More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2490 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_2490  transcriptional regulator  100 
 
 		 120 aa  240  3.9999999999999997e-63  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0268874 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2126  helix-turn-helix HxlR type  51.38 
 
 		 129 aa  127  6e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.653298  normal  0.626696 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4102  transcriptional regulator, HxlR family  51.82 
 
 		 118 aa  117  3.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149147 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1292  transcriptional regulator, HxlR family  49.54 
 
 		 129 aa  114  3e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.109042  normal  0.938313 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01970  transcriptional regulator  52.13 
 
 		 140 aa  108  3e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3816  HxlR family transcriptional regulator  44.25 
 
 		 120 aa  106  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2703  transcriptional regulator, HxlR family  43.36 
 
 		 118 aa  102  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9284  transcriptional regulator (MarR family protein)  46.32 
 
 		 122 aa  100  8e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0738  transcriptional regulator, HxlR family  38.94 
 
 		 124 aa  100  9e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.342617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1564  HxlR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 119 aa  98.6  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0663317  normal  0.0831873 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1088  MarR family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 116 aa  98.2  4e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1063  transcriptional regulator  48.04 
 
 		 110 aa  97.4  5e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0576989  hitchhiker  0.000107529 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6381  HxlR family transcriptional regulator  51.04 
 
 		 139 aa  97.4  6e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.06337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2974  transcriptional regulator, HxlR family  47.47 
 
 		 160 aa  97.4  6e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.607542 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2087  transcriptional regulator  44.64 
 
 		 116 aa  97.4  6e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3455  hypothetical protein  44.21 
 
 		 107 aa  97.4  6e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.365377  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3115  MarR family transcriptional regulator  48 
 
 		 114 aa  97.1  7e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.451528  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3129  MarR family transcriptional regulator  44.21 
 
 		 115 aa  97.1  7e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.576671  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0240  helix-turn-helix HxlR type  46.08 
 
 		 118 aa  97.1  8e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.566878  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3785  transcriptional regulator, HxlR family  50.54 
 
 		 118 aa  97.1  8e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.139955  normal  0.719008 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5072  transcriptional regulator, HxlR family  48.94 
 
 		 117 aa  97.1  8e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.550945 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0168  helix-turn-helix HxlR type  46.08 
 
 		 118 aa  97.1  8e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3209  hypothetical protein  48 
 
 		 113 aa  96.7  9e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3462  hypothetical protein  48 
 
 		 113 aa  96.7  9e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.457433  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3440  hypothetical protein  48 
 
 		 113 aa  96.7  9e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3895  HxlR family transcriptional regulator  47.87 
 
 		 120 aa  96.3  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000755308  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3438  hypothetical protein  43.16 
 
 		 107 aa  96.3  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.166485  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5174  HxlR family transcriptional regulator  48.91 
 
 		 119 aa  96.3  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.187988  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2595  transcriptional regulator  46.32 
 
 		 124 aa  96.3  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2224  transcriptional regulator, HxlR family  46.32 
 
 		 124 aa  96.3  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.647927  normal  0.782754 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3187  MarR family transcriptional regulator  47 
 
 		 114 aa  95.5  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0290  transcriptional regulator protein-like protein  46.24 
 
 		 154 aa  95.5  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5989  transcriptional regulator, HxlR family  44.25 
 
 		 133 aa  95.9  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3428  hypothetical protein  47 
 
 		 114 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4895  HxlR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 115 aa  95.1  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5212  hypothetical protein  48.04 
 
 		 114 aa  95.9  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0703  transcriptional regulator, HxlR family  44.57 
 
 		 134 aa  95.1  3e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.383651  normal  0.144185 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4933  hypothetical protein  47.96 
 
 		 114 aa  95.1  3e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4774  transciprtional regulator  47.96 
 
 		 114 aa  95.1  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4794  transciprtional regulator  47.96 
 
 		 114 aa  95.1  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5311  hypothetical protein  47.96 
 
 		 114 aa  95.1  3e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1819  hypothetical protein  42.11 
 
 		 107 aa  94.7  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.100816 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5225  hypothetical protein  47.96 
 
 		 114 aa  95.1  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5176  hypothetical protein  47.96 
 
 		 114 aa  95.1  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0230101 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0015  transcriptional regulator, HxlR family  47.92 
 
 		 107 aa  94.4  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3157  helix-turn-helix, HxlR type  40.59 
 
 		 130 aa  94.4  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.38389  normal  0.468508 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0178  hypothetical protein  39.47 
 
 		 114 aa  94.4  5e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5208  hypothetical protein  48 
 
 		 114 aa  94.4  5e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1437  transcriptional regulator family protein  48.45 
 
 		 141 aa  94.4  5e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0036  hypothetical protein  48 
 
 		 114 aa  94.4  5e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000638982 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3564  HxlR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 140 aa  94  7e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4746  HxlR family transcriptional regulator  50 
 
 		 116 aa  94  7e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2005  transcriptional regulator family protein  48.45 
 
 		 144 aa  94  7e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0905  transcriptional regulator family protein  48.45 
 
 		 220 aa  93.6  7e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2738  transcriptional regulator family protein  48.45 
 
 		 144 aa  94  7e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.115101  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3126  putative transcriptional regulator  48.45 
 
 		 144 aa  94  7e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3163  putative transcriptional regulator  48.45 
 
 		 144 aa  94  7e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1870  transcriptional regulator family protein  48.45 
 
 		 144 aa  94  7e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.284748  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3179  transcriptional regulator family protein  48.45 
 
 		 206 aa  93.6  8e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0560718  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0862  transcriptional regulator, HxlR family  42.55 
 
 		 119 aa  93.6  8e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273669  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1143  MarR family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 120 aa  93.6  8e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.553828  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1405  HxlR family transcriptional regulator  50.51 
 
 		 105 aa  93.6  9e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3119  HxlR family transcriptional regulator  43.16 
 
 		 107 aa  93.2  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0144533  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0456  transcriptional regulator, HxlR family  49.46 
 
 		 149 aa  92.8  1e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.208849  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3428  hypothetical protein  43.16 
 
 		 107 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.157748  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3110  MarR family transcriptional regulator  47 
 
 		 114 aa  92  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2814  helix-turn-helix HxlR type  47.78 
 
 		 110 aa  92.4  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.94291  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2802  transcriptional regulator, HxlR family  44.33 
 
 		 127 aa  92.4  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3435  hypothetical protein  47 
 
 		 114 aa  92  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3418  putative transcriptional regulator  44.68 
 
 		 132 aa  92.8  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.190487 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1834  hypothetical protein  48 
 
 		 114 aa  92.8  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.118626  normal  0.386956 
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2738  HxlR family transcriptional regulator  47.78 
 
 		 110 aa  92.4  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1097  transcriptional regulator, HxlR family  46.32 
 
 		 112 aa  91.7  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3638  transcriptional regulator, HxlR family  43.62 
 
 		 129 aa  91.7  3e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.386135  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0808  HxlR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 159 aa  91.7  3e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.40472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3293  putative transcriptional regulator  47.83 
 
 		 119 aa  91.3  4e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0763403 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3203  hypothetical protein  46 
 
 		 114 aa  90.9  5e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.135519  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3457  hypothetical protein  46 
 
 		 114 aa  90.9  5e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1109  HxlR family transcriptional regulator  42 
 
 		 116 aa  91.3  5e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.116925  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0802  transcriptional regulator, HxlR family  40.95 
 
 		 106 aa  90.9  6e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0464121  normal  0.73342 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1097  transcriptional regulator, HxlR family  42.11 
 
 		 134 aa  90.5  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.199182  normal  0.222478 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0952  HxlR family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 117 aa  90.5  7e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.473433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2474  transcriptional regulator, HxlR family  46.88 
 
 		 115 aa  90.5  7e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1769  transcriptional regulator superfamily  40 
 
 		 112 aa  90.5  7e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000531887  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1317  HxlR family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 122 aa  90.1  8e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000449926  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2255  transcriptional regulator, HxlR family  43.16 
 
 		 159 aa  90.1  8e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.395748  normal  0.27377 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3208  hypothetical protein  47.87 
 
 		 108 aa  90.1  9e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3186  MarR family transcriptional regulator  47.87 
 
 		 108 aa  90.1  9e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1377  MarR family transcriptional regulator  47.31 
 
 		 122 aa  90.1  9e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3461  hypothetical protein  47.87 
 
 		 108 aa  90.1  9e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.692347  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3223  hypothetical protein  41.05 
 
 		 107 aa  89.7  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.246071  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3200  MarR family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 107 aa  89.7  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0287258  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2973  transcriptional regulator, HxlR family  45.16 
 
 		 116 aa  89.7  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.116721  normal  0.457372 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1617  transcriptional regulator, HxlR family  43.81 
 
 		 117 aa  89.7  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.19292 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1661  HxlR family transcriptional regulator  45.92 
 
 		 114 aa  90.1  1e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000438417  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3441  hypothetical protein  41.05 
 
 		 107 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0113  HxlR family transcriptional regulator  47 
 
 		 115 aa  90.1  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.742523  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1607  transcriptional regulator, HxlR family  44.09 
 
 		 113 aa  89  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000104346  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3427  hypothetical protein  47.87 
 
 		 108 aa  89.4  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1352  transcriptional regulator, HxlR family  46.32 
 
 		 112 aa  89.4  2e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000111257  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>