More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6637 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6637  HxlR family transcriptional regulator  100 
 
 		 119 aa  240  3.9999999999999997e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7105  transcriptional regulator protein-like protein  56.64 
 
 		 164 aa  115  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.248427  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3963  transcriptional regulator, HxlR family  49.06 
 
 		 127 aa  99.4  1e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.368494 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3216  transcriptional regulator, HxlR family  44.86 
 
 		 132 aa  85.5  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2865  HxlR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 146 aa  84.7  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.17139 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4243  transcriptional regulator, HxlR family  45.79 
 
 		 122 aa  84.7  4e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.216775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7868  HxlR family transcriptional regulator  43.27 
 
 		 121 aa  84.3  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3335  transcriptional regulator, HxlR family  44.04 
 
 		 117 aa  83.6  9e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4262  transcriptional regulator, HxlR family  44.76 
 
 		 144 aa  83.6  9e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.388354  normal  0.116604 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0446  transcriptional regulator, HxlR family  46.46 
 
 		 135 aa  81.6  0.000000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7647  transcriptional regulator, HxlR family  51.09 
 
 		 123 aa  81.3  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2370  putative transcriptional regulator  40 
 
 		 121 aa  81.3  0.000000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.132848  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5545  HxlR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 128 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.691894  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1021  putative transcriptional regulator  42.34 
 
 		 128 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.247516 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3630  HxlR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 128 aa  80.1  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4737  HxlR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 128 aa  80.1  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00638725 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0184  HxlR family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 144 aa  79.3  0.00000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3681  transcriptional regulator, HxlR family  42.86 
 
 		 101 aa  80.1  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0208  hypothetical protein  37.27 
 
 		 144 aa  77.8  0.00000000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3327  transcriptional regulator, HxlR family  39.66 
 
 		 126 aa  77.4  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000038683 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5625  HxlR family transcriptional regulator  45.05 
 
 		 126 aa  77  0.00000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.229377  normal  0.277837 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1615  putative transcriptional regulatory protein  39.81 
 
 		 144 aa  77  0.00000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0735023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4975  HxlR family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 112 aa  76.3  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5063  HxlR family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 112 aa  76.3  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5356  HxlR family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 112 aa  76.3  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2765  transcriptional regulator, HxlR family  43 
 
 		 125 aa  76.3  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.307556  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1997  transcriptional regulator, HxlR family  44.04 
 
 		 135 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.271973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4812  HxlR family transcriptional regulator  38.32 
 
 		 180 aa  75.9  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.14161 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4392  transcriptional regulator, HxlR family  38.89 
 
 		 163 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.201066 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1776  putative transcriptional regulator  43.48 
 
 		 134 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0379  transcriptional regulator  36.11 
 
 		 115 aa  75.9  0.0000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0341948  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1166  HxlR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 131 aa  76.3  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329867 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2036  helix-turn-helix HxlR type  44.04 
 
 		 135 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3513  HxlR family transcriptional regulator  42.72 
 
 		 125 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000897234  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2311  transcriptional regulator, HxlR family  44.04 
 
 		 135 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.255383  normal  0.225568 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4023  helix-turn-helix HxlR type  37.96 
 
 		 163 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.259288  normal  0.513403 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5429  transcriptional regulator, HxlR family  41.3 
 
 		 149 aa  74.3  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5518  putative transcriptional regulatory protein  37.61 
 
 		 124 aa  73.6  0.0000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2312  hypothetical protein  37.17 
 
 		 154 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.866672 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3552  HxlR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 125 aa  73.6  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.640344 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0621  HxlR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 140 aa  72.8  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2872  transcriptional regulator, HxlR family  36.89 
 
 		 130 aa  73.2  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.246022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2400  HxlR family transcriptional regulator  40.95 
 
 		 137 aa  72.8  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.956461  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2295  transcriptional regulator, HxlR family  36.45 
 
 		 134 aa  72  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6779  transcriptional regulator, HxlR family  40.82 
 
 		 132 aa  72.8  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.636824 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0042  transcriptional regulator, HxlR family  38.46 
 
 		 132 aa  72.4  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0639  transcriptional regulator, HxlR family  38.89 
 
 		 124 aa  72  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.601638  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2508  hypothetical protein  36.61 
 
 		 142 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.261635  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1881  HxlR family transcriptional regulator  46.32 
 
 		 129 aa  72  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.572162 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4104  transcriptional regulator, HxlR family  45 
 
 		 119 aa  72  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.533713  normal  0.821475 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4151  HxlR family transcriptional regulator  40 
 
 		 134 aa  71.6  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4732  transcriptional regulator, HxlR family  39.81 
 
 		 128 aa  71.6  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2281  HxlR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 124 aa  72  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.134727 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04084  predicted transcriptional regulator  39.81 
 
 		 126 aa  71.2  0.000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.552706  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3781  transcriptional regulator, HxlR family  39.81 
 
 		 126 aa  71.2  0.000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3794  HxlR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 126 aa  71.2  0.000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.437038  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4753  putative transcriptional regulator  39.81 
 
 		 126 aa  71.2  0.000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4465  putative transcriptional regulator  39.81 
 
 		 126 aa  71.2  0.000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.49178  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5729  putative transcriptional regulator  39.81 
 
 		 126 aa  71.2  0.000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0786413  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2523  transcriptional regulator  38.66 
 
 		 135 aa  71.2  0.000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1179  HxlR family transcriptional regulator  40.57 
 
 		 137 aa  71.6  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.795487 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2693  putative transcriptional regulator  41.3 
 
 		 235 aa  71.2  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.863177 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5256  HxlR family transcriptional regulator  38.32 
 
 		 135 aa  71.6  0.000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.86161  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1455  transcriptional regulator, HxlR family  39.39 
 
 		 146 aa  71.2  0.000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.250685  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4782  putative transcriptional regulator  39.81 
 
 		 126 aa  71.2  0.000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0423531  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1296  HxlR family transcriptional regulator  42 
 
 		 159 aa  71.2  0.000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0218186  normal  0.682914 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04047  hypothetical protein  39.81 
 
 		 126 aa  71.2  0.000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.725315  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1242  hypothetical protein  42 
 
 		 159 aa  71.2  0.000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3743  transcriptional regulator, HxlR family  40.19 
 
 		 151 aa  71.2  0.000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.680438  normal  0.0400276 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2385  transcriptional regulator, HxlR family  40.74 
 
 		 135 aa  70.9  0.000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5072  transcriptional regulator, HxlR family  42.53 
 
 		 117 aa  70.9  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.550945 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0324  transcriptional regulator, HxlR family  41.41 
 
 		 130 aa  71.2  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.948926  normal  0.0884753 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2243  putative transcriptional regulator  39.13 
 
 		 150 aa  70.9  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.58782  normal  0.248871 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1800  putative transcriptional regulator  41.24 
 
 		 128 aa  70.9  0.000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0313  HxlR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 121 aa  70.9  0.000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.250935  normal  0.451658 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2871  HxlR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 141 aa  70.9  0.000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.30961 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3785  transcriptional regulator, HxlR family  43.16 
 
 		 118 aa  70.5  0.000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.139955  normal  0.719008 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3815  transcriptional regulator, HxlR family  38.79 
 
 		 125 aa  70.5  0.000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.266885  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0290  transcriptional regulator protein-like protein  42.11 
 
 		 154 aa  70.5  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2608  transcriptional regulator, HxlR family  36.45 
 
 		 175 aa  70.5  0.000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1825  transcriptional regulator, HxlR family  41.3 
 
 		 119 aa  70.1  0.000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4705  transcriptional regulator, HxlR family  39.32 
 
 		 148 aa  70.1  0.000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.979262  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0266  helix-turn-helix HxlR type  35.14 
 
 		 130 aa  70.1  0.000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.661813  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3209  hypothetical protein  38.82 
 
 		 113 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3187  MarR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 114 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3115  MarR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 114 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.451528  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3428  hypothetical protein  38.82 
 
 		 114 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5290  transcriptional regulator, HxlR family  38.46 
 
 		 127 aa  69.7  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3462  hypothetical protein  38.82 
 
 		 113 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.457433  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1430  transcriptional regulatory protein  37.61 
 
 		 154 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.240046  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4691  putative transcriptional regulator  38.89 
 
 		 126 aa  70.1  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2124  HxlR family transcriptional regulator  40.57 
 
 		 136 aa  69.3  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.235971  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3440  hypothetical protein  38.82 
 
 		 113 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1440  HxlR family transcriptional regulator  41.35 
 
 		 146 aa  69.7  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1227  putative transcriptional regulator  38.38 
 
 		 119 aa  68.9  0.00000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.916879  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02250  predicted transcriptional regulator  41.77 
 
 		 110 aa  69.3  0.00000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4233  transcriptional regulator, HxlR family  37.86 
 
 		 128 aa  69.3  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1097  putative transcriptional regulator  44.19 
 
 		 130 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0145861 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3135  PadR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 148 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5039  putative transcriptional regulatory protein  39.39 
 
 		 125 aa  69.3  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>