More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_9338 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_9338  transcriptional regulator, HxlR family  100 
 
 		 132 aa  266  8e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.785405 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1318  transcriptional regulator, HxlR family  60.28 
 
 		 141 aa  146  1.0000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.294065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5768  transcriptional regulator, HxlR family  54.79 
 
 		 148 aa  136  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.610006 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0313  HxlR family transcriptional regulator  55.26 
 
 		 121 aa  132  1.9999999999999998e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.250935  normal  0.451658 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3513  HxlR family transcriptional regulator  53.45 
 
 		 125 aa  128  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000897234  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2865  HxlR family transcriptional regulator  51.3 
 
 		 146 aa  124  4.0000000000000003e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.17139 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0042  transcriptional regulator, HxlR family  46.97 
 
 		 132 aa  124  5e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4769  HxlR family transcriptional regulator  58.14 
 
 		 147 aa  123  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0287  transcriptional regulator, HxlR family  50 
 
 		 129 aa  120  9e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1430  transcriptional regulatory protein  53.51 
 
 		 154 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.240046  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2730  PadR family transcriptional regulator  52.63 
 
 		 154 aa  118  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.42105  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3135  PadR family transcriptional regulator  52.63 
 
 		 148 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3172  PadR family transcriptional regulator  52.63 
 
 		 174 aa  118  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.767015  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1879  PadR family transcriptional regulator  52.63 
 
 		 174 aa  118  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3189  transcriptional regulator, putative  52.63 
 
 		 146 aa  118  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0929776  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0897  PadR family transcriptional regulator  52.63 
 
 		 154 aa  118  3e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2016  transcriptional regulator, putative  52.63 
 
 		 171 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3423  transcriptional regulator, HxlR family  44.74 
 
 		 127 aa  117  7e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.201208  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4151  HxlR family transcriptional regulator  50.47 
 
 		 134 aa  116  7.999999999999999e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2523  transcriptional regulator  47.79 
 
 		 135 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2243  putative transcriptional regulator  50.49 
 
 		 150 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.58782  normal  0.248871 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4164  HxlR family transcriptional regulator  53.47 
 
 		 122 aa  116  9.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.596618  normal  0.514488 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7868  HxlR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 121 aa  115  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3206  transcriptional regulator, HxlR family  43.61 
 
 		 139 aa  114  5e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1971  HxlR family transcriptional regulator  47.66 
 
 		 134 aa  114  5e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3282  transcriptional regulator, HxlR family  46.55 
 
 		 125 aa  114  6e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3391  transcriptional regulator, HxlR family  46.55 
 
 		 125 aa  114  6e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8738  putative transcriptional regulator  50.91 
 
 		 137 aa  114  6e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4262  transcriptional regulator, HxlR family  50.44 
 
 		 144 aa  113  7.999999999999999e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.388354  normal  0.116604 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2036  helix-turn-helix HxlR type  50 
 
 		 135 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1997  transcriptional regulator, HxlR family  49.04 
 
 		 135 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.271973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0246  putative transcriptional regulator  53.4 
 
 		 160 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0469  putative transcriptional regulator  53.51 
 
 		 128 aa  112  2.0000000000000002e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2706  putative transcriptional regulator  44.92 
 
 		 133 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.370277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2311  transcriptional regulator, HxlR family  49.04 
 
 		 135 aa  111  3e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.255383  normal  0.225568 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0163  HxlR family transcriptional regulator  49.54 
 
 		 144 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.379253  hitchhiker  0.00857335 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2650  transcriptional regulator, HxlR family  48.08 
 
 		 130 aa  110  5e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.116917  normal  0.771114 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4812  HxlR family transcriptional regulator  48.18 
 
 		 180 aa  110  6e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.14161 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1731  putative transcriptional regulator  50.96 
 
 		 144 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2460  transcriptional regulator, HxlR family  46.36 
 
 		 121 aa  109  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5518  putative transcriptional regulatory protein  44.83 
 
 		 124 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263293  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3743  transcriptional regulator, HxlR family  49.54 
 
 		 151 aa  109  1.0000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.680438  normal  0.0400276 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1015  HxlR family transcriptional regulator  50.51 
 
 		 144 aa  108  2.0000000000000002e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0428333  normal  0.95229 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5256  HxlR family transcriptional regulator  45.69 
 
 		 135 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.86161  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2765  transcriptional regulator, HxlR family  41.96 
 
 		 138 aa  108  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.340614  normal  0.683768 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4513  transcriptional regulator, HxlR family  44.35 
 
 		 133 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.558457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4817  HxlR family transcriptional regulator  46.36 
 
 		 133 aa  106  9.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.85164  normal  0.139481 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4705  transcriptional regulator, HxlR family  50.45 
 
 		 148 aa  106  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.979262  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1242  hypothetical protein  48.62 
 
 		 159 aa  106  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4023  helix-turn-helix HxlR type  41.86 
 
 		 163 aa  106  1e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.259288  normal  0.513403 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1367  HxlR family transcriptional regulator  49.04 
 
 		 126 aa  106  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00269622 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2311  transcriptional regulator, HxlR family  48.57 
 
 		 124 aa  105  1e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.272645  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4392  transcriptional regulator, HxlR family  45.54 
 
 		 163 aa  106  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.201066 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0446  transcriptional regulator, HxlR family  49.02 
 
 		 135 aa  105  2e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4732  transcriptional regulator, HxlR family  46.36 
 
 		 128 aa  105  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6178  transcriptional regulator, HxlR family  44.95 
 
 		 135 aa  105  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0462511 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0618  HxlR family transcriptional regulator  52.13 
 
 		 157 aa  104  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.953045  hitchhiker  0.00866972 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2428  transcriptional regulator, HxlR family  47.37 
 
 		 119 aa  104  4e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.490851 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3327  transcriptional regulator, HxlR family  39.82 
 
 		 126 aa  104  4e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000038683 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3289  transcriptional regulator, HxlR family  44.74 
 
 		 144 aa  104  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0688006  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0208  hypothetical protein  48.25 
 
 		 144 aa  103  5e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2124  HxlR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 136 aa  104  5e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.235971  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5290  transcriptional regulator, HxlR family  44.07 
 
 		 127 aa  103  8e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0615  transcriptional regulator protein-like protein  48.15 
 
 		 168 aa  103  8e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4233  transcriptional regulator, HxlR family  42.98 
 
 		 128 aa  103  8e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2005  putative transcriptional regulator  46.73 
 
 		 134 aa  103  9e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.684543 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2385  transcriptional regulator, HxlR family  48.04 
 
 		 135 aa  103  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0324  transcriptional regulator, HxlR family  42.98 
 
 		 130 aa  103  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.948926  normal  0.0884753 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0580  transcriptional regulator, HxlR family  47.17 
 
 		 125 aa  103  1e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0795968 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2138  hypothetical protein  44.25 
 
 		 125 aa  102  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.30336  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0476  hypothetical protein  39.29 
 
 		 126 aa  102  2e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0552  transcriptional regulator, HxlR family  42.15 
 
 		 128 aa  102  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.328618  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2843  putative transcriptional regulator  45.63 
 
 		 133 aa  102  2e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0861419  normal  0.0924063 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1728  HxlR family transcriptional regulator  45.63 
 
 		 135 aa  102  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1620  putative transcriptional regulator  45.63 
 
 		 133 aa  102  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2510  transcriptional regulator, HxlR family  38.64 
 
 		 138 aa  102  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2281  HxlR family transcriptional regulator  47.57 
 
 		 124 aa  102  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.134727 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2221  transcriptional regulator, HxlR family  45.63 
 
 		 152 aa  101  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.405222  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0500  hypothetical protein  39.29 
 
 		 126 aa  101  3e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2295  transcriptional regulator, HxlR family  42.73 
 
 		 134 aa  101  3e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1021  putative transcriptional regulator  47.57 
 
 		 128 aa  100  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.247516 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5429  transcriptional regulator, HxlR family  41.53 
 
 		 149 aa  101  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0639  transcriptional regulator, HxlR family  43.52 
 
 		 124 aa  100  5e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.601638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5545  HxlR family transcriptional regulator  50 
 
 		 128 aa  100  5e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.691894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3630  HxlR family transcriptional regulator  50 
 
 		 128 aa  100  5e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4737  HxlR family transcriptional regulator  50 
 
 		 128 aa  100  5e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00638725 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5865  HxlR family transcriptional regulator  44.63 
 
 		 149 aa  100  5e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.480533  normal  0.03101 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3815  transcriptional regulator, HxlR family  45.1 
 
 		 125 aa  100  7e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.266885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2619  putative transcriptional regulator  42.99 
 
 		 164 aa  100  7e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.329844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6638  transcriptional regulator, HxlR family  46.6 
 
 		 134 aa  100  8e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3552  HxlR family transcriptional regulator  51.49 
 
 		 125 aa  100  9e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.640344 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4646  transcriptional regulator, HxlR family  47.37 
 
 		 136 aa  99.8  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.103859  normal  0.28367 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6779  transcriptional regulator, HxlR family  48.08 
 
 		 132 aa  99.8  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.636824 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0184  HxlR family transcriptional regulator  46.49 
 
 		 144 aa  99.8  1e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4040  HxlR family transcriptional regulator  45.79 
 
 		 137 aa  99.4  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.232895  normal  0.0486648 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4243  transcriptional regulator, HxlR family  42.34 
 
 		 122 aa  99  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.216775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3369  hypothetical protein  47.62 
 
 		 111 aa  99  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0346683  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5625  HxlR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 126 aa  99  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.229377  normal  0.277837 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1615  putative transcriptional regulatory protein  41.32 
 
 		 144 aa  99.4  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0735023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2400  HxlR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 137 aa  99  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.956461  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>