More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4263 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4263  transcriptional regulator, HxlR family  100 
 
 		 140 aa  291  2e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.042978  normal  0.290046 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5668  transcriptional regulator, HxlR family  56.03 
 
 		 119 aa  134  5e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.433337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2633  transcriptional regulator, HxlR family  55.75 
 
 		 121 aa  129  1.0000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.895266  normal  0.749568 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0879  transcriptional regulator, HxlR family  57.52 
 
 		 119 aa  127  4.0000000000000003e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.399174  normal  0.958869 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3848  HxlR family transcriptional regulator  58.88 
 
 		 121 aa  126  1.0000000000000001e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.774801  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0881  transcriptional regulator, HxlR family  55.17 
 
 		 122 aa  125  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4237  transcriptional regulator, HxlR family  54.78 
 
 		 125 aa  122  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.940949 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5687  transcriptional regulator, HxlR family  50.43 
 
 		 124 aa  122  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.643264 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2531  transcriptional regulator, HxlR family  44.26 
 
 		 123 aa  117  7e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6703  transcriptional regulator, HxlR family  47.32 
 
 		 133 aa  107  7.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4895  HxlR family transcriptional regulator  50.56 
 
 		 115 aa  102  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1876  HxlR family transcriptional regulator  50.54 
 
 		 122 aa  102  2e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5212  hypothetical protein  50.56 
 
 		 114 aa  102  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5208  hypothetical protein  49.44 
 
 		 114 aa  100  5e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0036  hypothetical protein  49.44 
 
 		 114 aa  100  5e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000638982 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0808  HxlR family transcriptional regulator  49.07 
 
 		 159 aa  99.8  1e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.40472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5225  hypothetical protein  48.31 
 
 		 114 aa  99  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4933  hypothetical protein  48.31 
 
 		 114 aa  99  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5176  hypothetical protein  48.31 
 
 		 114 aa  99  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0230101 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4774  transciprtional regulator  48.31 
 
 		 114 aa  99  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4794  transciprtional regulator  48.31 
 
 		 114 aa  99  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5311  hypothetical protein  48.31 
 
 		 114 aa  99  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2974  transcriptional regulator, HxlR family  44.44 
 
 		 160 aa  97.4  5e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.607542 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1135  transcriptional regulator, HxlR family  44.33 
 
 		 111 aa  97.4  6e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3203  hypothetical protein  49.44 
 
 		 114 aa  96.7  8e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.135519  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3457  hypothetical protein  49.44 
 
 		 114 aa  96.7  8e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1834  hypothetical protein  50.56 
 
 		 114 aa  96.7  9e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.118626  normal  0.386956 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3110  MarR family transcriptional regulator  49.44 
 
 		 114 aa  96.3  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1437  transcriptional regulator family protein  43.75 
 
 		 141 aa  96.7  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3435  hypothetical protein  49.44 
 
 		 114 aa  96.3  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2005  transcriptional regulator family protein  43.75 
 
 		 144 aa  95.9  2e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3179  transcriptional regulator family protein  43.3 
 
 		 206 aa  95.5  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0560718  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2693  putative transcriptional regulator  38.33 
 
 		 235 aa  95.5  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.863177 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0905  transcriptional regulator family protein  43.75 
 
 		 220 aa  95.5  2e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2738  transcriptional regulator family protein  43.75 
 
 		 144 aa  95.9  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.115101  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3126  putative transcriptional regulator  43.75 
 
 		 144 aa  95.9  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3163  putative transcriptional regulator  43.75 
 
 		 144 aa  95.9  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1870  transcriptional regulator family protein  43.75 
 
 		 144 aa  95.9  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.284748  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2802  transcriptional regulator, HxlR family  50 
 
 		 127 aa  94.7  4e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3427  hypothetical protein  46.67 
 
 		 108 aa  94.7  4e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3208  hypothetical protein  48.28 
 
 		 108 aa  94  6e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3186  MarR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 108 aa  94  6e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3461  hypothetical protein  48.28 
 
 		 108 aa  94  6e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.692347  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1063  transcriptional regulator  43.01 
 
 		 110 aa  93.2  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0576989  hitchhiker  0.000107529 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0952  HxlR family transcriptional regulator  44.33 
 
 		 117 aa  92.8  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.473433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1088  MarR family transcriptional regulator  43.96 
 
 		 116 aa  92  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6381  HxlR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 139 aa  92.8  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.06337  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2245  transcriptional regulator, HxlR family  43.88 
 
 		 128 aa  92  3e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2255  transcriptional regulator, HxlR family  41.51 
 
 		 159 aa  92  3e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.395748  normal  0.27377 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3439  hypothetical protein  44.44 
 
 		 108 aa  91.3  4e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5039  putative transcriptional regulatory protein  40.82 
 
 		 125 aa  91.3  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4102  transcriptional regulator, HxlR family  37.25 
 
 		 118 aa  91.3  5e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149147 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3209  hypothetical protein  46.07 
 
 		 113 aa  90.5  7e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3115  MarR family transcriptional regulator  46.07 
 
 		 114 aa  90.5  7e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.451528  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1352  putative transcriptional regulator  42.42 
 
 		 155 aa  90.5  7e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000297864  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3462  hypothetical protein  46.07 
 
 		 113 aa  90.5  7e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.457433  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3440  hypothetical protein  46.07 
 
 		 113 aa  90.5  7e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3114  MarR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 108 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.448387  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0373  putative transcriptional regulator  42.86 
 
 		 123 aa  89.7  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0376009  normal  0.449269 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0456  transcriptional regulator, HxlR family  43.4 
 
 		 149 aa  89.7  1e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.208849  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3187  MarR family transcriptional regulator  44.94 
 
 		 114 aa  89  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3428  hypothetical protein  44.94 
 
 		 114 aa  89  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1292  transcriptional regulator, HxlR family  40.62 
 
 		 129 aa  89  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.109042  normal  0.938313 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3332  hypothetical protein  46.81 
 
 		 126 aa  88.2  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2595  transcriptional regulator  36.75 
 
 		 124 aa  87.4  5e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2224  transcriptional regulator, HxlR family  36.75 
 
 		 124 aa  87.4  5e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.647927  normal  0.782754 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5989  transcriptional regulator, HxlR family  33.88 
 
 		 133 aa  87.4  6e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3895  HxlR family transcriptional regulator  40.59 
 
 		 120 aa  87.4  6e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000755308  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3069  transcriptional regulator, HxlR family  44.71 
 
 		 137 aa  87  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0845928  normal  0.988142 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3120  transcriptional regulator  45.26 
 
 		 126 aa  87  7e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.118143  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3027  transcriptional regulator  45.26 
 
 		 126 aa  87  7e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.710275  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3357  hypothetical protein  45.26 
 
 		 129 aa  87  7e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221434  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3133  hypothetical protein  45.26 
 
 		 126 aa  87  8e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.441436  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2474  transcriptional regulator, HxlR family  39 
 
 		 115 aa  87  8e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3379  hypothetical protein  45.26 
 
 		 126 aa  87  8e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3354  hypothetical protein  45.26 
 
 		 126 aa  87  8e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1899  hypothetical protein  45.26 
 
 		 126 aa  87  8e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3157  helix-turn-helix, HxlR type  33.33 
 
 		 130 aa  86.7  9e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.38389  normal  0.468508 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3059  HxlR family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 124 aa  86.7  9e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23135  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0178  hypothetical protein  41.76 
 
 		 114 aa  86.7  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0703  transcriptional regulator, HxlR family  35.4 
 
 		 134 aa  86.3  1e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.383651  normal  0.144185 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3638  transcriptional regulator, HxlR family  34.48 
 
 		 129 aa  86.7  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.386135  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1564  HxlR family transcriptional regulator  44.57 
 
 		 119 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0663317  normal  0.0831873 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3442  transcriptional regulator, HxlR family  39.39 
 
 		 119 aa  85.5  2e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000021737  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2778  transcriptional regulator  41.41 
 
 		 112 aa  85.5  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000060346 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5072  transcriptional regulator, HxlR family  38.83 
 
 		 117 aa  85.1  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.550945 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1143  MarR family transcriptional regulator  40.86 
 
 		 120 aa  85.1  3e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.553828  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2547  transcriptional regulator, MarR family  41.41 
 
 		 112 aa  84.7  4e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1109  HxlR family transcriptional regulator  40.86 
 
 		 116 aa  84.7  4e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.116925  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0013  HxlR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 126 aa  84  6e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0379  transcriptional regulator  38.61 
 
 		 115 aa  84.3  6e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0341948  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1782  transcriptional regulator, HxlR family  36.19 
 
 		 119 aa  83.6  7e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1097  transcriptional regulator, HxlR family  42.39 
 
 		 134 aa  84  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.199182  normal  0.222478 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3585  transcriptional regulator, HxlR family  39.56 
 
 		 108 aa  84  7e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000738633  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0015  transcriptional regulator, HxlR family  43.82 
 
 		 107 aa  83.6  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1317  HxlR family transcriptional regulator  43.01 
 
 		 122 aa  83.6  8e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000449926  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4287  transcriptional regulator, HxlR family  42.11 
 
 		 119 aa  83.6  8e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.332291  normal  0.235494 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0948  transcriptional regulator, HxlR family  40.22 
 
 		 151 aa  83.6  9e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2387  HxlR family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 115 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.157796  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4065  transcriptional regulator  40.43 
 
 		 124 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.966493  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>