More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2865 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2865  HxlR family transcriptional regulator  100 
 
 		 146 aa  296  8e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.17139 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3513  HxlR family transcriptional regulator  58.77 
 
 		 125 aa  141  3e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000897234  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5518  putative transcriptional regulatory protein  55.46 
 
 		 124 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0287  transcriptional regulator, HxlR family  53.15 
 
 		 129 aa  129  2.0000000000000002e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7868  HxlR family transcriptional regulator  50.43 
 
 		 121 aa  127  8.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0042  transcriptional regulator, HxlR family  52.21 
 
 		 132 aa  126  8.000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0324  transcriptional regulator, HxlR family  50 
 
 		 130 aa  126  1.0000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.948926  normal  0.0884753 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5429  transcriptional regulator, HxlR family  49.15 
 
 		 149 aa  125  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1430  transcriptional regulatory protein  52.94 
 
 		 154 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.240046  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0246  putative transcriptional regulator  56.73 
 
 		 160 aa  124  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9338  transcriptional regulator, HxlR family  51.3 
 
 		 132 aa  124  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.785405 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2730  PadR family transcriptional regulator  53.91 
 
 		 154 aa  124  6e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.42105  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0897  PadR family transcriptional regulator  53.91 
 
 		 154 aa  123  7e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3135  PadR family transcriptional regulator  51.64 
 
 		 148 aa  123  7e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3172  PadR family transcriptional regulator  53.91 
 
 		 174 aa  123  7e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.767015  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1879  PadR family transcriptional regulator  53.91 
 
 		 174 aa  123  7e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2016  transcriptional regulator, putative  53.91 
 
 		 171 aa  123  9e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3189  transcriptional regulator, putative  53.91 
 
 		 146 aa  122  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0929776  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4705  transcriptional regulator, HxlR family  52.73 
 
 		 148 aa  122  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.979262  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2523  transcriptional regulator  53.91 
 
 		 135 aa  122  2e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3552  HxlR family transcriptional regulator  54.39 
 
 		 125 aa  121  4e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.640344 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0313  HxlR family transcriptional regulator  50.42 
 
 		 121 aa  120  7e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.250935  normal  0.451658 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0446  transcriptional regulator, HxlR family  51.43 
 
 		 135 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3743  transcriptional regulator, HxlR family  50.43 
 
 		 151 aa  119  9.999999999999999e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.680438  normal  0.0400276 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4151  HxlR family transcriptional regulator  49.12 
 
 		 134 aa  119  9.999999999999999e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8738  putative transcriptional regulator  50 
 
 		 137 aa  119  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4812  HxlR family transcriptional regulator  44.36 
 
 		 180 aa  119  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.14161 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0469  putative transcriptional regulator  52.68 
 
 		 128 aa  117  3.9999999999999996e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0552  transcriptional regulator, HxlR family  48.7 
 
 		 128 aa  117  3.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.328618  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5256  HxlR family transcriptional regulator  53.7 
 
 		 135 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.86161  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3423  transcriptional regulator, HxlR family  50.96 
 
 		 127 aa  117  6e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.201208  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0324  transcriptional regulator protein-like protein  50.93 
 
 		 272 aa  117  6e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2400  HxlR family transcriptional regulator  48.03 
 
 		 137 aa  116  9e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.956461  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0615  transcriptional regulator protein-like protein  51.89 
 
 		 168 aa  116  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2669  transcriptional regulator, HxlR family  45.08 
 
 		 130 aa  115  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4392  transcriptional regulator, HxlR family  53.85 
 
 		 163 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.201066 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4262  transcriptional regulator, HxlR family  47.41 
 
 		 144 aa  116  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.388354  normal  0.116604 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0618  HxlR family transcriptional regulator  57.43 
 
 		 157 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.953045  hitchhiker  0.00866972 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0026  transcriptional regulator, HxlR family  48.67 
 
 		 153 aa  115  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7647  transcriptional regulator, HxlR family  48.25 
 
 		 123 aa  115  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4023  helix-turn-helix HxlR type  49.56 
 
 		 163 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.259288  normal  0.513403 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04084  predicted transcriptional regulator  45.05 
 
 		 126 aa  114  3e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.552706  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3781  transcriptional regulator, HxlR family  45.05 
 
 		 126 aa  114  3e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4465  putative transcriptional regulator  45.05 
 
 		 126 aa  114  3e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.49178  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4782  putative transcriptional regulator  45.05 
 
 		 126 aa  114  3e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0423531  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4753  putative transcriptional regulator  45.05 
 
 		 126 aa  114  3e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04047  hypothetical protein  45.05 
 
 		 126 aa  114  3e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.725315  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3794  HxlR family transcriptional regulator  45.05 
 
 		 126 aa  114  3e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.437038  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5729  putative transcriptional regulator  45.05 
 
 		 126 aa  114  3e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0786413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1615  putative transcriptional regulatory protein  45.74 
 
 		 144 aa  115  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0735023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0006  HxlR family transcriptional regulator  48.11 
 
 		 137 aa  115  3e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000703871 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4243  transcriptional regulator, HxlR family  48.15 
 
 		 122 aa  114  3.9999999999999997e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.216775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0621  HxlR family transcriptional regulator  45.95 
 
 		 140 aa  114  3.9999999999999997e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1440  HxlR family transcriptional regulator  47.75 
 
 		 146 aa  114  6e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4691  putative transcriptional regulator  44.14 
 
 		 126 aa  113  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2036  helix-turn-helix HxlR type  51.92 
 
 		 135 aa  113  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3282  transcriptional regulator, HxlR family  47.32 
 
 		 125 aa  113  6.9999999999999995e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1179  HxlR family transcriptional regulator  50 
 
 		 137 aa  113  6.9999999999999995e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.795487 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1997  transcriptional regulator, HxlR family  52.43 
 
 		 135 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.271973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2311  transcriptional regulator, HxlR family  52.43 
 
 		 135 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.255383  normal  0.225568 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1776  putative transcriptional regulator  47.27 
 
 		 134 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5625  HxlR family transcriptional regulator  47.79 
 
 		 126 aa  112  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.229377  normal  0.277837 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6638  transcriptional regulator, HxlR family  45.76 
 
 		 134 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0580  transcriptional regulator, HxlR family  49.57 
 
 		 125 aa  112  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0795968 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0384  HxlR family transcriptional regulator  47.52 
 
 		 128 aa  112  2.0000000000000002e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0103  transcriptional regulator, HxlR family  44.74 
 
 		 125 aa  111  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.917179  normal  0.669443 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2650  transcriptional regulator, HxlR family  48.54 
 
 		 130 aa  111  3e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.116917  normal  0.771114 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0106  transcriptional regulator, HxlR family  44.74 
 
 		 125 aa  111  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0208  hypothetical protein  49.53 
 
 		 144 aa  111  3e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2876  transcriptional regulator, HxlR family  47.12 
 
 		 133 aa  111  4.0000000000000004e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4845  HxlR family transcriptional regulator  52.43 
 
 		 108 aa  111  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.686423  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3289  transcriptional regulator, HxlR family  46.79 
 
 		 144 aa  111  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0688006  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4289  transcriptional regulator, HxlR family  43.1 
 
 		 144 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3391  transcriptional regulator, HxlR family  46.43 
 
 		 125 aa  110  5e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2871  HxlR family transcriptional regulator  49.07 
 
 		 141 aa  110  5e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.30961 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1015  HxlR family transcriptional regulator  52.94 
 
 		 144 aa  110  6e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0428333  normal  0.95229 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1881  HxlR family transcriptional regulator  46.61 
 
 		 129 aa  110  7.000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.572162 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1367  HxlR family transcriptional regulator  46.96 
 
 		 126 aa  110  7.000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00269622 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2124  HxlR family transcriptional regulator  46.9 
 
 		 136 aa  110  9e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.235971  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0163  HxlR family transcriptional regulator  50.93 
 
 		 144 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.379253  hitchhiker  0.00857335 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4233  transcriptional regulator, HxlR family  42.11 
 
 		 128 aa  109  1.0000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6779  transcriptional regulator, HxlR family  49.51 
 
 		 132 aa  108  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.636824 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6661  transcriptional regulator, HxlR family  43.09 
 
 		 131 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.762172 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2243  putative transcriptional regulator  50.49 
 
 		 150 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.58782  normal  0.248871 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4164  HxlR family transcriptional regulator  50.98 
 
 		 122 aa  108  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.596618  normal  0.514488 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0184  HxlR family transcriptional regulator  48.6 
 
 		 144 aa  108  3e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4732  transcriptional regulator, HxlR family  47.22 
 
 		 128 aa  108  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2385  transcriptional regulator, HxlR family  47.22 
 
 		 135 aa  108  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2138  hypothetical protein  48.25 
 
 		 125 aa  107  4.0000000000000004e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.30336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3025  HxlR family transcriptional regulator  51.49 
 
 		 131 aa  107  4.0000000000000004e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.29638  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1296  HxlR family transcriptional regulator  45.79 
 
 		 159 aa  107  4.0000000000000004e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0218186  normal  0.682914 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4817  HxlR family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 133 aa  107  5e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.85164  normal  0.139481 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27270  predicted transcriptional regulator  49.11 
 
 		 154 aa  107  5e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0592087  normal  0.288834 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2977  transcriptional regulator, HxlR family  44.53 
 
 		 170 aa  107  6e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.369685  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2460  transcriptional regulator, HxlR family  50 
 
 		 121 aa  107  7.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1620  putative transcriptional regulator  42.34 
 
 		 133 aa  106  8.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2843  putative transcriptional regulator  42.34 
 
 		 133 aa  106  8.000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0861419  normal  0.0924063 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1728  HxlR family transcriptional regulator  42.34 
 
 		 135 aa  107  8.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0476  hypothetical protein  48.6 
 
 		 126 aa  106  1e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3630  HxlR family transcriptional regulator  44.86 
 
 		 128 aa  106  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>