More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4237 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4237  transcriptional regulator, HxlR family  100 
 
 		 125 aa  253  5e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.940949 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3848  HxlR family transcriptional regulator  77.36 
 
 		 121 aa  178  2.9999999999999997e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.774801  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0879  transcriptional regulator, HxlR family  72.57 
 
 		 119 aa  176  1e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.399174  normal  0.958869 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2633  transcriptional regulator, HxlR family  71.79 
 
 		 121 aa  172  9.999999999999999e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.895266  normal  0.749568 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0881  transcriptional regulator, HxlR family  71.68 
 
 		 122 aa  171  1.9999999999999998e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4263  transcriptional regulator, HxlR family  54.78 
 
 		 140 aa  122  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.042978  normal  0.290046 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5687  transcriptional regulator, HxlR family  51.38 
 
 		 124 aa  114  3.9999999999999997e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.643264 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2531  transcriptional regulator, HxlR family  46.85 
 
 		 123 aa  103  6e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5668  transcriptional regulator, HxlR family  48.57 
 
 		 119 aa  101  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.433337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4102  transcriptional regulator, HxlR family  45.83 
 
 		 118 aa  97.1  7e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149147 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5072  transcriptional regulator, HxlR family  45.19 
 
 		 117 aa  97.1  7e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.550945 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3638  transcriptional regulator, HxlR family  43.88 
 
 		 129 aa  96.3  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.386135  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0178  hypothetical protein  44.21 
 
 		 114 aa  94.4  5e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1097  transcriptional regulator, HxlR family  45.26 
 
 		 134 aa  94.4  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.199182  normal  0.222478 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2245  transcriptional regulator, HxlR family  42.06 
 
 		 128 aa  94  6e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1317  HxlR family transcriptional regulator  43.69 
 
 		 122 aa  93.6  9e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000449926  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0808  HxlR family transcriptional regulator  47.42 
 
 		 159 aa  92.4  2e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.40472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3895  HxlR family transcriptional regulator  43.3 
 
 		 120 aa  92  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000755308  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0933  transcriptional regulator, HxlR family  42 
 
 		 108 aa  90.9  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.973186 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1292  transcriptional regulator, HxlR family  41.05 
 
 		 129 aa  90.5  7e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.109042  normal  0.938313 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0013  HxlR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 126 aa  90.1  8e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1489  transcriptional regulator, HxlR family  37.04 
 
 		 130 aa  90.1  8e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.657133  normal  0.735424 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1109  HxlR family transcriptional regulator  37.38 
 
 		 116 aa  90.1  9e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.116925  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1541  putative transcriptional regulator  42.11 
 
 		 121 aa  89.7  1e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000091847  normal  0.207791 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3418  putative transcriptional regulator  41.75 
 
 		 132 aa  90.1  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.190487 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0438  transcriptional regulator, HxlR family  39.8 
 
 		 128 aa  89.4  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0118461 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5039  putative transcriptional regulatory protein  40.4 
 
 		 125 aa  89.7  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0703  transcriptional regulator, HxlR family  38.46 
 
 		 134 aa  89  2e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.383651  normal  0.144185 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0168  helix-turn-helix HxlR type  45.83 
 
 		 118 aa  89  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0240  helix-turn-helix HxlR type  45.83 
 
 		 118 aa  89  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.566878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3157  helix-turn-helix, HxlR type  36.04 
 
 		 130 aa  88.6  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.38389  normal  0.468508 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5264  transcriptional regulator, HxlR family  37.7 
 
 		 130 aa  89  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000676248 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0948  transcriptional regulator, HxlR family  42.11 
 
 		 151 aa  89  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3442  transcriptional regulator, HxlR family  43.16 
 
 		 119 aa  88.6  3e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000021737  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2802  transcriptional regulator, HxlR family  42.16 
 
 		 127 aa  88.2  4e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4104  transcriptional regulator, HxlR family  42.16 
 
 		 119 aa  87.4  5e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.533713  normal  0.821475 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1143  MarR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 120 aa  87.4  5e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.553828  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1564  HxlR family transcriptional regulator  43.3 
 
 		 119 aa  87.4  6e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0663317  normal  0.0831873 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6703  transcriptional regulator, HxlR family  39.29 
 
 		 133 aa  87  7e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0799  hypothetical protein  37.74 
 
 		 124 aa  86.7  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000413922  hitchhiker  1.6907100000000001e-18 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4399  hypothetical protein  37.74 
 
 		 124 aa  86.7  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3203  hypothetical protein  41 
 
 		 114 aa  86.3  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.135519  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4217  hypothetical protein  37.74 
 
 		 124 aa  86.7  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4055  transcriptional regulator  37.74 
 
 		 124 aa  86.7  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.396916  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2974  transcriptional regulator, HxlR family  42.71 
 
 		 160 aa  86.3  1e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.607542 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4065  transcriptional regulator  37.74 
 
 		 124 aa  86.7  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.966493  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4340  hypothetical protein  37.74 
 
 		 124 aa  86.7  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.43956e-24 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3457  hypothetical protein  41 
 
 		 114 aa  86.3  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4543  hypothetical protein  37.74 
 
 		 124 aa  86.7  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.719807  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3435  hypothetical protein  41 
 
 		 114 aa  86.3  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0653  HxlR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 133 aa  86.7  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.174756 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4437  hypothetical protein  37.74 
 
 		 124 aa  86.7  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000169623  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4451  hypothetical protein  37.74 
 
 		 124 aa  86.7  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000232165  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3428  hypothetical protein  37.5 
 
 		 107 aa  86.3  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.157748  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1834  hypothetical protein  42 
 
 		 114 aa  86.3  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.118626  normal  0.386956 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5212  hypothetical protein  45.56 
 
 		 114 aa  85.5  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3110  MarR family transcriptional regulator  41 
 
 		 114 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1135  transcriptional regulator, HxlR family  43.62 
 
 		 111 aa  85.5  2e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1876  HxlR family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 122 aa  85.9  2e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4933  hypothetical protein  44.44 
 
 		 114 aa  85.1  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5225  hypothetical protein  44.44 
 
 		 114 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4774  transciprtional regulator  44.44 
 
 		 114 aa  85.1  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4794  transciprtional regulator  44.44 
 
 		 114 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5311  hypothetical protein  44.44 
 
 		 114 aa  85.1  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0373  putative transcriptional regulator  43.96 
 
 		 123 aa  84.7  3e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0376009  normal  0.449269 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5176  hypothetical protein  44.44 
 
 		 114 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0230101 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01970  transcriptional regulator  43.43 
 
 		 140 aa  84.7  3e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4169  HxlR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 124 aa  84.7  4e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000193508  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5208  hypothetical protein  44.44 
 
 		 114 aa  84.3  5e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0036  hypothetical protein  44.44 
 
 		 114 aa  84.3  5e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000638982 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1352  putative transcriptional regulator  39.22 
 
 		 155 aa  84.3  5e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000297864  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3455  hypothetical protein  36.46 
 
 		 107 aa  84.3  5e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.365377  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2973  transcriptional regulator, HxlR family  39.81 
 
 		 116 aa  84  6e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.116721  normal  0.457372 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0862  transcriptional regulator, HxlR family  42.45 
 
 		 119 aa  84  6e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273669  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3129  MarR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 115 aa  84  6e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.576671  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1377  MarR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 122 aa  84  6e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0015  transcriptional regulator, HxlR family  43.96 
 
 		 107 aa  84  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3044  HxlR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 124 aa  84  7e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000040463  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2476  HxlR family transcriptional regulator  41.49 
 
 		 127 aa  83.6  7e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1088  MarR family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 116 aa  83.6  9e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5989  transcriptional regulator, HxlR family  37.76 
 
 		 133 aa  83.6  9e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3119  HxlR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 107 aa  83.6  9e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0144533  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3439  hypothetical protein  41.84 
 
 		 108 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0386  HxlR family transcriptional regulator  46.34 
 
 		 159 aa  83.2  0.000000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.26449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1782  transcriptional regulator, HxlR family  36.07 
 
 		 119 aa  82.8  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3438  hypothetical protein  35.42 
 
 		 107 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.166485  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0290  transcriptional regulator protein-like protein  37.14 
 
 		 154 aa  82.4  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1063  transcriptional regulator  39.58 
 
 		 110 aa  82.4  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0576989  hitchhiker  0.000107529 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1081  HxlR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 125 aa  82.8  0.000000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.124143  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4895  HxlR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 115 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1819  hypothetical protein  35.42 
 
 		 107 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.100816 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3427  hypothetical protein  41.84 
 
 		 108 aa  82  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2474  transcriptional regulator, HxlR family  37.14 
 
 		 115 aa  82  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3120  transcriptional regulator  41.9 
 
 		 126 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.118143  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3027  transcriptional regulator  41.9 
 
 		 126 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.710275  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3354  hypothetical protein  41.9 
 
 		 126 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3357  hypothetical protein  41.9 
 
 		 129 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221434  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1899  hypothetical protein  41.9 
 
 		 126 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2483  HxlR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 116 aa  81.6  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0347086  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0952  HxlR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 117 aa  81.6  0.000000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.473433  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>