More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5989 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5989  transcriptional regulator, HxlR family  100 
 
 		 133 aa  277  3e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3816  HxlR family transcriptional regulator  56.52 
 
 		 120 aa  136  1e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2703  transcriptional regulator, HxlR family  56.9 
 
 		 118 aa  132  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0738  transcriptional regulator, HxlR family  50.83 
 
 		 124 aa  127  6e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.342617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4102  transcriptional regulator, HxlR family  53.15 
 
 		 118 aa  124  5e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149147 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1292  transcriptional regulator, HxlR family  42.74 
 
 		 129 aa  117  3.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.109042  normal  0.938313 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2802  transcriptional regulator, HxlR family  46.67 
 
 		 127 aa  117  3.9999999999999996e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1063  transcriptional regulator  51.52 
 
 		 110 aa  117  4.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0576989  hitchhiker  0.000107529 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5039  putative transcriptional regulatory protein  53.61 
 
 		 125 aa  116  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1135  transcriptional regulator, HxlR family  50 
 
 		 111 aa  115  1.9999999999999998e-25  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1352  putative transcriptional regulator  51.49 
 
 		 155 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000297864  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2255  transcriptional regulator, HxlR family  51.72 
 
 		 159 aa  115  1.9999999999999998e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.395748  normal  0.27377 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4987  transcriptional regulator, HxlR family  49.57 
 
 		 125 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.432063 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0933  transcriptional regulator, HxlR family  51.4 
 
 		 108 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.973186 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3895  HxlR family transcriptional regulator  47.52 
 
 		 120 aa  114  3e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000755308  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3332  hypothetical protein  48.62 
 
 		 126 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3133  hypothetical protein  48.62 
 
 		 126 aa  114  5e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.441436  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3059  HxlR family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 124 aa  114  5e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23135  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3357  hypothetical protein  48.62 
 
 		 129 aa  114  5e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221434  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3379  hypothetical protein  48.62 
 
 		 126 aa  114  5e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1899  hypothetical protein  48.62 
 
 		 126 aa  114  5e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3354  hypothetical protein  48.62 
 
 		 126 aa  114  5e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3120  transcriptional regulator  48.62 
 
 		 126 aa  114  6.9999999999999995e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.118143  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3027  transcriptional regulator  47.71 
 
 		 126 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.710275  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0703  transcriptional regulator, HxlR family  52.04 
 
 		 134 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.383651  normal  0.144185 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2005  transcriptional regulator family protein  51.55 
 
 		 144 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2474  transcriptional regulator, HxlR family  47 
 
 		 115 aa  108  2.0000000000000002e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1437  transcriptional regulator family protein  51.46 
 
 		 141 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6381  HxlR family transcriptional regulator  52.63 
 
 		 139 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.06337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2738  transcriptional regulator family protein  51.55 
 
 		 144 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.115101  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3126  putative transcriptional regulator  51.55 
 
 		 144 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3163  putative transcriptional regulator  51.55 
 
 		 144 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1870  transcriptional regulator family protein  51.55 
 
 		 144 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.284748  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0438  transcriptional regulator, HxlR family  46.67 
 
 		 128 aa  108  3e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0118461 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0952  HxlR family transcriptional regulator  48.96 
 
 		 117 aa  108  3e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.473433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0905  transcriptional regulator family protein  51.55 
 
 		 220 aa  108  3e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3179  transcriptional regulator family protein  51.55 
 
 		 206 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0560718  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2224  transcriptional regulator, HxlR family  50.55 
 
 		 124 aa  107  6e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.647927  normal  0.782754 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3428  hypothetical protein  51.04 
 
 		 107 aa  107  6e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.157748  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2595  transcriptional regulator  50.55 
 
 		 124 aa  107  6e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3957  HxlR family transcriptional regulator  44.17 
 
 		 122 aa  107  6e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3427  hypothetical protein  50 
 
 		 108 aa  107  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3208  hypothetical protein  50 
 
 		 108 aa  106  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3186  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 		 108 aa  106  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1564  HxlR family transcriptional regulator  51.06 
 
 		 119 aa  106  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0663317  normal  0.0831873 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3461  hypothetical protein  50 
 
 		 108 aa  106  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.692347  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1607  transcriptional regulator, HxlR family  49.47 
 
 		 113 aa  106  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000104346  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5072  transcriptional regulator, HxlR family  45.45 
 
 		 117 aa  106  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.550945 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9284  transcriptional regulator (MarR family protein)  53.06 
 
 		 122 aa  105  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3438  hypothetical protein  48.96 
 
 		 107 aa  105  3e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.166485  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3119  HxlR family transcriptional regulator  48.96 
 
 		 107 aa  105  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0144533  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3638  transcriptional regulator, HxlR family  49.47 
 
 		 129 aa  105  3e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.386135  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5176  hypothetical protein  49.5 
 
 		 114 aa  104  4e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0230101 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4933  hypothetical protein  49.5 
 
 		 114 aa  104  4e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4774  transciprtional regulator  49.5 
 
 		 114 aa  104  4e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3110  MarR family transcriptional regulator  48.54 
 
 		 114 aa  104  4e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3114  MarR family transcriptional regulator  48.98 
 
 		 108 aa  104  4e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.448387  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4794  transciprtional regulator  49.5 
 
 		 114 aa  104  4e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5311  hypothetical protein  49.5 
 
 		 114 aa  104  4e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5225  hypothetical protein  49.5 
 
 		 114 aa  104  4e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0808  HxlR family transcriptional regulator  53.26 
 
 		 159 aa  104  4e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.40472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0802  transcriptional regulator, HxlR family  46.88 
 
 		 106 aa  104  4e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0464121  normal  0.73342 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3847  helix-turn-helix HxlR type  45.05 
 
 		 119 aa  104  5e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.803353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3439  hypothetical protein  48.98 
 
 		 108 aa  104  5e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0456  transcriptional regulator, HxlR family  52.17 
 
 		 149 aa  104  5e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.208849  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10173  YdeP  49.47 
 
 		 122 aa  103  6e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1819  hypothetical protein  48.96 
 
 		 107 aa  103  6e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.100816 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3418  putative transcriptional regulator  51.58 
 
 		 132 aa  103  6e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.190487 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1617  transcriptional regulator, HxlR family  52.69 
 
 		 117 aa  103  6e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.19292 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3435  hypothetical protein  48.54 
 
 		 114 aa  103  6e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1834  hypothetical protein  47.57 
 
 		 114 aa  103  6e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.118626  normal  0.386956 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0998  HxlR family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 106 aa  103  7e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00396575 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1349  transcriptional regulator, HxlR family  44.25 
 
 		 128 aa  103  8e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.124535 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3157  helix-turn-helix, HxlR type  50.53 
 
 		 130 aa  103  8e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.38389  normal  0.468508 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1698  putative transcriptional regulator  48.39 
 
 		 113 aa  103  9e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.171254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2974  transcriptional regulator, HxlR family  45.79 
 
 		 160 aa  103  9e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.607542 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01970  transcriptional regulator  48.96 
 
 		 140 aa  102  1e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4895  HxlR family transcriptional regulator  51.58 
 
 		 115 aa  103  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1166  HxlR family transcriptional regulator  48.42 
 
 		 131 aa  102  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329867 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5212  hypothetical protein  51.58 
 
 		 114 aa  102  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0221  transcriptional regulator, HxlR family  48.45 
 
 		 106 aa  102  1e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012384  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3455  hypothetical protein  47.92 
 
 		 107 aa  103  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.365377  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0015  transcriptional regulator, HxlR family  53.93 
 
 		 107 aa  102  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5208  hypothetical protein  49.5 
 
 		 114 aa  102  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3203  hypothetical protein  47.57 
 
 		 114 aa  102  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.135519  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3223  hypothetical protein  49.47 
 
 		 107 aa  102  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.246071  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3200  MarR family transcriptional regulator  49.47 
 
 		 107 aa  102  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0287258  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3115  MarR family transcriptional regulator  51.46 
 
 		 114 aa  102  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.451528  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3129  MarR family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 115 aa  102  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.576671  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3457  hypothetical protein  47.57 
 
 		 114 aa  102  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1179  HxlR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 137 aa  102  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.795487 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3441  hypothetical protein  49.47 
 
 		 107 aa  102  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1541  putative transcriptional regulator  44.12 
 
 		 121 aa  102  2e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000091847  normal  0.207791 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0036  hypothetical protein  49.5 
 
 		 114 aa  102  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000638982 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2087  transcriptional regulator  43.86 
 
 		 116 aa  102  2e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3440  hypothetical protein  55.06 
 
 		 113 aa  101  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3209  hypothetical protein  55.06 
 
 		 113 aa  101  3e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3428  hypothetical protein  51.46 
 
 		 114 aa  101  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4746  HxlR family transcriptional regulator  49.47 
 
 		 116 aa  101  3e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3462  hypothetical protein  55.06 
 
 		 113 aa  101  3e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.457433  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>