More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_1769 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_1769  transcriptional regulator superfamily  100 
 
 
112 aa  228  3e-59  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000531887  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0703  transcriptional regulator, HxlR family  48.48 
 
 
134 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.383651  normal  0.144185 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1819  hypothetical protein  48.48 
 
 
107 aa  108  3e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.100816 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3119  HxlR family transcriptional regulator  48.48 
 
 
107 aa  106  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0144533  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3438  hypothetical protein  47.47 
 
 
107 aa  105  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.166485  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3455  hypothetical protein  47.47 
 
 
107 aa  105  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.365377  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1352  putative transcriptional regulator  50.51 
 
 
155 aa  105  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000297864  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1135  transcriptional regulator, HxlR family  50 
 
 
111 aa  105  2e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3129  MarR family transcriptional regulator  47.47 
 
 
115 aa  104  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.576671  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3428  hypothetical protein  48.48 
 
 
107 aa  105  3e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.157748  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3223  hypothetical protein  49.49 
 
 
107 aa  104  5e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.246071  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3200  MarR family transcriptional regulator  49.49 
 
 
107 aa  104  5e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0287258  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3441  hypothetical protein  49.49 
 
 
107 aa  104  5e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02250  predicted transcriptional regulator  51.06 
 
 
110 aa  100  5e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1166  HxlR family transcriptional regulator  48.45 
 
 
131 aa  99.8  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.329867 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01970  transcriptional regulator  49.48 
 
 
140 aa  98.2  3e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4287  transcriptional regulator, HxlR family  46 
 
 
119 aa  97.8  4e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.332291  normal  0.235494 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0808  HxlR family transcriptional regulator  51.55 
 
 
159 aa  97.8  4e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.40472  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0178  hypothetical protein  46.88 
 
 
114 aa  97.4  6e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2974  transcriptional regulator, HxlR family  47.92 
 
 
160 aa  96.7  9e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.607542 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1097  transcriptional regulator, HxlR family  45.19 
 
 
134 aa  96.7  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.199182  normal  0.222478 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0341  transcriptional regulator, MarR family  47.42 
 
 
109 aa  95.9  2e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.45733  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0998  HxlR family transcriptional regulator  49.49 
 
 
106 aa  95.5  2e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00396575 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1063  transcriptional regulator  47.06 
 
 
110 aa  94.7  4e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0576989  hitchhiker  0.000107529 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0862  transcriptional regulator, HxlR family  41.9 
 
 
119 aa  94.7  4e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273669  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0948  transcriptional regulator, HxlR family  44.23 
 
 
151 aa  94.4  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3895  HxlR family transcriptional regulator  45.45 
 
 
120 aa  94  6e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000755308  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3585  transcriptional regulator, HxlR family  42.86 
 
 
108 aa  94  6e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000738633  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4933  hypothetical protein  53.26 
 
 
114 aa  93.2  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4774  transciprtional regulator  53.26 
 
 
114 aa  93.2  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4794  transciprtional regulator  53.26 
 
 
114 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5176  hypothetical protein  53.26 
 
 
114 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0230101 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5311  hypothetical protein  53.26 
 
 
114 aa  93.2  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6381  HxlR family transcriptional regulator  49.53 
 
 
139 aa  93.2  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.06337  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5225  hypothetical protein  53.26 
 
 
114 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9284  transcriptional regulator (MarR family protein)  48.42 
 
 
122 aa  92  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0933  transcriptional regulator, HxlR family  47 
 
 
108 aa  92.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.973186 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0456  transcriptional regulator, HxlR family  45.45 
 
 
149 aa  92.8  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.208849  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1227  putative transcriptional regulator  44 
 
 
119 aa  92  2e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.916879  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0373  putative transcriptional regulator  45.71 
 
 
123 aa  92.4  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0376009  normal  0.449269 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2120  transcriptional regulator, HxlR family  47.37 
 
 
111 aa  92.4  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000013994  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1109  HxlR family transcriptional regulator  45.1 
 
 
116 aa  92  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.116925  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0290  transcriptional regulator protein-like protein  44.21 
 
 
154 aa  91.7  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5208  hypothetical protein  53.26 
 
 
114 aa  91.3  4e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2737  transcriptional regulator, HxlR family  47.87 
 
 
121 aa  91.3  4e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1405  HxlR family transcriptional regulator  43.56 
 
 
105 aa  91.3  4e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1511  HxlR family transcriptional regulator  41.12 
 
 
119 aa  91.3  4e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.353103 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1564  HxlR family transcriptional regulator  46.32 
 
 
119 aa  90.9  5e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0663317  normal  0.0831873 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3110  MarR family transcriptional regulator  53.76 
 
 
114 aa  90.9  5e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0036  hypothetical protein  53.26 
 
 
114 aa  90.9  5e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000638982 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4895  HxlR family transcriptional regulator  53.26 
 
 
115 aa  90.9  5e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17890  predicted transcriptional regulator  42.72 
 
 
111 aa  90.9  6e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.382985 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3435  hypothetical protein  53.76 
 
 
114 aa  90.9  6e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2645  transcriptional regulator, HxlR family  45.83 
 
 
119 aa  90.5  6e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.512568  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5212  hypothetical protein  53.26 
 
 
114 aa  90.5  6e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1834  hypothetical protein  52.69 
 
 
114 aa  90.5  7e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.118626  normal  0.386956 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2370  putative transcriptional regulator  41.41 
 
 
121 aa  90.5  7e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.132848  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2490  transcriptional regulator  40 
 
 
120 aa  90.5  7e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0268874 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3564  HxlR family transcriptional regulator  44.44 
 
 
140 aa  90.1  8e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0013  HxlR family transcriptional regulator  45.1 
 
 
126 aa  90.1  9e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1352  transcriptional regulator, HxlR family  40.59 
 
 
112 aa  90.1  1e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000111257  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3203  hypothetical protein  52.69 
 
 
114 aa  89.7  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.135519  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0015  transcriptional regulator, HxlR family  45.28 
 
 
107 aa  89.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3457  hypothetical protein  52.69 
 
 
114 aa  89.7  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1698  putative transcriptional regulator  46.39 
 
 
113 aa  89.7  1e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.171254  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3293  putative transcriptional regulator  44 
 
 
119 aa  89.7  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0763403 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2693  putative transcriptional regulator  45.28 
 
 
235 aa  89.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.863177 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4104  transcriptional regulator, HxlR family  44.44 
 
 
119 aa  89.7  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.533713  normal  0.821475 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0802  transcriptional regulator, HxlR family  40.59 
 
 
106 aa  90.1  1e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0464121  normal  0.73342 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1489  transcriptional regulator, HxlR family  43.12 
 
 
130 aa  89.4  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.657133  normal  0.735424 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5072  transcriptional regulator, HxlR family  40.91 
 
 
117 aa  89  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.550945 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1437  transcriptional regulator family protein  46.85 
 
 
141 aa  89  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2224  transcriptional regulator, HxlR family  44.79 
 
 
124 aa  88.2  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.647927  normal  0.782754 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3428  hypothetical protein  48.94 
 
 
114 aa  88.2  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0738  transcriptional regulator, HxlR family  42.06 
 
 
124 aa  88.2  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.342617  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2595  transcriptional regulator  44.79 
 
 
124 aa  88.2  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3187  MarR family transcriptional regulator  48.94 
 
 
114 aa  88.2  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2703  transcriptional regulator, HxlR family  43.93 
 
 
118 aa  88.6  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3115  MarR family transcriptional regulator  48.94 
 
 
114 aa  88.2  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.451528  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0564  transcriptional regulator, HxlR family  38.95 
 
 
124 aa  88.6  3e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000666218  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1918  HxlR family transcriptional regulator  39.09 
 
 
125 aa  88.6  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.53463  hitchhiker  0.00000467082 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0684  transcriptional regulator, HxlR family  41.84 
 
 
121 aa  88.6  3e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1488  transcriptional regulator, HxlR family  40 
 
 
109 aa  88.2  3e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.696737 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3209  hypothetical protein  48.94 
 
 
113 aa  87.8  4e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5989  transcriptional regulator, HxlR family  45.83 
 
 
133 aa  88.2  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3462  hypothetical protein  48.94 
 
 
113 aa  87.8  4e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.457433  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3440  hypothetical protein  48.94 
 
 
113 aa  87.8  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3059  HxlR family transcriptional regulator  51.06 
 
 
124 aa  87.8  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23135  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2126  helix-turn-helix HxlR type  37.14 
 
 
129 aa  87.8  5e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.653298  normal  0.626696 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1541  putative transcriptional regulator  41.58 
 
 
121 aa  87.8  5e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000091847  normal  0.207791 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1607  transcriptional regulator, HxlR family  40.82 
 
 
113 aa  87.8  5e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000104346  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2005  transcriptional regulator family protein  49.5 
 
 
144 aa  87.4  6e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1088  MarR family transcriptional regulator  47.83 
 
 
116 aa  87.4  6e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4332  transcriptional regulator, HxlR family  46.81 
 
 
121 aa  87.4  6e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.101336 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2738  transcriptional regulator family protein  49.5 
 
 
144 aa  87.4  6e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.115101  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3126  putative transcriptional regulator  49.5 
 
 
144 aa  87.4  6e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3163  putative transcriptional regulator  49.5 
 
 
144 aa  87.4  6e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1870  transcriptional regulator family protein  49.5 
 
 
144 aa  87.4  6e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.284748  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0653  HxlR family transcriptional regulator  39.81 
 
 
133 aa  86.7  9e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.174756 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0518  transcriptional regulator, HxlR family  37.11 
 
 
127 aa  87  9e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>