More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2703 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2703  transcriptional regulator, HxlR family  100 
 
 		 118 aa  242  9.999999999999999e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0738  transcriptional regulator, HxlR family  82.91 
 
 		 124 aa  208  2e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.342617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3816  HxlR family transcriptional regulator  74.36 
 
 		 120 aa  189  1e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5989  transcriptional regulator, HxlR family  56.9 
 
 		 133 aa  132  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4102  transcriptional regulator, HxlR family  48.65 
 
 		 118 aa  118  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149147 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2126  helix-turn-helix HxlR type  45.54 
 
 		 129 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.653298  normal  0.626696 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4987  transcriptional regulator, HxlR family  47.86 
 
 		 125 aa  110  5e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.432063 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3638  transcriptional regulator, HxlR family  51 
 
 		 129 aa  110  6e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.386135  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3418  putative transcriptional regulator  52.63 
 
 		 132 aa  105  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.190487 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3157  helix-turn-helix, HxlR type  50.53 
 
 		 130 aa  105  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.38389  normal  0.468508 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5039  putative transcriptional regulatory protein  49.52 
 
 		 125 aa  105  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1292  transcriptional regulator, HxlR family  41.44 
 
 		 129 aa  104  5e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.109042  normal  0.938313 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1437  transcriptional regulator family protein  52.08 
 
 		 141 aa  103  6e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1097  transcriptional regulator, HxlR family  52.13 
 
 		 134 aa  103  7e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.199182  normal  0.222478 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3163  putative transcriptional regulator  52.08 
 
 		 144 aa  103  8e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2005  transcriptional regulator family protein  52.08 
 
 		 144 aa  103  9e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2738  transcriptional regulator family protein  52.08 
 
 		 144 aa  103  9e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.115101  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3126  putative transcriptional regulator  52.08 
 
 		 144 aa  103  9e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1870  transcriptional regulator family protein  52.08 
 
 		 144 aa  103  9e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.284748  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1063  transcriptional regulator  48.94 
 
 		 110 aa  102  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0576989  hitchhiker  0.000107529 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3179  transcriptional regulator family protein  52.08 
 
 		 206 aa  102  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0560718  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2490  transcriptional regulator  43.36 
 
 		 120 aa  102  2e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0268874 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3895  HxlR family transcriptional regulator  52.87 
 
 		 120 aa  102  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000755308  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0905  transcriptional regulator family protein  52.08 
 
 		 220 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6381  HxlR family transcriptional regulator  50.53 
 
 		 139 aa  100  8e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.06337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0948  transcriptional regulator, HxlR family  48.94 
 
 		 151 aa  100  9e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1135  transcriptional regulator, HxlR family  43.43 
 
 		 111 aa  100  9e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0952  HxlR family transcriptional regulator  49.48 
 
 		 117 aa  99.8  1e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.473433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2255  transcriptional regulator, HxlR family  49.48 
 
 		 159 aa  99.4  2e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.395748  normal  0.27377 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1564  HxlR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 119 aa  99  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0663317  normal  0.0831873 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3059  HxlR family transcriptional regulator  48.18 
 
 		 124 aa  98.6  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23135  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3847  helix-turn-helix HxlR type  43.24 
 
 		 119 aa  97.8  4e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.803353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5177  HxlR family transcriptional regulator  47.87 
 
 		 118 aa  97.8  5e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1349  transcriptional regulator, HxlR family  41.44 
 
 		 128 aa  96.3  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.124535 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1224  transcriptional regulator  46.53 
 
 		 110 aa  96.3  1e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1352  putative transcriptional regulator  48.96 
 
 		 155 aa  95.5  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000297864  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3100  HxlR family transcriptional regulator  48.35 
 
 		 107 aa  95.5  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4746  HxlR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 116 aa  94.7  4e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0703  transcriptional regulator, HxlR family  46.94 
 
 		 134 aa  94.4  5e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.383651  normal  0.144185 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2087  transcriptional regulator  39.47 
 
 		 116 aa  94.4  5e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1097  transcriptional regulator, HxlR family  43.43 
 
 		 112 aa  94.4  5e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2802  transcriptional regulator, HxlR family  45.36 
 
 		 127 aa  94  7e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3332  hypothetical protein  47.52 
 
 		 126 aa  93.6  7e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1819  hypothetical protein  44.33 
 
 		 107 aa  94  7e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.100816 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1317  HxlR family transcriptional regulator  46.32 
 
 		 122 aa  94  7e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000449926  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3357  hypothetical protein  47.52 
 
 		 129 aa  93.6  9e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221434  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0653  HxlR family transcriptional regulator  49.47 
 
 		 133 aa  93.6  9e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.174756 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3438  hypothetical protein  43.3 
 
 		 107 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.166485  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3133  hypothetical protein  47.52 
 
 		 126 aa  93.2  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.441436  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3120  transcriptional regulator  47.52 
 
 		 126 aa  93.2  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.118143  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3027  transcriptional regulator  47.52 
 
 		 126 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.710275  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3379  hypothetical protein  47.52 
 
 		 126 aa  93.2  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0933  transcriptional regulator, HxlR family  42.99 
 
 		 108 aa  93.2  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.973186 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3354  hypothetical protein  47.52 
 
 		 126 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1542  transcriptional regulator  47.37 
 
 		 110 aa  93.2  1e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000282269  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1899  hypothetical protein  47.52 
 
 		 126 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3455  hypothetical protein  43.3 
 
 		 107 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.365377  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1471  transcriptional regulator, HxlR family  47.87 
 
 		 108 aa  92.4  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01970  transcriptional regulator  48.48 
 
 		 140 aa  92.4  2e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2974  transcriptional regulator, HxlR family  47.31 
 
 		 160 aa  92  2e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.607542 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0808  HxlR family transcriptional regulator  51.61 
 
 		 159 aa  92.4  2e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.40472  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3208  hypothetical protein  49.41 
 
 		 108 aa  91.7  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3186  MarR family transcriptional regulator  49.41 
 
 		 108 aa  91.7  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3129  MarR family transcriptional regulator  43.3 
 
 		 115 aa  91.7  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.576671  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3461  hypothetical protein  49.41 
 
 		 108 aa  91.7  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.692347  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0862  transcriptional regulator, HxlR family  47.37 
 
 		 119 aa  91.7  3e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273669  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0015  transcriptional regulator, HxlR family  50 
 
 		 107 aa  91.7  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3339  HxlR family transcriptional regulator  49.4 
 
 		 103 aa  91.3  4e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0438  transcriptional regulator, HxlR family  42.71 
 
 		 128 aa  91.3  4e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0118461 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5208  hypothetical protein  48.28 
 
 		 114 aa  90.9  5e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3439  hypothetical protein  49.41 
 
 		 108 aa  90.9  5e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9284  transcriptional regulator (MarR family protein)  43.56 
 
 		 122 aa  90.9  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5072  transcriptional regulator, HxlR family  44.68 
 
 		 117 aa  90.9  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.550945 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0036  hypothetical protein  48.84 
 
 		 114 aa  90.5  6e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000638982 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3114  MarR family transcriptional regulator  49.41 
 
 		 108 aa  90.5  7e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.448387  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5212  hypothetical protein  48.84 
 
 		 114 aa  90.5  7e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0168  helix-turn-helix HxlR type  45.16 
 
 		 118 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3223  hypothetical protein  42.27 
 
 		 107 aa  90.1  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.246071  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3200  MarR family transcriptional regulator  42.27 
 
 		 107 aa  90.1  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0287258  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1617  transcriptional regulator, HxlR family  50 
 
 		 117 aa  90.1  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.19292 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0240  helix-turn-helix HxlR type  45.16 
 
 		 118 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.566878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3119  HxlR family transcriptional regulator  42.27 
 
 		 107 aa  89.7  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0144533  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3427  hypothetical protein  48.24 
 
 		 108 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3441  hypothetical protein  42.27 
 
 		 107 aa  90.1  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4933  hypothetical protein  47.67 
 
 		 114 aa  88.6  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4774  transciprtional regulator  47.67 
 
 		 114 aa  88.6  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4794  transciprtional regulator  47.67 
 
 		 114 aa  88.6  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3428  hypothetical protein  43.3 
 
 		 107 aa  89.4  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.157748  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5311  hypothetical protein  47.67 
 
 		 114 aa  88.6  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5176  hypothetical protein  47.67 
 
 		 114 aa  88.6  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0230101 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4895  HxlR family transcriptional regulator  47.67 
 
 		 115 aa  89  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10173  YdeP  46.24 
 
 		 122 aa  89  2e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5225  hypothetical protein  47.67 
 
 		 114 aa  88.6  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4705  transcriptional regulator, HxlR family  42.71 
 
 		 148 aa  88.6  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.979262  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1769  transcriptional regulator superfamily  43.93 
 
 		 112 aa  88.6  3e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000531887  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0998  HxlR family transcriptional regulator  46.59 
 
 		 106 aa  87.8  4e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00396575 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2474  transcriptional regulator, HxlR family  41.84 
 
 		 115 aa  87.8  5e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0013  HxlR family transcriptional regulator  41.35 
 
 		 126 aa  87  7e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2595  transcriptional regulator  41.94 
 
 		 124 aa  87  8e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2224  transcriptional regulator, HxlR family  41.94 
 
 		 124 aa  87  8e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.647927  normal  0.782754 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>