More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_2221 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_2221  transcriptional regulator, HxlR family  100 
 
 		 152 aa  308  2e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.405222  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5865  HxlR family transcriptional regulator  84.62 
 
 		 149 aa  231  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.480533  normal  0.03101 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1015  HxlR family transcriptional regulator  57.55 
 
 		 144 aa  167  6e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0428333  normal  0.95229 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3206  transcriptional regulator, HxlR family  61.79 
 
 		 139 aa  162  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1731  putative transcriptional regulator  61.02 
 
 		 144 aa  157  4e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5164  transcriptional regulator, HxlR family  53.66 
 
 		 145 aa  148  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.68624 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0324  transcriptional regulator protein-like protein  53.77 
 
 		 272 aa  112  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0278  putative transcriptional regulator  43.44 
 
 		 128 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.640242  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2281  HxlR family transcriptional regulator  50.96 
 
 		 124 aa  107  7.000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.134727 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3743  transcriptional regulator, HxlR family  50 
 
 		 151 aa  107  8.000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.680438  normal  0.0400276 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3369  hypothetical protein  50 
 
 		 111 aa  105  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0346683  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4023  helix-turn-helix HxlR type  46.02 
 
 		 163 aa  105  3e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.259288  normal  0.513403 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4705  transcriptional regulator, HxlR family  42.64 
 
 		 148 aa  105  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.979262  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4392  transcriptional regulator, HxlR family  46.02 
 
 		 163 aa  104  5e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.201066 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2865  HxlR family transcriptional regulator  50 
 
 		 146 aa  103  9e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.17139 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0618  HxlR family transcriptional regulator  53.92 
 
 		 157 aa  102  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.953045  hitchhiker  0.00866972 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4817  HxlR family transcriptional regulator  50.48 
 
 		 133 aa  102  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.85164  normal  0.139481 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0184  HxlR family transcriptional regulator  44.95 
 
 		 144 aa  102  3e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9338  transcriptional regulator, HxlR family  45.63 
 
 		 132 aa  101  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.785405 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0208  hypothetical protein  44.95 
 
 		 144 aa  100  7e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0246  putative transcriptional regulator  45.87 
 
 		 160 aa  100  7e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0615  transcriptional regulator protein-like protein  44.44 
 
 		 168 aa  100  9e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1242  hypothetical protein  42.86 
 
 		 159 aa  99.8  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1021  putative transcriptional regulator  41.44 
 
 		 128 aa  98.6  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.247516 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1430  transcriptional regulatory protein  44.95 
 
 		 154 aa  99  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.240046  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2243  putative transcriptional regulator  48.08 
 
 		 150 aa  99.4  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.58782  normal  0.248871 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0446  transcriptional regulator, HxlR family  43.7 
 
 		 135 aa  98.2  3e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0639  transcriptional regulator, HxlR family  46.73 
 
 		 124 aa  98.2  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.601638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2523  transcriptional regulator  43.59 
 
 		 135 aa  97.8  4e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2730  PadR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 154 aa  97.8  5e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.42105  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3172  PadR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 174 aa  97.8  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.767015  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1879  PadR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 174 aa  97.8  5e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2036  helix-turn-helix HxlR type  47.62 
 
 		 135 aa  97.4  6e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2016  transcriptional regulator, putative  42.62 
 
 		 171 aa  97.4  6e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0163  HxlR family transcriptional regulator  46.96 
 
 		 144 aa  97.4  6e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.379253  hitchhiker  0.00857335 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3513  HxlR family transcriptional regulator  44.95 
 
 		 125 aa  97.4  6e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000897234  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5545  HxlR family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 128 aa  97.1  7e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.691894  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3189  transcriptional regulator, putative  43.86 
 
 		 146 aa  97.4  7e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0929776  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2311  transcriptional regulator, HxlR family  47.62 
 
 		 135 aa  97.4  7e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.255383  normal  0.225568 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2439  HxlR family transcriptional regulator  40.5 
 
 		 130 aa  97.1  7e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.520251  normal  0.274126 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1997  transcriptional regulator, HxlR family  47.62 
 
 		 135 aa  97.1  7e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.271973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0897  PadR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 154 aa  97.4  7e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4732  transcriptional regulator, HxlR family  44.12 
 
 		 128 aa  97.4  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3630  HxlR family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 128 aa  97.1  8e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4737  HxlR family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 128 aa  97.1  8e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00638725 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3135  PadR family transcriptional regulator  44.04 
 
 		 148 aa  97.1  8e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2385  transcriptional regulator, HxlR family  45.63 
 
 		 135 aa  96.7  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2994  helix-turn-helix, HxlR type  43.12 
 
 		 130 aa  96.3  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2608  transcriptional regulator, HxlR family  37.76 
 
 		 175 aa  96.3  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4233  transcriptional regulator, HxlR family  41.35 
 
 		 128 aa  95.9  2e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1367  HxlR family transcriptional regulator  46.85 
 
 		 126 aa  95.9  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00269622 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0552  transcriptional regulator, HxlR family  48.62 
 
 		 128 aa  95.9  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.328618  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1455  transcriptional regulator, HxlR family  39.45 
 
 		 146 aa  95.9  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.250685  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2124  HxlR family transcriptional regulator  42.2 
 
 		 136 aa  94.4  5e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.235971  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0271  transcriptional regulator, HxlR family  35.34 
 
 		 140 aa  94.4  5e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1615  putative transcriptional regulatory protein  42.48 
 
 		 144 aa  94.4  5e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0735023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1728  HxlR family transcriptional regulator  43 
 
 		 135 aa  94.4  5e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2843  putative transcriptional regulator  43 
 
 		 133 aa  94.4  6e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0861419  normal  0.0924063 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3025  HxlR family transcriptional regulator  42.48 
 
 		 131 aa  94.4  6e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.29638  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1620  putative transcriptional regulator  43 
 
 		 133 aa  94.4  6e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3327  transcriptional regulator, HxlR family  39.09 
 
 		 126 aa  92.4  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000038683 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3552  HxlR family transcriptional regulator  48.45 
 
 		 125 aa  92  3e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.640344 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8738  putative transcriptional regulator  43.14 
 
 		 137 aa  91.7  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1776  putative transcriptional regulator  42.86 
 
 		 134 aa  91.7  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6638  transcriptional regulator, HxlR family  44.34 
 
 		 134 aa  91.3  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1971  HxlR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 134 aa  91.3  4e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4289  transcriptional regulator, HxlR family  39.66 
 
 		 144 aa  90.9  5e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2871  HxlR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 141 aa  90.9  5e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.30961 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2977  transcriptional regulator, HxlR family  45.19 
 
 		 170 aa  90.9  6e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.369685  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2255  HxlR family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 156 aa  90.9  6e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.018064 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4164  HxlR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 122 aa  90.5  7e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.596618  normal  0.514488 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4040  HxlR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 137 aa  90.5  8e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.232895  normal  0.0486648 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1800  putative transcriptional regulator  39.22 
 
 		 128 aa  90.5  8e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5429  transcriptional regulator, HxlR family  40.78 
 
 		 149 aa  90.1  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04084  predicted transcriptional regulator  40.38 
 
 		 126 aa  90.1  9e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.552706  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3781  transcriptional regulator, HxlR family  40.38 
 
 		 126 aa  90.1  9e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4465  putative transcriptional regulator  40.38 
 
 		 126 aa  90.1  9e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.49178  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5729  putative transcriptional regulator  40.38 
 
 		 126 aa  90.1  9e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0786413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6661  transcriptional regulator, HxlR family  42.57 
 
 		 131 aa  90.1  9e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.762172 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3794  HxlR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 126 aa  90.1  9e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.437038  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4753  putative transcriptional regulator  40.38 
 
 		 126 aa  90.1  9e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04047  hypothetical protein  40.38 
 
 		 126 aa  90.1  9e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.725315  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4782  putative transcriptional regulator  40.38 
 
 		 126 aa  90.1  9e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0423531  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6779  transcriptional regulator, HxlR family  38.76 
 
 		 132 aa  89.7  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.636824 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2650  transcriptional regulator, HxlR family  40.18 
 
 		 130 aa  90.1  1e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.116917  normal  0.771114 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1661  HxlR family transcriptional regulator  46.51 
 
 		 114 aa  89.7  1e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000438417  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4845  HxlR family transcriptional regulator  43.27 
 
 		 108 aa  89.7  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.686423  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5625  HxlR family transcriptional regulator  40 
 
 		 126 aa  89.7  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.229377  normal  0.277837 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4691  putative transcriptional regulator  40.38 
 
 		 126 aa  89.4  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2619  putative transcriptional regulator  43.12 
 
 		 164 aa  89.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.329844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1607  transcriptional regulator, HxlR family  42.55 
 
 		 113 aa  90.1  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000104346  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3815  transcriptional regulator, HxlR family  45.19 
 
 		 125 aa  89.7  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.266885  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1227  putative transcriptional regulator  41.51 
 
 		 119 aa  89.7  1e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.916879  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4646  transcriptional regulator, HxlR family  43 
 
 		 136 aa  89  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.103859  normal  0.28367 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0324  transcriptional regulator, HxlR family  44.9 
 
 		 130 aa  89.4  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.948926  normal  0.0884753 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4262  transcriptional regulator, HxlR family  40.37 
 
 		 144 aa  88.6  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.388354  normal  0.116604 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1179  HxlR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 137 aa  89.4  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.795487 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6178  transcriptional regulator, HxlR family  41.44 
 
 		 135 aa  88.2  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0462511 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4812  HxlR family transcriptional regulator  42.2 
 
 		 180 aa  88.2  4e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.14161 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2876  transcriptional regulator, HxlR family  46.15 
 
 		 133 aa  87.8  5e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>