More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0653 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0653  HxlR family transcriptional regulator  100 
 
 		 133 aa  269  8.000000000000001e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.174756 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1097  transcriptional regulator, HxlR family  71.68 
 
 		 134 aa  173  7e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.199182  normal  0.222478 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0948  transcriptional regulator, HxlR family  69.03 
 
 		 151 aa  169  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2802  transcriptional regulator, HxlR family  62.1 
 
 		 127 aa  154  5.0000000000000005e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0952  HxlR family transcriptional regulator  65.14 
 
 		 117 aa  147  6e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.473433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1564  HxlR family transcriptional regulator  63.64 
 
 		 119 aa  141  2e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0663317  normal  0.0831873 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2255  transcriptional regulator, HxlR family  57.85 
 
 		 159 aa  140  6e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.395748  normal  0.27377 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3638  transcriptional regulator, HxlR family  64.95 
 
 		 129 aa  130  6.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.386135  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3157  helix-turn-helix, HxlR type  63.92 
 
 		 130 aa  130  6.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.38389  normal  0.468508 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3418  putative transcriptional regulator  62 
 
 		 132 aa  129  9e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.190487 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5039  putative transcriptional regulatory protein  60.82 
 
 		 125 aa  124  4.0000000000000003e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1541  putative transcriptional regulator  51.79 
 
 		 121 aa  118  3e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000091847  normal  0.207791 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0703  transcriptional regulator, HxlR family  58.51 
 
 		 134 aa  115  9.999999999999999e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.383651  normal  0.144185 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3895  HxlR family transcriptional regulator  57.45 
 
 		 120 aa  116  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000755308  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0862  transcriptional regulator, HxlR family  49.53 
 
 		 119 aa  114  3.9999999999999997e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273669  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3332  hypothetical protein  54.64 
 
 		 126 aa  113  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3133  hypothetical protein  53.61 
 
 		 126 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.441436  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3120  transcriptional regulator  53.61 
 
 		 126 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.118143  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3027  transcriptional regulator  53.61 
 
 		 126 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.710275  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3354  hypothetical protein  53.61 
 
 		 126 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3379  hypothetical protein  53.61 
 
 		 126 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3357  hypothetical protein  53.61 
 
 		 129 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221434  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1899  hypothetical protein  53.61 
 
 		 126 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3059  HxlR family transcriptional regulator  53.61 
 
 		 124 aa  111  3e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23135  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1352  putative transcriptional regulator  50 
 
 		 155 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000297864  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4746  HxlR family transcriptional regulator  50 
 
 		 116 aa  106  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1489  transcriptional regulator, HxlR family  52.13 
 
 		 130 aa  105  2e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.657133  normal  0.735424 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1437  transcriptional regulator family protein  51.46 
 
 		 141 aa  105  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2476  HxlR family transcriptional regulator  51.06 
 
 		 127 aa  105  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2005  transcriptional regulator family protein  47.11 
 
 		 144 aa  104  4e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2737  transcriptional regulator, HxlR family  48.94 
 
 		 121 aa  104  4e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2738  transcriptional regulator family protein  47.11 
 
 		 144 aa  104  4e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.115101  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3126  putative transcriptional regulator  47.11 
 
 		 144 aa  104  4e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1870  transcriptional regulator family protein  47.11 
 
 		 144 aa  104  4e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.284748  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3163  putative transcriptional regulator  47.11 
 
 		 144 aa  104  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0808  HxlR family transcriptional regulator  52.17 
 
 		 159 aa  103  6e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.40472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3179  transcriptional regulator family protein  51.46 
 
 		 206 aa  103  7e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0560718  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6381  HxlR family transcriptional regulator  51.46 
 
 		 139 aa  103  7e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.06337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0905  transcriptional regulator family protein  51.46 
 
 		 220 aa  103  7e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1135  transcriptional regulator, HxlR family  50 
 
 		 111 aa  103  1e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0456  transcriptional regulator, HxlR family  48.28 
 
 		 149 aa  103  1e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.208849  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2974  transcriptional regulator, HxlR family  52.17 
 
 		 160 aa  103  1e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.607542 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2474  transcriptional regulator, HxlR family  50.49 
 
 		 115 aa  102  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1488  transcriptional regulator, HxlR family  41.67 
 
 		 109 aa  102  2e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.696737 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0933  transcriptional regulator, HxlR family  45.83 
 
 		 108 aa  101  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.973186 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01970  transcriptional regulator  54.35 
 
 		 140 aa  102  3e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1698  putative transcriptional regulator  50 
 
 		 113 aa  101  3e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.171254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1377  MarR family transcriptional regulator  49 
 
 		 122 aa  100  4e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0013  HxlR family transcriptional regulator  51.09 
 
 		 126 aa  101  4e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1317  HxlR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 122 aa  101  4e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000449926  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4399  hypothetical protein  46.08 
 
 		 124 aa  100  5e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4217  hypothetical protein  46.08 
 
 		 124 aa  100  5e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4055  transcriptional regulator  46.08 
 
 		 124 aa  100  5e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.396916  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4065  transcriptional regulator  46.08 
 
 		 124 aa  100  5e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.966493  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1063  transcriptional regulator  46.88 
 
 		 110 aa  100  5e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0576989  hitchhiker  0.000107529 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4451  hypothetical protein  46.08 
 
 		 124 aa  100  5e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000232165  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4543  hypothetical protein  46.08 
 
 		 124 aa  100  5e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.719807  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4340  hypothetical protein  46.08 
 
 		 124 aa  100  5e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.43956e-24 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0799  hypothetical protein  46.08 
 
 		 124 aa  100  6e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000413922  hitchhiker  1.6907100000000001e-18 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4437  hypothetical protein  46.08 
 
 		 124 aa  100  6e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000169623  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1081  HxlR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 125 aa  100  6e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.124143  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4104  transcriptional regulator, HxlR family  48.96 
 
 		 119 aa  100  8e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.533713  normal  0.821475 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0252  transcriptional regulator, HxlR family  42.99 
 
 		 118 aa  99.8  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1607  transcriptional regulator, HxlR family  44.57 
 
 		 113 aa  99.8  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000104346  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1876  HxlR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 122 aa  99.4  2e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1661  HxlR family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 114 aa  98.6  2e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000438417  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5989  transcriptional regulator, HxlR family  44.64 
 
 		 133 aa  99  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1227  putative transcriptional regulator  47.47 
 
 		 119 aa  98.2  3e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.916879  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5264  transcriptional regulator, HxlR family  47.92 
 
 		 130 aa  98.6  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000676248 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1088  MarR family transcriptional regulator  48.91 
 
 		 116 aa  97.8  4e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2814  helix-turn-helix HxlR type  50 
 
 		 110 aa  97.8  4e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.94291  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2738  HxlR family transcriptional regulator  50 
 
 		 110 aa  97.8  4e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3427  hypothetical protein  50 
 
 		 108 aa  97.4  5e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3484  MarR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 109 aa  97.8  5e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.816245  normal  0.77191 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3044  HxlR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 124 aa  97.4  5e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000040463  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4169  HxlR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 124 aa  97.4  6e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000193508  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3208  hypothetical protein  51.09 
 
 		 108 aa  97.1  8e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3186  MarR family transcriptional regulator  51.09 
 
 		 108 aa  97.1  8e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3110  MarR family transcriptional regulator  45.37 
 
 		 114 aa  97.1  8e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3461  hypothetical protein  51.09 
 
 		 108 aa  97.1  8e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.692347  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl051  MarR family transcriptional regulator  48.42 
 
 		 101 aa  96.3  1e-19  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1834  hypothetical protein  44.44 
 
 		 114 aa  96.7  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.118626  normal  0.386956 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1471  transcriptional regulator, HxlR family  41.51 
 
 		 108 aa  96.3  1e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3435  hypothetical protein  45.37 
 
 		 114 aa  96.3  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4895  HxlR family transcriptional regulator  50 
 
 		 115 aa  96.3  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4933  hypothetical protein  48.91 
 
 		 114 aa  95.9  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4774  transciprtional regulator  48.91 
 
 		 114 aa  95.9  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4794  transciprtional regulator  48.91 
 
 		 114 aa  95.9  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5225  hypothetical protein  48.91 
 
 		 114 aa  95.9  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17890  predicted transcriptional regulator  51.09 
 
 		 111 aa  95.9  2e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.382985 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5311  hypothetical protein  48.91 
 
 		 114 aa  95.9  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1262  transcriptional regulator, HxlR family  44.12 
 
 		 148 aa  95.5  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.84733 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09328  hypothetical protein  42.71 
 
 		 103 aa  95.9  2e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5176  hypothetical protein  48.91 
 
 		 114 aa  95.9  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0230101 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1292  transcriptional regulator, HxlR family  49.47 
 
 		 129 aa  95.9  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.109042  normal  0.938313 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5208  hypothetical protein  44.55 
 
 		 114 aa  94.7  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0036  hypothetical protein  46 
 
 		 114 aa  95.1  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000638982 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3114  MarR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 108 aa  95.1  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.448387  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2120  transcriptional regulator, HxlR family  44.79 
 
 		 111 aa  95.1  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000013994  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0341  transcriptional regulator, MarR family  41.84 
 
 		 109 aa  95.1  3e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.45733  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>