More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1347 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_1347  transcriptional regulator  100 
 
 		 132 aa  271  1.0000000000000001e-72  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00610853  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1876  HxlR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 122 aa  100  8e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3895  HxlR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 120 aa  86.3  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000755308  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4746  HxlR family transcriptional regulator  43.69 
 
 		 116 aa  86.3  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0948  transcriptional regulator, HxlR family  38.54 
 
 		 151 aa  85.5  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1097  transcriptional regulator, HxlR family  38.54 
 
 		 134 aa  85.5  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.199182  normal  0.222478 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1063  transcriptional regulator  38.54 
 
 		 110 aa  83.6  8e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0576989  hitchhiker  0.000107529 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0653  HxlR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 133 aa  83.6  9e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.174756 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2005  transcriptional regulator family protein  38.95 
 
 		 144 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2738  transcriptional regulator family protein  38.95 
 
 		 144 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.115101  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3126  putative transcriptional regulator  38.95 
 
 		 144 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1870  transcriptional regulator family protein  38.95 
 
 		 144 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.284748  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3179  transcriptional regulator family protein  38.95 
 
 		 206 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0560718  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0905  transcriptional regulator family protein  38.95 
 
 		 220 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3163  putative transcriptional regulator  38.95 
 
 		 144 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1437  transcriptional regulator family protein  34.91 
 
 		 141 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3133  hypothetical protein  34.75 
 
 		 126 aa  78.6  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.441436  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3379  hypothetical protein  34.75 
 
 		 126 aa  78.6  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3332  hypothetical protein  34.75 
 
 		 126 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3354  hypothetical protein  34.75 
 
 		 126 aa  78.6  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1081  HxlR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 125 aa  79  0.00000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.124143  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3059  HxlR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 124 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23135  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1899  hypothetical protein  34.75 
 
 		 126 aa  78.6  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3120  transcriptional regulator  33.9 
 
 		 126 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.118143  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3027  transcriptional regulator  34.75 
 
 		 126 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.710275  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3357  hypothetical protein  34.75 
 
 		 129 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221434  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6381  HxlR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 139 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.06337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0933  transcriptional regulator, HxlR family  36.84 
 
 		 108 aa  77.8  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.973186 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0438  transcriptional regulator, HxlR family  33.33 
 
 		 128 aa  77  0.00000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0118461 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2802  transcriptional regulator, HxlR family  34.23 
 
 		 127 aa  76.3  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2224  transcriptional regulator, HxlR family  36.73 
 
 		 124 aa  76.3  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.647927  normal  0.782754 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2974  transcriptional regulator, HxlR family  35.85 
 
 		 160 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.607542 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2474  transcriptional regulator, HxlR family  33.96 
 
 		 115 aa  76.6  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2595  transcriptional regulator  36.73 
 
 		 124 aa  76.3  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0862  transcriptional regulator, HxlR family  39.8 
 
 		 119 aa  75.9  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273669  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1352  putative transcriptional regulator  37.96 
 
 		 155 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000297864  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2255  transcriptional regulator, HxlR family  30.4 
 
 		 159 aa  75.5  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.395748  normal  0.27377 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0703  transcriptional regulator, HxlR family  32.77 
 
 		 134 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.383651  normal  0.144185 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1143  MarR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 120 aa  75.5  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.553828  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4263  transcriptional regulator, HxlR family  41.3 
 
 		 140 aa  75.1  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.042978  normal  0.290046 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0456  transcriptional regulator, HxlR family  38.78 
 
 		 149 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.208849  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5548  transcriptional regulator, HxlR family  39.13 
 
 		 107 aa  75.1  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3157  helix-turn-helix, HxlR type  33.33 
 
 		 130 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.38389  normal  0.468508 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1564  HxlR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 119 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0663317  normal  0.0831873 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0952  HxlR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 117 aa  74.7  0.0000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.473433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1135  transcriptional regulator, HxlR family  37.76 
 
 		 111 aa  74.7  0.0000000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0945  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 119 aa  74.7  0.0000000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3041  transcriptional regulator, HxlR family  40.21 
 
 		 119 aa  74.3  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3044  HxlR family transcriptional regulator  40 
 
 		 124 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000040463  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1489  transcriptional regulator, HxlR family  33.66 
 
 		 130 aa  73.9  0.0000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.657133  normal  0.735424 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1541  putative transcriptional regulator  31.86 
 
 		 121 aa  73.6  0.0000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000091847  normal  0.207791 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0808  HxlR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 159 aa  73.6  0.0000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.40472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1377  MarR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 122 aa  73.6  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2483  HxlR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 116 aa  73.2  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0347086  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0799  hypothetical protein  42.86 
 
 		 124 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000413922  hitchhiker  1.6907100000000001e-18 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2476  HxlR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 127 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4399  hypothetical protein  42.86 
 
 		 124 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4340  hypothetical protein  42.86 
 
 		 124 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.43956e-24 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4217  hypothetical protein  42.86 
 
 		 124 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4055  transcriptional regulator  42.86 
 
 		 124 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.396916  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl051  MarR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 101 aa  72.4  0.000000000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17890  predicted transcriptional regulator  35 
 
 		 111 aa  72  0.000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.382985 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4065  transcriptional regulator  42.86 
 
 		 124 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.966493  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4543  hypothetical protein  42.86 
 
 		 124 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.719807  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4451  hypothetical protein  42.86 
 
 		 124 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000232165  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4437  hypothetical protein  42.86 
 
 		 124 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000169623  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0802  transcriptional regulator, HxlR family  33.67 
 
 		 106 aa  72.8  0.000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0464121  normal  0.73342 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4102  transcriptional regulator, HxlR family  38 
 
 		 118 aa  72.4  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149147 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1109  HxlR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 116 aa  71.6  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.116925  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3848  HxlR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 121 aa  71.6  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.774801  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2126  helix-turn-helix HxlR type  30.16 
 
 		 129 aa  71.2  0.000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.653298  normal  0.626696 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4237  transcriptional regulator, HxlR family  40 
 
 		 125 aa  71.2  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.940949 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0013  HxlR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 126 aa  70.9  0.000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1803  HxlR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 223 aa  70.5  0.000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0896859  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1850  HxlR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 223 aa  70.5  0.000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.363073 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1292  transcriptional regulator, HxlR family  35.11 
 
 		 129 aa  70.9  0.000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.109042  normal  0.938313 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1784  HxlR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 223 aa  70.5  0.000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.105843  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0178  hypothetical protein  31.63 
 
 		 114 aa  69.3  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3638  transcriptional regulator, HxlR family  33.68 
 
 		 129 aa  69.7  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.386135  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0879  transcriptional regulator, HxlR family  36.84 
 
 		 119 aa  69.7  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.399174  normal  0.958869 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4169  HxlR family transcriptional regulator  42.27 
 
 		 124 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000193508  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01970  transcriptional regulator  34.34 
 
 		 140 aa  68.9  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3441  hypothetical protein  35.11 
 
 		 107 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3223  hypothetical protein  35.11 
 
 		 107 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.246071  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3200  MarR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 107 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0287258  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1088  MarR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 116 aa  69.3  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1607  transcriptional regulator, HxlR family  34.34 
 
 		 113 aa  68.9  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000104346  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0373  putative transcriptional regulator  30.61 
 
 		 123 aa  68.9  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0376009  normal  0.449269 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3418  putative transcriptional regulator  32.63 
 
 		 132 aa  69.3  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.190487 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5072  transcriptional regulator, HxlR family  31.37 
 
 		 117 aa  69.3  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.550945 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4243  transcriptional regulator, HxlR family  36.36 
 
 		 105 aa  68.9  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.333534  normal  0.800382 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9284  transcriptional regulator (MarR family protein)  36.73 
 
 		 122 aa  69.3  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0252  transcriptional regulator, HxlR family  36.56 
 
 		 118 aa  68.6  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5177  HxlR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 118 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1317  HxlR family transcriptional regulator  36 
 
 		 122 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000449926  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3438  hypothetical protein  34.78 
 
 		 107 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.166485  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3203  hypothetical protein  34.62 
 
 		 114 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.135519  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2245  transcriptional regulator, HxlR family  38.54 
 
 		 128 aa  67.8  0.00000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1834  hypothetical protein  36.26 
 
 		 114 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.118626  normal  0.386956 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3457  hypothetical protein  34.62 
 
 		 114 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>