More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5264 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5264  transcriptional regulator, HxlR family  100 
 
 		 130 aa  271  3e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000676248 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0808  HxlR family transcriptional regulator  56.52 
 
 		 159 aa  114  6e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.40472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0703  transcriptional regulator, HxlR family  44.8 
 
 		 134 aa  108  3e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.383651  normal  0.144185 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2974  transcriptional regulator, HxlR family  52.17 
 
 		 160 aa  108  3e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.607542 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2245  transcriptional regulator, HxlR family  46.08 
 
 		 128 aa  107  5e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0013  HxlR family transcriptional regulator  47.57 
 
 		 126 aa  104  4e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1109  HxlR family transcriptional regulator  42.73 
 
 		 116 aa  104  4e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.116925  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1352  putative transcriptional regulator  51.09 
 
 		 155 aa  103  6e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000297864  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0456  transcriptional regulator, HxlR family  51.09 
 
 		 149 aa  103  6e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.208849  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4332  transcriptional regulator, HxlR family  47.47 
 
 		 121 aa  103  7e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.101336 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2737  transcriptional regulator, HxlR family  43.93 
 
 		 121 aa  103  8e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3638  transcriptional regulator, HxlR family  49 
 
 		 129 aa  102  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.386135  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3564  HxlR family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 140 aa  103  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4287  transcriptional regulator, HxlR family  52.17 
 
 		 119 aa  102  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.332291  normal  0.235494 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3157  helix-turn-helix, HxlR type  45.95 
 
 		 130 aa  101  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.38389  normal  0.468508 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3293  putative transcriptional regulator  46.88 
 
 		 119 aa  100  6e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0763403 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3418  putative transcriptional regulator  49.02 
 
 		 132 aa  100  6e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.190487 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01970  transcriptional regulator  52.69 
 
 		 140 aa  100  7e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1564  HxlR family transcriptional regulator  49.46 
 
 		 119 aa  98.6  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0663317  normal  0.0831873 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2802  transcriptional regulator, HxlR family  46.88 
 
 		 127 aa  98.2  3e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0653  HxlR family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 133 aa  98.6  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.174756 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0014  transcriptional regulator, HxlR family  49 
 
 		 121 aa  98.2  3e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000846639  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0178  hypothetical protein  45.83 
 
 		 114 aa  97.4  6e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4104  transcriptional regulator, HxlR family  45.36 
 
 		 119 aa  97.1  8e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.533713  normal  0.821475 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1377  MarR family transcriptional regulator  47.52 
 
 		 122 aa  96.7  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1088  MarR family transcriptional regulator  48.91 
 
 		 116 aa  96.3  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5039  putative transcriptional regulatory protein  51.58 
 
 		 125 aa  96.3  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1063  transcriptional regulator  44.55 
 
 		 110 aa  94.7  4e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0576989  hitchhiker  0.000107529 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1097  transcriptional regulator, HxlR family  48 
 
 		 134 aa  94  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.199182  normal  0.222478 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1488  transcriptional regulator, HxlR family  36.11 
 
 		 109 aa  93.6  7e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.696737 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0952  HxlR family transcriptional regulator  46.32 
 
 		 117 aa  93.6  8e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.473433  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3133  hypothetical protein  46.94 
 
 		 126 aa  92.8  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.441436  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3379  hypothetical protein  46.94 
 
 		 126 aa  92.8  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0373  putative transcriptional regulator  45.1 
 
 		 123 aa  93.2  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0376009  normal  0.449269 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3354  hypothetical protein  46.94 
 
 		 126 aa  92.8  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3120  transcriptional regulator  46.94 
 
 		 126 aa  92.8  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.118143  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3027  transcriptional regulator  46.94 
 
 		 126 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.710275  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2476  HxlR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 127 aa  92.8  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3332  hypothetical protein  46.94 
 
 		 126 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0933  transcriptional regulator, HxlR family  47.83 
 
 		 108 aa  92.8  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.973186 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1899  hypothetical protein  46.94 
 
 		 126 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3357  hypothetical protein  46.94 
 
 		 129 aa  92.8  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221434  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0290  transcriptional regulator protein-like protein  48.96 
 
 		 154 aa  91.7  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0948  transcriptional regulator, HxlR family  46 
 
 		 151 aa  91.7  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0341  transcriptional regulator, MarR family  40.59 
 
 		 109 aa  91.3  4e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.45733  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5072  transcriptional regulator, HxlR family  44.66 
 
 		 117 aa  91.3  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.550945 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3059  HxlR family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 124 aa  90.9  5e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23135  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1541  putative transcriptional regulator  39.81 
 
 		 121 aa  90.9  5e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000091847  normal  0.207791 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2255  transcriptional regulator, HxlR family  44.33 
 
 		 159 aa  90.9  5e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.395748  normal  0.27377 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2973  transcriptional regulator, HxlR family  44.79 
 
 		 116 aa  90.5  6e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.116721  normal  0.457372 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4102  transcriptional regulator, HxlR family  43.16 
 
 		 118 aa  90.5  7e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149147 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4933  hypothetical protein  47.96 
 
 		 114 aa  89.7  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1684  transcriptional regulator, HxlR family  43.43 
 
 		 119 aa  89.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4774  transciprtional regulator  47.96 
 
 		 114 aa  89.7  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4794  transciprtional regulator  47.96 
 
 		 114 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5311  hypothetical protein  47.96 
 
 		 114 aa  89.7  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3785  transcriptional regulator, HxlR family  45.63 
 
 		 118 aa  89.7  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.139955  normal  0.719008 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4895  HxlR family transcriptional regulator  44.09 
 
 		 115 aa  89.7  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5176  hypothetical protein  47.96 
 
 		 114 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0230101 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1702  transcriptional regulator, HxlR family  43.43 
 
 		 115 aa  89.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.371682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1292  transcriptional regulator, HxlR family  44.57 
 
 		 129 aa  89.4  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.109042  normal  0.938313 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0851  transcriptional regulator, HxlR family  44.55 
 
 		 116 aa  89.7  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.973222 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25580  predicted transcriptional regulator  45.98 
 
 		 93 aa  89.7  1e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.358953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5225  hypothetical protein  47.96 
 
 		 114 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3203  hypothetical protein  48.96 
 
 		 114 aa  89  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.135519  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3119  HxlR family transcriptional regulator  43.56 
 
 		 107 aa  89.4  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0144533  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3457  hypothetical protein  48.96 
 
 		 114 aa  89  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2595  transcriptional regulator  43.24 
 
 		 124 aa  89  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2224  transcriptional regulator, HxlR family  43.24 
 
 		 124 aa  89  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.647927  normal  0.782754 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3490  HxlR family transcriptional regulator  44.66 
 
 		 124 aa  89  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.462296 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3327  transcriptional regulator, HxlR family  42.48 
 
 		 126 aa  89  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000038683 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4237  transcriptional regulator, HxlR family  37.7 
 
 		 125 aa  89  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.940949 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3438  hypothetical protein  44.44 
 
 		 107 aa  88.6  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.166485  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1717  transcriptional regulator, putative  42 
 
 		 115 aa  88.6  3e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0564  transcriptional regulator, HxlR family  31.82 
 
 		 124 aa  88.2  3e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000666218  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1819  hypothetical protein  44.44 
 
 		 107 aa  88.2  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.100816 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0438  transcriptional regulator, HxlR family  38.68 
 
 		 128 aa  88.2  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0118461 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2645  transcriptional regulator, HxlR family  51.14 
 
 		 119 aa  88.6  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.512568  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1405  HxlR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 105 aa  88.2  3e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1489  transcriptional regulator, HxlR family  39 
 
 		 130 aa  88.2  4e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.657133  normal  0.735424 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3110  MarR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 114 aa  87.8  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3129  MarR family transcriptional regulator  43.56 
 
 		 115 aa  87.8  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.576671  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0210  hypothetical protein  47.06 
 
 		 131 aa  87.4  5e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.453071 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5208  hypothetical protein  45.45 
 
 		 114 aa  87.4  5e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3435  hypothetical protein  43.86 
 
 		 114 aa  87.8  5e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0036  hypothetical protein  45.45 
 
 		 114 aa  87.4  6e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000638982 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1834  hypothetical protein  42.98 
 
 		 114 aa  87.4  6e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.118626  normal  0.386956 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1531  transcriptional regulator, putative  44.32 
 
 		 115 aa  87.4  6e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3455  hypothetical protein  43.43 
 
 		 107 aa  87.4  6e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.365377  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1661  HxlR family transcriptional regulator  40.59 
 
 		 114 aa  87.4  7e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000438417  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3325  transcriptional regulator, HxlR family  50 
 
 		 128 aa  87  8e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.196974  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3428  hypothetical protein  42.86 
 
 		 107 aa  86.7  9e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.157748  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3223  hypothetical protein  44.57 
 
 		 107 aa  87  9e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.246071  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3200  MarR family transcriptional regulator  44.57 
 
 		 107 aa  87  9e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0287258  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3441  hypothetical protein  44.57 
 
 		 107 aa  87  9e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0862  transcriptional regulator, HxlR family  40.4 
 
 		 119 aa  85.5  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273669  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1607  transcriptional regulator, HxlR family  42.39 
 
 		 113 aa  85.5  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000104346  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1227  putative transcriptional regulator  47.96 
 
 		 119 aa  85.5  2e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.916879  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3439  hypothetical protein  43.88 
 
 		 108 aa  85.5  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0113  HxlR family transcriptional regulator  46.53 
 
 		 115 aa  85.5  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.742523  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>