More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1782 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1782  transcriptional regulator, HxlR family  100 
 
 		 119 aa  246  9e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6703  transcriptional regulator, HxlR family  48.57 
 
 		 133 aa  106  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5687  transcriptional regulator, HxlR family  41.03 
 
 		 124 aa  97.1  8e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.643264 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5668  transcriptional regulator, HxlR family  41.82 
 
 		 119 aa  93.6  7e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.433337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3848  HxlR family transcriptional regulator  39.05 
 
 		 121 aa  89  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.774801  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0879  transcriptional regulator, HxlR family  38.1 
 
 		 119 aa  87  7e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.399174  normal  0.958869 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2531  transcriptional regulator, HxlR family  35.24 
 
 		 123 aa  86.3  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0881  transcriptional regulator, HxlR family  38.1 
 
 		 122 aa  84  7e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4263  transcriptional regulator, HxlR family  36.19 
 
 		 140 aa  83.6  8e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.042978  normal  0.290046 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4237  transcriptional regulator, HxlR family  36.07 
 
 		 125 aa  82.8  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.940949 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2595  transcriptional regulator  34.82 
 
 		 124 aa  82  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2224  transcriptional regulator, HxlR family  34.82 
 
 		 124 aa  82  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.647927  normal  0.782754 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2633  transcriptional regulator, HxlR family  33.93 
 
 		 121 aa  77.4  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.895266  normal  0.749568 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0518  transcriptional regulator, HxlR family  35.29 
 
 		 127 aa  77.4  0.00000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0564  transcriptional regulator, HxlR family  35.14 
 
 		 124 aa  75.5  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000666218  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0952  transcriptional regulator  34.86 
 
 		 130 aa  72.4  0.000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000720896  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1063  transcriptional regulator  36.36 
 
 		 110 aa  72  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0576989  hitchhiker  0.000107529 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1135  transcriptional regulator, HxlR family  37.63 
 
 		 111 aa  71.6  0.000000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0823  hypothetical protein  39.18 
 
 		 104 aa  70.9  0.000000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1450  hypothetical protein  39.18 
 
 		 104 aa  70.9  0.000000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2483  HxlR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 116 aa  67.4  0.00000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0347086  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2693  putative transcriptional regulator  31.58 
 
 		 235 aa  67.4  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.863177 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1876  HxlR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 122 aa  66.6  0.0000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1884  transcriptional regulator  33.67 
 
 		 100 aa  65.5  0.0000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.189342  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0178  hypothetical protein  31.63 
 
 		 114 aa  65.5  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1489  transcriptional regulator, HxlR family  34.41 
 
 		 130 aa  64.7  0.0000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.657133  normal  0.735424 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0933  transcriptional regulator, HxlR family  29.81 
 
 		 108 aa  64.7  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.973186 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1262  transcriptional regulator, HxlR family  35.79 
 
 		 148 aa  64.7  0.0000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.84733 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0290  transcriptional regulator protein-like protein  34.04 
 
 		 154 aa  64.7  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2973  transcriptional regulator, HxlR family  36.26 
 
 		 116 aa  64.3  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.116721  normal  0.457372 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0361  putative transcriptional regulator  35.05 
 
 		 139 aa  64.3  0.0000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.554398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0703  transcriptional regulator, HxlR family  31.91 
 
 		 134 aa  64.3  0.0000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.383651  normal  0.144185 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3428  hypothetical protein  31.68 
 
 		 107 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.157748  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3129  MarR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 115 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.576671  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3455  hypothetical protein  30.69 
 
 		 107 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.365377  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl051  MarR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 101 aa  63.9  0.0000000008  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3438  hypothetical protein  30.69 
 
 		 107 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.166485  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3223  hypothetical protein  32.99 
 
 		 107 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.246071  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3200  MarR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 107 aa  63.2  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0287258  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5989  transcriptional regulator, HxlR family  32.26 
 
 		 133 aa  63.2  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1097  transcriptional regulator, HxlR family  34.04 
 
 		 112 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3119  HxlR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 107 aa  62.8  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0144533  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1292  transcriptional regulator, HxlR family  28.87 
 
 		 129 aa  63.2  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.109042  normal  0.938313 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10173  YdeP  32.99 
 
 		 122 aa  63.5  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3441  hypothetical protein  32.99 
 
 		 107 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1819  hypothetical protein  30.69 
 
 		 107 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.100816 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4102  transcriptional regulator, HxlR family  33.67 
 
 		 118 aa  62.4  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149147 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5682  transcriptional regulator, HxlR family  33.71 
 
 		 128 aa  62  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.103189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1541  putative transcriptional regulator  34.41 
 
 		 121 aa  62.8  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000091847  normal  0.207791 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3785  transcriptional regulator, HxlR family  35.16 
 
 		 118 aa  62.4  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.139955  normal  0.719008 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4975  HxlR family transcriptional regulator  25.96 
 
 		 112 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0653  HxlR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 133 aa  62.4  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.174756 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2289  hypothetical protein  31.43 
 
 		 112 aa  62.8  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.373425 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5063  HxlR family transcriptional regulator  25.96 
 
 		 112 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5356  HxlR family transcriptional regulator  25.96 
 
 		 112 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1352  putative transcriptional regulator  34.04 
 
 		 155 aa  62  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000297864  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1698  putative transcriptional regulator  30.77 
 
 		 113 aa  61.6  0.000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.171254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2370  putative transcriptional regulator  28.71 
 
 		 121 aa  62  0.000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.132848  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1347  transcriptional regulator  31.91 
 
 		 132 aa  62  0.000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00610853  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3895  HxlR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 120 aa  61.6  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000755308  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0386  HxlR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 159 aa  61.6  0.000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.26449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3427  hypothetical protein  32.58 
 
 		 108 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3208  hypothetical protein  31.46 
 
 		 108 aa  61.2  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3186  MarR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 108 aa  61.2  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1097  transcriptional regulator, HxlR family  27.66 
 
 		 134 aa  61.2  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.199182  normal  0.222478 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3461  hypothetical protein  31.46 
 
 		 108 aa  61.2  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.692347  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2245  transcriptional regulator, HxlR family  36.89 
 
 		 128 aa  61.2  0.000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1661  HxlR family transcriptional regulator  36 
 
 		 114 aa  61.2  0.000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000438417  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4732  transcriptional regulator, HxlR family  29.09 
 
 		 128 aa  61.2  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1171  HxlR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 149 aa  60.8  0.000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6178  transcriptional regulator, HxlR family  30.77 
 
 		 135 aa  60.8  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0462511 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0880  transcriptional regulator, HxlR family  31.68 
 
 		 118 aa  60.8  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3110  MarR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 114 aa  60.5  0.000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3435  hypothetical protein  29.25 
 
 		 114 aa  60.5  0.000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3816  HxlR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 120 aa  60.5  0.000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7105  transcriptional regulator protein-like protein  28.71 
 
 		 164 aa  60.5  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.248427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1070  helix-turn-helix HxlR type  28.57 
 
 		 128 aa  60.5  0.000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000989417  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0948  transcriptional regulator, HxlR family  27.66 
 
 		 151 aa  60.5  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3439  hypothetical protein  32.58 
 
 		 108 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2005  transcriptional regulator family protein  28.7 
 
 		 144 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2738  transcriptional regulator family protein  28.7 
 
 		 144 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.115101  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3126  putative transcriptional regulator  28.7 
 
 		 144 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3163  putative transcriptional regulator  28.7 
 
 		 144 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1870  transcriptional regulator family protein  28.7 
 
 		 144 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.284748  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1834  hypothetical protein  29.52 
 
 		 114 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.118626  normal  0.386956 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3203  hypothetical protein  31.46 
 
 		 114 aa  59.7  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.135519  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3027  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 126 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.710275  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3114  MarR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 108 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.448387  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1899  hypothetical protein  33.33 
 
 		 126 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3457  hypothetical protein  31.46 
 
 		 114 aa  59.7  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3019  transcriptional regulator, HxlR family  31 
 
 		 247 aa  59.7  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.179056  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2120  transcriptional regulator, HxlR family  31.53 
 
 		 111 aa  60.1  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000013994  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6381  HxlR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 139 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.06337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1109  HxlR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 116 aa  60.1  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.116925  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17890  predicted transcriptional regulator  31.87 
 
 		 111 aa  59.7  0.00000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.382985 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2974  transcriptional regulator, HxlR family  31.25 
 
 		 160 aa  60.1  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.607542 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3133  hypothetical protein  33.33 
 
 		 126 aa  59.3  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.441436  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3332  hypothetical protein  34 
 
 		 126 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3059  HxlR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 124 aa  59.3  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23135  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2703  transcriptional regulator, HxlR family  30.77 
 
 		 118 aa  58.9  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>