More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_2595 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011761  AFE_2595  transcriptional regulator  100 
 
 
124 aa  255  2e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2224  transcriptional regulator, HxlR family  100 
 
 
124 aa  255  2e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.647927  normal  0.782754 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1063  transcriptional regulator  64 
 
 
110 aa  140  8e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0576989  hitchhiker  0.000107529 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1135  transcriptional regulator, HxlR family  51.89 
 
 
111 aa  124  5e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1352  putative transcriptional regulator  50.88 
 
 
155 aa  120  5e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000297864  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1661  HxlR family transcriptional regulator  53.77 
 
 
114 aa  120  5e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000438417  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1143  MarR family transcriptional regulator  52.94 
 
 
120 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.553828  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0998  HxlR family transcriptional regulator  58.24 
 
 
106 aa  118  3e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00396575 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0933  transcriptional regulator, HxlR family  58.06 
 
 
108 aa  117  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.973186 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1607  transcriptional regulator, HxlR family  51.43 
 
 
113 aa  117  7e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000104346  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0802  transcriptional regulator, HxlR family  58.24 
 
 
106 aa  116  9e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0464121  normal  0.73342 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3110  MarR family transcriptional regulator  57 
 
 
114 aa  115  3e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3435  hypothetical protein  57 
 
 
114 aa  114  3e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1834  hypothetical protein  56 
 
 
114 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.118626  normal  0.386956 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01970  transcriptional regulator  59.34 
 
 
140 aa  114  6e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1564  HxlR family transcriptional regulator  58.24 
 
 
119 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0663317  normal  0.0831873 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0221  transcriptional regulator, HxlR family  55 
 
 
106 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012384  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4895  HxlR family transcriptional regulator  56 
 
 
115 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0862  transcriptional regulator, HxlR family  52.83 
 
 
119 aa  111  3e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273669  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3585  transcriptional regulator, HxlR family  51.55 
 
 
108 aa  111  3e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000738633  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3203  hypothetical protein  55 
 
 
114 aa  110  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.135519  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3457  hypothetical protein  55 
 
 
114 aa  110  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5212  hypothetical protein  56 
 
 
114 aa  111  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0905  transcriptional regulator family protein  49.18 
 
 
220 aa  110  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0036  hypothetical protein  56 
 
 
114 aa  110  5e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000638982 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2005  transcriptional regulator family protein  49.18 
 
 
144 aa  110  5e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2802  transcriptional regulator, HxlR family  50.46 
 
 
127 aa  110  5e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3179  transcriptional regulator family protein  49.18 
 
 
206 aa  110  5e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0560718  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2738  transcriptional regulator family protein  49.18 
 
 
144 aa  110  5e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.115101  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3126  putative transcriptional regulator  49.18 
 
 
144 aa  110  5e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1870  transcriptional regulator family protein  49.18 
 
 
144 aa  110  5e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.284748  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0178  hypothetical protein  53 
 
 
114 aa  110  6e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9284  transcriptional regulator (MarR family protein)  53.76 
 
 
122 aa  110  7.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1698  putative transcriptional regulator  52.75 
 
 
113 aa  110  9e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.171254  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5176  hypothetical protein  55 
 
 
114 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0230101 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5208  hypothetical protein  53.77 
 
 
114 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4933  hypothetical protein  55 
 
 
114 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5225  hypothetical protein  55 
 
 
114 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4774  transciprtional regulator  55 
 
 
114 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4794  transciprtional regulator  55 
 
 
114 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5311  hypothetical protein  55 
 
 
114 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0703  transcriptional regulator, HxlR family  49.12 
 
 
134 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.383651  normal  0.144185 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3163  putative transcriptional regulator  49.59 
 
 
144 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2974  transcriptional regulator, HxlR family  55.67 
 
 
160 aa  108  3e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.607542 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0945  MarR family transcriptional regulator  56.04 
 
 
119 aa  108  3e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3187  MarR family transcriptional regulator  52 
 
 
114 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3428  hypothetical protein  52 
 
 
114 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3895  HxlR family transcriptional regulator  49.5 
 
 
120 aa  107  4.0000000000000004e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000755308  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3440  hypothetical protein  52 
 
 
113 aa  107  5e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3209  hypothetical protein  52 
 
 
113 aa  107  5e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3115  MarR family transcriptional regulator  52 
 
 
114 aa  107  5e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.451528  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3462  hypothetical protein  52 
 
 
113 aa  107  5e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.457433  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3785  transcriptional regulator, HxlR family  50 
 
 
118 aa  107  5e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.139955  normal  0.719008 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2474  transcriptional regulator, HxlR family  58.24 
 
 
115 aa  107  6e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5989  transcriptional regulator, HxlR family  50.55 
 
 
133 aa  107  6e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1542  transcriptional regulator  48.96 
 
 
110 aa  107  6e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000282269  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0952  HxlR family transcriptional regulator  53.85 
 
 
117 aa  106  1e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.473433  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3059  HxlR family transcriptional regulator  49.06 
 
 
124 aa  105  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23135  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1437  transcriptional regulator family protein  50 
 
 
141 aa  106  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3357  hypothetical protein  48.18 
 
 
129 aa  106  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221434  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3332  hypothetical protein  53.68 
 
 
126 aa  106  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0290  transcriptional regulator protein-like protein  48.72 
 
 
154 aa  105  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3638  transcriptional regulator, HxlR family  46.49 
 
 
129 aa  105  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.386135  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6381  HxlR family transcriptional regulator  57.14 
 
 
139 aa  105  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.06337  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1224  transcriptional regulator  47.42 
 
 
110 aa  105  2e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1109  HxlR family transcriptional regulator  48.62 
 
 
116 aa  105  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.116925  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0015  transcriptional regulator, HxlR family  57.3 
 
 
107 aa  105  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3133  hypothetical protein  54.95 
 
 
126 aa  105  3e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.441436  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1899  hypothetical protein  48.15 
 
 
126 aa  105  3e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3120  transcriptional regulator  48.15 
 
 
126 aa  105  3e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.118143  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3379  hypothetical protein  54.95 
 
 
126 aa  105  3e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0948  transcriptional regulator, HxlR family  42.4 
 
 
151 aa  104  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3354  hypothetical protein  54.95 
 
 
126 aa  105  3e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1227  putative transcriptional regulator  52.75 
 
 
119 aa  104  4e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.916879  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3027  transcriptional regulator  52.63 
 
 
126 aa  104  4e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.710275  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1377  MarR family transcriptional regulator  51.04 
 
 
122 aa  104  4e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1088  MarR family transcriptional regulator  54.17 
 
 
116 aa  104  4e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1489  transcriptional regulator, HxlR family  51.61 
 
 
130 aa  104  4e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.657133  normal  0.735424 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2255  transcriptional regulator, HxlR family  47.41 
 
 
159 aa  104  5e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.395748  normal  0.27377 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0013  HxlR family transcriptional regulator  43.48 
 
 
126 aa  102  1e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3069  transcriptional regulator, HxlR family  51 
 
 
137 aa  102  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0845928  normal  0.988142 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0808  HxlR family transcriptional regulator  48.7 
 
 
159 aa  102  1e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.40472  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3438  hypothetical protein  49.48 
 
 
107 aa  102  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.166485  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3455  hypothetical protein  49.48 
 
 
107 aa  102  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.365377  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1541  putative transcriptional regulator  43.8 
 
 
121 aa  102  2e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000091847  normal  0.207791 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4975  HxlR family transcriptional regulator  44.9 
 
 
112 aa  102  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3428  hypothetical protein  50.52 
 
 
107 aa  102  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.157748  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5063  HxlR family transcriptional regulator  44.9 
 
 
112 aa  102  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5356  HxlR family transcriptional regulator  44.9 
 
 
112 aa  102  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0456  transcriptional regulator, HxlR family  50 
 
 
149 aa  101  3e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.208849  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1819  hypothetical protein  49.48 
 
 
107 aa  101  3e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.100816 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3223  hypothetical protein  49.48 
 
 
107 aa  101  3e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.246071  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3200  MarR family transcriptional regulator  49.48 
 
 
107 aa  101  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0287258  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3129  MarR family transcriptional regulator  49.48 
 
 
115 aa  101  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.576671  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3441  hypothetical protein  49.48 
 
 
107 aa  101  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4746  HxlR family transcriptional regulator  53.12 
 
 
116 aa  101  3e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1317  HxlR family transcriptional regulator  52.58 
 
 
122 aa  101  4e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000449926  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5039  putative transcriptional regulatory protein  52.75 
 
 
125 aa  100  5e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1097  transcriptional regulator, HxlR family  49.45 
 
 
134 aa  100  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.199182  normal  0.222478 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6402  HxlR family transcriptional regulator  48.04 
 
 
121 aa  100  8e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.299726 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>