More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4987 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4987  transcriptional regulator, HxlR family  100 
 
 		 125 aa  256  5.0000000000000005e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.432063 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5989  transcriptional regulator, HxlR family  49.57 
 
 		 133 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4102  transcriptional regulator, HxlR family  45.54 
 
 		 118 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149147 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2703  transcriptional regulator, HxlR family  47.86 
 
 		 118 aa  110  5e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0738  transcriptional regulator, HxlR family  47.01 
 
 		 124 aa  110  8.000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.342617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3816  HxlR family transcriptional regulator  44.17 
 
 		 120 aa  106  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1292  transcriptional regulator, HxlR family  39.66 
 
 		 129 aa  103  6e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.109042  normal  0.938313 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1352  putative transcriptional regulator  38.1 
 
 		 155 aa  99  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000297864  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1617  transcriptional regulator, HxlR family  45.74 
 
 		 117 aa  98.2  4e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.19292 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0252  transcriptional regulator, HxlR family  45.74 
 
 		 118 aa  97.4  6e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3418  putative transcriptional regulator  45.83 
 
 		 132 aa  96.3  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.190487 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3157  helix-turn-helix, HxlR type  44.79 
 
 		 130 aa  96.7  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.38389  normal  0.468508 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2087  transcriptional regulator  40.35 
 
 		 116 aa  95.9  1e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5039  putative transcriptional regulatory protein  45.74 
 
 		 125 aa  96.3  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3638  transcriptional regulator, HxlR family  41.75 
 
 		 129 aa  95.1  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.386135  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01970  transcriptional regulator  43.27 
 
 		 140 aa  94.7  3e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0013  HxlR family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 126 aa  94  7e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2120  transcriptional regulator, HxlR family  40.82 
 
 		 111 aa  93.6  8e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000013994  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2255  transcriptional regulator, HxlR family  40.21 
 
 		 159 aa  92.8  1e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.395748  normal  0.27377 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3490  HxlR family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 124 aa  93.2  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.462296 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1564  HxlR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 119 aa  92  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0663317  normal  0.0831873 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0952  HxlR family transcriptional regulator  44.33 
 
 		 117 aa  92  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.473433  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9284  transcriptional regulator (MarR family protein)  46.46 
 
 		 122 aa  92  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1109  HxlR family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 116 aa  92  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.116925  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3325  transcriptional regulator, HxlR family  48.86 
 
 		 128 aa  92  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.196974  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0210  hypothetical protein  48.86 
 
 		 131 aa  92  3e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.453071 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1088  MarR family transcriptional regulator  41.49 
 
 		 116 aa  90.9  6e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0703  transcriptional regulator, HxlR family  42.27 
 
 		 134 aa  90.9  6e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.383651  normal  0.144185 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3895  HxlR family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 120 aa  89.4  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000755308  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3484  MarR family transcriptional regulator  41.49 
 
 		 109 aa  89.7  1e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.816245  normal  0.77191 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3332  hypothetical protein  40.68 
 
 		 126 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0456  transcriptional regulator, HxlR family  37.86 
 
 		 149 aa  88.6  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.208849  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5072  transcriptional regulator, HxlR family  41.49 
 
 		 117 aa  88.6  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.550945 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3133  hypothetical protein  39.67 
 
 		 126 aa  88.6  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.441436  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3379  hypothetical protein  39.67 
 
 		 126 aa  88.6  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1684  transcriptional regulator, HxlR family  42.71 
 
 		 119 aa  88.2  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3354  hypothetical protein  39.67 
 
 		 126 aa  88.6  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3357  hypothetical protein  40.68 
 
 		 129 aa  87.8  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221434  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1702  transcriptional regulator, HxlR family  42.71 
 
 		 115 aa  88.2  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.371682  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3120  transcriptional regulator  40.68 
 
 		 126 aa  87.8  4e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.118143  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1899  hypothetical protein  40.68 
 
 		 126 aa  87.8  4e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0015  transcriptional regulator, HxlR family  40.62 
 
 		 107 aa  88.2  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6779  transcriptional regulator, HxlR family  44.21 
 
 		 132 aa  87.8  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.636824 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2311  transcriptional regulator, HxlR family  44.44 
 
 		 124 aa  87.4  5e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.272645  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1352  transcriptional regulator, HxlR family  45.45 
 
 		 112 aa  87.8  5e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000111257  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3027  transcriptional regulator  42.45 
 
 		 126 aa  87.4  6e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.710275  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1489  transcriptional regulator, HxlR family  39.18 
 
 		 130 aa  87.4  6e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.657133  normal  0.735424 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3564  HxlR family transcriptional regulator  43.62 
 
 		 140 aa  87  8e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4243  transcriptional regulator, HxlR family  45.56 
 
 		 105 aa  87  8e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.333534  normal  0.800382 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3059  HxlR family transcriptional regulator  45.74 
 
 		 124 aa  87  8e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23135  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1097  transcriptional regulator, HxlR family  44.68 
 
 		 134 aa  87  8e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.199182  normal  0.222478 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0290  transcriptional regulator protein-like protein  40 
 
 		 154 aa  86.3  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3327  transcriptional regulator, HxlR family  40.95 
 
 		 126 aa  86.3  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000038683 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3427  hypothetical protein  48.39 
 
 		 108 aa  86.3  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1166  HxlR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 131 aa  86.3  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329867 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0178  hypothetical protein  37.96 
 
 		 114 aa  85.5  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0862  transcriptional regulator, HxlR family  43.16 
 
 		 119 aa  85.5  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273669  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5174  HxlR family transcriptional regulator  46.74 
 
 		 119 aa  85.9  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.187988  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2126  helix-turn-helix HxlR type  36.28 
 
 		 129 aa  85.9  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.653298  normal  0.626696 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3785  transcriptional regulator, HxlR family  38.83 
 
 		 118 aa  85.5  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.139955  normal  0.719008 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0373  putative transcriptional regulator  40.22 
 
 		 123 aa  85.5  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0376009  normal  0.449269 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0946  HxlR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 117 aa  85.5  2e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.26449  normal  0.613112 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3847  helix-turn-helix HxlR type  36.7 
 
 		 119 aa  85.5  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.803353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3439  hypothetical protein  48.39 
 
 		 108 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4287  transcriptional regulator, HxlR family  39.18 
 
 		 119 aa  85.1  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.332291  normal  0.235494 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3957  HxlR family transcriptional regulator  38.74 
 
 		 122 aa  84.7  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2490  transcriptional regulator  38.39 
 
 		 120 aa  85.1  3e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0268874 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2667  transcriptional regulator, HxlR family  44.79 
 
 		 132 aa  85.1  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.196875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1143  MarR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 120 aa  85.1  3e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.553828  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2974  transcriptional regulator, HxlR family  38.71 
 
 		 160 aa  85.1  3e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.607542 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0933  transcriptional regulator, HxlR family  39.36 
 
 		 108 aa  84.7  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.973186 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2973  transcriptional regulator, HxlR family  40.66 
 
 		 116 aa  84.3  5e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.116721  normal  0.457372 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4332  transcriptional regulator, HxlR family  43.16 
 
 		 121 aa  84.3  5e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.101336 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2005  transcriptional regulator family protein  40.62 
 
 		 144 aa  84.3  5e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1377  MarR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 122 aa  84.3  5e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3179  transcriptional regulator family protein  40.62 
 
 		 206 aa  84.3  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0560718  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0802  transcriptional regulator, HxlR family  38.95 
 
 		 106 aa  84.3  5e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0464121  normal  0.73342 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3428  hypothetical protein  40 
 
 		 107 aa  84.3  5e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.157748  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0905  transcriptional regulator family protein  40.62 
 
 		 220 aa  84.3  5e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2738  transcriptional regulator family protein  40.62 
 
 		 144 aa  84.3  5e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.115101  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3126  putative transcriptional regulator  40.62 
 
 		 144 aa  84.3  5e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3163  putative transcriptional regulator  40.62 
 
 		 144 aa  84.3  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1870  transcriptional regulator family protein  40.62 
 
 		 144 aa  84.3  5e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.284748  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3119  HxlR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 107 aa  84  6e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0144533  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5668  transcriptional regulator, HxlR family  34.62 
 
 		 119 aa  84  6e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.433337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3513  HxlR family transcriptional regulator  40 
 
 		 125 aa  83.6  7e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000897234  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3208  hypothetical protein  46.81 
 
 		 108 aa  84  7e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3186  MarR family transcriptional regulator  46.81 
 
 		 108 aa  84  7e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3461  hypothetical protein  46.81 
 
 		 108 aa  84  7e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.692347  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0069  transcriptional regulator, HxlR family  43.88 
 
 		 110 aa  84  7e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.700237  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1179  HxlR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 137 aa  84  7e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.795487 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1063  transcriptional regulator  39.36 
 
 		 110 aa  83.6  9e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0576989  hitchhiker  0.000107529 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1437  transcriptional regulator family protein  40.62 
 
 		 141 aa  83.6  9e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0684  transcriptional regulator, HxlR family  43.3 
 
 		 121 aa  83.2  0.000000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3552  HxlR family transcriptional regulator  43.16 
 
 		 125 aa  82.8  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.640344 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0998  HxlR family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 106 aa  83.2  0.000000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00396575 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2802  transcriptional regulator, HxlR family  39.56 
 
 		 127 aa  82.8  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0808  HxlR family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 159 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.40472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6381  HxlR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 139 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.06337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5264  transcriptional regulator, HxlR family  40.38 
 
 		 130 aa  82  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000676248 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>