More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_0948 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0948  transcriptional regulator, HxlR family  100 
 
 		 151 aa  312  9e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1097  transcriptional regulator, HxlR family  89.15 
 
 		 134 aa  246  8e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.199182  normal  0.222478 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0653  HxlR family transcriptional regulator  69.03 
 
 		 133 aa  169  1e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.174756 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2802  transcriptional regulator, HxlR family  63.3 
 
 		 127 aa  150  5e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0952  HxlR family transcriptional regulator  62.26 
 
 		 117 aa  147  6e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.473433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1564  HxlR family transcriptional regulator  64.95 
 
 		 119 aa  144  6e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0663317  normal  0.0831873 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3418  putative transcriptional regulator  62.5 
 
 		 132 aa  138  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.190487 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3157  helix-turn-helix, HxlR type  60.42 
 
 		 130 aa  138  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.38389  normal  0.468508 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2255  transcriptional regulator, HxlR family  58.72 
 
 		 159 aa  137  6e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.395748  normal  0.27377 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5039  putative transcriptional regulatory protein  57.27 
 
 		 125 aa  135  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3638  transcriptional regulator, HxlR family  57.84 
 
 		 129 aa  133  9e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.386135  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1135  transcriptional regulator, HxlR family  56.38 
 
 		 111 aa  124  6e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3895  HxlR family transcriptional regulator  56.84 
 
 		 120 aa  123  9e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000755308  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0862  transcriptional regulator, HxlR family  56.25 
 
 		 119 aa  121  4e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273669  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3179  transcriptional regulator family protein  47.22 
 
 		 206 aa  120  5e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0560718  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0905  transcriptional regulator family protein  47.22 
 
 		 220 aa  120  5e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3163  putative transcriptional regulator  47.22 
 
 		 144 aa  120  7e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1541  putative transcriptional regulator  54.17 
 
 		 121 aa  120  8e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000091847  normal  0.207791 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2005  transcriptional regulator family protein  46.9 
 
 		 144 aa  120  9e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2738  transcriptional regulator family protein  46.9 
 
 		 144 aa  120  9e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.115101  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3126  putative transcriptional regulator  46.9 
 
 		 144 aa  120  9e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1870  transcriptional regulator family protein  46.9 
 
 		 144 aa  120  9e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.284748  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1437  transcriptional regulator family protein  58.95 
 
 		 141 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3332  hypothetical protein  54 
 
 		 126 aa  117  6e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01970  transcriptional regulator  57.45 
 
 		 140 aa  117  6e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3133  hypothetical protein  47.86 
 
 		 126 aa  117  7.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.441436  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3379  hypothetical protein  47.86 
 
 		 126 aa  117  7.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3354  hypothetical protein  47.86 
 
 		 126 aa  117  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3027  transcriptional regulator  49.11 
 
 		 126 aa  116  9e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.710275  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6381  HxlR family transcriptional regulator  54.81 
 
 		 139 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.06337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3357  hypothetical protein  53 
 
 		 129 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221434  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3059  HxlR family transcriptional regulator  49.11 
 
 		 124 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23135  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3120  transcriptional regulator  53 
 
 		 126 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.118143  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1352  putative transcriptional regulator  52.63 
 
 		 155 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000297864  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1899  hypothetical protein  53 
 
 		 126 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4933  hypothetical protein  47.71 
 
 		 114 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4774  transciprtional regulator  47.71 
 
 		 114 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4794  transciprtional regulator  47.71 
 
 		 114 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5311  hypothetical protein  47.71 
 
 		 114 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5225  hypothetical protein  47.71 
 
 		 114 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5176  hypothetical protein  47.71 
 
 		 114 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0230101 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0703  transcriptional regulator, HxlR family  49.17 
 
 		 134 aa  114  5e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.383651  normal  0.144185 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2474  transcriptional regulator, HxlR family  54.81 
 
 		 115 aa  114  6e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1227  putative transcriptional regulator  50 
 
 		 119 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.916879  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4746  HxlR family transcriptional regulator  54.74 
 
 		 116 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0036  hypothetical protein  47.71 
 
 		 114 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000638982 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4895  HxlR family transcriptional regulator  52.13 
 
 		 115 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5208  hypothetical protein  52.13 
 
 		 114 aa  111  3e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0013  HxlR family transcriptional regulator  52.63 
 
 		 126 aa  111  4.0000000000000004e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5212  hypothetical protein  52.13 
 
 		 114 aa  111  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3110  MarR family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 114 aa  110  5e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1109  HxlR family transcriptional regulator  50.53 
 
 		 116 aa  110  5e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.116925  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1834  hypothetical protein  52.75 
 
 		 114 aa  110  6e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.118626  normal  0.386956 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1088  MarR family transcriptional regulator  52.75 
 
 		 116 aa  110  7.000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3435  hypothetical protein  53.85 
 
 		 114 aa  110  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3585  transcriptional regulator, HxlR family  48.94 
 
 		 108 aa  109  1.0000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000738633  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3203  hypothetical protein  51.06 
 
 		 114 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.135519  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0221  transcriptional regulator, HxlR family  50.51 
 
 		 106 aa  109  1.0000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012384  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1377  MarR family transcriptional regulator  50.49 
 
 		 122 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3457  hypothetical protein  51.06 
 
 		 114 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0808  HxlR family transcriptional regulator  57.61 
 
 		 159 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.40472  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0178  hypothetical protein  47.37 
 
 		 114 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3484  MarR family transcriptional regulator  47.42 
 
 		 109 aa  108  2.0000000000000002e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.816245  normal  0.77191 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0998  HxlR family transcriptional regulator  48.48 
 
 		 106 aa  108  3e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00396575 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1063  transcriptional regulator  48.42 
 
 		 110 aa  107  4.0000000000000004e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0576989  hitchhiker  0.000107529 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1489  transcriptional regulator, HxlR family  51.06 
 
 		 130 aa  107  4.0000000000000004e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.657133  normal  0.735424 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl051  MarR family transcriptional regulator  50.55 
 
 		 101 aa  107  5e-23  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3427  hypothetical protein  50.55 
 
 		 108 aa  107  6e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0373  putative transcriptional regulator  51.58 
 
 		 123 aa  107  6e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0376009  normal  0.449269 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0015  transcriptional regulator, HxlR family  50.54 
 
 		 107 aa  107  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0933  transcriptional regulator, HxlR family  46.32 
 
 		 108 aa  106  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.973186 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1617  transcriptional regulator, HxlR family  45.83 
 
 		 117 aa  106  1e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.19292 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2974  transcriptional regulator, HxlR family  52.63 
 
 		 160 aa  106  1e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.607542 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3208  hypothetical protein  50.55 
 
 		 108 aa  105  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3186  MarR family transcriptional regulator  50.55 
 
 		 108 aa  105  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3461  hypothetical protein  50.55 
 
 		 108 aa  105  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.692347  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5174  HxlR family transcriptional regulator  52.17 
 
 		 119 aa  105  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.187988  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0945  MarR family transcriptional regulator  41.44 
 
 		 119 aa  105  2e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0946  HxlR family transcriptional regulator  46.36 
 
 		 117 aa  105  2e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.26449  normal  0.613112 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1143  MarR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 120 aa  105  2e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.553828  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4437  hypothetical protein  50 
 
 		 124 aa  105  3e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000169623  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4399  hypothetical protein  50 
 
 		 124 aa  105  3e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4217  hypothetical protein  50 
 
 		 124 aa  105  3e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4055  transcriptional regulator  50 
 
 		 124 aa  105  3e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.396916  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4065  transcriptional regulator  50 
 
 		 124 aa  105  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.966493  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0799  hypothetical protein  50 
 
 		 124 aa  105  3e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000413922  hitchhiker  1.6907100000000001e-18 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4543  hypothetical protein  50 
 
 		 124 aa  105  3e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.719807  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4340  hypothetical protein  50 
 
 		 124 aa  105  3e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.43956e-24 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3490  HxlR family transcriptional regulator  53.26 
 
 		 124 aa  105  3e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.462296 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2224  transcriptional regulator, HxlR family  42.4 
 
 		 124 aa  104  3e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.647927  normal  0.782754 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0802  transcriptional regulator, HxlR family  48.42 
 
 		 106 aa  104  3e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0464121  normal  0.73342 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2595  transcriptional regulator  42.4 
 
 		 124 aa  104  3e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4451  hypothetical protein  50 
 
 		 124 aa  105  3e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000232165  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3069  transcriptional regulator, HxlR family  39.53 
 
 		 137 aa  104  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0845928  normal  0.988142 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3439  hypothetical protein  49.45 
 
 		 108 aa  104  4e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1292  transcriptional regulator, HxlR family  48.91 
 
 		 129 aa  104  5e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.109042  normal  0.938313 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3114  MarR family transcriptional regulator  49.45 
 
 		 108 aa  104  5e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.448387  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0456  transcriptional regulator, HxlR family  49.09 
 
 		 149 aa  104  5e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.208849  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0348  HxlR family transcriptional regulator  52.17 
 
 		 107 aa  104  5e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3044  HxlR family transcriptional regulator  51.61 
 
 		 124 aa  104  5e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000040463  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>