More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1488 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1488  transcriptional regulator, HxlR family  100 
 
 		 109 aa  220  4.9999999999999996e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.696737 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1352  transcriptional regulator, HxlR family  54.35 
 
 		 112 aa  109  1.0000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000111257  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1109  HxlR family transcriptional regulator  48.54 
 
 		 116 aa  108  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.116925  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4104  transcriptional regulator, HxlR family  46.46 
 
 		 119 aa  107  5e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.533713  normal  0.821475 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1607  transcriptional regulator, HxlR family  48.96 
 
 		 113 aa  107  8.000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000104346  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0373  putative transcriptional regulator  49.48 
 
 		 123 aa  106  9.000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0376009  normal  0.449269 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0933  transcriptional regulator, HxlR family  50 
 
 		 108 aa  106  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.973186 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0808  HxlR family transcriptional regulator  48.91 
 
 		 159 aa  106  1e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.40472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4332  transcriptional regulator, HxlR family  46.53 
 
 		 121 aa  105  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.101336 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3564  HxlR family transcriptional regulator  45.54 
 
 		 140 aa  105  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0252  transcriptional regulator, HxlR family  48.96 
 
 		 118 aa  104  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0862  transcriptional regulator, HxlR family  46.94 
 
 		 119 aa  104  3e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273669  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1405  HxlR family transcriptional regulator  50.53 
 
 		 105 aa  104  5e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0013  HxlR family transcriptional regulator  43.43 
 
 		 126 aa  103  6e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1292  transcriptional regulator, HxlR family  44.33 
 
 		 129 aa  103  7e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.109042  normal  0.938313 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4243  transcriptional regulator, HxlR family  45.19 
 
 		 105 aa  103  8e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.333534  normal  0.800382 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3895  HxlR family transcriptional regulator  49.47 
 
 		 120 aa  103  9e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000755308  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1377  MarR family transcriptional regulator  48.98 
 
 		 122 aa  103  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2974  transcriptional regulator, HxlR family  46.74 
 
 		 160 aa  103  1e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.607542 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0703  transcriptional regulator, HxlR family  44.9 
 
 		 134 aa  102  2e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.383651  normal  0.144185 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0653  HxlR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 133 aa  102  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.174756 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1541  putative transcriptional regulator  46.46 
 
 		 121 aa  102  2e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000091847  normal  0.207791 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4102  transcriptional regulator, HxlR family  47.47 
 
 		 118 aa  102  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149147 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2802  transcriptional regulator, HxlR family  41.67 
 
 		 127 aa  101  3e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0178  hypothetical protein  45.36 
 
 		 114 aa  101  4e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1661  HxlR family transcriptional regulator  50 
 
 		 114 aa  101  4e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000438417  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2737  transcriptional regulator, HxlR family  45.1 
 
 		 121 aa  100  7e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0341  transcriptional regulator, MarR family  44 
 
 		 109 aa  99.8  1e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.45733  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01970  transcriptional regulator  48.39 
 
 		 140 aa  99.8  1e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1063  transcriptional regulator  45.1 
 
 		 110 aa  98.6  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0576989  hitchhiker  0.000107529 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1352  putative transcriptional regulator  44.21 
 
 		 155 aa  99  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000297864  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1143  MarR family transcriptional regulator  45.36 
 
 		 120 aa  99  2e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.553828  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3293  putative transcriptional regulator  43.56 
 
 		 119 aa  98.2  3e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0763403 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3119  HxlR family transcriptional regulator  46.32 
 
 		 107 aa  98.2  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0144533  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1088  MarR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 116 aa  98.2  4e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0015  transcriptional regulator, HxlR family  44.79 
 
 		 107 aa  97.8  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0438  transcriptional regulator, HxlR family  44.34 
 
 		 128 aa  98.2  4e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0118461 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3223  hypothetical protein  46.32 
 
 		 107 aa  97.8  5e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.246071  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3200  MarR family transcriptional regulator  46.32 
 
 		 107 aa  97.8  5e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0287258  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3059  HxlR family transcriptional regulator  44.79 
 
 		 124 aa  97.4  5e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23135  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3441  hypothetical protein  46.32 
 
 		 107 aa  97.8  5e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3785  transcriptional regulator, HxlR family  42.71 
 
 		 118 aa  97.1  6e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.139955  normal  0.719008 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3157  helix-turn-helix, HxlR type  40.82 
 
 		 130 aa  97.4  6e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.38389  normal  0.468508 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1531  transcriptional regulator, putative  43.88 
 
 		 115 aa  97.4  6e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1819  hypothetical protein  45.26 
 
 		 107 aa  97.1  7e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.100816 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2387  HxlR family transcriptional regulator  48.35 
 
 		 115 aa  97.1  7e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.157796  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2476  HxlR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 127 aa  97.1  7e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2973  transcriptional regulator, HxlR family  42.42 
 
 		 116 aa  96.7  9e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.116721  normal  0.457372 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4437  hypothetical protein  48.96 
 
 		 124 aa  96.7  9e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000169623  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5039  putative transcriptional regulatory protein  42.86 
 
 		 125 aa  96.7  9e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0799  hypothetical protein  48.96 
 
 		 124 aa  96.7  9e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000413922  hitchhiker  1.6907100000000001e-18 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0456  transcriptional regulator, HxlR family  45.26 
 
 		 149 aa  96.7  1e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.208849  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3438  hypothetical protein  45.26 
 
 		 107 aa  95.9  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.166485  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4399  hypothetical protein  48.96 
 
 		 124 aa  96.7  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4340  hypothetical protein  48.96 
 
 		 124 aa  96.7  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.43956e-24 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4217  hypothetical protein  48.96 
 
 		 124 aa  96.7  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4055  transcriptional regulator  48.96 
 
 		 124 aa  96.7  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.396916  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4065  transcriptional regulator  48.96 
 
 		 124 aa  96.7  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.966493  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3428  hypothetical protein  46.32 
 
 		 107 aa  96.3  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.157748  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2778  transcriptional regulator  44 
 
 		 112 aa  96.7  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000060346 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4543  hypothetical protein  48.96 
 
 		 124 aa  96.7  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.719807  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0684  transcriptional regulator, HxlR family  44.33 
 
 		 121 aa  96.3  1e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3332  hypothetical protein  42.86 
 
 		 126 aa  96.7  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4451  hypothetical protein  48.96 
 
 		 124 aa  96.7  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000232165  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1717  transcriptional regulator, putative  47.19 
 
 		 115 aa  95.9  2e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3133  hypothetical protein  42.86 
 
 		 126 aa  95.9  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.441436  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2245  transcriptional regulator, HxlR family  43 
 
 		 128 aa  95.5  2e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3120  transcriptional regulator  42.86 
 
 		 126 aa  95.9  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.118143  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3027  transcriptional regulator  42.86 
 
 		 126 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.710275  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3638  transcriptional regulator, HxlR family  39.8 
 
 		 129 aa  95.5  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.386135  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3379  hypothetical protein  42.86 
 
 		 126 aa  95.9  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6156  transcriptional regulator protein-like protein  45 
 
 		 125 aa  95.9  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.747118  hitchhiker  0.000536988 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0069  transcriptional regulator, HxlR family  45.16 
 
 		 110 aa  95.9  2e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.700237  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1135  transcriptional regulator, HxlR family  46.32 
 
 		 111 aa  95.5  2e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3354  hypothetical protein  42.86 
 
 		 126 aa  95.9  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1317  HxlR family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 122 aa  95.5  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000449926  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1899  hypothetical protein  42.86 
 
 		 126 aa  95.9  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2547  transcriptional regulator, MarR family  44 
 
 		 112 aa  95.9  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3455  hypothetical protein  45.26 
 
 		 107 aa  95.9  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.365377  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3357  hypothetical protein  42.86 
 
 		 129 aa  95.9  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221434  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4680  transcriptional regulator, HxlR family  46.81 
 
 		 130 aa  95.9  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0170058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0290  transcriptional regulator protein-like protein  42.71 
 
 		 154 aa  95.1  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3129  MarR family transcriptional regulator  45.26 
 
 		 115 aa  95.1  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.576671  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2255  transcriptional regulator, HxlR family  41.05 
 
 		 159 aa  94.7  3e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.395748  normal  0.27377 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1081  HxlR family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 125 aa  95.1  3e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.124143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3418  putative transcriptional regulator  39.8 
 
 		 132 aa  95.1  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.190487 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1564  HxlR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 119 aa  94.7  4e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0663317  normal  0.0831873 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0564  transcriptional regulator, HxlR family  43.16 
 
 		 124 aa  94.7  4e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000666218  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4169  HxlR family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 124 aa  94.7  4e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000193508  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3044  HxlR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 124 aa  94.7  4e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000040463  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1097  transcriptional regulator, HxlR family  40.62 
 
 		 134 aa  94.4  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.199182  normal  0.222478 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0271  transcriptional regulator, HxlR family  45.92 
 
 		 140 aa  94.4  5e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4287  transcriptional regulator, HxlR family  45.65 
 
 		 119 aa  94  6e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.332291  normal  0.235494 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5264  transcriptional regulator, HxlR family  36.11 
 
 		 130 aa  93.6  7e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000676248 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1684  transcriptional regulator, HxlR family  43.75 
 
 		 119 aa  92.8  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1489  transcriptional regulator, HxlR family  37.76 
 
 		 130 aa  92.8  1e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.657133  normal  0.735424 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1702  transcriptional regulator, HxlR family  43.75 
 
 		 115 aa  92.8  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.371682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5668  transcriptional regulator, HxlR family  44.66 
 
 		 119 aa  92.8  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.433337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3484  MarR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 109 aa  93.2  1e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.816245  normal  0.77191 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2499  transcriptional regulator, HxlR family  44.34 
 
 		 119 aa  92.8  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0968705  normal  0.226529 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>