More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH9_2738 on replicon NC_009477
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009619  SaurJH1_2814  helix-turn-helix HxlR type  100 
 
 
110 aa  224  3e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.94291  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2738  HxlR family transcriptional regulator  100 
 
 
110 aa  224  3e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0240  helix-turn-helix HxlR type  70.75 
 
 
118 aa  153  7e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.566878  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0168  helix-turn-helix HxlR type  70.75 
 
 
118 aa  153  7e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2974  transcriptional regulator, HxlR family  47.12 
 
 
160 aa  106  8.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.607542 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0703  transcriptional regulator, HxlR family  42.16 
 
 
134 aa  103  1e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.383651  normal  0.144185 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0013  HxlR family transcriptional regulator  49.5 
 
 
126 aa  102  1e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0808  HxlR family transcriptional regulator  46.67 
 
 
159 aa  100  6e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.40472  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1352  putative transcriptional regulator  45.36 
 
 
155 aa  100  9e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000297864  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3442  transcriptional regulator, HxlR family  53.76 
 
 
119 aa  99.8  1e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000021737  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1437  transcriptional regulator family protein  51.58 
 
 
141 aa  98.6  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2005  transcriptional regulator family protein  51.58 
 
 
144 aa  98.6  3e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2738  transcriptional regulator family protein  51.58 
 
 
144 aa  98.6  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.115101  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3126  putative transcriptional regulator  51.58 
 
 
144 aa  98.6  3e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3163  putative transcriptional regulator  51.58 
 
 
144 aa  98.6  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1870  transcriptional regulator family protein  51.58 
 
 
144 aa  98.6  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.284748  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0653  HxlR family transcriptional regulator  50 
 
 
133 aa  97.8  4e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.174756 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3179  transcriptional regulator family protein  51.58 
 
 
206 aa  97.8  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0560718  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0905  transcriptional regulator family protein  51.58 
 
 
220 aa  97.8  4e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1097  transcriptional regulator, HxlR family  50 
 
 
134 aa  97.4  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.199182  normal  0.222478 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01970  transcriptional regulator  44.12 
 
 
140 aa  97.4  6e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3115  MarR family transcriptional regulator  51.11 
 
 
114 aa  97.1  8e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.451528  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3187  MarR family transcriptional regulator  48.45 
 
 
114 aa  96.7  9e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3428  hypothetical protein  48.45 
 
 
114 aa  96.7  9e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0178  hypothetical protein  42.57 
 
 
114 aa  96.3  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3209  hypothetical protein  48.45 
 
 
113 aa  96.7  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4933  hypothetical protein  45.36 
 
 
114 aa  96.7  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4774  transciprtional regulator  45.36 
 
 
114 aa  96.7  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3440  hypothetical protein  48.45 
 
 
113 aa  96.7  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4794  transciprtional regulator  45.36 
 
 
114 aa  96.7  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3462  hypothetical protein  48.45 
 
 
113 aa  96.7  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.457433  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5311  hypothetical protein  45.36 
 
 
114 aa  96.7  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5176  hypothetical protein  45.36 
 
 
114 aa  96.7  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0230101 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5225  hypothetical protein  45.36 
 
 
114 aa  96.7  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2802  transcriptional regulator, HxlR family  50 
 
 
127 aa  96.3  1e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0948  transcriptional regulator, HxlR family  50 
 
 
151 aa  95.5  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4895  HxlR family transcriptional regulator  46.39 
 
 
115 aa  95.9  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5208  hypothetical protein  45.36 
 
 
114 aa  94.4  5e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0036  hypothetical protein  45.36 
 
 
114 aa  94.4  5e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000638982 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0952  HxlR family transcriptional regulator  48.94 
 
 
117 aa  94.4  5e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.473433  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5212  hypothetical protein  45.36 
 
 
114 aa  94.4  5e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6381  HxlR family transcriptional regulator  50.54 
 
 
139 aa  94  7e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.06337  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3203  hypothetical protein  42.86 
 
 
114 aa  92.8  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.135519  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3435  hypothetical protein  45.92 
 
 
114 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3110  MarR family transcriptional regulator  45.92 
 
 
114 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5072  transcriptional regulator, HxlR family  44.44 
 
 
117 aa  93.2  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.550945 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1834  hypothetical protein  45.92 
 
 
114 aa  92.8  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.118626  normal  0.386956 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1088  MarR family transcriptional regulator  43.56 
 
 
116 aa  93.2  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3457  hypothetical protein  42.86 
 
 
114 aa  92.8  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1063  transcriptional regulator  49.44 
 
 
110 aa  92.4  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0576989  hitchhiker  0.000107529 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1541  putative transcriptional regulator  45.19 
 
 
121 aa  92.4  2e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000091847  normal  0.207791 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3895  HxlR family transcriptional regulator  45.83 
 
 
120 aa  92  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000755308  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2490  transcriptional regulator  47.78 
 
 
120 aa  92.4  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0268874 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0015  transcriptional regulator, HxlR family  50 
 
 
107 aa  92.8  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2474  transcriptional regulator, HxlR family  47.31 
 
 
115 aa  91.3  4e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2126  helix-turn-helix HxlR type  41.49 
 
 
129 aa  91.3  4e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.653298  normal  0.626696 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1489  transcriptional regulator, HxlR family  46.74 
 
 
130 aa  90.5  6e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.657133  normal  0.735424 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1564  HxlR family transcriptional regulator  49.45 
 
 
119 aa  90.9  6e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0663317  normal  0.0831873 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3208  hypothetical protein  45.36 
 
 
108 aa  90.5  7e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3186  MarR family transcriptional regulator  45.36 
 
 
108 aa  90.5  7e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9284  transcriptional regulator (MarR family protein)  46.81 
 
 
122 aa  90.5  7e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3461  hypothetical protein  45.36 
 
 
108 aa  90.5  7e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.692347  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1317  HxlR family transcriptional regulator  42.42 
 
 
122 aa  90.5  7e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000449926  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3816  HxlR family transcriptional regulator  47.37 
 
 
120 aa  90.5  7e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2778  transcriptional regulator  48.28 
 
 
112 aa  89.4  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000060346 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1262  transcriptional regulator, HxlR family  46.53 
 
 
148 aa  89.7  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.84733 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2255  transcriptional regulator, HxlR family  50 
 
 
159 aa  89  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.395748  normal  0.27377 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2547  transcriptional regulator, MarR family  48.28 
 
 
112 aa  89.4  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1081  HxlR family transcriptional regulator  47.83 
 
 
125 aa  89.4  2e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.124143  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17890  predicted transcriptional regulator  46.74 
 
 
111 aa  88.6  3e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.382985 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2476  HxlR family transcriptional regulator  47.83 
 
 
127 aa  88.6  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1097  transcriptional regulator, HxlR family  42.71 
 
 
112 aa  88.2  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3638  transcriptional regulator, HxlR family  45.65 
 
 
129 aa  88.6  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.386135  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3427  hypothetical protein  44.33 
 
 
108 aa  87.8  4e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0456  transcriptional regulator, HxlR family  44.9 
 
 
149 aa  88.2  4e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.208849  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2452  helix-turn-helix HxlR type  52.87 
 
 
128 aa  88.2  4e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0348  HxlR family transcriptional regulator  48.28 
 
 
107 aa  87.4  5e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3157  helix-turn-helix, HxlR type  45.56 
 
 
130 aa  87.8  5e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.38389  normal  0.468508 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0386  HxlR family transcriptional regulator  46.53 
 
 
159 aa  87.4  6e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.26449  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3490  HxlR family transcriptional regulator  42.22 
 
 
124 aa  87  7e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.462296 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2387  HxlR family transcriptional regulator  48.28 
 
 
115 aa  86.7  9e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.157796  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3418  putative transcriptional regulator  45.56 
 
 
132 aa  87  9e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.190487 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0862  transcriptional regulator, HxlR family  47.13 
 
 
119 aa  86.7  9e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273669  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3332  hypothetical protein  53.57 
 
 
126 aa  87  9e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2703  transcriptional regulator, HxlR family  45.65 
 
 
118 aa  86.7  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3357  hypothetical protein  52.38 
 
 
129 aa  85.5  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221434  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2737  transcriptional regulator, HxlR family  43.96 
 
 
121 aa  85.5  2e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3133  hypothetical protein  52.38 
 
 
126 aa  85.9  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.441436  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3120  transcriptional regulator  52.38 
 
 
126 aa  85.9  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.118143  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3027  transcriptional regulator  52.38 
 
 
126 aa  85.5  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.710275  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3114  MarR family transcriptional regulator  43.3 
 
 
108 aa  85.5  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.448387  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3379  hypothetical protein  52.38 
 
 
126 aa  85.9  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1899  hypothetical protein  52.38 
 
 
126 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5174  HxlR family transcriptional regulator  44.32 
 
 
119 aa  85.9  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.187988  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3354  hypothetical protein  52.38 
 
 
126 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1109  HxlR family transcriptional regulator  44.94 
 
 
116 aa  85.5  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.116925  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1405  HxlR family transcriptional regulator  46.74 
 
 
105 aa  85.9  2e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4746  HxlR family transcriptional regulator  48.39 
 
 
116 aa  85.9  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0280  HxlR family transcriptional regulator  43 
 
 
116 aa  85.9  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.900551 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3439  hypothetical protein  43.3 
 
 
108 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>