More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4262 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4262  transcriptional regulator, HxlR family  100 
 
 		 144 aa  289  8e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.388354  normal  0.116604 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7868  HxlR family transcriptional regulator  66.09 
 
 		 121 aa  159  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4151  HxlR family transcriptional regulator  54.55 
 
 		 134 aa  140  4e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3513  HxlR family transcriptional regulator  52.1 
 
 		 125 aa  132  9.999999999999999e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000897234  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1430  transcriptional regulatory protein  47.41 
 
 		 154 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.240046  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3135  PadR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 148 aa  127  6e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4243  transcriptional regulator, HxlR family  53.7 
 
 		 122 aa  127  7.000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.216775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0287  transcriptional regulator, HxlR family  50.85 
 
 		 129 aa  126  1.0000000000000001e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0313  HxlR family transcriptional regulator  49.56 
 
 		 121 aa  125  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.250935  normal  0.451658 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3172  PadR family transcriptional regulator  45.93 
 
 		 174 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.767015  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1879  PadR family transcriptional regulator  45.93 
 
 		 174 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3189  transcriptional regulator, putative  47.29 
 
 		 146 aa  125  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0929776  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2016  transcriptional regulator, putative  45.19 
 
 		 171 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2730  PadR family transcriptional regulator  49.59 
 
 		 154 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.42105  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0897  PadR family transcriptional regulator  48.76 
 
 		 154 aa  124  6e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0324  transcriptional regulator, HxlR family  50.86 
 
 		 130 aa  122  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.948926  normal  0.0884753 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5429  transcriptional regulator, HxlR family  45.54 
 
 		 149 aa  121  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1881  HxlR family transcriptional regulator  52.94 
 
 		 129 aa  120  8e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.572162 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1367  HxlR family transcriptional regulator  57.84 
 
 		 126 aa  120  9e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00269622 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1825  transcriptional regulator, HxlR family  51.69 
 
 		 119 aa  120  9e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7647  transcriptional regulator, HxlR family  54.87 
 
 		 123 aa  119  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5518  putative transcriptional regulatory protein  45 
 
 		 124 aa  119  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1242  hypothetical protein  49.09 
 
 		 159 aa  119  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3423  transcriptional regulator, HxlR family  44.07 
 
 		 127 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.201208  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1997  transcriptional regulator, HxlR family  53.47 
 
 		 135 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.271973  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3282  transcriptional regulator, HxlR family  48.21 
 
 		 125 aa  117  7e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2036  helix-turn-helix HxlR type  53.47 
 
 		 135 aa  117  7.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2311  transcriptional regulator, HxlR family  53.47 
 
 		 135 aa  116  9e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.255383  normal  0.225568 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2865  HxlR family transcriptional regulator  47.41 
 
 		 146 aa  116  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.17139 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4732  transcriptional regulator, HxlR family  48.18 
 
 		 128 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2019  putative transcriptional regulator  52.59 
 
 		 129 aa  114  3e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.837562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5625  HxlR family transcriptional regulator  48.18 
 
 		 126 aa  114  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.229377  normal  0.277837 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2243  putative transcriptional regulator  48.51 
 
 		 150 aa  114  6e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.58782  normal  0.248871 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2400  HxlR family transcriptional regulator  49.55 
 
 		 137 aa  114  6e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.956461  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0446  transcriptional regulator, HxlR family  51.46 
 
 		 135 aa  114  6.9999999999999995e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9338  transcriptional regulator, HxlR family  50.44 
 
 		 132 aa  113  7.999999999999999e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.785405 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4233  transcriptional regulator, HxlR family  43.24 
 
 		 128 aa  113  1.0000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3025  HxlR family transcriptional regulator  49.51 
 
 		 131 aa  112  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.29638  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4812  HxlR family transcriptional regulator  50 
 
 		 180 aa  112  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.14161 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0042  transcriptional regulator, HxlR family  43.9 
 
 		 132 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2669  transcriptional regulator, HxlR family  51.26 
 
 		 130 aa  111  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0163  HxlR family transcriptional regulator  47.86 
 
 		 144 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.379253  hitchhiker  0.00857335 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6638  transcriptional regulator, HxlR family  50.98 
 
 		 134 aa  110  5e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2385  transcriptional regulator, HxlR family  50 
 
 		 135 aa  110  5e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2650  transcriptional regulator, HxlR family  43.44 
 
 		 130 aa  110  6e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.116917  normal  0.771114 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2977  transcriptional regulator, HxlR family  43.38 
 
 		 170 aa  110  6e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.369685  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3391  transcriptional regulator, HxlR family  42.24 
 
 		 125 aa  110  7.000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7105  transcriptional regulator protein-like protein  53.61 
 
 		 164 aa  110  8.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.248427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2706  putative transcriptional regulator  43.64 
 
 		 133 aa  110  8.000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.370277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3592  HxlR family transcriptional regulator  43.7 
 
 		 124 aa  109  1.0000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.501771 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2523  transcriptional regulator  46.55 
 
 		 135 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3327  transcriptional regulator, HxlR family  41.53 
 
 		 126 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000038683 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0469  putative transcriptional regulator  51.75 
 
 		 128 aa  109  1.0000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1615  putative transcriptional regulatory protein  44.25 
 
 		 144 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0735023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4164  HxlR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 122 aa  108  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.596618  normal  0.514488 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0246  putative transcriptional regulator  48.21 
 
 		 160 aa  108  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6779  transcriptional regulator, HxlR family  43.65 
 
 		 132 aa  108  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.636824 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1455  transcriptional regulator, HxlR family  45.92 
 
 		 146 aa  108  3e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.250685  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0639  transcriptional regulator, HxlR family  44.04 
 
 		 124 aa  107  4.0000000000000004e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.601638  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04084  predicted transcriptional regulator  41.28 
 
 		 126 aa  106  9.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.552706  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3781  transcriptional regulator, HxlR family  41.28 
 
 		 126 aa  106  9.000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3794  HxlR family transcriptional regulator  41.28 
 
 		 126 aa  106  9.000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.437038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4465  putative transcriptional regulator  41.28 
 
 		 126 aa  106  9.000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.49178  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4691  putative transcriptional regulator  41.28 
 
 		 126 aa  106  9.000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4782  putative transcriptional regulator  41.28 
 
 		 126 aa  106  9.000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0423531  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5256  HxlR family transcriptional regulator  43.7 
 
 		 135 aa  106  9.000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.86161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4753  putative transcriptional regulator  41.28 
 
 		 126 aa  106  9.000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04047  hypothetical protein  41.28 
 
 		 126 aa  106  9.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.725315  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5729  putative transcriptional regulator  41.28 
 
 		 126 aa  106  9.000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0786413  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4392  transcriptional regulator, HxlR family  42.61 
 
 		 163 aa  106  9.000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.201066 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2508  hypothetical protein  37.82 
 
 		 142 aa  106  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.261635  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4023  helix-turn-helix HxlR type  41.03 
 
 		 163 aa  106  1e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.259288  normal  0.513403 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1971  HxlR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 134 aa  106  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3128  transcriptional regulator, HxlR family  42.24 
 
 		 130 aa  105  2e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0879  transcriptional regulator, HxlR family  52.88 
 
 		 126 aa  105  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.40376  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4705  transcriptional regulator, HxlR family  50 
 
 		 148 aa  105  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.979262  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4706  transcriptional regulator, HxlR family  47.17 
 
 		 143 aa  104  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0222658  normal  0.87312 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1021  putative transcriptional regulator  51.04 
 
 		 128 aa  105  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.247516 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2138  hypothetical protein  47.62 
 
 		 125 aa  104  5e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.30336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0621  HxlR family transcriptional regulator  42.34 
 
 		 140 aa  103  5e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0384  HxlR family transcriptional regulator  43.81 
 
 		 128 aa  103  5e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1440  HxlR family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 146 aa  103  6e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5545  HxlR family transcriptional regulator  50 
 
 		 128 aa  103  6e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.691894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3630  HxlR family transcriptional regulator  50 
 
 		 128 aa  103  6e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4737  HxlR family transcriptional regulator  50 
 
 		 128 aa  103  6e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00638725 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2195  transcriptional regulator, HxlR family  43.52 
 
 		 136 aa  103  6e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0618  HxlR family transcriptional regulator  53.19 
 
 		 157 aa  103  7e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.953045  hitchhiker  0.00866972 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2876  transcriptional regulator, HxlR family  44.23 
 
 		 133 aa  103  7e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2619  putative transcriptional regulator  40.6 
 
 		 164 aa  103  9e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.329844  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05353  hypothetical protein  52.75 
 
 		 137 aa  102  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.387591  normal  0.848219 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2765  transcriptional regulator, HxlR family  41.07 
 
 		 138 aa  103  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.340614  normal  0.683768 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2295  transcriptional regulator, HxlR family  42.59 
 
 		 134 aa  103  1e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2510  transcriptional regulator, HxlR family  41.96 
 
 		 138 aa  102  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2312  hypothetical protein  36.97 
 
 		 154 aa  102  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.866672 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1728  HxlR family transcriptional regulator  40 
 
 		 135 aa  102  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6178  transcriptional regulator, HxlR family  43.48 
 
 		 135 aa  102  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0462511 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1800  putative transcriptional regulator  44.86 
 
 		 128 aa  102  2e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2843  putative transcriptional regulator  40 
 
 		 133 aa  102  2e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0861419  normal  0.0924063 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4817  HxlR family transcriptional regulator  42.64 
 
 		 133 aa  102  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.85164  normal  0.139481 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1620  putative transcriptional regulator  40 
 
 		 133 aa  102  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>