More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1166 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_1166  HxlR family transcriptional regulator  100 
 
 
131 aa  264  2.9999999999999995e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.329867 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3895  HxlR family transcriptional regulator  55.79 
 
 
120 aa  115  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000755308  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0013  HxlR family transcriptional regulator  50 
 
 
126 aa  114  3.9999999999999997e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0933  transcriptional regulator, HxlR family  50.52 
 
 
108 aa  111  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.973186 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1541  putative transcriptional regulator  50.51 
 
 
121 aa  110  8.000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000091847  normal  0.207791 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1377  MarR family transcriptional regulator  51.55 
 
 
122 aa  110  9e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1698  putative transcriptional regulator  50 
 
 
113 aa  108  2.0000000000000002e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.171254  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1292  transcriptional regulator, HxlR family  46.39 
 
 
129 aa  106  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.109042  normal  0.938313 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4104  transcriptional regulator, HxlR family  52.69 
 
 
119 aa  106  1e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.533713  normal  0.821475 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3208  hypothetical protein  48.11 
 
 
108 aa  105  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3186  MarR family transcriptional regulator  48.11 
 
 
108 aa  105  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3461  hypothetical protein  48.11 
 
 
108 aa  105  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.692347  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3427  hypothetical protein  47.17 
 
 
108 aa  105  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1227  putative transcriptional regulator  48.45 
 
 
119 aa  105  2e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.916879  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3119  HxlR family transcriptional regulator  43.56 
 
 
107 aa  104  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0144533  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3428  hypothetical protein  43.56 
 
 
107 aa  104  3e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.157748  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3114  MarR family transcriptional regulator  46.23 
 
 
108 aa  104  4e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.448387  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1135  transcriptional regulator, HxlR family  44 
 
 
111 aa  104  4e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9284  transcriptional regulator (MarR family protein)  44.86 
 
 
122 aa  104  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3439  hypothetical protein  46.23 
 
 
108 aa  103  6e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3455  hypothetical protein  42.57 
 
 
107 aa  103  8e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.365377  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1607  transcriptional regulator, HxlR family  40.78 
 
 
113 aa  103  9e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000104346  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5989  transcriptional regulator, HxlR family  48.42 
 
 
133 aa  102  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3129  MarR family transcriptional regulator  42.57 
 
 
115 aa  103  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.576671  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0252  transcriptional regulator, HxlR family  43 
 
 
118 aa  102  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1097  transcriptional regulator, HxlR family  50 
 
 
134 aa  102  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.199182  normal  0.222478 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1352  putative transcriptional regulator  47.37 
 
 
155 aa  102  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000297864  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5039  putative transcriptional regulatory protein  43.24 
 
 
125 aa  102  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1819  hypothetical protein  41.58 
 
 
107 aa  102  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.100816 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3438  hypothetical protein  41.58 
 
 
107 aa  102  3e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.166485  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3203  hypothetical protein  41.12 
 
 
114 aa  101  3e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.135519  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4933  hypothetical protein  40.74 
 
 
114 aa  101  3e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4774  transciprtional regulator  40.74 
 
 
114 aa  101  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3110  MarR family transcriptional regulator  41.12 
 
 
114 aa  101  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4794  transciprtional regulator  40.74 
 
 
114 aa  101  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1063  transcriptional regulator  45.45 
 
 
110 aa  102  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0576989  hitchhiker  0.000107529 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3059  HxlR family transcriptional regulator  46.39 
 
 
124 aa  101  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23135  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3457  hypothetical protein  41.12 
 
 
114 aa  101  3e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5311  hypothetical protein  40.74 
 
 
114 aa  101  3e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3484  MarR family transcriptional regulator  44.55 
 
 
109 aa  101  3e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.816245  normal  0.77191 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6381  HxlR family transcriptional regulator  45.19 
 
 
139 aa  101  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.06337  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5176  hypothetical protein  40.74 
 
 
114 aa  101  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0230101 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5225  hypothetical protein  40.74 
 
 
114 aa  101  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1661  HxlR family transcriptional regulator  40.78 
 
 
114 aa  101  4e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000438417  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3209  hypothetical protein  40.19 
 
 
113 aa  101  4e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3115  MarR family transcriptional regulator  40.19 
 
 
114 aa  101  4e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.451528  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3435  hypothetical protein  41.12 
 
 
114 aa  101  4e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3462  hypothetical protein  40.19 
 
 
113 aa  101  4e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.457433  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3440  hypothetical protein  40.19 
 
 
113 aa  101  4e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1834  hypothetical protein  40.19 
 
 
114 aa  101  4e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.118626  normal  0.386956 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3332  hypothetical protein  45.36 
 
 
126 aa  100  5e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3187  MarR family transcriptional regulator  40.19 
 
 
114 aa  100  6e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2474  transcriptional regulator, HxlR family  47.52 
 
 
115 aa  100  6e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3428  hypothetical protein  40.19 
 
 
114 aa  100  6e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1437  transcriptional regulator family protein  41.46 
 
 
141 aa  100  7e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4895  HxlR family transcriptional regulator  41.12 
 
 
115 aa  100  8e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0948  transcriptional regulator, HxlR family  48.42 
 
 
151 aa  99.4  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5208  hypothetical protein  40.57 
 
 
114 aa  99.4  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3133  hypothetical protein  44.33 
 
 
126 aa  99.8  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.441436  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3120  transcriptional regulator  44.33 
 
 
126 aa  99.8  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.118143  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3027  transcriptional regulator  44.33 
 
 
126 aa  99.8  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.710275  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3379  hypothetical protein  44.33 
 
 
126 aa  99.8  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1899  hypothetical protein  44.33 
 
 
126 aa  99.8  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3354  hypothetical protein  44.33 
 
 
126 aa  99.8  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3357  hypothetical protein  44.33 
 
 
129 aa  99.8  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221434  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3163  putative transcriptional regulator  47.42 
 
 
144 aa  99.4  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1769  transcriptional regulator superfamily  48.45 
 
 
112 aa  99.8  1e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000531887  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2005  transcriptional regulator family protein  47.42 
 
 
144 aa  99.4  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3179  transcriptional regulator family protein  47.42 
 
 
206 aa  98.6  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0560718  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3418  putative transcriptional regulator  46.94 
 
 
132 aa  99  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.190487 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3157  helix-turn-helix, HxlR type  45.54 
 
 
130 aa  99  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.38389  normal  0.468508 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2738  transcriptional regulator family protein  47.42 
 
 
144 aa  99.4  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.115101  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3126  putative transcriptional regulator  47.42 
 
 
144 aa  99.4  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1870  transcriptional regulator family protein  47.42 
 
 
144 aa  99.4  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.284748  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5212  hypothetical protein  40.57 
 
 
114 aa  98.6  3e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0036  hypothetical protein  40.57 
 
 
114 aa  98.2  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000638982 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0802  transcriptional regulator, HxlR family  42.27 
 
 
106 aa  98.2  3e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0464121  normal  0.73342 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0905  transcriptional regulator family protein  47.42 
 
 
220 aa  98.6  3e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1143  MarR family transcriptional regulator  37.76 
 
 
120 aa  98.6  3e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.553828  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3223  hypothetical protein  41.58 
 
 
107 aa  97.8  4e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.246071  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3200  MarR family transcriptional regulator  41.58 
 
 
107 aa  97.8  4e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0287258  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3441  hypothetical protein  41.58 
 
 
107 aa  97.8  4e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2802  transcriptional regulator, HxlR family  48.35 
 
 
127 aa  97.1  6e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3638  transcriptional regulator, HxlR family  45.45 
 
 
129 aa  96.7  9e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.386135  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4332  transcriptional regulator, HxlR family  46.94 
 
 
121 aa  96.7  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.101336 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2370  putative transcriptional regulator  45.74 
 
 
121 aa  95.1  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.132848  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5072  transcriptional regulator, HxlR family  42.72 
 
 
117 aa  94.7  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.550945 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4243  transcriptional regulator, HxlR family  46 
 
 
105 aa  95.1  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.333534  normal  0.800382 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2693  putative transcriptional regulator  46.81 
 
 
235 aa  95.1  3e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.863177 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2087  transcriptional regulator  46.81 
 
 
116 aa  94.7  3e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0851  transcriptional regulator, HxlR family  55.91 
 
 
116 aa  94.7  4e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.973222 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5668  transcriptional regulator, HxlR family  40.74 
 
 
119 aa  94.7  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.433337  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3785  transcriptional regulator, HxlR family  46.88 
 
 
118 aa  94.4  4e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.139955  normal  0.719008 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0210  hypothetical protein  44.92 
 
 
131 aa  94  6e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.453071 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0456  transcriptional regulator, HxlR family  46.32 
 
 
149 aa  94  6e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.208849  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1489  transcriptional regulator, HxlR family  41.35 
 
 
130 aa  94  6e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.657133  normal  0.735424 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4102  transcriptional regulator, HxlR family  37.62 
 
 
118 aa  94  7e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00149147 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4746  HxlR family transcriptional regulator  43.62 
 
 
116 aa  93.6  7e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0703  transcriptional regulator, HxlR family  46.32 
 
 
134 aa  94  7e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.383651  normal  0.144185 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2973  transcriptional regulator, HxlR family  44.66 
 
 
116 aa  93.2  9e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.116721  normal  0.457372 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>