More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4705 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4705  transcriptional regulator, HxlR family  100 
 
 		 148 aa  296  5e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.979262  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0324  transcriptional regulator protein-like protein  76.64 
 
 		 272 aa  211  2.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3743  transcriptional regulator, HxlR family  67.35 
 
 		 151 aa  184  4e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.680438  normal  0.0400276 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2243  putative transcriptional regulator  53.47 
 
 		 150 aa  142  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.58782  normal  0.248871 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0246  putative transcriptional regulator  59.5 
 
 		 160 aa  137  6e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8738  putative transcriptional regulator  59.82 
 
 		 137 aa  134  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0615  transcriptional regulator protein-like protein  57.39 
 
 		 168 aa  134  6.0000000000000005e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1242  hypothetical protein  55.74 
 
 		 159 aa  134  6.0000000000000005e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1997  transcriptional regulator, HxlR family  59.65 
 
 		 135 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.271973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1179  HxlR family transcriptional regulator  50.77 
 
 		 137 aa  131  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.795487 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2036  helix-turn-helix HxlR type  56.1 
 
 		 135 aa  130  5e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1367  HxlR family transcriptional regulator  60.53 
 
 		 126 aa  130  6e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00269622 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2311  transcriptional regulator, HxlR family  56.1 
 
 		 135 aa  130  6.999999999999999e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.255383  normal  0.225568 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0446  transcriptional regulator, HxlR family  60 
 
 		 135 aa  128  2.0000000000000002e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3552  HxlR family transcriptional regulator  66.67 
 
 		 125 aa  128  2.0000000000000002e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.640344 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4812  HxlR family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 180 aa  128  3e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.14161 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6638  transcriptional regulator, HxlR family  58.26 
 
 		 134 aa  128  3e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2871  HxlR family transcriptional regulator  50.37 
 
 		 141 aa  127  4.0000000000000003e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.30961 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2650  transcriptional regulator, HxlR family  47.33 
 
 		 130 aa  125  1.0000000000000001e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.116917  normal  0.771114 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4040  HxlR family transcriptional regulator  50.47 
 
 		 137 aa  122  1e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.232895  normal  0.0486648 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2865  HxlR family transcriptional regulator  52.73 
 
 		 146 aa  122  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.17139 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4732  transcriptional regulator, HxlR family  53.21 
 
 		 128 aa  122  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2385  transcriptional regulator, HxlR family  55.05 
 
 		 135 aa  122  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4817  HxlR family transcriptional regulator  55.45 
 
 		 133 aa  120  4e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.85164  normal  0.139481 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4164  HxlR family transcriptional regulator  49.61 
 
 		 122 aa  121  4e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.596618  normal  0.514488 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6779  transcriptional regulator, HxlR family  55.05 
 
 		 132 aa  119  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.636824 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5518  putative transcriptional regulatory protein  48.25 
 
 		 124 aa  119  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6178  transcriptional regulator, HxlR family  52.21 
 
 		 135 aa  118  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0462511 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1615  putative transcriptional regulatory protein  49.17 
 
 		 144 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0735023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2311  transcriptional regulator, HxlR family  56.6 
 
 		 124 aa  119  1.9999999999999998e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.272645  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0287  transcriptional regulator, HxlR family  52.73 
 
 		 129 aa  117  3.9999999999999996e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0208  hypothetical protein  49.15 
 
 		 144 aa  117  6e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3327  transcriptional regulator, HxlR family  50.89 
 
 		 126 aa  117  6e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000038683 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0184  HxlR family transcriptional regulator  48.31 
 
 		 144 aa  117  7e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3025  HxlR family transcriptional regulator  46.22 
 
 		 131 aa  117  7e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.29638  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0552  transcriptional regulator, HxlR family  52.29 
 
 		 128 aa  116  7.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.328618  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2730  PadR family transcriptional regulator  49.56 
 
 		 154 aa  116  9e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.42105  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3172  PadR family transcriptional regulator  49.56 
 
 		 174 aa  116  9e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.767015  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1879  PadR family transcriptional regulator  49.56 
 
 		 174 aa  116  9e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3189  transcriptional regulator, putative  49.12 
 
 		 146 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0929776  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2523  transcriptional regulator  50.44 
 
 		 135 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2124  HxlR family transcriptional regulator  49.07 
 
 		 136 aa  116  9.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.235971  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0897  PadR family transcriptional regulator  48.67 
 
 		 154 aa  115  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2016  transcriptional regulator, putative  48.67 
 
 		 171 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7868  HxlR family transcriptional regulator  54.05 
 
 		 121 aa  115  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4845  HxlR family transcriptional regulator  55.14 
 
 		 108 aa  115  3e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.686423  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0639  transcriptional regulator, HxlR family  49.09 
 
 		 124 aa  114  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.601638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3135  PadR family transcriptional regulator  48.67 
 
 		 148 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2005  putative transcriptional regulator  47.32 
 
 		 134 aa  114  5e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.684543 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1430  transcriptional regulatory protein  49.11 
 
 		 154 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.240046  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5823  transcriptional regulator, HxlR family  48.6 
 
 		 155 aa  113  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0742243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4646  transcriptional regulator, HxlR family  55.91 
 
 		 136 aa  112  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.103859  normal  0.28367 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4151  HxlR family transcriptional regulator  50 
 
 		 134 aa  112  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2281  HxlR family transcriptional regulator  52.68 
 
 		 124 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.134727 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6661  transcriptional regulator, HxlR family  50.88 
 
 		 131 aa  111  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.762172 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2400  HxlR family transcriptional regulator  49.57 
 
 		 137 aa  112  3e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.956461  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4392  transcriptional regulator, HxlR family  50 
 
 		 163 aa  111  3e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.201066 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4023  helix-turn-helix HxlR type  49.07 
 
 		 163 aa  110  5e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.259288  normal  0.513403 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2295  transcriptional regulator, HxlR family  41.32 
 
 		 134 aa  110  6e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0163  HxlR family transcriptional regulator  52.78 
 
 		 144 aa  110  7.000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.379253  hitchhiker  0.00857335 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2667  transcriptional regulator, HxlR family  45.22 
 
 		 132 aa  110  7.000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.196875  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3220  transcriptional regulator, HxlR family  50.5 
 
 		 131 aa  110  9e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2765  transcriptional regulator, HxlR family  43.51 
 
 		 138 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.340614  normal  0.683768 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3289  transcriptional regulator, HxlR family  47.01 
 
 		 144 aa  108  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0688006  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3513  HxlR family transcriptional regulator  45 
 
 		 125 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000897234  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1971  HxlR family transcriptional regulator  50.47 
 
 		 134 aa  108  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4233  transcriptional regulator, HxlR family  48.15 
 
 		 128 aa  108  2.0000000000000002e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1455  transcriptional regulator, HxlR family  45.45 
 
 		 146 aa  108  3e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.250685  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5290  transcriptional regulator, HxlR family  45.53 
 
 		 127 aa  108  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1776  putative transcriptional regulator  48.11 
 
 		 134 aa  108  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2994  helix-turn-helix, HxlR type  43.12 
 
 		 130 aa  108  3e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1296  HxlR family transcriptional regulator  53.54 
 
 		 159 aa  107  4.0000000000000004e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0218186  normal  0.682914 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2439  HxlR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 130 aa  107  5e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.520251  normal  0.274126 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2608  transcriptional regulator, HxlR family  49.54 
 
 		 175 aa  106  9.000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9338  transcriptional regulator, HxlR family  50.45 
 
 		 132 aa  106  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.785405 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3128  transcriptional regulator, HxlR family  50 
 
 		 130 aa  106  1e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1800  putative transcriptional regulator  48.25 
 
 		 128 aa  106  1e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2255  HxlR family transcriptional regulator  42.74 
 
 		 156 aa  105  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.018064 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1021  putative transcriptional regulator  48.65 
 
 		 128 aa  105  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.247516 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2619  putative transcriptional regulator  47.27 
 
 		 164 aa  105  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.329844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0618  HxlR family transcriptional regulator  53.68 
 
 		 157 aa  105  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.953045  hitchhiker  0.00866972 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4262  transcriptional regulator, HxlR family  50 
 
 		 144 aa  105  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.388354  normal  0.116604 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1490  HxlR family transcriptional regulator  51.85 
 
 		 131 aa  105  3e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.263711 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1015  HxlR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 144 aa  105  3e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0428333  normal  0.95229 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0042  transcriptional regulator, HxlR family  45.79 
 
 		 132 aa  105  3e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2221  transcriptional regulator, HxlR family  42.64 
 
 		 152 aa  105  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.405222  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3206  transcriptional regulator, HxlR family  41.88 
 
 		 139 aa  105  3e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2669  transcriptional regulator, HxlR family  47.06 
 
 		 130 aa  104  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5429  transcriptional regulator, HxlR family  44.86 
 
 		 149 aa  104  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0264  HxlR family transcriptional regulator  46.02 
 
 		 137 aa  104  4e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5164  transcriptional regulator, HxlR family  43.2 
 
 		 145 aa  104  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.68624 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1728  HxlR family transcriptional regulator  46.23 
 
 		 135 aa  104  5e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2843  putative transcriptional regulator  46.23 
 
 		 133 aa  104  5e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0861419  normal  0.0924063 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1620  putative transcriptional regulator  46.23 
 
 		 133 aa  104  5e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2977  transcriptional regulator, HxlR family  49.06 
 
 		 170 aa  103  6e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.369685  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3815  transcriptional regulator, HxlR family  47.37 
 
 		 125 aa  103  6e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.266885  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2792  hypothetical protein  44.55 
 
 		 136 aa  103  6e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1731  putative transcriptional regulator  43.75 
 
 		 144 aa  103  6e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2195  transcriptional regulator, HxlR family  43.22 
 
 		 136 aa  103  7e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0278  putative transcriptional regulator  50.94 
 
 		 128 aa  103  7e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.640242  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>