More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0341 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_0341  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 109 aa  225  2e-58  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.45733  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1717  transcriptional regulator, putative  81.25 
 
 		 115 aa  167  4e-41  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1531  transcriptional regulator, putative  83.87 
 
 		 115 aa  166  7e-41  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0069  transcriptional regulator, HxlR family  69.39 
 
 		 110 aa  145  2.0000000000000003e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.700237  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1352  transcriptional regulator, HxlR family  57.84 
 
 		 112 aa  129  1.0000000000000001e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000111257  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02250  predicted transcriptional regulator  55 
 
 		 110 aa  127  4.0000000000000003e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1405  HxlR family transcriptional regulator  57.61 
 
 		 105 aa  120  8e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1088  MarR family transcriptional regulator  52.17 
 
 		 116 aa  105  3e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0178  hypothetical protein  45.92 
 
 		 114 aa  103  6e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2802  transcriptional regulator, HxlR family  49.47 
 
 		 127 aa  102  2e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1352  putative transcriptional regulator  48.98 
 
 		 155 aa  101  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000297864  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1317  HxlR family transcriptional regulator  48 
 
 		 122 aa  100  6e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000449926  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1488  transcriptional regulator, HxlR family  44 
 
 		 109 aa  99.8  1e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.696737 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2974  transcriptional regulator, HxlR family  45.16 
 
 		 160 aa  97.4  5e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.607542 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0280  HxlR family transcriptional regulator  44.66 
 
 		 116 aa  97.4  6e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.900551 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1769  transcriptional regulator superfamily  47.42 
 
 		 112 aa  95.9  1e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000531887  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2737  transcriptional regulator, HxlR family  40.82 
 
 		 121 aa  95.5  2e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0518  transcriptional regulator, HxlR family  43.43 
 
 		 127 aa  95.5  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0703  transcriptional regulator, HxlR family  44.33 
 
 		 134 aa  95.1  2e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.383651  normal  0.144185 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1292  transcriptional regulator, HxlR family  44.79 
 
 		 129 aa  95.5  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.109042  normal  0.938313 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3527  HxlR family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 117 aa  95.1  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.502253 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4370  HxlR family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 117 aa  95.1  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4102  transcriptional regulator, HxlR family  43.43 
 
 		 118 aa  95.1  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149147 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0653  HxlR family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 133 aa  95.1  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.174756 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3996  HxlR family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 117 aa  95.1  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.208473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6402  HxlR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 121 aa  94.7  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.299726 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2476  HxlR family transcriptional regulator  45.54 
 
 		 127 aa  94  5e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0808  HxlR family transcriptional regulator  44.57 
 
 		 159 aa  93.6  8e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.40472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1564  HxlR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 119 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0663317  normal  0.0831873 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0952  HxlR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 117 aa  92  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.473433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3638  transcriptional regulator, HxlR family  43 
 
 		 129 aa  92.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.386135  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1109  HxlR family transcriptional regulator  43.62 
 
 		 116 aa  92.4  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.116925  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0456  transcriptional regulator, HxlR family  46.39 
 
 		 149 aa  92.4  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.208849  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0862  transcriptional regulator, HxlR family  43.3 
 
 		 119 aa  91.7  3e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273669  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0013  HxlR family transcriptional regulator  46.24 
 
 		 126 aa  92  3e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5264  transcriptional regulator, HxlR family  40.59 
 
 		 130 aa  91.3  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000676248 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0639  transcriptional regulator, HxlR family  42.55 
 
 		 124 aa  90.1  9e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.601638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1377  MarR family transcriptional regulator  46.32 
 
 		 122 aa  90.1  9e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2645  transcriptional regulator, HxlR family  45.45 
 
 		 119 aa  89.7  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.512568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1607  transcriptional regulator, HxlR family  43.81 
 
 		 113 aa  90.1  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000104346  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3442  transcriptional regulator, HxlR family  46.74 
 
 		 119 aa  89  2e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000021737  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0168  helix-turn-helix HxlR type  39.78 
 
 		 118 aa  89  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01970  transcriptional regulator  41 
 
 		 140 aa  89  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0933  transcriptional regulator, HxlR family  45.26 
 
 		 108 aa  89  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.973186 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3585  transcriptional regulator, HxlR family  50 
 
 		 108 aa  89.4  2e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000738633  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0240  helix-turn-helix HxlR type  39.78 
 
 		 118 aa  89  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.566878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1884  transcriptional regulator  39.58 
 
 		 100 aa  89  2e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.189342  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3490  HxlR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 124 aa  89  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.462296 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1819  hypothetical protein  42.27 
 
 		 107 aa  88.6  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.100816 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0564  transcriptional regulator, HxlR family  40.86 
 
 		 124 aa  88.2  3e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000666218  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3458  transcriptional regulator, HxlR family  40.2 
 
 		 120 aa  88.2  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0218436 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1227  putative transcriptional regulator  42.86 
 
 		 119 aa  88.2  4e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.916879  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5174  HxlR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 119 aa  87.8  4e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.187988  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4243  transcriptional regulator, HxlR family  39.42 
 
 		 105 aa  87.4  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.333534  normal  0.800382 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1661  HxlR family transcriptional regulator  45.63 
 
 		 114 aa  87.8  5e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000438417  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2474  transcriptional regulator, HxlR family  45.16 
 
 		 115 aa  87.4  6e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1063  transcriptional regulator  46.46 
 
 		 110 aa  87.4  6e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0576989  hitchhiker  0.000107529 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6381  HxlR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 139 aa  87.4  6e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.06337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1489  transcriptional regulator, HxlR family  37.96 
 
 		 130 aa  87  7e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.657133  normal  0.735424 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5989  transcriptional regulator, HxlR family  44.44 
 
 		 133 aa  87  7e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1541  putative transcriptional regulator  39.81 
 
 		 121 aa  87  7e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000091847  normal  0.207791 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0684  transcriptional regulator, HxlR family  41.3 
 
 		 121 aa  87  8e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0802  transcriptional regulator, HxlR family  40.2 
 
 		 106 aa  87  8e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0464121  normal  0.73342 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2778  transcriptional regulator  46.15 
 
 		 112 aa  87  9e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000060346 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2126  helix-turn-helix HxlR type  40.62 
 
 		 129 aa  86.7  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.653298  normal  0.626696 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2547  transcriptional regulator, MarR family  46.15 
 
 		 112 aa  86.7  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3157  helix-turn-helix, HxlR type  40 
 
 		 130 aa  86.3  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.38389  normal  0.468508 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4746  HxlR family transcriptional regulator  41.9 
 
 		 116 aa  86.3  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0379  transcriptional regulator  46.74 
 
 		 115 aa  86.3  1e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0341948  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3119  HxlR family transcriptional regulator  42.71 
 
 		 107 aa  86.3  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0144533  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0348  HxlR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 107 aa  86.7  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4169  HxlR family transcriptional regulator  43.43 
 
 		 124 aa  85.9  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000193508  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1617  transcriptional regulator, HxlR family  44.44 
 
 		 117 aa  85.9  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.19292 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4104  transcriptional regulator, HxlR family  40.22 
 
 		 119 aa  85.5  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.533713  normal  0.821475 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09328  hypothetical protein  45.45 
 
 		 103 aa  85.9  2e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1097  transcriptional regulator, HxlR family  38.78 
 
 		 134 aa  85.5  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.199182  normal  0.222478 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3110  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 		 114 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3435  hypothetical protein  50 
 
 		 114 aa  85.5  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1097  transcriptional regulator, HxlR family  40.57 
 
 		 112 aa  85.5  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1834  hypothetical protein  50 
 
 		 114 aa  85.5  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.118626  normal  0.386956 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2255  transcriptional regulator, HxlR family  40 
 
 		 159 aa  85.5  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.395748  normal  0.27377 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4287  transcriptional regulator, HxlR family  40.86 
 
 		 119 aa  85.5  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.332291  normal  0.235494 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2387  HxlR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 115 aa  85.5  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.157796  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2245  transcriptional regulator, HxlR family  38.61 
 
 		 128 aa  85.5  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0946  HxlR family transcriptional regulator  48.35 
 
 		 117 aa  85.5  2e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.26449  normal  0.613112 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3044  HxlR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 124 aa  85.9  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000040463  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0328  transcriptional regulator, HxlR family  39.78 
 
 		 120 aa  85.5  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.122093  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0252  transcriptional regulator, HxlR family  41.41 
 
 		 118 aa  85.9  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3203  hypothetical protein  50 
 
 		 114 aa  85.1  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.135519  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4451  hypothetical protein  42.42 
 
 		 124 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000232165  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4340  hypothetical protein  42.42 
 
 		 124 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.43956e-24 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4065  transcriptional regulator  42.42 
 
 		 124 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.966493  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4543  hypothetical protein  42.42 
 
 		 124 aa  85.1  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.719807  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1698  putative transcriptional regulator  38.14 
 
 		 113 aa  85.1  3e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.171254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2693  putative transcriptional regulator  39.8 
 
 		 235 aa  85.1  3e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.863177 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0799  hypothetical protein  42.42 
 
 		 124 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000413922  hitchhiker  1.6907100000000001e-18 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2738  transcriptional regulator family protein  44.09 
 
 		 144 aa  85.1  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.115101  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3126  putative transcriptional regulator  44.09 
 
 		 144 aa  85.1  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3163  putative transcriptional regulator  44.09 
 
 		 144 aa  85.1  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1870  transcriptional regulator family protein  44.09 
 
 		 144 aa  85.1  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.284748  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>