More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5177 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_5177  HxlR family transcriptional regulator  100 
 
 		 118 aa  238  2e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3339  HxlR family transcriptional regulator  97.09 
 
 		 103 aa  203  6e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4770  HxlR family transcriptional regulator  89.57 
 
 		 126 aa  184  4e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4119  HxlR family transcriptional regulator  89.57 
 
 		 126 aa  184  4e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.538433 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3397  HxlR family transcriptional regulator  89.57 
 
 		 126 aa  184  4e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2772  HxlR family transcriptional regulator  88.7 
 
 		 130 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.296986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3100  HxlR family transcriptional regulator  76.92 
 
 		 107 aa  177  4.999999999999999e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0633  HxlR family transcriptional regulator  54.64 
 
 		 114 aa  110  8.000000000000001e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.437406 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3895  HxlR family transcriptional regulator  48.74 
 
 		 120 aa  109  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000755308  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1135  transcriptional regulator, HxlR family  42.06 
 
 		 111 aa  104  4e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5039  putative transcriptional regulatory protein  53.26 
 
 		 125 aa  103  7e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3638  transcriptional regulator, HxlR family  49.51 
 
 		 129 aa  103  7e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.386135  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1063  transcriptional regulator  43.88 
 
 		 110 aa  102  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0576989  hitchhiker  0.000107529 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3332  hypothetical protein  48.42 
 
 		 126 aa  99.8  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0933  transcriptional regulator, HxlR family  46.15 
 
 		 108 aa  99.8  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.973186 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0862  transcriptional regulator, HxlR family  49.47 
 
 		 119 aa  99.4  1e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273669  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1698  putative transcriptional regulator  51.02 
 
 		 113 aa  99.8  1e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.171254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1437  transcriptional regulator family protein  45.95 
 
 		 141 aa  99.4  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0952  HxlR family transcriptional regulator  43.52 
 
 		 117 aa  99  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.473433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3059  HxlR family transcriptional regulator  48.42 
 
 		 124 aa  99.4  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23135  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2005  transcriptional regulator family protein  45.95 
 
 		 144 aa  99.4  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3179  transcriptional regulator family protein  45.95 
 
 		 206 aa  99  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0560718  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2738  transcriptional regulator family protein  45.95 
 
 		 144 aa  99.4  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.115101  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3126  putative transcriptional regulator  45.95 
 
 		 144 aa  99.4  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3163  putative transcriptional regulator  45.95 
 
 		 144 aa  99  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1870  transcriptional regulator family protein  45.95 
 
 		 144 aa  99.4  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.284748  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3133  hypothetical protein  47.37 
 
 		 126 aa  98.2  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.441436  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3120  transcriptional regulator  48.91 
 
 		 126 aa  98.6  3e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.118143  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3027  transcriptional regulator  47.37 
 
 		 126 aa  98.6  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.710275  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3357  hypothetical protein  47.37 
 
 		 129 aa  98.2  3e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221434  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3354  hypothetical protein  47.37 
 
 		 126 aa  98.2  3e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3379  hypothetical protein  47.37 
 
 		 126 aa  98.2  3e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0738  transcriptional regulator, HxlR family  49.45 
 
 		 124 aa  98.2  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.342617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1899  hypothetical protein  48.91 
 
 		 126 aa  98.2  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0905  transcriptional regulator family protein  45.95 
 
 		 220 aa  98.6  3e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3816  HxlR family transcriptional regulator  45.05 
 
 		 120 aa  97.8  4e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2703  transcriptional regulator, HxlR family  47.87 
 
 		 118 aa  97.8  5e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1097  transcriptional regulator, HxlR family  47.83 
 
 		 134 aa  97.4  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.199182  normal  0.222478 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6381  HxlR family transcriptional regulator  49.47 
 
 		 139 aa  97.4  6e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.06337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3418  putative transcriptional regulator  48.04 
 
 		 132 aa  97.4  6e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.190487 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1607  transcriptional regulator, HxlR family  44.68 
 
 		 113 aa  96.7  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000104346  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3157  helix-turn-helix, HxlR type  44.07 
 
 		 130 aa  96.7  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.38389  normal  0.468508 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4746  HxlR family transcriptional regulator  49.46 
 
 		 116 aa  95.5  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9284  transcriptional regulator (MarR family protein)  53.76 
 
 		 122 aa  95.5  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0221  transcriptional regulator, HxlR family  44.9 
 
 		 106 aa  95.5  2e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012384  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5989  transcriptional regulator, HxlR family  47.25 
 
 		 133 aa  95.5  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0386  HxlR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 159 aa  94.4  4e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.26449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0013  HxlR family transcriptional regulator  46.08 
 
 		 126 aa  94.4  5e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1352  putative transcriptional regulator  41.07 
 
 		 155 aa  94.4  5e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000297864  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3585  transcriptional regulator, HxlR family  40.4 
 
 		 108 aa  94  7e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000738633  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2802  transcriptional regulator, HxlR family  42.55 
 
 		 127 aa  93.6  8e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1564  HxlR family transcriptional regulator  44.57 
 
 		 119 aa  93.6  9e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0663317  normal  0.0831873 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4164  HxlR family transcriptional regulator  48.45 
 
 		 122 aa  93.6  9e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.596618  normal  0.514488 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1489  transcriptional regulator, HxlR family  43.88 
 
 		 130 aa  93.2  1e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.657133  normal  0.735424 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1661  HxlR family transcriptional regulator  44.09 
 
 		 114 aa  93.2  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000438417  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0015  transcriptional regulator, HxlR family  48.31 
 
 		 107 aa  93.2  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1262  transcriptional regulator, HxlR family  45.05 
 
 		 148 aa  93.2  1e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.84733 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17890  predicted transcriptional regulator  52.75 
 
 		 111 aa  93.2  1e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.382985 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1227  putative transcriptional regulator  45.92 
 
 		 119 aa  92.4  2e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.916879  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3025  HxlR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 131 aa  92.4  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.29638  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2224  transcriptional regulator, HxlR family  44.76 
 
 		 124 aa  92  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.647927  normal  0.782754 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0948  transcriptional regulator, HxlR family  46.74 
 
 		 151 aa  92.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2595  transcriptional regulator  44.76 
 
 		 124 aa  92  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6402  HxlR family transcriptional regulator  46.61 
 
 		 121 aa  92.4  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.299726 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2255  transcriptional regulator, HxlR family  44.68 
 
 		 159 aa  92  3e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.395748  normal  0.27377 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2474  transcriptional regulator, HxlR family  48.39 
 
 		 115 aa  91.7  3e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1541  putative transcriptional regulator  48.35 
 
 		 121 aa  90.9  6e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000091847  normal  0.207791 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1143  MarR family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 120 aa  90.9  6e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.553828  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0802  transcriptional regulator, HxlR family  43.88 
 
 		 106 aa  90.5  7e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0464121  normal  0.73342 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2245  transcriptional regulator, HxlR family  43.62 
 
 		 128 aa  90.5  7e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2974  transcriptional regulator, HxlR family  44.76 
 
 		 160 aa  90.1  8e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.607542 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4102  transcriptional regulator, HxlR family  43.48 
 
 		 118 aa  90.1  9e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149147 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2057  transcriptional regulator, HxlR family  46.15 
 
 		 113 aa  90.1  9e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.776461  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4933  hypothetical protein  43.82 
 
 		 114 aa  89.7  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5176  hypothetical protein  43.82 
 
 		 114 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0230101 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4774  transciprtional regulator  43.82 
 
 		 114 aa  89.7  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1292  transcriptional regulator, HxlR family  43.48 
 
 		 129 aa  89.7  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.109042  normal  0.938313 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4794  transciprtional regulator  43.82 
 
 		 114 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5311  hypothetical protein  43.82 
 
 		 114 aa  89.7  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0280  HxlR family transcriptional regulator  48.45 
 
 		 116 aa  89.7  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.900551 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5225  hypothetical protein  43.82 
 
 		 114 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1971  HxlR family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 134 aa  89  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5174  HxlR family transcriptional regulator  48.94 
 
 		 119 aa  89  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.187988  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4680  transcriptional regulator, HxlR family  46.79 
 
 		 130 aa  89  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0170058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0703  transcriptional regulator, HxlR family  44.95 
 
 		 134 aa  89.4  2e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.383651  normal  0.144185 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0653  HxlR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 133 aa  89.4  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.174756 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1542  transcriptional regulator  37.86 
 
 		 110 aa  89  2e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000282269  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1179  HxlR family transcriptional regulator  50 
 
 		 137 aa  88.2  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.795487 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1317  HxlR family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 122 aa  88.2  3e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000449926  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5212  hypothetical protein  43.82 
 
 		 114 aa  88.6  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1081  HxlR family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 125 aa  87.8  4e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.124143  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5208  hypothetical protein  43.82 
 
 		 114 aa  87.8  4e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0036  hypothetical protein  43.82 
 
 		 114 aa  87.8  5e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000638982 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1242  hypothetical protein  43.69 
 
 		 159 aa  87.8  5e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0287  transcriptional regulator, HxlR family  50 
 
 		 129 aa  87.4  5e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4812  HxlR family transcriptional regulator  54.55 
 
 		 180 aa  87.4  6e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.14161 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0785  transcriptional regulator, HxlR family  46.15 
 
 		 107 aa  87.4  6e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4055  transcriptional regulator  40.4 
 
 		 124 aa  87  7e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.396916  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4543  hypothetical protein  40.4 
 
 		 124 aa  87  7e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.719807  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4340  hypothetical protein  40.4 
 
 		 124 aa  87  7e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.43956e-24 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>