More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0639 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0639  transcriptional regulator, HxlR family  100 
 
 		 124 aa  256  7e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.601638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3327  transcriptional regulator, HxlR family  59.81 
 
 		 126 aa  142  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000038683 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0615  transcriptional regulator protein-like protein  54.72 
 
 		 168 aa  122  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1021  putative transcriptional regulator  51.82 
 
 		 128 aa  122  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.247516 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4233  transcriptional regulator, HxlR family  56.6 
 
 		 128 aa  122  2e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2243  putative transcriptional regulator  54.05 
 
 		 150 aa  120  7e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.58782  normal  0.248871 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1800  putative transcriptional regulator  51.82 
 
 		 128 aa  120  7e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0246  putative transcriptional regulator  53.15 
 
 		 160 aa  120  8e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1997  transcriptional regulator, HxlR family  49.59 
 
 		 135 aa  118  3e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.271973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5545  HxlR family transcriptional regulator  55 
 
 		 128 aa  118  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.691894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3630  HxlR family transcriptional regulator  55 
 
 		 128 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4737  HxlR family transcriptional regulator  55 
 
 		 128 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00638725 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1455  transcriptional regulator, HxlR family  51.85 
 
 		 146 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.250685  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2311  transcriptional regulator, HxlR family  54.72 
 
 		 135 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.255383  normal  0.225568 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2036  helix-turn-helix HxlR type  54.72 
 
 		 135 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0446  transcriptional regulator, HxlR family  49.12 
 
 		 135 aa  115  9.999999999999999e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2385  transcriptional regulator, HxlR family  50.46 
 
 		 135 aa  114  3e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1179  HxlR family transcriptional regulator  49.54 
 
 		 137 aa  114  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.795487 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4705  transcriptional regulator, HxlR family  49.09 
 
 		 148 aa  114  3e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.979262  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0287  transcriptional regulator, HxlR family  46.85 
 
 		 129 aa  114  5e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1242  hypothetical protein  52.29 
 
 		 159 aa  113  6.9999999999999995e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4812  HxlR family transcriptional regulator  47.01 
 
 		 180 aa  113  8.999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.14161 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5256  HxlR family transcriptional regulator  46.61 
 
 		 135 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.86161  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4732  transcriptional regulator, HxlR family  45.45 
 
 		 128 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4164  HxlR family transcriptional regulator  52.88 
 
 		 122 aa  112  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.596618  normal  0.514488 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0208  hypothetical protein  44.83 
 
 		 144 aa  112  2.0000000000000002e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0184  HxlR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 144 aa  111  4.0000000000000004e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0278  putative transcriptional regulator  45.45 
 
 		 128 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.640242  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0163  HxlR family transcriptional regulator  47.41 
 
 		 144 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.379253  hitchhiker  0.00857335 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2311  transcriptional regulator, HxlR family  50.91 
 
 		 124 aa  110  5e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.272645  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2400  HxlR family transcriptional regulator  49.11 
 
 		 137 aa  110  5e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.956461  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4023  helix-turn-helix HxlR type  47.41 
 
 		 163 aa  110  9e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.259288  normal  0.513403 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3513  HxlR family transcriptional regulator  45.3 
 
 		 125 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000897234  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3025  HxlR family transcriptional regulator  46.9 
 
 		 131 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.29638  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7868  HxlR family transcriptional regulator  46.79 
 
 		 121 aa  108  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4392  transcriptional regulator, HxlR family  46.55 
 
 		 163 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.201066 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6779  transcriptional regulator, HxlR family  53.85 
 
 		 132 aa  108  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.636824 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2619  putative transcriptional regulator  47.41 
 
 		 164 aa  108  3e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.329844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4262  transcriptional regulator, HxlR family  44.04 
 
 		 144 aa  107  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.388354  normal  0.116604 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2977  transcriptional regulator, HxlR family  46.55 
 
 		 170 aa  107  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.369685  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1615  putative transcriptional regulatory protein  45.69 
 
 		 144 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0735023  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6178  transcriptional regulator, HxlR family  50 
 
 		 135 aa  107  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0462511 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3743  transcriptional regulator, HxlR family  52.83 
 
 		 151 aa  107  7.000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.680438  normal  0.0400276 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3552  HxlR family transcriptional regulator  54 
 
 		 125 aa  106  8.000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.640344 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5823  transcriptional regulator, HxlR family  46.36 
 
 		 155 aa  105  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0742243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0313  HxlR family transcriptional regulator  46.96 
 
 		 121 aa  105  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.250935  normal  0.451658 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6638  transcriptional regulator, HxlR family  51.92 
 
 		 134 aa  105  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4845  HxlR family transcriptional regulator  51.96 
 
 		 108 aa  105  3e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.686423  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4151  HxlR family transcriptional regulator  43.8 
 
 		 134 aa  105  3e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4817  HxlR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 133 aa  104  4e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.85164  normal  0.139481 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2650  transcriptional regulator, HxlR family  48.51 
 
 		 130 aa  104  4e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.116917  normal  0.771114 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2124  HxlR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 136 aa  103  6e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.235971  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1971  HxlR family transcriptional regulator  43.93 
 
 		 134 aa  103  6e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0618  HxlR family transcriptional regulator  55.32 
 
 		 157 aa  103  7e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.953045  hitchhiker  0.00866972 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4646  transcriptional regulator, HxlR family  51.89 
 
 		 136 aa  103  9e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.103859  normal  0.28367 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1776  putative transcriptional regulator  45.87 
 
 		 134 aa  102  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3815  transcriptional regulator, HxlR family  42.37 
 
 		 125 aa  103  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.266885  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8738  putative transcriptional regulator  49.06 
 
 		 137 aa  102  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0324  transcriptional regulator protein-like protein  43.8 
 
 		 272 aa  101  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1367  HxlR family transcriptional regulator  50 
 
 		 126 aa  101  4e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00269622 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1490  HxlR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 131 aa  100  5e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.263711 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9338  transcriptional regulator, HxlR family  43.52 
 
 		 132 aa  100  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.785405 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1607  transcriptional regulator, HxlR family  44.55 
 
 		 113 aa  100  5e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000104346  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0703  transcriptional regulator, HxlR family  50.53 
 
 		 134 aa  100  6e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.383651  normal  0.144185 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2865  HxlR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 146 aa  100  7e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.17139 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6661  transcriptional regulator, HxlR family  50 
 
 		 131 aa  100  8e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.762172 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1015  HxlR family transcriptional regulator  43.93 
 
 		 144 aa  99.4  1e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0428333  normal  0.95229 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1564  HxlR family transcriptional regulator  49.48 
 
 		 119 aa  99.4  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0663317  normal  0.0831873 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4243  transcriptional regulator, HxlR family  46.23 
 
 		 122 aa  99  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.216775  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3423  transcriptional regulator, HxlR family  42.61 
 
 		 127 aa  98.6  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.201208  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2221  transcriptional regulator, HxlR family  46.73 
 
 		 152 aa  98.2  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.405222  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2871  HxlR family transcriptional regulator  44.86 
 
 		 141 aa  98.2  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.30961 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3895  HxlR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 120 aa  98.2  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000755308  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5518  putative transcriptional regulatory protein  42.59 
 
 		 124 aa  98.6  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2667  transcriptional regulator, HxlR family  41.67 
 
 		 132 aa  97.8  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.196875  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0042  transcriptional regulator, HxlR family  43.48 
 
 		 132 aa  97.4  5e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0802  transcriptional regulator, HxlR family  45.92 
 
 		 106 aa  97.4  5e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0464121  normal  0.73342 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3129  MarR family transcriptional regulator  41.9 
 
 		 115 aa  97.4  6e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.576671  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2510  transcriptional regulator, HxlR family  43.52 
 
 		 138 aa  97.4  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2281  HxlR family transcriptional regulator  45.13 
 
 		 124 aa  97.4  6e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.134727 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1430  transcriptional regulatory protein  45.37 
 
 		 154 aa  97.1  8e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.240046  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0013  HxlR family transcriptional regulator  45.36 
 
 		 126 aa  96.7  9e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4399  hypothetical protein  41.53 
 
 		 124 aa  96.3  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4217  hypothetical protein  41.53 
 
 		 124 aa  96.3  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4055  transcriptional regulator  41.53 
 
 		 124 aa  96.3  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.396916  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4065  transcriptional regulator  41.53 
 
 		 124 aa  96.3  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.966493  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4543  hypothetical protein  41.53 
 
 		 124 aa  96.3  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.719807  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0799  hypothetical protein  42.48 
 
 		 124 aa  95.9  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000413922  hitchhiker  1.6907100000000001e-18 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4437  hypothetical protein  42.48 
 
 		 124 aa  95.9  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000169623  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1731  putative transcriptional regulator  43.27 
 
 		 144 aa  96.3  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4340  hypothetical protein  41.53 
 
 		 124 aa  96.3  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.43956e-24 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4451  hypothetical protein  41.53 
 
 		 124 aa  96.3  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000232165  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3369  hypothetical protein  48.08 
 
 		 111 aa  95.9  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0346683  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5625  HxlR family transcriptional regulator  43.12 
 
 		 126 aa  95.9  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.229377  normal  0.277837 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5865  HxlR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 149 aa  95.9  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.480533  normal  0.03101 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0897  PadR family transcriptional regulator  45.37 
 
 		 154 aa  95.5  2e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2730  PadR family transcriptional regulator  45.37 
 
 		 154 aa  95.5  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.42105  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3135  PadR family transcriptional regulator  45.37 
 
 		 148 aa  95.5  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3172  PadR family transcriptional regulator  45.37 
 
 		 174 aa  95.5  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.767015  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1879  PadR family transcriptional regulator  45.37 
 
 		 174 aa  95.5  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>