More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_1063 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_1063  transcriptional regulator  100 
 
 
110 aa  224  2e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0576989  hitchhiker  0.000107529 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0933  transcriptional regulator, HxlR family  64.15 
 
 
108 aa  145  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.973186 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2224  transcriptional regulator, HxlR family  64 
 
 
124 aa  140  9e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.647927  normal  0.782754 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2595  transcriptional regulator  64 
 
 
124 aa  140  9e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5176  hypothetical protein  64.52 
 
 
114 aa  125  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0230101 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4933  hypothetical protein  64.52 
 
 
114 aa  125  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4774  transciprtional regulator  64.52 
 
 
114 aa  125  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4794  transciprtional regulator  64.52 
 
 
114 aa  125  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5311  hypothetical protein  64.52 
 
 
114 aa  125  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0802  transcriptional regulator, HxlR family  56.84 
 
 
106 aa  126  1.0000000000000001e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0464121  normal  0.73342 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1135  transcriptional regulator, HxlR family  56.7 
 
 
111 aa  126  1.0000000000000001e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5225  hypothetical protein  64.52 
 
 
114 aa  125  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3332  hypothetical protein  57.58 
 
 
126 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1607  transcriptional regulator, HxlR family  57.73 
 
 
113 aa  124  3e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000104346  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3059  HxlR family transcriptional regulator  58.16 
 
 
124 aa  124  4.0000000000000003e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23135  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3133  hypothetical protein  57.58 
 
 
126 aa  124  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.441436  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3120  transcriptional regulator  57.58 
 
 
126 aa  124  4.0000000000000003e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.118143  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3379  hypothetical protein  57.58 
 
 
126 aa  124  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1899  hypothetical protein  57.58 
 
 
126 aa  124  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3357  hypothetical protein  57.58 
 
 
129 aa  124  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221434  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3354  hypothetical protein  57.58 
 
 
126 aa  124  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5208  hypothetical protein  64.52 
 
 
114 aa  124  5e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3027  transcriptional regulator  57.58 
 
 
126 aa  124  5e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.710275  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0036  hypothetical protein  64.52 
 
 
114 aa  124  5e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000638982 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3895  HxlR family transcriptional regulator  57.89 
 
 
120 aa  124  6e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000755308  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5212  hypothetical protein  64.52 
 
 
114 aa  124  6e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3110  MarR family transcriptional regulator  63.44 
 
 
114 aa  122  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4895  HxlR family transcriptional regulator  63.44 
 
 
115 aa  122  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3435  hypothetical protein  63.44 
 
 
114 aa  121  3e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0013  HxlR family transcriptional regulator  55.67 
 
 
126 aa  121  4e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1834  hypothetical protein  62.37 
 
 
114 aa  121  4e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.118626  normal  0.386956 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3203  hypothetical protein  63.44 
 
 
114 aa  120  5e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.135519  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3457  hypothetical protein  63.44 
 
 
114 aa  120  5e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1661  HxlR family transcriptional regulator  58.76 
 
 
114 aa  120  5e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000438417  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0945  MarR family transcriptional regulator  54.74 
 
 
119 aa  119  9.999999999999999e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0905  transcriptional regulator family protein  57.29 
 
 
220 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2005  transcriptional regulator family protein  57.29 
 
 
144 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3179  transcriptional regulator family protein  57.29 
 
 
206 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0560718  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1437  transcriptional regulator family protein  56.12 
 
 
141 aa  118  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6381  HxlR family transcriptional regulator  58.33 
 
 
139 aa  118  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.06337  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1224  transcriptional regulator  57.29 
 
 
110 aa  119  1.9999999999999998e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2738  transcriptional regulator family protein  57.29 
 
 
144 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.115101  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3126  putative transcriptional regulator  57.29 
 
 
144 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3163  putative transcriptional regulator  57.29 
 
 
144 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1870  transcriptional regulator family protein  57.29 
 
 
144 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.284748  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1088  MarR family transcriptional regulator  56 
 
 
116 aa  118  3e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3585  transcriptional regulator, HxlR family  58.16 
 
 
108 aa  117  3.9999999999999996e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000738633  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2974  transcriptional regulator, HxlR family  58.16 
 
 
160 aa  117  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.607542 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1698  putative transcriptional regulator  54.35 
 
 
113 aa  117  4.9999999999999996e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.171254  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5989  transcriptional regulator, HxlR family  51.52 
 
 
133 aa  117  4.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5039  putative transcriptional regulatory protein  53.19 
 
 
125 aa  117  4.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0998  HxlR family transcriptional regulator  55.32 
 
 
106 aa  117  6e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00396575 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1542  transcriptional regulator  54.17 
 
 
110 aa  116  7.999999999999999e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000282269  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0178  hypothetical protein  51.46 
 
 
114 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1352  putative transcriptional regulator  59.78 
 
 
155 aa  115  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000297864  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1143  MarR family transcriptional regulator  50.96 
 
 
120 aa  115  9.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.553828  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3638  transcriptional regulator, HxlR family  52.04 
 
 
129 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.386135  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1227  putative transcriptional regulator  53.85 
 
 
119 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.916879  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3428  hypothetical protein  60.22 
 
 
114 aa  115  3e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3187  MarR family transcriptional regulator  60.22 
 
 
114 aa  115  3e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3115  MarR family transcriptional regulator  60.22 
 
 
114 aa  114  3e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.451528  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1109  HxlR family transcriptional regulator  54.46 
 
 
116 aa  115  3e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.116925  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1317  HxlR family transcriptional regulator  52.94 
 
 
122 aa  115  3e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000449926  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3209  hypothetical protein  60.22 
 
 
113 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3462  hypothetical protein  60.22 
 
 
113 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.457433  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2474  transcriptional regulator, HxlR family  51.46 
 
 
115 aa  114  3.9999999999999997e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3440  hypothetical protein  60.22 
 
 
113 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1564  HxlR family transcriptional regulator  54.74 
 
 
119 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0663317  normal  0.0831873 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0221  transcriptional regulator, HxlR family  53.61 
 
 
106 aa  114  5e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012384  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0862  transcriptional regulator, HxlR family  52.53 
 
 
119 aa  114  6.9999999999999995e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273669  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2802  transcriptional regulator, HxlR family  52.75 
 
 
127 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0015  transcriptional regulator, HxlR family  54.17 
 
 
107 aa  113  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9284  transcriptional regulator (MarR family protein)  54.95 
 
 
122 aa  112  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0808  HxlR family transcriptional regulator  59.78 
 
 
159 aa  113  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.40472  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2120  transcriptional regulator, HxlR family  52.94 
 
 
111 aa  113  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000013994  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3785  transcriptional regulator, HxlR family  50.52 
 
 
118 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.139955  normal  0.719008 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3129  MarR family transcriptional regulator  52.53 
 
 
115 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.576671  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1377  MarR family transcriptional regulator  47.27 
 
 
122 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3455  hypothetical protein  52.53 
 
 
107 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.365377  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3438  hypothetical protein  55.32 
 
 
107 aa  111  3e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.166485  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5072  transcriptional regulator, HxlR family  49.5 
 
 
117 aa  111  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.550945 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3223  hypothetical protein  52.53 
 
 
107 aa  111  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.246071  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3200  MarR family transcriptional regulator  52.53 
 
 
107 aa  111  4.0000000000000004e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0287258  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3441  hypothetical protein  52.53 
 
 
107 aa  111  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1097  transcriptional regulator, HxlR family  51.65 
 
 
134 aa  110  6e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.199182  normal  0.222478 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl051  MarR family transcriptional regulator  53.19 
 
 
101 aa  110  7.000000000000001e-24  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0456  transcriptional regulator, HxlR family  52.53 
 
 
149 aa  110  7.000000000000001e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.208849  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1541  putative transcriptional regulator  52.63 
 
 
121 aa  110  7.000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000091847  normal  0.207791 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3439  hypothetical protein  54.17 
 
 
108 aa  110  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0952  HxlR family transcriptional regulator  52.75 
 
 
117 aa  110  7.000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.473433  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3114  MarR family transcriptional regulator  54.17 
 
 
108 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.448387  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5668  transcriptional regulator, HxlR family  52.58 
 
 
119 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.433337  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3427  hypothetical protein  53.12 
 
 
108 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3564  HxlR family transcriptional regulator  48.08 
 
 
140 aa  109  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3418  putative transcriptional regulator  48.98 
 
 
132 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.190487 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0703  transcriptional regulator, HxlR family  53.26 
 
 
134 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.383651  normal  0.144185 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0946  HxlR family transcriptional regulator  51.92 
 
 
117 aa  108  2.0000000000000002e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.26449  normal  0.613112 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01970  transcriptional regulator  53.85 
 
 
140 aa  109  2.0000000000000002e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1819  hypothetical protein  54.26 
 
 
107 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.100816 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3157  helix-turn-helix, HxlR type  48.98 
 
 
130 aa  108  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.38389  normal  0.468508 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>