More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0684 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_0684  transcriptional regulator, HxlR family  100 
 
 		 121 aa  252  1.0000000000000001e-66  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25590  predicted transcriptional regulator  63.87 
 
 		 129 aa  166  9e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.6055  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0456  transcriptional regulator, HxlR family  46.88 
 
 		 149 aa  100  1e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.208849  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1352  transcriptional regulator, HxlR family  50.54 
 
 		 112 aa  99  2e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000111257  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0802  transcriptional regulator, HxlR family  45.36 
 
 		 106 aa  97.1  8e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0464121  normal  0.73342 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0252  transcriptional regulator, HxlR family  46.6 
 
 		 118 aa  96.7  9e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0998  HxlR family transcriptional regulator  51.58 
 
 		 106 aa  96.7  1e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00396575 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0014  transcriptional regulator, HxlR family  46.81 
 
 		 121 aa  96.3  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000846639  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0703  transcriptional regulator, HxlR family  46.32 
 
 		 134 aa  96.3  1e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.383651  normal  0.144185 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1698  putative transcriptional regulator  47.31 
 
 		 113 aa  96.7  1e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.171254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1488  transcriptional regulator, HxlR family  44.33 
 
 		 109 aa  96.3  1e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.696737 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0862  transcriptional regulator, HxlR family  45.83 
 
 		 119 aa  95.5  2e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273669  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4287  transcriptional regulator, HxlR family  46.32 
 
 		 119 aa  95.5  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.332291  normal  0.235494 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25580  predicted transcriptional regulator  56.25 
 
 		 93 aa  95.1  3e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.358953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1352  putative transcriptional regulator  45.26 
 
 		 155 aa  94.7  4e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000297864  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0210  hypothetical protein  52.87 
 
 		 131 aa  94.4  5e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.453071 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1564  HxlR family transcriptional regulator  42.27 
 
 		 119 aa  94.4  5e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0663317  normal  0.0831873 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1081  HxlR family transcriptional regulator  43.56 
 
 		 125 aa  94.4  5e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.124143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1377  MarR family transcriptional regulator  48.45 
 
 		 122 aa  94  7e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3157  helix-turn-helix, HxlR type  50.54 
 
 		 130 aa  93.6  8e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.38389  normal  0.468508 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3325  transcriptional regulator, HxlR family  55.42 
 
 		 128 aa  93.6  9e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.196974  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3785  transcriptional regulator, HxlR family  43.3 
 
 		 118 aa  93.6  9e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.139955  normal  0.719008 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4243  transcriptional regulator, HxlR family  43 
 
 		 105 aa  93.2  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.333534  normal  0.800382 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3418  putative transcriptional regulator  50.54 
 
 		 132 aa  93.2  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.190487 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01970  transcriptional regulator  46.32 
 
 		 140 aa  92  2e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1405  HxlR family transcriptional regulator  42 
 
 		 105 aa  92.4  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4332  transcriptional regulator, HxlR family  45.83 
 
 		 121 aa  92  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.101336 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2595  transcriptional regulator  42.16 
 
 		 124 aa  91.7  3e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2224  transcriptional regulator, HxlR family  42.16 
 
 		 124 aa  91.7  3e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.647927  normal  0.782754 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1317  HxlR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 122 aa  91.7  3e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000449926  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3638  transcriptional regulator, HxlR family  47.47 
 
 		 129 aa  91.7  4e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.386135  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1489  transcriptional regulator, HxlR family  42.42 
 
 		 130 aa  91.3  4e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.657133  normal  0.735424 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0373  putative transcriptional regulator  46.88 
 
 		 123 aa  91.3  4e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0376009  normal  0.449269 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2974  transcriptional regulator, HxlR family  46.32 
 
 		 160 aa  90.9  5e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.607542 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1063  transcriptional regulator  43.3 
 
 		 110 aa  90.9  6e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0576989  hitchhiker  0.000107529 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0952  HxlR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 117 aa  90.5  7e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.473433  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0221  transcriptional regulator, HxlR family  48.42 
 
 		 106 aa  90.1  8e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012384  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4104  transcriptional regulator, HxlR family  42.71 
 
 		 119 aa  90.1  9e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.533713  normal  0.821475 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0933  transcriptional regulator, HxlR family  46.88 
 
 		 108 aa  89.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.973186 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0564  transcriptional regulator, HxlR family  37.27 
 
 		 124 aa  89.7  1e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000666218  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9284  transcriptional regulator (MarR family protein)  44.33 
 
 		 122 aa  89.4  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1166  HxlR family transcriptional regulator  45.36 
 
 		 131 aa  89.7  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329867 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2802  transcriptional regulator, HxlR family  44.57 
 
 		 127 aa  89  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2645  transcriptional regulator, HxlR family  44.33 
 
 		 119 aa  89  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.512568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0013  HxlR family transcriptional regulator  42.27 
 
 		 126 aa  88.6  2e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0653  HxlR family transcriptional regulator  42.27 
 
 		 133 aa  89  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.174756 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1769  transcriptional regulator superfamily  41.84 
 
 		 112 aa  88.6  3e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000531887  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3895  HxlR family transcriptional regulator  43 
 
 		 120 aa  88.2  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000755308  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1527  transcriptional regulator, HxlR family  44.57 
 
 		 125 aa  88.6  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0577409  normal  0.0923704 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0348  HxlR family transcriptional regulator  47.78 
 
 		 107 aa  88.2  3e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6402  HxlR family transcriptional regulator  47.78 
 
 		 121 aa  88.6  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.299726 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4680  transcriptional regulator, HxlR family  42.27 
 
 		 130 aa  87.8  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0170058  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4399  hypothetical protein  41.51 
 
 		 124 aa  88.2  4e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4217  hypothetical protein  41.51 
 
 		 124 aa  88.2  4e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4055  transcriptional regulator  41.51 
 
 		 124 aa  88.2  4e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.396916  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1661  HxlR family transcriptional regulator  44.21 
 
 		 114 aa  87.8  4e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000438417  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4065  transcriptional regulator  41.51 
 
 		 124 aa  88.2  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.966493  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4451  hypothetical protein  41.51 
 
 		 124 aa  88.2  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000232165  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1097  transcriptional regulator, HxlR family  44.33 
 
 		 134 aa  88.2  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.199182  normal  0.222478 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0290  transcriptional regulator protein-like protein  42.27 
 
 		 154 aa  87.8  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4543  hypothetical protein  41.51 
 
 		 124 aa  88.2  4e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.719807  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0518  transcriptional regulator, HxlR family  41.49 
 
 		 127 aa  88.2  4e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4340  hypothetical protein  41.51 
 
 		 124 aa  88.2  4e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.43956e-24 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0945  MarR family transcriptional regulator  43.69 
 
 		 119 aa  87.8  4e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5039  putative transcriptional regulatory protein  46.88 
 
 		 125 aa  87.4  5e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0891  hypothetical protein  40.43 
 
 		 112 aa  87.4  6e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2255  transcriptional regulator, HxlR family  44.09 
 
 		 159 aa  87.4  6e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.395748  normal  0.27377 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2452  helix-turn-helix HxlR type  46.59 
 
 		 128 aa  87  7e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4437  hypothetical protein  40.57 
 
 		 124 aa  87  7e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000169623  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0799  hypothetical protein  40.57 
 
 		 124 aa  87  7e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000413922  hitchhiker  1.6907100000000001e-18 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0929  hypothetical protein  39.36 
 
 		 112 aa  87  8e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0341  transcriptional regulator, MarR family  41.3 
 
 		 109 aa  87  8e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.45733  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0796  hypothetical protein  39.36 
 
 		 112 aa  86.7  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.580799  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3209  hypothetical protein  44.33 
 
 		 113 aa  86.7  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0745  MarR family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 112 aa  86.7  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000483022  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3440  hypothetical protein  44.33 
 
 		 113 aa  86.7  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0740  MarR family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 112 aa  86.7  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3115  MarR family transcriptional regulator  44.33 
 
 		 114 aa  86.7  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.451528  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0836  hypothetical protein  39.36 
 
 		 112 aa  86.7  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.126369  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3462  hypothetical protein  44.33 
 
 		 113 aa  86.7  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.457433  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0931  hypothetical protein  39.36 
 
 		 112 aa  86.7  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.480340000000001e-32 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3585  transcriptional regulator, HxlR family  41.41 
 
 		 108 aa  86.7  1e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000738633  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1876  HxlR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 122 aa  86.3  1e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0980  cinnamoyl ester hydrolase  44.19 
 
 		 108 aa  86.3  1e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.124883  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2737  transcriptional regulator, HxlR family  41.67 
 
 		 121 aa  86.7  1e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0748  HxlR family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 112 aa  86.3  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1109  HxlR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 116 aa  86.7  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.116925  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4443  transcriptional regulator, MarR family  39.36 
 
 		 112 aa  86.3  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.937867  normal  0.431407 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4169  HxlR family transcriptional regulator  40.57 
 
 		 124 aa  86.3  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000193508  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1717  transcriptional regulator, putative  42.7 
 
 		 115 aa  85.5  2e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0948  transcriptional regulator, HxlR family  43.3 
 
 		 151 aa  85.5  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3187  MarR family transcriptional regulator  43.3 
 
 		 114 aa  85.5  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4102  transcriptional regulator, HxlR family  41.84 
 
 		 118 aa  85.9  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149147 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3044  HxlR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 124 aa  85.9  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000040463  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3428  hypothetical protein  43.3 
 
 		 114 aa  85.5  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4370  HxlR family transcriptional regulator  44.57 
 
 		 117 aa  85.9  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3996  HxlR family transcriptional regulator  44.57 
 
 		 117 aa  85.9  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.208473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3564  HxlR family transcriptional regulator  43.62 
 
 		 140 aa  85.5  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3527  HxlR family transcriptional regulator  44.57 
 
 		 117 aa  85.9  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.502253 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5174  HxlR family transcriptional regulator  44.19 
 
 		 119 aa  85.9  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.187988  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>