More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3100 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_3100  HxlR family transcriptional regulator  100 
 
 		 107 aa  216  7.999999999999999e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5177  HxlR family transcriptional regulator  76.92 
 
 		 118 aa  177  4.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4770  HxlR family transcriptional regulator  76.92 
 
 		 126 aa  152  1e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3339  HxlR family transcriptional regulator  77.53 
 
 		 103 aa  152  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3397  HxlR family transcriptional regulator  76.92 
 
 		 126 aa  152  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4119  HxlR family transcriptional regulator  76.92 
 
 		 126 aa  152  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.538433 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2772  HxlR family transcriptional regulator  75.96 
 
 		 130 aa  149  8e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.296986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0633  HxlR family transcriptional regulator  52.58 
 
 		 114 aa  105  2e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.437406 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1097  transcriptional regulator, HxlR family  49.47 
 
 		 134 aa  102  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.199182  normal  0.222478 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0948  transcriptional regulator, HxlR family  48.42 
 
 		 151 aa  99.4  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1063  transcriptional regulator  46.74 
 
 		 110 aa  97.1  7e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0576989  hitchhiker  0.000107529 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3895  HxlR family transcriptional regulator  46.74 
 
 		 120 aa  97.1  8e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000755308  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5039  putative transcriptional regulatory protein  51.09 
 
 		 125 aa  96.3  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1135  transcriptional regulator, HxlR family  47.25 
 
 		 111 aa  95.9  2e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0738  transcriptional regulator, HxlR family  50.55 
 
 		 124 aa  95.5  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.342617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2703  transcriptional regulator, HxlR family  48.35 
 
 		 118 aa  95.5  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3816  HxlR family transcriptional regulator  45.05 
 
 		 120 aa  94.7  3e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0862  transcriptional regulator, HxlR family  47.37 
 
 		 119 aa  95.1  3e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273669  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6381  HxlR family transcriptional regulator  50.54 
 
 		 139 aa  94.7  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.06337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3638  transcriptional regulator, HxlR family  50 
 
 		 129 aa  94.4  5e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.386135  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2005  transcriptional regulator family protein  50.54 
 
 		 144 aa  94  6e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3179  transcriptional regulator family protein  50.54 
 
 		 206 aa  94  6e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0560718  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0905  transcriptional regulator family protein  50.54 
 
 		 220 aa  94  6e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2738  transcriptional regulator family protein  50.54 
 
 		 144 aa  94  6e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.115101  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3126  putative transcriptional regulator  50.54 
 
 		 144 aa  94  6e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3163  putative transcriptional regulator  50.54 
 
 		 144 aa  94  6e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1870  transcriptional regulator family protein  50.54 
 
 		 144 aa  94  6e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.284748  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1437  transcriptional regulator family protein  50.54 
 
 		 141 aa  93.6  7e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3332  hypothetical protein  47.37 
 
 		 126 aa  93.2  9e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9284  transcriptional regulator (MarR family protein)  46.79 
 
 		 122 aa  93.2  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3059  HxlR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 124 aa  93.2  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23135  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3354  hypothetical protein  46.32 
 
 		 126 aa  92  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3133  hypothetical protein  46.32 
 
 		 126 aa  92  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.441436  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3120  transcriptional regulator  46.32 
 
 		 126 aa  92  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.118143  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3027  transcriptional regulator  46.32 
 
 		 126 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.710275  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3357  hypothetical protein  46.32 
 
 		 129 aa  92  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221434  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3379  hypothetical protein  46.32 
 
 		 126 aa  92  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1698  putative transcriptional regulator  47.42 
 
 		 113 aa  92.4  2e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.171254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0221  transcriptional regulator, HxlR family  44.9 
 
 		 106 aa  92  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012384  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4164  HxlR family transcriptional regulator  49.48 
 
 		 122 aa  92  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.596618  normal  0.514488 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1899  hypothetical protein  46.32 
 
 		 126 aa  92  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1262  transcriptional regulator, HxlR family  45.05 
 
 		 148 aa  91.7  3e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.84733 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1564  HxlR family transcriptional regulator  45.65 
 
 		 119 aa  92  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0663317  normal  0.0831873 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3585  transcriptional regulator, HxlR family  43.43 
 
 		 108 aa  91.3  4e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000738633  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0933  transcriptional regulator, HxlR family  45.05 
 
 		 108 aa  90.9  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.973186 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0653  HxlR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 133 aa  90.1  9e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.174756 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2802  transcriptional regulator, HxlR family  43.48 
 
 		 127 aa  89.7  1e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5989  transcriptional regulator, HxlR family  47.25 
 
 		 133 aa  89.7  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2650  transcriptional regulator, HxlR family  54.76 
 
 		 130 aa  89  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.116917  normal  0.771114 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0386  HxlR family transcriptional regulator  43.96 
 
 		 159 aa  89.4  2e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.26449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3157  helix-turn-helix, HxlR type  47.83 
 
 		 130 aa  89  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.38389  normal  0.468508 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17890  predicted transcriptional regulator  47.25 
 
 		 111 aa  88.2  3e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.382985 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2595  transcriptional regulator  45.65 
 
 		 124 aa  88.6  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4746  HxlR family transcriptional regulator  43.3 
 
 		 116 aa  88.2  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2224  transcriptional regulator, HxlR family  45.65 
 
 		 124 aa  88.6  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.647927  normal  0.782754 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1971  HxlR family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 134 aa  88.6  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1242  hypothetical protein  46.32 
 
 		 159 aa  88.2  4e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1227  putative transcriptional regulator  41.35 
 
 		 119 aa  87.4  5e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.916879  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1179  HxlR family transcriptional regulator  47.78 
 
 		 137 aa  87.4  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.795487 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2474  transcriptional regulator, HxlR family  45.45 
 
 		 115 aa  87  7e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10173  YdeP  43.01 
 
 		 122 aa  87  7e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3418  putative transcriptional regulator  45.65 
 
 		 132 aa  86.7  9e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.190487 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2255  transcriptional regulator, HxlR family  44.57 
 
 		 159 aa  86.3  1e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.395748  normal  0.27377 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0952  HxlR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 117 aa  86.3  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.473433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0015  transcriptional regulator, HxlR family  46.07 
 
 		 107 aa  85.5  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl051  MarR family transcriptional regulator  45.36 
 
 		 101 aa  85.9  2e-16  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1607  transcriptional regulator, HxlR family  42.55 
 
 		 113 aa  85.5  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000104346  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4102  transcriptional regulator, HxlR family  42.39 
 
 		 118 aa  84.7  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149147 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1352  putative transcriptional regulator  43.48 
 
 		 155 aa  85.1  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000297864  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1776  putative transcriptional regulator  47.25 
 
 		 134 aa  85.1  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1471  transcriptional regulator, HxlR family  42.86 
 
 		 108 aa  84.7  3e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6229  HxlR family transcriptional regulator  45.74 
 
 		 115 aa  84.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.25386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1292  transcriptional regulator, HxlR family  41.3 
 
 		 129 aa  84.7  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.109042  normal  0.938313 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6398  HxlR family transcriptional regulator  45.74 
 
 		 115 aa  84.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3025  HxlR family transcriptional regulator  45 
 
 		 131 aa  84.7  4e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.29638  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1997  transcriptional regulator, HxlR family  47.78 
 
 		 135 aa  84.7  4e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.271973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6631  HxlR family transcriptional regulator  45.74 
 
 		 115 aa  84.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.932723  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1661  HxlR family transcriptional regulator  44.09 
 
 		 114 aa  84.7  4e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000438417  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0013  HxlR family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 126 aa  84.7  4e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0802  transcriptional regulator, HxlR family  43.01 
 
 		 106 aa  84.3  5e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0464121  normal  0.73342 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6402  HxlR family transcriptional regulator  47.78 
 
 		 121 aa  84.3  5e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.299726 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2120  transcriptional regulator, HxlR family  42.42 
 
 		 111 aa  84  6e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000013994  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1171  transcriptional regulator, HxlR family  45.36 
 
 		 136 aa  84  7e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.299437  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2385  transcriptional regulator, HxlR family  44.9 
 
 		 135 aa  83.6  8e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1489  transcriptional regulator, HxlR family  39.56 
 
 		 130 aa  83.6  8e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.657133  normal  0.735424 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0785  transcriptional regulator, HxlR family  42.86 
 
 		 107 aa  83.6  8e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7246  transcriptional regulator, HxlR family  47.06 
 
 		 116 aa  83.6  8e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00534813  normal  0.675501 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0184  HxlR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 144 aa  83.6  9e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2036  helix-turn-helix HxlR type  47.78 
 
 		 135 aa  83.6  9e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0280  HxlR family transcriptional regulator  45.65 
 
 		 116 aa  83.6  9e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.900551 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0208  hypothetical protein  45.16 
 
 		 144 aa  83.2  0.000000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0246  putative transcriptional regulator  50.55 
 
 		 160 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2311  transcriptional regulator, HxlR family  47.78 
 
 		 135 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.255383  normal  0.225568 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0945  MarR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 119 aa  82.8  0.000000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2245  transcriptional regulator, HxlR family  41.49 
 
 		 128 aa  82.4  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0446  transcriptional regulator, HxlR family  47.67 
 
 		 135 aa  82.4  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1542  transcriptional regulator  40.78 
 
 		 110 aa  82.4  0.000000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000282269  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1143  MarR family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 120 aa  82.4  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.553828  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3200  MarR family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 107 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0287258  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1819  hypothetical protein  38.78 
 
 		 107 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.100816 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>