More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1876 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1876  HxlR family transcriptional regulator  100 
 
 		 122 aa  245  2e-64  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1352  putative transcriptional regulator  46.94 
 
 		 155 aa  107  7.000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000297864  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0456  transcriptional regulator, HxlR family  46.39 
 
 		 149 aa  104  3e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.208849  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0373  putative transcriptional regulator  47.96 
 
 		 123 aa  104  4e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0376009  normal  0.449269 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5039  putative transcriptional regulatory protein  43.88 
 
 		 125 aa  103  7e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4263  transcriptional regulator, HxlR family  50.54 
 
 		 140 aa  102  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.042978  normal  0.290046 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3895  HxlR family transcriptional regulator  43.88 
 
 		 120 aa  101  4e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000755308  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1317  HxlR family transcriptional regulator  46.39 
 
 		 122 aa  100  6e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000449926  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1347  transcriptional regulator  45.45 
 
 		 132 aa  100  8e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00610853  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0808  HxlR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 159 aa  100  8e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.40472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1143  MarR family transcriptional regulator  45.19 
 
 		 120 aa  100  8e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.553828  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2005  transcriptional regulator family protein  46.39 
 
 		 144 aa  99.8  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0703  transcriptional regulator, HxlR family  38.78 
 
 		 134 aa  99.8  1e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.383651  normal  0.144185 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3157  helix-turn-helix, HxlR type  41.84 
 
 		 130 aa  99.4  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.38389  normal  0.468508 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2738  transcriptional regulator family protein  46.39 
 
 		 144 aa  99.8  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.115101  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3126  putative transcriptional regulator  46.39 
 
 		 144 aa  99.8  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3163  putative transcriptional regulator  46.88 
 
 		 144 aa  99.8  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1870  transcriptional regulator family protein  46.39 
 
 		 144 aa  99.8  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.284748  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2974  transcriptional regulator, HxlR family  40 
 
 		 160 aa  99.4  1e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.607542 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0653  HxlR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 133 aa  99.4  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.174756 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1564  HxlR family transcriptional regulator  46.74 
 
 		 119 aa  99  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0663317  normal  0.0831873 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3418  putative transcriptional regulator  41.84 
 
 		 132 aa  99  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.190487 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6381  HxlR family transcriptional regulator  43.88 
 
 		 139 aa  99.4  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.06337  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2245  transcriptional regulator, HxlR family  43.69 
 
 		 128 aa  99.4  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0905  transcriptional regulator family protein  46.88 
 
 		 220 aa  98.6  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3179  transcriptional regulator family protein  46.88 
 
 		 206 aa  98.6  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0560718  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3059  HxlR family transcriptional regulator  48.91 
 
 		 124 aa  97.8  4e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23135  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1437  transcriptional regulator family protein  45.83 
 
 		 141 aa  97.8  4e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4451  hypothetical protein  46.81 
 
 		 124 aa  97.4  6e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000232165  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4437  hypothetical protein  46.81 
 
 		 124 aa  97.4  6e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000169623  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4399  hypothetical protein  46.81 
 
 		 124 aa  97.4  6e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4217  hypothetical protein  46.81 
 
 		 124 aa  97.4  6e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4055  transcriptional regulator  46.81 
 
 		 124 aa  97.4  6e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.396916  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4065  transcriptional regulator  46.81 
 
 		 124 aa  97.4  6e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.966493  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4543  hypothetical protein  46.81 
 
 		 124 aa  97.4  6e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.719807  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3332  hypothetical protein  48.91 
 
 		 126 aa  97.4  6e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4340  hypothetical protein  46.81 
 
 		 124 aa  97.4  6e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.43956e-24 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0799  hypothetical protein  46.81 
 
 		 124 aa  97.4  6e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000413922  hitchhiker  1.6907100000000001e-18 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1097  transcriptional regulator, HxlR family  40.62 
 
 		 134 aa  97.1  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.199182  normal  0.222478 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3027  transcriptional regulator  48.91 
 
 		 126 aa  97.1  7e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.710275  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1541  putative transcriptional regulator  43.75 
 
 		 121 aa  97.1  7e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000091847  normal  0.207791 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3357  hypothetical protein  48.91 
 
 		 129 aa  97.1  8e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221434  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3133  hypothetical protein  48.91 
 
 		 126 aa  97.1  8e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.441436  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3354  hypothetical protein  48.91 
 
 		 126 aa  97.1  8e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3379  hypothetical protein  48.91 
 
 		 126 aa  97.1  8e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2476  HxlR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 127 aa  97.1  8e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1899  hypothetical protein  48.91 
 
 		 126 aa  96.7  8e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3120  transcriptional regulator  48.91 
 
 		 126 aa  96.7  9e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.118143  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3044  HxlR family transcriptional regulator  45.74 
 
 		 124 aa  96.7  9e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000040463  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1063  transcriptional regulator  44.21 
 
 		 110 aa  96.3  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0576989  hitchhiker  0.000107529 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1081  HxlR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 125 aa  96.3  1e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.124143  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3638  transcriptional regulator, HxlR family  40.82 
 
 		 129 aa  95.9  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.386135  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1377  MarR family transcriptional regulator  45.26 
 
 		 122 aa  95.5  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2255  transcriptional regulator, HxlR family  42.71 
 
 		 159 aa  95.5  2e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.395748  normal  0.27377 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4169  HxlR family transcriptional regulator  45.74 
 
 		 124 aa  95.5  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000193508  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1607  transcriptional regulator, HxlR family  46.53 
 
 		 113 aa  94.7  4e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000104346  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2802  transcriptional regulator, HxlR family  39.64 
 
 		 127 aa  94.7  4e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0952  HxlR family transcriptional regulator  44.57 
 
 		 117 aa  94.4  5e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.473433  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0438  transcriptional regulator, HxlR family  43.69 
 
 		 128 aa  94.4  5e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0118461 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0948  transcriptional regulator, HxlR family  37.89 
 
 		 151 aa  94  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01970  transcriptional regulator  39.58 
 
 		 140 aa  93.6  7e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3110  MarR family transcriptional regulator  46.46 
 
 		 114 aa  93.6  8e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3208  hypothetical protein  44.44 
 
 		 108 aa  93.6  9e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3186  MarR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 108 aa  93.6  9e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3461  hypothetical protein  44.44 
 
 		 108 aa  93.6  9e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.692347  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3435  hypothetical protein  46.46 
 
 		 114 aa  93.6  9e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4287  transcriptional regulator, HxlR family  41.75 
 
 		 119 aa  92.8  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.332291  normal  0.235494 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl051  MarR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 101 aa  93.2  1e-18  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0862  transcriptional regulator, HxlR family  38.61 
 
 		 119 aa  93.2  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273669  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3293  putative transcriptional regulator  39.36 
 
 		 119 aa  93.2  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0763403 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1834  hypothetical protein  45.45 
 
 		 114 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.118626  normal  0.386956 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3427  hypothetical protein  45.45 
 
 		 108 aa  92.8  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0933  transcriptional regulator, HxlR family  39.8 
 
 		 108 aa  93.2  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.973186 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3203  hypothetical protein  45.45 
 
 		 114 aa  92.4  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.135519  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2737  transcriptional regulator, HxlR family  41.94 
 
 		 121 aa  92.4  2e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1088  MarR family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 116 aa  92.4  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3457  hypothetical protein  45.45 
 
 		 114 aa  92.4  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4746  HxlR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 116 aa  92.4  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1135  transcriptional regulator, HxlR family  41.41 
 
 		 111 aa  92.4  2e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1661  HxlR family transcriptional regulator  49.47 
 
 		 114 aa  92.4  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000438417  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5212  hypothetical protein  46.46 
 
 		 114 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4895  HxlR family transcriptional regulator  46.46 
 
 		 115 aa  92.4  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5208  hypothetical protein  46.39 
 
 		 114 aa  91.3  4e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0036  hypothetical protein  46.39 
 
 		 114 aa  91.3  4e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000638982 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5989  transcriptional regulator, HxlR family  39.58 
 
 		 133 aa  91.3  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0247  HxlR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 129 aa  91.3  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.402556  normal  0.678764 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3816  HxlR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 120 aa  91.3  4e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4102  transcriptional regulator, HxlR family  42.42 
 
 		 118 aa  90.9  5e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149147 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0015  transcriptional regulator, HxlR family  42.71 
 
 		 107 aa  90.9  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1109  HxlR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 116 aa  90.9  5e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.116925  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1971  HxlR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 134 aa  90.9  6e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1352  transcriptional regulator, HxlR family  42.55 
 
 		 112 aa  90.9  6e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000111257  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2224  transcriptional regulator, HxlR family  43.16 
 
 		 124 aa  90.1  8e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.647927  normal  0.782754 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2595  transcriptional regulator  43.16 
 
 		 124 aa  90.1  8e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3439  hypothetical protein  44.44 
 
 		 108 aa  90.5  8e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6178  transcriptional regulator, HxlR family  38.38 
 
 		 135 aa  90.1  8e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0462511 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3209  hypothetical protein  45.36 
 
 		 113 aa  89.7  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3115  MarR family transcriptional regulator  45.36 
 
 		 114 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.451528  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0013  HxlR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 126 aa  89.7  1e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3564  HxlR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 140 aa  89.7  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>