More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_1455 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_1455  transcriptional regulator, HxlR family  100 
 
 		 146 aa  301  1.0000000000000001e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.250685  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1800  putative transcriptional regulator  73.73 
 
 		 128 aa  185  2e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4233  transcriptional regulator, HxlR family  67.24 
 
 		 128 aa  171  2.9999999999999996e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1021  putative transcriptional regulator  69.37 
 
 		 128 aa  169  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.247516 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5545  HxlR family transcriptional regulator  71.84 
 
 		 128 aa  161  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.691894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3630  HxlR family transcriptional regulator  68.75 
 
 		 128 aa  161  3e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4737  HxlR family transcriptional regulator  68.75 
 
 		 128 aa  161  3e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00638725 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4732  transcriptional regulator, HxlR family  65.05 
 
 		 128 aa  144  5e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3369  hypothetical protein  58.33 
 
 		 111 aa  125  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0346683  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4023  helix-turn-helix HxlR type  52.88 
 
 		 163 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.259288  normal  0.513403 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4392  transcriptional regulator, HxlR family  52.88 
 
 		 163 aa  124  5e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.201066 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0163  HxlR family transcriptional regulator  44.2 
 
 		 144 aa  122  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.379253  hitchhiker  0.00857335 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1615  putative transcriptional regulatory protein  53.85 
 
 		 144 aa  122  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0735023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0278  putative transcriptional regulator  56.31 
 
 		 128 aa  120  5e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.640242  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0246  putative transcriptional regulator  51.52 
 
 		 160 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0639  transcriptional regulator, HxlR family  51.85 
 
 		 124 aa  117  3.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.601638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4243  transcriptional regulator, HxlR family  46.96 
 
 		 122 aa  117  6e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.216775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4845  HxlR family transcriptional regulator  48.11 
 
 		 108 aa  117  6e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.686423  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0208  hypothetical protein  50.98 
 
 		 144 aa  116  9.999999999999999e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0618  HxlR family transcriptional regulator  49.11 
 
 		 157 aa  115  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.953045  hitchhiker  0.00866972 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1430  transcriptional regulatory protein  46.22 
 
 		 154 aa  114  6e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.240046  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3743  transcriptional regulator, HxlR family  45.87 
 
 		 151 aa  113  8.999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.680438  normal  0.0400276 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0184  HxlR family transcriptional regulator  50.93 
 
 		 144 aa  113  8.999999999999998e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8738  putative transcriptional regulator  50.98 
 
 		 137 aa  113  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3135  PadR family transcriptional regulator  47.41 
 
 		 148 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1971  HxlR family transcriptional regulator  48.04 
 
 		 134 aa  112  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6779  transcriptional regulator, HxlR family  52.43 
 
 		 132 aa  112  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.636824 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2016  transcriptional regulator, putative  52.08 
 
 		 171 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2619  putative transcriptional regulator  49.02 
 
 		 164 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.329844  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3552  HxlR family transcriptional regulator  52.75 
 
 		 125 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.640344 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0897  PadR family transcriptional regulator  52.08 
 
 		 154 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2730  PadR family transcriptional regulator  52.08 
 
 		 154 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.42105  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3172  PadR family transcriptional regulator  52.08 
 
 		 174 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.767015  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1879  PadR family transcriptional regulator  52.08 
 
 		 174 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4646  transcriptional regulator, HxlR family  46.83 
 
 		 136 aa  112  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.103859  normal  0.28367 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3189  transcriptional regulator, putative  49.54 
 
 		 146 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0929776  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2765  transcriptional regulator, HxlR family  44.74 
 
 		 138 aa  110  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.340614  normal  0.683768 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2124  HxlR family transcriptional regulator  40.29 
 
 		 136 aa  110  5e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.235971  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3513  HxlR family transcriptional regulator  42.99 
 
 		 125 aa  110  5e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000897234  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3025  HxlR family transcriptional regulator  45 
 
 		 131 aa  110  6e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.29638  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2400  HxlR family transcriptional regulator  46.09 
 
 		 137 aa  110  7.000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.956461  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3282  transcriptional regulator, HxlR family  44.04 
 
 		 125 aa  110  8.000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2977  transcriptional regulator, HxlR family  48.04 
 
 		 170 aa  110  8.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.369685  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5256  HxlR family transcriptional regulator  49.07 
 
 		 135 aa  110  8.000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.86161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0615  transcriptional regulator protein-like protein  47.01 
 
 		 168 aa  109  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6178  transcriptional regulator, HxlR family  50 
 
 		 135 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0462511 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7868  HxlR family transcriptional regulator  46.23 
 
 		 121 aa  108  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0287  transcriptional regulator, HxlR family  45.28 
 
 		 129 aa  108  2.0000000000000002e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0324  transcriptional regulator protein-like protein  46.08 
 
 		 272 aa  108  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4705  transcriptional regulator, HxlR family  45.45 
 
 		 148 aa  108  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.979262  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4817  HxlR family transcriptional regulator  45.54 
 
 		 133 aa  108  3e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.85164  normal  0.139481 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2792  hypothetical protein  44.12 
 
 		 136 aa  108  3e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4262  transcriptional regulator, HxlR family  45.92 
 
 		 144 aa  108  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.388354  normal  0.116604 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4151  HxlR family transcriptional regulator  46.23 
 
 		 134 aa  108  3e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1242  hypothetical protein  50 
 
 		 159 aa  107  4.0000000000000004e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2523  transcriptional regulator  48.98 
 
 		 135 aa  107  4.0000000000000004e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2510  transcriptional regulator, HxlR family  44.07 
 
 		 138 aa  107  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3391  transcriptional regulator, HxlR family  47 
 
 		 125 aa  107  7.000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1179  HxlR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 137 aa  106  9.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.795487 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3327  transcriptional regulator, HxlR family  42.86 
 
 		 126 aa  106  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000038683 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2865  HxlR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 146 aa  105  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.17139 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3919  transcriptional regulator, HxlR family  42.59 
 
 		 131 aa  105  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.972554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2255  HxlR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 156 aa  104  3e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.018064 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1728  HxlR family transcriptional regulator  47.12 
 
 		 135 aa  104  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2843  putative transcriptional regulator  47.12 
 
 		 133 aa  104  3e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0861419  normal  0.0924063 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2650  transcriptional regulator, HxlR family  47.22 
 
 		 130 aa  105  3e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.116917  normal  0.771114 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1620  putative transcriptional regulator  47.12 
 
 		 133 aa  104  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2385  transcriptional regulator, HxlR family  49.06 
 
 		 135 aa  104  4e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2138  hypothetical protein  46 
 
 		 125 aa  103  7e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.30336  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3423  transcriptional regulator, HxlR family  41.35 
 
 		 127 aa  103  7e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.201208  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2871  HxlR family transcriptional regulator  43.81 
 
 		 141 aa  102  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.30961 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1776  putative transcriptional regulator  48.96 
 
 		 134 aa  103  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3128  transcriptional regulator, HxlR family  41.6 
 
 		 130 aa  102  2e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3220  transcriptional regulator, HxlR family  50 
 
 		 131 aa  102  2e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4040  HxlR family transcriptional regulator  42.02 
 
 		 137 aa  102  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.232895  normal  0.0486648 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0446  transcriptional regulator, HxlR family  46.88 
 
 		 135 aa  101  3e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6638  transcriptional regulator, HxlR family  45.83 
 
 		 134 aa  101  4e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0042  transcriptional regulator, HxlR family  41.38 
 
 		 132 aa  100  5e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4812  HxlR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 180 aa  100  6e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.14161 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1490  HxlR family transcriptional regulator  43.31 
 
 		 131 aa  100  6e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.263711 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3357  hypothetical protein  45.95 
 
 		 129 aa  100  6e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221434  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4289  transcriptional regulator, HxlR family  43.36 
 
 		 144 aa  100  7e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3119  HxlR family transcriptional regulator  48.42 
 
 		 107 aa  100  7e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0144533  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5865  HxlR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 149 aa  100  7e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.480533  normal  0.03101 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2243  putative transcriptional regulator  46 
 
 		 150 aa  100  7e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.58782  normal  0.248871 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0384  HxlR family transcriptional regulator  41.88 
 
 		 128 aa  100  8e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5518  putative transcriptional regulatory protein  42.59 
 
 		 124 aa  100  9e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1899  hypothetical protein  47.62 
 
 		 126 aa  99.8  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3133  hypothetical protein  47.62 
 
 		 126 aa  99.8  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.441436  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3120  transcriptional regulator  47.62 
 
 		 126 aa  99.8  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.118143  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3379  hypothetical protein  47.62 
 
 		 126 aa  99.8  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3681  transcriptional regulator, HxlR family  41.94 
 
 		 101 aa  99.8  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3354  hypothetical protein  47.62 
 
 		 126 aa  99.8  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0621  HxlR family transcriptional regulator  44.14 
 
 		 140 aa  99.8  1e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1367  HxlR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 126 aa  99.4  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00269622 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3027  transcriptional regulator  47.62 
 
 		 126 aa  99.4  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.710275  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3129  MarR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 115 aa  98.6  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.576671  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3455  hypothetical protein  47.37 
 
 		 107 aa  99  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.365377  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2669  transcriptional regulator, HxlR family  42.86 
 
 		 130 aa  99  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1997  transcriptional regulator, HxlR family  46.3 
 
 		 135 aa  99.4  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.271973  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>