More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7105 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_7105  transcriptional regulator protein-like protein  100 
 
 
164 aa  325  2.0000000000000001e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.248427  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6637  HxlR family transcriptional regulator  56.64 
 
 
119 aa  116  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4262  transcriptional regulator, HxlR family  53.61 
 
 
144 aa  110  8.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.388354  normal  0.116604 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3216  transcriptional regulator, HxlR family  53.15 
 
 
132 aa  110  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4243  transcriptional regulator, HxlR family  52.21 
 
 
122 aa  109  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.216775  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3513  HxlR family transcriptional regulator  48.15 
 
 
125 aa  108  3e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000897234  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7868  HxlR family transcriptional regulator  44.83 
 
 
121 aa  107  9.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4151  HxlR family transcriptional regulator  45.61 
 
 
134 aa  105  3e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3335  transcriptional regulator, HxlR family  50.44 
 
 
117 aa  103  1e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5625  HxlR family transcriptional regulator  46.36 
 
 
126 aa  98.2  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.229377  normal  0.277837 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1997  transcriptional regulator, HxlR family  49.07 
 
 
135 aa  97.4  7e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.271973  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1971  HxlR family transcriptional regulator  38.66 
 
 
134 aa  97.4  8e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2400  HxlR family transcriptional regulator  46.73 
 
 
137 aa  97.4  8e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.956461  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1179  HxlR family transcriptional regulator  43.97 
 
 
137 aa  97.1  9e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.795487 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5429  transcriptional regulator, HxlR family  40.18 
 
 
149 aa  96.7  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2311  transcriptional regulator, HxlR family  49.07 
 
 
135 aa  96.7  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.255383  normal  0.225568 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2036  helix-turn-helix HxlR type  49.07 
 
 
135 aa  96.7  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1430  transcriptional regulatory protein  40.98 
 
 
154 aa  96.7  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.240046  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4812  HxlR family transcriptional regulator  43.12 
 
 
180 aa  95.9  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.14161 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2865  HxlR family transcriptional regulator  43.75 
 
 
146 aa  96.3  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.17139 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7647  transcriptional regulator, HxlR family  45.95 
 
 
123 aa  96.3  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1825  transcriptional regulator, HxlR family  47.47 
 
 
119 aa  95.9  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1242  hypothetical protein  45.79 
 
 
159 aa  95.5  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3135  PadR family transcriptional regulator  40.16 
 
 
148 aa  95.1  4e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3681  transcriptional regulator, HxlR family  45.92 
 
 
101 aa  94.7  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3189  transcriptional regulator, putative  40.16 
 
 
146 aa  94.7  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0929776  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3172  PadR family transcriptional regulator  40.16 
 
 
174 aa  94.7  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.767015  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1879  PadR family transcriptional regulator  40.16 
 
 
174 aa  94.7  5e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0313  HxlR family transcriptional regulator  40.87 
 
 
121 aa  94.4  6e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.250935  normal  0.451658 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0324  transcriptional regulator, HxlR family  40.5 
 
 
130 aa  93.6  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.948926  normal  0.0884753 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2016  transcriptional regulator, putative  39.34 
 
 
171 aa  93.6  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1776  putative transcriptional regulator  45.92 
 
 
134 aa  93.6  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0287  transcriptional regulator, HxlR family  45.45 
 
 
129 aa  93.6  1e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2730  PadR family transcriptional regulator  40.5 
 
 
154 aa  93.6  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.42105  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6779  transcriptional regulator, HxlR family  46.88 
 
 
132 aa  92.8  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.636824 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0802  transcriptional regulator, HxlR family  40.59 
 
 
106 aa  92.4  2e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0464121  normal  0.73342 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0042  transcriptional regulator, HxlR family  40.18 
 
 
132 aa  92.8  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0897  PadR family transcriptional regulator  39.67 
 
 
154 aa  92.8  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3282  transcriptional regulator, HxlR family  39.66 
 
 
125 aa  92.8  2e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0221  transcriptional regulator, HxlR family  41.58 
 
 
106 aa  92  3e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012384  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6638  transcriptional regulator, HxlR family  46.94 
 
 
134 aa  92  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0879  transcriptional regulator, HxlR family  44.86 
 
 
126 aa  91.7  4e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.40376  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5256  HxlR family transcriptional regulator  44.55 
 
 
135 aa  91.7  4e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.86161  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0933  transcriptional regulator, HxlR family  40.62 
 
 
108 aa  91.3  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.973186 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5518  putative transcriptional regulatory protein  39.32 
 
 
124 aa  90.9  6e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263293  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0208  hypothetical protein  40.74 
 
 
144 aa  90.9  7e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1292  transcriptional regulator, HxlR family  40.18 
 
 
129 aa  90.5  9e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.109042  normal  0.938313 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1227  putative transcriptional regulator  46.39 
 
 
119 aa  90.1  1e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.916879  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2428  transcriptional regulator, HxlR family  46.73 
 
 
119 aa  90.1  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.490851 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3059  HxlR family transcriptional regulator  40.78 
 
 
124 aa  89.7  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23135  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1367  HxlR family transcriptional regulator  47.96 
 
 
126 aa  90.5  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00269622 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4164  HxlR family transcriptional regulator  46.73 
 
 
122 aa  90.1  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.596618  normal  0.514488 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0184  HxlR family transcriptional regulator  39.81 
 
 
144 aa  89.4  2e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01970  transcriptional regulator  39.18 
 
 
140 aa  89.4  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3585  transcriptional regulator, HxlR family  39.6 
 
 
108 aa  89.7  2e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000738633  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0013  HxlR family transcriptional regulator  39.18 
 
 
126 aa  89  2e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3438  hypothetical protein  40 
 
 
107 aa  88.6  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.166485  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0103  transcriptional regulator, HxlR family  39.05 
 
 
125 aa  88.6  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.917179  normal  0.669443 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0106  transcriptional regulator, HxlR family  39.05 
 
 
125 aa  88.6  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1489  transcriptional regulator, HxlR family  40 
 
 
130 aa  88.2  4e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.657133  normal  0.735424 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1352  putative transcriptional regulator  41.05 
 
 
155 aa  88.6  4e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000297864  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3552  HxlR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
125 aa  88.2  4e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.640344 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3327  transcriptional regulator, HxlR family  40.18 
 
 
126 aa  88.6  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000038683 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9338  transcriptional regulator, HxlR family  46.39 
 
 
132 aa  87.8  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.785405 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1819  hypothetical protein  40 
 
 
107 aa  87.8  6e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.100816 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1143  MarR family transcriptional regulator  36.26 
 
 
120 aa  87.8  6e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.553828  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3133  hypothetical protein  37.38 
 
 
126 aa  87.4  7e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.441436  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3027  transcriptional regulator  37.38 
 
 
126 aa  87.4  7e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.710275  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3379  hypothetical protein  37.38 
 
 
126 aa  87.4  7e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2650  transcriptional regulator, HxlR family  40.16 
 
 
130 aa  87.4  7e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.116917  normal  0.771114 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3785  transcriptional regulator, HxlR family  43.93 
 
 
118 aa  87.4  7e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.139955  normal  0.719008 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3157  helix-turn-helix, HxlR type  41.49 
 
 
130 aa  87.4  7e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.38389  normal  0.468508 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3354  hypothetical protein  37.38 
 
 
126 aa  87.4  7e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1899  hypothetical protein  37.38 
 
 
126 aa  87.4  8e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3120  transcriptional regulator  37.38 
 
 
126 aa  87.4  8e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.118143  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3357  hypothetical protein  37.38 
 
 
129 aa  87.4  8e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221434  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0446  transcriptional regulator, HxlR family  46.39 
 
 
135 aa  87  9e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4243  transcriptional regulator, HxlR family  46.74 
 
 
105 aa  86.7  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.333534  normal  0.800382 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3638  transcriptional regulator, HxlR family  41.49 
 
 
129 aa  87  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.386135  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3455  hypothetical protein  38.95 
 
 
107 aa  86.7  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.365377  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1377  MarR family transcriptional regulator  36.7 
 
 
122 aa  86.7  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0246  putative transcriptional regulator  42.59 
 
 
160 aa  86.7  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3418  putative transcriptional regulator  42.55 
 
 
132 aa  86.7  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.190487 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8738  putative transcriptional regulator  44 
 
 
137 aa  86.7  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0998  HxlR family transcriptional regulator  42.22 
 
 
106 aa  86.3  2e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00396575 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3187  MarR family transcriptional regulator  38.2 
 
 
114 aa  85.9  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3428  hypothetical protein  38.2 
 
 
114 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1063  transcriptional regulator  39.36 
 
 
110 aa  86.3  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0576989  hitchhiker  0.000107529 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1021  putative transcriptional regulator  42.59 
 
 
128 aa  86.3  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.247516 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3332  hypothetical protein  37.38 
 
 
126 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5072  transcriptional regulator, HxlR family  40.82 
 
 
117 aa  85.9  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.550945 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4233  transcriptional regulator, HxlR family  40.91 
 
 
128 aa  86.3  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5290  transcriptional regulator, HxlR family  39.66 
 
 
127 aa  85.9  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5989  transcriptional regulator, HxlR family  38.83 
 
 
133 aa  86.3  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4732  transcriptional regulator, HxlR family  42.34 
 
 
128 aa  86.3  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1615  putative transcriptional regulatory protein  37.07 
 
 
144 aa  85.9  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0735023  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5039  putative transcriptional regulatory protein  41.67 
 
 
125 aa  85.9  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0639  transcriptional regulator, HxlR family  39.25 
 
 
124 aa  85.5  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.601638  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3129  MarR family transcriptional regulator  38.95 
 
 
115 aa  85.5  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.576671  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0006  HxlR family transcriptional regulator  36.97 
 
 
137 aa  85.1  3e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000703871 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>