More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_6631 on replicon NC_008544
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008062  Bcen_6398  HxlR family transcriptional regulator  100 
 
 		 115 aa  225  2e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6631  HxlR family transcriptional regulator  100 
 
 		 115 aa  225  2e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.932723  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6229  HxlR family transcriptional regulator  100 
 
 		 115 aa  225  2e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.25386  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0928  hypothetical protein  56.9 
 
 		 122 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1971  HxlR family transcriptional regulator  46.74 
 
 		 134 aa  90.9  6e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0633  HxlR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 114 aa  87.8  4e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.437406 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1292  transcriptional regulator, HxlR family  41.94 
 
 		 129 aa  87.4  7e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.109042  normal  0.938313 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5668  transcriptional regulator, HxlR family  47.31 
 
 		 119 aa  87  7e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.433337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1541  putative transcriptional regulator  41.84 
 
 		 121 aa  86.7  9e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000091847  normal  0.207791 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6178  transcriptional regulator, HxlR family  53.09 
 
 		 135 aa  86.7  9e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0462511 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1097  transcriptional regulator, HxlR family  39.09 
 
 		 134 aa  85.9  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.199182  normal  0.222478 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5256  HxlR family transcriptional regulator  47.19 
 
 		 135 aa  84.7  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.86161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0948  transcriptional regulator, HxlR family  35.45 
 
 		 151 aa  84.7  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5177  HxlR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 118 aa  84.7  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6381  HxlR family transcriptional regulator  40 
 
 		 139 aa  84.7  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.06337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3100  HxlR family transcriptional regulator  45.74 
 
 		 107 aa  84.7  4e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2474  transcriptional regulator, HxlR family  40.4 
 
 		 115 aa  84.3  5e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2974  transcriptional regulator, HxlR family  45.26 
 
 		 160 aa  83.6  8e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.607542 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3847  helix-turn-helix HxlR type  41.3 
 
 		 119 aa  83.2  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.803353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2087  transcriptional regulator  40 
 
 		 116 aa  83.2  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2765  transcriptional regulator, HxlR family  44.44 
 
 		 138 aa  82.8  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.340614  normal  0.683768 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2510  transcriptional regulator, HxlR family  44.57 
 
 		 138 aa  82  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0013  HxlR family transcriptional regulator  40 
 
 		 126 aa  82.8  0.000000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2005  transcriptional regulator family protein  41.41 
 
 		 144 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2792  hypothetical protein  38.46 
 
 		 136 aa  82.4  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1352  putative transcriptional regulator  38.05 
 
 		 155 aa  82  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000297864  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0373  putative transcriptional regulator  39.39 
 
 		 123 aa  82.4  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0376009  normal  0.449269 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3895  HxlR family transcriptional regulator  43.62 
 
 		 120 aa  82  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000755308  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2738  transcriptional regulator family protein  41.41 
 
 		 144 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.115101  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3126  putative transcriptional regulator  41.41 
 
 		 144 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3163  putative transcriptional regulator  41 
 
 		 144 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1870  transcriptional regulator family protein  41.41 
 
 		 144 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.284748  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1489  transcriptional regulator, HxlR family  36.04 
 
 		 130 aa  82.4  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.657133  normal  0.735424 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0933  transcriptional regulator, HxlR family  39.39 
 
 		 108 aa  81.6  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.973186 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4102  transcriptional regulator, HxlR family  40.43 
 
 		 118 aa  81.6  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149147 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3957  HxlR family transcriptional regulator  41.49 
 
 		 122 aa  82  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4746  HxlR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 116 aa  81.3  0.000000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0808  HxlR family transcriptional regulator  44.94 
 
 		 159 aa  80.9  0.000000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.40472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3332  hypothetical protein  41.49 
 
 		 126 aa  80.5  0.000000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1437  transcriptional regulator family protein  41 
 
 		 141 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2124  HxlR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 136 aa  80.9  0.000000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.235971  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3133  hypothetical protein  41.49 
 
 		 126 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.441436  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3027  transcriptional regulator  41.49 
 
 		 126 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.710275  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3379  hypothetical protein  41.49 
 
 		 126 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3357  hypothetical protein  41.49 
 
 		 129 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221434  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3428  hypothetical protein  40.22 
 
 		 107 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.157748  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0271  transcriptional regulator, HxlR family  43.3 
 
 		 140 aa  80.5  0.000000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3354  hypothetical protein  41.49 
 
 		 126 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3120  transcriptional regulator  41.49 
 
 		 126 aa  80.5  0.000000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.118143  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1899  hypothetical protein  41.49 
 
 		 126 aa  80.5  0.000000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3179  transcriptional regulator family protein  41.41 
 
 		 206 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0560718  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0905  transcriptional regulator family protein  41.41 
 
 		 220 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0438  transcriptional regulator, HxlR family  34.91 
 
 		 128 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0118461 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3455  hypothetical protein  37.76 
 
 		 107 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.365377  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0653  HxlR family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 133 aa  79.7  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.174756 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3059  HxlR family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 124 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23135  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3069  transcriptional regulator, HxlR family  38.54 
 
 		 137 aa  79  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0845928  normal  0.988142 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1166  HxlR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 131 aa  79.3  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329867 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3438  hypothetical protein  39.13 
 
 		 107 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.166485  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4399  hypothetical protein  40.86 
 
 		 124 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4217  hypothetical protein  40.86 
 
 		 124 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4055  transcriptional regulator  40.86 
 
 		 124 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.396916  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3129  MarR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 115 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.576671  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4065  transcriptional regulator  40.86 
 
 		 124 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.966493  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4437  hypothetical protein  40.86 
 
 		 124 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000169623  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1377  MarR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 122 aa  79  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4732  transcriptional regulator, HxlR family  40 
 
 		 128 aa  79.3  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0799  hypothetical protein  40.86 
 
 		 124 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000413922  hitchhiker  1.6907100000000001e-18 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4543  hypothetical protein  40.86 
 
 		 124 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.719807  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4451  hypothetical protein  40.86 
 
 		 124 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000232165  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4340  hypothetical protein  40.86 
 
 		 124 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.43956e-24 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3472  transcriptional regulator  41.3 
 
 		 136 aa  79  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.157036 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2973  transcriptional regulator, HxlR family  41.94 
 
 		 116 aa  79.3  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.116721  normal  0.457372 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1825  transcriptional regulator, HxlR family  46.15 
 
 		 119 aa  79.3  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3339  HxlR family transcriptional regulator  47.78 
 
 		 103 aa  78.6  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2802  transcriptional regulator, HxlR family  37.62 
 
 		 127 aa  78.2  0.00000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0163  HxlR family transcriptional regulator  44.94 
 
 		 144 aa  78.2  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.379253  hitchhiker  0.00857335 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1819  hypothetical protein  38.14 
 
 		 107 aa  78.2  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.100816 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4975  HxlR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 112 aa  78.2  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5063  HxlR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 112 aa  78.2  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5356  HxlR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 112 aa  78.2  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1143  MarR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 120 aa  78.2  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.553828  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1615  putative transcriptional regulatory protein  40.21 
 
 		 144 aa  78.2  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0735023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5039  putative transcriptional regulatory protein  40.2 
 
 		 125 aa  78.2  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3044  HxlR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 124 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000040463  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3585  transcriptional regulator, HxlR family  42.86 
 
 		 108 aa  77.8  0.00000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000738633  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3119  HxlR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 107 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0144533  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2977  transcriptional regulator, HxlR family  42.05 
 
 		 170 aa  78.2  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.369685  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3484  MarR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 109 aa  77.8  0.00000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.816245  normal  0.77191 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17890  predicted transcriptional regulator  40 
 
 		 111 aa  78.2  0.00000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.382985 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5989  transcriptional regulator, HxlR family  38.71 
 
 		 133 aa  77.4  0.00000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1081  HxlR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 125 aa  77.8  0.00000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.124143  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0703  transcriptional regulator, HxlR family  42.39 
 
 		 134 aa  77.4  0.00000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.383651  normal  0.144185 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4169  HxlR family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 124 aa  77.4  0.00000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000193508  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4812  HxlR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 180 aa  77  0.00000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.14161 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2245  transcriptional regulator, HxlR family  39.36 
 
 		 128 aa  77  0.00000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3785  transcriptional regulator, HxlR family  44.71 
 
 		 118 aa  76.6  0.00000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.139955  normal  0.719008 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0618  HxlR family transcriptional regulator  44.32 
 
 		 157 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.953045  hitchhiker  0.00866972 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5625  HxlR family transcriptional regulator  43.52 
 
 		 126 aa  76.6  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.229377  normal  0.277837 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1135  transcriptional regulator, HxlR family  40.86 
 
 		 111 aa  76.6  0.0000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>