More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_1242 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_1242  hypothetical protein  100 
 
 		 159 aa  330  4e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1997  transcriptional regulator, HxlR family  63.5 
 
 		 135 aa  177  7e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.271973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2311  transcriptional regulator, HxlR family  64.23 
 
 		 135 aa  174  6e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.255383  normal  0.225568 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2036  helix-turn-helix HxlR type  64.23 
 
 		 135 aa  174  6e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2243  putative transcriptional regulator  57.43 
 
 		 150 aa  171  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.58782  normal  0.248871 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0446  transcriptional regulator, HxlR family  63.33 
 
 		 135 aa  166  1e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4164  HxlR family transcriptional regulator  69.72 
 
 		 122 aa  158  3e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.596618  normal  0.514488 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2650  transcriptional regulator, HxlR family  57.14 
 
 		 130 aa  157  6e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.116917  normal  0.771114 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0246  putative transcriptional regulator  54 
 
 		 160 aa  149  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1367  HxlR family transcriptional regulator  57.48 
 
 		 126 aa  149  1e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00269622 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2385  transcriptional regulator, HxlR family  56 
 
 		 135 aa  147  4e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6638  transcriptional regulator, HxlR family  57.98 
 
 		 134 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0615  transcriptional regulator protein-like protein  59.83 
 
 		 168 aa  145  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3025  HxlR family transcriptional regulator  55.86 
 
 		 131 aa  141  3e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.29638  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4705  transcriptional regulator, HxlR family  55.74 
 
 		 148 aa  134  7.000000000000001e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.979262  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1179  HxlR family transcriptional regulator  48.97 
 
 		 137 aa  133  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.795487 
 
 
-
 
NC_003296  RS05353  hypothetical protein  52.94 
 
 		 137 aa  131  3.9999999999999996e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.387591  normal  0.848219 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2124  HxlR family transcriptional regulator  49.25 
 
 		 136 aa  131  3.9999999999999996e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.235971  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1776  putative transcriptional regulator  48.48 
 
 		 134 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3743  transcriptional regulator, HxlR family  48.59 
 
 		 151 aa  128  4.0000000000000003e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.680438  normal  0.0400276 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6661  transcriptional regulator, HxlR family  54.05 
 
 		 131 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.762172 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2138  hypothetical protein  54.13 
 
 		 125 aa  124  4.0000000000000003e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.30336  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3815  transcriptional regulator, HxlR family  47.83 
 
 		 125 aa  123  1e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.266885  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6779  transcriptional regulator, HxlR family  48.85 
 
 		 132 aa  122  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.636824 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0163  HxlR family transcriptional regulator  47.48 
 
 		 144 aa  122  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.379253  hitchhiker  0.00857335 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4023  helix-turn-helix HxlR type  53.45 
 
 		 163 aa  122  3e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.259288  normal  0.513403 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4732  transcriptional regulator, HxlR family  53.77 
 
 		 128 aa  121  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4392  transcriptional regulator, HxlR family  49.6 
 
 		 163 aa  120  7e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.201066 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2400  HxlR family transcriptional regulator  53.57 
 
 		 137 aa  120  7e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.956461  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4151  HxlR family transcriptional regulator  53.4 
 
 		 134 aa  120  7e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3513  HxlR family transcriptional regulator  51.85 
 
 		 125 aa  120  7e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000897234  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7868  HxlR family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 121 aa  120  7e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6178  transcriptional regulator, HxlR family  51.69 
 
 		 135 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0462511 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4812  HxlR family transcriptional regulator  55.77 
 
 		 180 aa  120  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.14161 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8738  putative transcriptional regulator  50 
 
 		 137 aa  119  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4262  transcriptional regulator, HxlR family  49.09 
 
 		 144 aa  119  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.388354  normal  0.116604 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0208  hypothetical protein  45.65 
 
 		 144 aa  118  3.9999999999999996e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1490  HxlR family transcriptional regulator  45.67 
 
 		 131 aa  118  3.9999999999999996e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.263711 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4817  HxlR family transcriptional regulator  47.97 
 
 		 133 aa  118  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.85164  normal  0.139481 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1615  putative transcriptional regulatory protein  52.83 
 
 		 144 aa  117  4.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0735023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2281  HxlR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 124 aa  117  4.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.134727 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0287  transcriptional regulator, HxlR family  42.4 
 
 		 129 aa  117  6e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4845  HxlR family transcriptional regulator  54.29 
 
 		 108 aa  117  6e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.686423  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5256  HxlR family transcriptional regulator  55.77 
 
 		 135 aa  117  7.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.86161  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3552  HxlR family transcriptional regulator  62.22 
 
 		 125 aa  117  9e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.640344 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0264  HxlR family transcriptional regulator  48.25 
 
 		 137 aa  116  1.9999999999999998e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0324  transcriptional regulator protein-like protein  51.3 
 
 		 272 aa  115  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0184  HxlR family transcriptional regulator  49.56 
 
 		 144 aa  115  3e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2510  transcriptional regulator, HxlR family  44.36 
 
 		 138 aa  114  6e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1971  HxlR family transcriptional regulator  50.47 
 
 		 134 aa  114  6e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2792  hypothetical protein  52.38 
 
 		 136 aa  114  6.9999999999999995e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0639  transcriptional regulator, HxlR family  52.29 
 
 		 124 aa  113  8.999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.601638  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4233  transcriptional regulator, HxlR family  47.62 
 
 		 128 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2749  HxlR family transcriptional regulator  47.11 
 
 		 126 aa  112  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.556736 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0523  HxlR family transcriptional regulator  48.62 
 
 		 135 aa  112  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2977  transcriptional regulator, HxlR family  51.85 
 
 		 170 aa  112  3e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.369685  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0618  HxlR family transcriptional regulator  58.51 
 
 		 157 aa  111  3e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.953045  hitchhiker  0.00866972 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2005  putative transcriptional regulator  45.38 
 
 		 134 aa  110  6e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.684543 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2619  putative transcriptional regulator  52.25 
 
 		 164 aa  110  6e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.329844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3327  transcriptional regulator, HxlR family  48.18 
 
 		 126 aa  110  7.000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000038683 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2523  transcriptional regulator  50 
 
 		 135 aa  110  9e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2765  transcriptional regulator, HxlR family  43.51 
 
 		 138 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.340614  normal  0.683768 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6037  HxlR family transcriptional regulator  50 
 
 		 130 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.929576  normal  0.346808 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5429  transcriptional regulator, HxlR family  43.86 
 
 		 149 aa  109  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1227  putative transcriptional regulator  48.72 
 
 		 119 aa  108  3e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.916879  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1021  putative transcriptional regulator  50 
 
 		 128 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.247516 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1455  transcriptional regulator, HxlR family  50 
 
 		 146 aa  107  5e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.250685  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2255  HxlR family transcriptional regulator  43.31 
 
 		 156 aa  107  5e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.018064 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0313  HxlR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 121 aa  107  6e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.250935  normal  0.451658 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3369  hypothetical protein  53 
 
 		 111 aa  107  9.000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0346683  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0324  transcriptional regulator, HxlR family  44.34 
 
 		 130 aa  107  9.000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.948926  normal  0.0884753 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1015  HxlR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 144 aa  106  1e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0428333  normal  0.95229 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9338  transcriptional regulator, HxlR family  48.62 
 
 		 132 aa  106  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.785405 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0266  helix-turn-helix HxlR type  48.62 
 
 		 130 aa  106  1e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.661813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2311  transcriptional regulator, HxlR family  49.52 
 
 		 124 aa  106  1e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.272645  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0278  putative transcriptional regulator  48.31 
 
 		 128 aa  106  1e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.640242  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3206  transcriptional regulator, HxlR family  48.62 
 
 		 139 aa  106  1e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5545  HxlR family transcriptional regulator  51.61 
 
 		 128 aa  105  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.691894  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1800  putative transcriptional regulator  49 
 
 		 128 aa  106  2e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1731  putative transcriptional regulator  46.67 
 
 		 144 aa  105  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3681  transcriptional regulator, HxlR family  46.94 
 
 		 101 aa  106  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3630  HxlR family transcriptional regulator  51.61 
 
 		 128 aa  105  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4737  HxlR family transcriptional regulator  51.61 
 
 		 128 aa  105  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00638725 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2871  HxlR family transcriptional regulator  53.33 
 
 		 141 aa  105  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.30961 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0042  transcriptional regulator, HxlR family  47.06 
 
 		 132 aa  105  3e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3423  transcriptional regulator, HxlR family  46.15 
 
 		 127 aa  104  4e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.201208  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4040  HxlR family transcriptional regulator  50 
 
 		 137 aa  104  5e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.232895  normal  0.0486648 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2865  HxlR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 146 aa  104  6e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.17139 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3282  transcriptional regulator, HxlR family  47.52 
 
 		 125 aa  103  1e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5823  transcriptional regulator, HxlR family  47.62 
 
 		 155 aa  103  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0742243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2667  transcriptional regulator, HxlR family  44.64 
 
 		 132 aa  102  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.196875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4706  transcriptional regulator, HxlR family  42.86 
 
 		 143 aa  102  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0222658  normal  0.87312 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2195  transcriptional regulator, HxlR family  45.19 
 
 		 136 aa  102  2e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5290  transcriptional regulator, HxlR family  42.74 
 
 		 127 aa  101  4e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2608  transcriptional regulator, HxlR family  45.45 
 
 		 175 aa  101  5e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5625  HxlR family transcriptional regulator  48.45 
 
 		 126 aa  100  6e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.229377  normal  0.277837 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4646  transcriptional regulator, HxlR family  42.75 
 
 		 136 aa  100  6e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.103859  normal  0.28367 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3391  transcriptional regulator, HxlR family  41.32 
 
 		 125 aa  100  1e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3059  HxlR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 124 aa  99.8  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23135  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2994  helix-turn-helix, HxlR type  42.72 
 
 		 130 aa  100  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>