More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0271 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_0271  transcriptional regulator, HxlR family  100 
 
 
140 aa  282  1.0000000000000001e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1607  transcriptional regulator, HxlR family  43.52 
 
 
113 aa  105  3e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000104346  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1015  HxlR family transcriptional regulator  46.55 
 
 
144 aa  103  9e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0428333  normal  0.95229 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3513  HxlR family transcriptional regulator  49.54 
 
 
125 aa  102  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000897234  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0802  transcriptional regulator, HxlR family  52.69 
 
 
106 aa  99.4  1e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0464121  normal  0.73342 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5865  HxlR family transcriptional regulator  43.48 
 
 
149 aa  99  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.480533  normal  0.03101 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4812  HxlR family transcriptional regulator  46.43 
 
 
180 aa  98.6  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.14161 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1661  HxlR family transcriptional regulator  46.81 
 
 
114 aa  98.6  3e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000438417  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0933  transcriptional regulator, HxlR family  44.44 
 
 
108 aa  97.4  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.973186 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4104  transcriptional regulator, HxlR family  48.91 
 
 
119 aa  97.4  6e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.533713  normal  0.821475 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3438  hypothetical protein  46.23 
 
 
107 aa  97.1  8e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.166485  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1819  hypothetical protein  46.23 
 
 
107 aa  96.7  8e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.100816 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2974  transcriptional regulator, HxlR family  45.26 
 
 
160 aa  96.7  9e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.607542 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9338  transcriptional regulator, HxlR family  43.64 
 
 
132 aa  96.3  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.785405 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3455  hypothetical protein  46.23 
 
 
107 aa  96.7  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.365377  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3428  hypothetical protein  45.28 
 
 
107 aa  96.7  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.157748  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1143  MarR family transcriptional regulator  42.39 
 
 
120 aa  96.3  1e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.553828  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1352  putative transcriptional regulator  42.27 
 
 
155 aa  95.5  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000297864  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1731  putative transcriptional regulator  42.74 
 
 
144 aa  95.9  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3119  HxlR family transcriptional regulator  48.91 
 
 
107 aa  95.5  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0144533  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3327  transcriptional regulator, HxlR family  40.37 
 
 
126 aa  95.9  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000038683 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3223  hypothetical protein  43.93 
 
 
107 aa  95.1  3e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.246071  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3200  MarR family transcriptional regulator  43.93 
 
 
107 aa  95.1  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0287258  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3357  hypothetical protein  41.82 
 
 
129 aa  94.7  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221434  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3441  hypothetical protein  43.93 
 
 
107 aa  95.1  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2221  transcriptional regulator, HxlR family  35.34 
 
 
152 aa  94.4  5e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.405222  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3129  MarR family transcriptional regulator  48.91 
 
 
115 aa  94.4  5e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.576671  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1488  transcriptional regulator, HxlR family  45.92 
 
 
109 aa  94.4  5e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.696737 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01970  transcriptional regulator  48.91 
 
 
140 aa  94  6e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0808  HxlR family transcriptional regulator  46.74 
 
 
159 aa  94  6e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.40472  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2650  transcriptional regulator, HxlR family  44.86 
 
 
130 aa  94  6e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.116917  normal  0.771114 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1088  MarR family transcriptional regulator  45.45 
 
 
116 aa  94  7e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3133  hypothetical protein  42.86 
 
 
126 aa  93.2  9e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.441436  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1899  hypothetical protein  42.86 
 
 
126 aa  93.2  9e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3120  transcriptional regulator  42.86 
 
 
126 aa  93.6  9e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.118143  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3027  transcriptional regulator  42.86 
 
 
126 aa  93.6  9e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.710275  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3379  hypothetical protein  42.86 
 
 
126 aa  93.2  9e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3059  HxlR family transcriptional regulator  42.45 
 
 
124 aa  93.2  9e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23135  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3354  hypothetical protein  42.86 
 
 
126 aa  93.2  9e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4262  transcriptional regulator, HxlR family  44.86 
 
 
144 aa  93.2  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.388354  normal  0.116604 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4102  transcriptional regulator, HxlR family  42.11 
 
 
118 aa  92.8  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00149147 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3564  HxlR family transcriptional regulator  46.74 
 
 
140 aa  92.8  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2737  transcriptional regulator, HxlR family  40.18 
 
 
121 aa  92.8  1e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0013  HxlR family transcriptional regulator  43.48 
 
 
126 aa  92.4  2e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3206  transcriptional regulator, HxlR family  40.68 
 
 
139 aa  92.4  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7868  HxlR family transcriptional regulator  43.64 
 
 
121 aa  92  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1776  putative transcriptional regulator  45.3 
 
 
134 aa  91.7  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3332  hypothetical protein  42.86 
 
 
126 aa  91.7  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0287  transcriptional regulator, HxlR family  46.73 
 
 
129 aa  91.3  4e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1377  MarR family transcriptional regulator  40.86 
 
 
122 aa  91.3  4e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1292  transcriptional regulator, HxlR family  43.01 
 
 
129 aa  91.3  4e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.109042  normal  0.938313 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0703  transcriptional regulator, HxlR family  45.36 
 
 
134 aa  91.3  4e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.383651  normal  0.144185 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1063  transcriptional regulator  41.41 
 
 
110 aa  90.9  5e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0576989  hitchhiker  0.000107529 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1971  HxlR family transcriptional regulator  39.32 
 
 
134 aa  90.9  6e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5625  HxlR family transcriptional regulator  44.72 
 
 
126 aa  90.1  9e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.229377  normal  0.277837 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3293  putative transcriptional regulator  45.65 
 
 
119 aa  90.1  9e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0763403 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1918  HxlR family transcriptional regulator  50 
 
 
125 aa  90.1  9e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.53463  hitchhiker  0.00000467082 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0891  hypothetical protein  40.4 
 
 
112 aa  89.4  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0373  putative transcriptional regulator  45.26 
 
 
123 aa  89.7  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0376009  normal  0.449269 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4680  transcriptional regulator, HxlR family  47.31 
 
 
130 aa  89.4  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0170058  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4151  HxlR family transcriptional regulator  43.36 
 
 
134 aa  89.4  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4732  transcriptional regulator, HxlR family  44.14 
 
 
128 aa  89  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1166  HxlR family transcriptional regulator  46.74 
 
 
131 aa  88.6  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.329867 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1490  HxlR family transcriptional regulator  41.8 
 
 
131 aa  89  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.263711 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3585  transcriptional regulator, HxlR family  39.8 
 
 
108 aa  89  2e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000738633  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5429  transcriptional regulator, HxlR family  40 
 
 
149 aa  89  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4817  HxlR family transcriptional regulator  40.83 
 
 
133 aa  88.6  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.85164  normal  0.139481 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4437  hypothetical protein  41.24 
 
 
124 aa  88.6  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000169623  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0799  hypothetical protein  41.24 
 
 
124 aa  88.6  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000413922  hitchhiker  1.6907100000000001e-18 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0748  HxlR family transcriptional regulator  40.4 
 
 
112 aa  88.6  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1317  HxlR family transcriptional regulator  43.16 
 
 
122 aa  89  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000449926  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4443  transcriptional regulator, MarR family  40.4 
 
 
112 aa  89  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.937867  normal  0.431407 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0615  transcriptional regulator protein-like protein  41.53 
 
 
168 aa  88.2  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0929  hypothetical protein  40.4 
 
 
112 aa  88.6  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4399  hypothetical protein  41.24 
 
 
124 aa  88.6  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0796  hypothetical protein  40.4 
 
 
112 aa  88.6  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.580799  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4217  hypothetical protein  41.24 
 
 
124 aa  88.6  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0313  HxlR family transcriptional regulator  45.45 
 
 
121 aa  88.2  3e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.250935  normal  0.451658 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3895  HxlR family transcriptional regulator  38.38 
 
 
120 aa  88.6  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000755308  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4055  transcriptional regulator  41.24 
 
 
124 aa  88.6  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.396916  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4065  transcriptional regulator  41.24 
 
 
124 aa  88.6  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.966493  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0836  hypothetical protein  40.4 
 
 
112 aa  88.6  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.126369  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4543  hypothetical protein  41.24 
 
 
124 aa  88.6  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.719807  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4340  hypothetical protein  41.24 
 
 
124 aa  88.6  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.43956e-24 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1541  putative transcriptional regulator  42.39 
 
 
121 aa  88.6  3e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000091847  normal  0.207791 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1227  putative transcriptional regulator  46 
 
 
119 aa  88.2  3e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.916879  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2245  transcriptional regulator, HxlR family  38.38 
 
 
128 aa  88.2  3e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2124  HxlR family transcriptional regulator  41.94 
 
 
136 aa  88.6  3e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.235971  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4451  hypothetical protein  41.24 
 
 
124 aa  88.6  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000232165  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2400  HxlR family transcriptional regulator  44.35 
 
 
137 aa  88.2  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.956461  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0745  MarR family transcriptional regulator  40.4 
 
 
112 aa  88.2  4e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000483022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0740  MarR family transcriptional regulator  40.4 
 
 
112 aa  88.2  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1489  transcriptional regulator, HxlR family  40.52 
 
 
130 aa  87.8  4e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.657133  normal  0.735424 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4332  transcriptional regulator, HxlR family  39.47 
 
 
121 aa  87.8  4e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.101336 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0931  hypothetical protein  40.4 
 
 
112 aa  88.2  4e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.480340000000001e-32 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4233  transcriptional regulator, HxlR family  40.52 
 
 
128 aa  87.8  5e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1179  HxlR family transcriptional regulator  44.44 
 
 
137 aa  87.4  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.795487 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5256  HxlR family transcriptional regulator  44.14 
 
 
135 aa  87.8  5e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.86161  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0290  transcriptional regulator protein-like protein  41.8 
 
 
154 aa  87.4  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1109  HxlR family transcriptional regulator  39.05 
 
 
116 aa  87.4  6e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.116925  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>