 
 
 		 111 aa  112  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0346683  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1179  HxlR family transcriptional regulator  47.86 
 
 		 137 aa  112  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.795487 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0618  HxlR family transcriptional regulator  54.84 
 
 		 157 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.953045  hitchhiker  0.00866972 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1800  putative transcriptional regulator  50 
 
 		 128 aa  111  3e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6638  transcriptional regulator, HxlR family  48.54 
 
 		 134 aa  111  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2005  putative transcriptional regulator  49.07 
 
 		 134 aa  111  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.684543 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2385  transcriptional regulator, HxlR family  47.12 
 
 		 135 aa  110  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1455  transcriptional regulator, HxlR family  42.99 
 
 		 146 aa  110  5e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.250685  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3815  transcriptional regulator, HxlR family  49.06 
 
 		 125 aa  110  6e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.266885  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5545  HxlR family transcriptional regulator  49.48 
 
 		 128 aa  110  6e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.691894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6779  transcriptional regulator, HxlR family  49.54 
 
 		 132 aa  110  6e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.636824 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3630  HxlR family transcriptional regulator  49.48 
 
 		 128 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4737  HxlR family transcriptional regulator  49.48 
 
 		 128 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00638725 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0621  HxlR family transcriptional regulator  47.66 
 
 		 140 aa  110  7.000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7647  transcriptional regulator, HxlR family  44.14 
 
 		 123 aa  110  8.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1971  HxlR family transcriptional regulator  44.14 
 
 		 134 aa  110  8.000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4817  HxlR family transcriptional regulator  50.48 
 
 		 133 aa  109  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.85164  normal  0.139481 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0639  transcriptional regulator, HxlR family  45.3 
 
 		 124 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.601638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2255  HxlR family transcriptional regulator  47.32 
 
 		 156 aa  108  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.018064 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1728  HxlR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 135 aa  108  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4705  transcriptional regulator, HxlR family  45 
 
 		 148 aa  108  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.979262  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7105  transcriptional regulator protein-like protein  48.15 
 
 		 164 aa  108  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.248427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2843  putative transcriptional regulator  47.17 
 
 		 133 aa  108  2.0000000000000002e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0861419  normal  0.0924063 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1620  putative transcriptional regulator  47.17 
 
 		 133 aa  108  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2508  hypothetical protein  42.02 
 
 		 142 aa  108  3e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.261635  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0998  HxlR family transcriptional regulator  54.84 
 
 		 106 aa  108  3e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00396575 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0523  HxlR family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 135 aa  107  4.0000000000000004e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>