More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_0933 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_0933  transcriptional regulator, HxlR family  100 
 
 		 108 aa  221  2e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.973186 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1063  transcriptional regulator  64.15 
 
 		 110 aa  145  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0576989  hitchhiker  0.000107529 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1698  putative transcriptional regulator  58.06 
 
 		 113 aa  125  2.0000000000000002e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.171254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3895  HxlR family transcriptional regulator  50.49 
 
 		 120 aa  124  3e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000755308  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3120  transcriptional regulator  52.34 
 
 		 126 aa  124  6e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.118143  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0802  transcriptional regulator, HxlR family  53.68 
 
 		 106 aa  124  6e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0464121  normal  0.73342 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3133  hypothetical protein  53.92 
 
 		 126 aa  123  7e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.441436  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3379  hypothetical protein  53.92 
 
 		 126 aa  123  7e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3354  hypothetical protein  53.92 
 
 		 126 aa  123  7e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1899  hypothetical protein  53.92 
 
 		 126 aa  123  7e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3357  hypothetical protein  53.92 
 
 		 129 aa  123  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221434  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3027  transcriptional regulator  53.92 
 
 		 126 aa  123  9e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.710275  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3059  HxlR family transcriptional regulator  53.77 
 
 		 124 aa  123  1e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23135  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3332  hypothetical protein  53.92 
 
 		 126 aa  123  1e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0808  HxlR family transcriptional regulator  64.13 
 
 		 159 aa  120  4e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.40472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1607  transcriptional regulator, HxlR family  53.61 
 
 		 113 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000104346  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0013  HxlR family transcriptional regulator  53.19 
 
 		 126 aa  119  1.9999999999999998e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2224  transcriptional regulator, HxlR family  58.06 
 
 		 124 aa  117  3.9999999999999996e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.647927  normal  0.782754 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2595  transcriptional regulator  58.06 
 
 		 124 aa  117  3.9999999999999996e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1143  MarR family transcriptional regulator  53.61 
 
 		 120 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.553828  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2974  transcriptional regulator, HxlR family  58.7 
 
 		 160 aa  117  6e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.607542 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1135  transcriptional regulator, HxlR family  54.26 
 
 		 111 aa  115  9.999999999999999e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1661  HxlR family transcriptional regulator  55.21 
 
 		 114 aa  116  9.999999999999999e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000438417  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5039  putative transcriptional regulatory protein  48.51 
 
 		 125 aa  116  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5989  transcriptional regulator, HxlR family  51.4 
 
 		 133 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3585  transcriptional regulator, HxlR family  50 
 
 		 108 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000738633  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2802  transcriptional regulator, HxlR family  48.96 
 
 		 127 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1317  HxlR family transcriptional regulator  57.61 
 
 		 122 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000449926  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01970  transcriptional regulator  53.12 
 
 		 140 aa  114  6e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3157  helix-turn-helix, HxlR type  52.13 
 
 		 130 aa  113  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.38389  normal  0.468508 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl051  MarR family transcriptional regulator  54.17 
 
 		 101 aa  113  1.0000000000000001e-24  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5212  hypothetical protein  53.61 
 
 		 114 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4933  hypothetical protein  53.76 
 
 		 114 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4774  transciprtional regulator  53.76 
 
 		 114 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3110  MarR family transcriptional regulator  53.76 
 
 		 114 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4794  transciprtional regulator  53.76 
 
 		 114 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5311  hypothetical protein  53.76 
 
 		 114 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5176  hypothetical protein  53.76 
 
 		 114 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0230101 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3418  putative transcriptional regulator  48.51 
 
 		 132 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.190487 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1227  putative transcriptional regulator  50 
 
 		 119 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.916879  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5225  hypothetical protein  53.76 
 
 		 114 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1542  transcriptional regulator  47.52 
 
 		 110 aa  112  2.0000000000000002e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000282269  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3638  transcriptional regulator, HxlR family  46.53 
 
 		 129 aa  111  3e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.386135  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3435  hypothetical protein  53.76 
 
 		 114 aa  111  3e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1834  hypothetical protein  52.69 
 
 		 114 aa  111  3e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.118626  normal  0.386956 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0905  transcriptional regulator family protein  54 
 
 		 220 aa  111  3e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4104  transcriptional regulator, HxlR family  49.48 
 
 		 119 aa  111  3e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.533713  normal  0.821475 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4399  hypothetical protein  52.48 
 
 		 124 aa  111  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4217  hypothetical protein  52.48 
 
 		 124 aa  111  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1564  HxlR family transcriptional regulator  48.96 
 
 		 119 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0663317  normal  0.0831873 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4055  transcriptional regulator  52.48 
 
 		 124 aa  111  4.0000000000000004e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.396916  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0703  transcriptional regulator, HxlR family  54.74 
 
 		 134 aa  111  4.0000000000000004e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.383651  normal  0.144185 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4065  transcriptional regulator  52.48 
 
 		 124 aa  111  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.966493  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2005  transcriptional regulator family protein  53.47 
 
 		 144 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3179  transcriptional regulator family protein  54 
 
 		 206 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0560718  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4437  hypothetical protein  52.48 
 
 		 124 aa  111  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000169623  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4543  hypothetical protein  52.48 
 
 		 124 aa  111  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.719807  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0373  putative transcriptional regulator  48.96 
 
 		 123 aa  111  4.0000000000000004e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0376009  normal  0.449269 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1541  putative transcriptional regulator  48.51 
 
 		 121 aa  110  4.0000000000000004e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000091847  normal  0.207791 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4340  hypothetical protein  52.48 
 
 		 124 aa  111  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.43956e-24 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0799  hypothetical protein  52.48 
 
 		 124 aa  111  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000413922  hitchhiker  1.6907100000000001e-18 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4451  hypothetical protein  52.48 
 
 		 124 aa  111  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000232165  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2738  transcriptional regulator family protein  53.47 
 
 		 144 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.115101  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3126  putative transcriptional regulator  53.47 
 
 		 144 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3163  putative transcriptional regulator  53.47 
 
 		 144 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1870  transcriptional regulator family protein  53.47 
 
 		 144 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.284748  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1166  HxlR family transcriptional regulator  50.52 
 
 		 131 aa  111  4.0000000000000004e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329867 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5208  hypothetical protein  52.58 
 
 		 114 aa  110  5e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3203  hypothetical protein  53.76 
 
 		 114 aa  110  5e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.135519  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3457  hypothetical protein  53.76 
 
 		 114 aa  110  5e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4895  HxlR family transcriptional regulator  52.58 
 
 		 115 aa  110  5e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0036  hypothetical protein  52.58 
 
 		 114 aa  110  5e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000638982 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0945  MarR family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 119 aa  110  6e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1292  transcriptional regulator, HxlR family  45.26 
 
 		 129 aa  110  7.000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.109042  normal  0.938313 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2973  transcriptional regulator, HxlR family  52.08 
 
 		 116 aa  110  7.000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.116721  normal  0.457372 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0862  transcriptional regulator, HxlR family  53.68 
 
 		 119 aa  110  7.000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273669  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0221  transcriptional regulator, HxlR family  47.42 
 
 		 106 aa  109  1.0000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012384  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0015  transcriptional regulator, HxlR family  50 
 
 		 107 aa  109  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1352  putative transcriptional regulator  52.63 
 
 		 155 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000297864  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1097  transcriptional regulator, HxlR family  48.42 
 
 		 134 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.199182  normal  0.222478 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3564  HxlR family transcriptional regulator  49.48 
 
 		 140 aa  109  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3044  HxlR family transcriptional regulator  52.69 
 
 		 124 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000040463  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0438  transcriptional regulator, HxlR family  51.04 
 
 		 128 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0118461 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3438  hypothetical protein  48.94 
 
 		 107 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.166485  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4332  transcriptional regulator, HxlR family  52.63 
 
 		 121 aa  109  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.101336 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3129  MarR family transcriptional regulator  48.42 
 
 		 115 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.576671  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3293  putative transcriptional regulator  48.98 
 
 		 119 aa  108  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0763403 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3455  hypothetical protein  48.42 
 
 		 107 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.365377  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1489  transcriptional regulator, HxlR family  45.92 
 
 		 130 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.657133  normal  0.735424 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1819  hypothetical protein  48.94 
 
 		 107 aa  108  3e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.100816 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3440  hypothetical protein  53.76 
 
 		 113 aa  108  3e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3209  hypothetical protein  53.76 
 
 		 113 aa  108  3e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3115  MarR family transcriptional regulator  53.76 
 
 		 114 aa  108  3e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.451528  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1377  MarR family transcriptional regulator  52.13 
 
 		 122 aa  108  3e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3462  hypothetical protein  53.76 
 
 		 113 aa  108  3e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.457433  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4975  HxlR family transcriptional regulator  48.45 
 
 		 112 aa  108  3e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2476  HxlR family transcriptional regulator  54.64 
 
 		 127 aa  108  3e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5063  HxlR family transcriptional regulator  48.45 
 
 		 112 aa  108  3e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5356  HxlR family transcriptional regulator  48.45 
 
 		 112 aa  108  3e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0851  transcriptional regulator, HxlR family  52.94 
 
 		 116 aa  108  3e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.973222 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>