More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2126 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2126  helix-turn-helix HxlR type  100 
 
 		 129 aa  269  8.000000000000001e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.653298  normal  0.626696 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4102  transcriptional regulator, HxlR family  59.29 
 
 		 118 aa  142  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149147 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1292  transcriptional regulator, HxlR family  51.69 
 
 		 129 aa  134  5e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.109042  normal  0.938313 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2490  transcriptional regulator  51.38 
 
 		 120 aa  127  6e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0268874 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3816  HxlR family transcriptional regulator  49.55 
 
 		 120 aa  121  3e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2087  transcriptional regulator  45.79 
 
 		 116 aa  114  3e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2703  transcriptional regulator, HxlR family  45.54 
 
 		 118 aa  114  3.9999999999999997e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0738  transcriptional regulator, HxlR family  45.54 
 
 		 124 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.342617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2474  transcriptional regulator, HxlR family  47.47 
 
 		 115 aa  104  5e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3438  hypothetical protein  43 
 
 		 107 aa  103  8e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.166485  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1819  hypothetical protein  43 
 
 		 107 aa  103  8e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.100816 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1437  transcriptional regulator family protein  45.28 
 
 		 141 aa  103  9e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3455  hypothetical protein  43 
 
 		 107 aa  103  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.365377  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3223  hypothetical protein  44 
 
 		 107 aa  103  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.246071  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3200  MarR family transcriptional regulator  44 
 
 		 107 aa  103  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0287258  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3441  hypothetical protein  44 
 
 		 107 aa  103  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3119  HxlR family transcriptional regulator  44 
 
 		 107 aa  102  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0144533  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3428  hypothetical protein  45 
 
 		 107 aa  102  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.157748  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3129  MarR family transcriptional regulator  43 
 
 		 115 aa  102  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.576671  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3895  HxlR family transcriptional regulator  43.81 
 
 		 120 aa  102  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000755308  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2005  transcriptional regulator family protein  45.28 
 
 		 144 aa  101  3e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3179  transcriptional regulator family protein  44.64 
 
 		 206 aa  101  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0560718  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5989  transcriptional regulator, HxlR family  41.13 
 
 		 133 aa  101  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0905  transcriptional regulator family protein  44.64 
 
 		 220 aa  101  3e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2738  transcriptional regulator family protein  45.28 
 
 		 144 aa  101  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.115101  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3126  putative transcriptional regulator  45.28 
 
 		 144 aa  101  3e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3163  putative transcriptional regulator  44.64 
 
 		 144 aa  102  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1870  transcriptional regulator family protein  45.28 
 
 		 144 aa  101  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.284748  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6381  HxlR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 139 aa  100  5e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.06337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4746  HxlR family transcriptional regulator  48.91 
 
 		 116 aa  100  6e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2974  transcriptional regulator, HxlR family  50.54 
 
 		 160 aa  99.8  1e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.607542 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3847  helix-turn-helix HxlR type  43.93 
 
 		 119 aa  99.8  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.803353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0933  transcriptional regulator, HxlR family  44.33 
 
 		 108 aa  98.6  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.973186 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1088  MarR family transcriptional regulator  44.14 
 
 		 116 aa  99  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09328  hypothetical protein  46.74 
 
 		 103 aa  98.6  3e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3442  transcriptional regulator, HxlR family  44.33 
 
 		 119 aa  98.2  3e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000021737  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01970  transcriptional regulator  45.36 
 
 		 140 aa  98.6  3e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1489  transcriptional regulator, HxlR family  42.2 
 
 		 130 aa  97.4  5e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.657133  normal  0.735424 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0168  helix-turn-helix HxlR type  40.95 
 
 		 118 aa  97.4  6e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0240  helix-turn-helix HxlR type  40.95 
 
 		 118 aa  97.4  6e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.566878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1097  transcriptional regulator, HxlR family  41 
 
 		 112 aa  97.4  6e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1349  transcriptional regulator, HxlR family  41.12 
 
 		 128 aa  97.1  8e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.124535 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1097  transcriptional regulator, HxlR family  43.01 
 
 		 134 aa  96.7  9e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.199182  normal  0.222478 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1081  HxlR family transcriptional regulator  42.73 
 
 		 125 aa  96.3  1e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.124143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0013  HxlR family transcriptional regulator  43.62 
 
 		 126 aa  96.7  1e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1607  transcriptional regulator, HxlR family  44.66 
 
 		 113 aa  95.5  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000104346  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0808  HxlR family transcriptional regulator  48.91 
 
 		 159 aa  95.1  3e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.40472  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0178  hypothetical protein  42.11 
 
 		 114 aa  94.7  4e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1135  transcriptional regulator, HxlR family  41.41 
 
 		 111 aa  94.7  4e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1377  MarR family transcriptional regulator  48.35 
 
 		 122 aa  94.4  5e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2498  HxlR family transcriptional regulator  42.27 
 
 		 127 aa  94.4  5e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5176  hypothetical protein  45.65 
 
 		 114 aa  94  6e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0230101 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4933  hypothetical protein  45.65 
 
 		 114 aa  94  6e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4774  transciprtional regulator  45.65 
 
 		 114 aa  94  6e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4794  transciprtional regulator  45.65 
 
 		 114 aa  94  6e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5311  hypothetical protein  45.65 
 
 		 114 aa  94  6e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5225  hypothetical protein  45.65 
 
 		 114 aa  94  6e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2255  transcriptional regulator, HxlR family  44.21 
 
 		 159 aa  94  6e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.395748  normal  0.27377 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0948  transcriptional regulator, HxlR family  40.86 
 
 		 151 aa  93.6  7e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1564  HxlR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 119 aa  93.6  8e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0663317  normal  0.0831873 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3110  MarR family transcriptional regulator  42.72 
 
 		 114 aa  93.6  9e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3157  helix-turn-helix, HxlR type  41.12 
 
 		 130 aa  93.6  9e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.38389  normal  0.468508 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3435  hypothetical protein  42.72 
 
 		 114 aa  93.6  9e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1317  HxlR family transcriptional regulator  42.2 
 
 		 122 aa  92.8  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000449926  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5072  transcriptional regulator, HxlR family  35.96 
 
 		 117 aa  93.2  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.550945 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1834  hypothetical protein  41.75 
 
 		 114 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.118626  normal  0.386956 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3133  hypothetical protein  43.75 
 
 		 126 aa  92.4  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.441436  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3120  transcriptional regulator  45.45 
 
 		 126 aa  92.4  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.118143  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3027  transcriptional regulator  45.45 
 
 		 126 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.710275  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3379  hypothetical protein  43.75 
 
 		 126 aa  92.4  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5212  hypothetical protein  44.79 
 
 		 114 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1899  hypothetical protein  43.75 
 
 		 126 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2973  transcriptional regulator, HxlR family  41.94 
 
 		 116 aa  92.4  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.116721  normal  0.457372 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3357  hypothetical protein  45.45 
 
 		 129 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221434  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3354  hypothetical protein  43.75 
 
 		 126 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3203  hypothetical protein  41.75 
 
 		 114 aa  91.7  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.135519  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl051  MarR family transcriptional regulator  45.05 
 
 		 101 aa  91.7  3e-18  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3457  hypothetical protein  41.75 
 
 		 114 aa  91.7  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3059  HxlR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 124 aa  92  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23135  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0036  hypothetical protein  44.57 
 
 		 114 aa  91.3  4e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000638982 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4895  HxlR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 115 aa  91.3  4e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2738  HxlR family transcriptional regulator  41.49 
 
 		 110 aa  91.3  4e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2814  helix-turn-helix HxlR type  41.49 
 
 		 110 aa  91.3  4e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.94291  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5208  hypothetical protein  44.57 
 
 		 114 aa  91.3  5e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2370  putative transcriptional regulator  37.93 
 
 		 121 aa  90.9  5e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.132848  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1063  transcriptional regulator  41.05 
 
 		 110 aa  90.9  6e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0576989  hitchhiker  0.000107529 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1698  putative transcriptional regulator  39.62 
 
 		 113 aa  90.5  6e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.171254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0015  transcriptional regulator, HxlR family  44.09 
 
 		 107 aa  90.9  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3332  hypothetical protein  44.44 
 
 		 126 aa  90.9  6e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0952  HxlR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 117 aa  90.5  7e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.473433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3484  MarR family transcriptional regulator  43.16 
 
 		 109 aa  90.5  8e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.816245  normal  0.77191 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1542  transcriptional regulator  40.37 
 
 		 110 aa  90.5  8e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000282269  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0802  transcriptional regulator, HxlR family  42 
 
 		 106 aa  90.5  8e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0464121  normal  0.73342 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3208  hypothetical protein  48.84 
 
 		 108 aa  90.1  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3186  MarR family transcriptional regulator  48.84 
 
 		 108 aa  90.1  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2547  transcriptional regulator, MarR family  46.81 
 
 		 112 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3461  hypothetical protein  48.84 
 
 		 108 aa  90.1  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.692347  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2693  putative transcriptional regulator  36.45 
 
 		 235 aa  90.1  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.863177 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1227  putative transcriptional regulator  38.61 
 
 		 119 aa  89  2e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.916879  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3440  hypothetical protein  44.57 
 
 		 113 aa  89  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>