More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4243 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4243  transcriptional regulator, HxlR family  100 
 
 		 105 aa  216  6e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.333534  normal  0.800382 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0252  transcriptional regulator, HxlR family  60.61 
 
 		 118 aa  127  4.0000000000000003e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5548  transcriptional regulator, HxlR family  56.73 
 
 		 107 aa  115  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3895  HxlR family transcriptional regulator  53.19 
 
 		 120 aa  106  9.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000755308  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0802  transcriptional regulator, HxlR family  48.96 
 
 		 106 aa  105  2e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0464121  normal  0.73342 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3438  hypothetical protein  48.42 
 
 		 107 aa  105  3e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.166485  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1819  hypothetical protein  48.42 
 
 		 107 aa  105  3e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.100816 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3427  hypothetical protein  52 
 
 		 108 aa  105  3e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1698  putative transcriptional regulator  50 
 
 		 113 aa  104  4e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.171254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1607  transcriptional regulator, HxlR family  53.85 
 
 		 113 aa  103  7e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000104346  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1488  transcriptional regulator, HxlR family  45.19 
 
 		 109 aa  103  9e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.696737 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3455  hypothetical protein  47.37 
 
 		 107 aa  103  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.365377  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1063  transcriptional regulator  46.88 
 
 		 110 aa  102  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0576989  hitchhiker  0.000107529 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3133  hypothetical protein  44 
 
 		 126 aa  102  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.441436  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1899  hypothetical protein  44 
 
 		 126 aa  102  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3120  transcriptional regulator  44 
 
 		 126 aa  102  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.118143  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3027  transcriptional regulator  44 
 
 		 126 aa  102  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.710275  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3129  MarR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 115 aa  102  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.576671  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3428  hypothetical protein  47.37 
 
 		 107 aa  102  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.157748  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3379  hypothetical protein  44 
 
 		 126 aa  102  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3354  hypothetical protein  44 
 
 		 126 aa  102  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2802  transcriptional regulator, HxlR family  48.42 
 
 		 127 aa  102  2e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3357  hypothetical protein  44 
 
 		 129 aa  102  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221434  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3439  hypothetical protein  50 
 
 		 108 aa  101  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3332  hypothetical protein  44 
 
 		 126 aa  101  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0373  putative transcriptional regulator  47.92 
 
 		 123 aa  101  4e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0376009  normal  0.449269 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3223  hypothetical protein  48.91 
 
 		 107 aa  100  5e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.246071  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3200  MarR family transcriptional regulator  48.91 
 
 		 107 aa  100  5e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0287258  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3441  hypothetical protein  48.91 
 
 		 107 aa  100  5e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3208  hypothetical protein  49 
 
 		 108 aa  100  6e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3186  MarR family transcriptional regulator  49 
 
 		 108 aa  100  6e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3461  hypothetical protein  49 
 
 		 108 aa  100  6e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.692347  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3119  HxlR family transcriptional regulator  46.32 
 
 		 107 aa  100  6e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0144533  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0933  transcriptional regulator, HxlR family  47.78 
 
 		 108 aa  100  8e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.973186 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1661  HxlR family transcriptional regulator  53.26 
 
 		 114 aa  100  8e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000438417  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1292  transcriptional regulator, HxlR family  45.19 
 
 		 129 aa  99.8  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.109042  normal  0.938313 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3490  HxlR family transcriptional regulator  45.54 
 
 		 124 aa  99.4  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.462296 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3203  hypothetical protein  48.35 
 
 		 114 aa  99  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.135519  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3457  hypothetical protein  48.35 
 
 		 114 aa  99  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3059  HxlR family transcriptional regulator  42 
 
 		 124 aa  99  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23135  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3110  MarR family transcriptional regulator  48.35 
 
 		 114 aa  98.6  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1541  putative transcriptional regulator  47.42 
 
 		 121 aa  98.6  3e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000091847  normal  0.207791 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0013  HxlR family transcriptional regulator  48.89 
 
 		 126 aa  98.6  3e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5176  hypothetical protein  46.32 
 
 		 114 aa  97.8  4e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0230101 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3435  hypothetical protein  48.35 
 
 		 114 aa  97.8  4e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5225  hypothetical protein  46.32 
 
 		 114 aa  97.8  4e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4933  hypothetical protein  46.32 
 
 		 114 aa  97.8  4e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4774  transciprtional regulator  46.32 
 
 		 114 aa  97.8  4e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3114  MarR family transcriptional regulator  49 
 
 		 108 aa  98.2  4e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.448387  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4794  transciprtional regulator  46.32 
 
 		 114 aa  97.8  4e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5989  transcriptional regulator, HxlR family  44.21 
 
 		 133 aa  97.8  4e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5311  hypothetical protein  46.32 
 
 		 114 aa  97.8  4e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1834  hypothetical protein  48.35 
 
 		 114 aa  98.2  4e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.118626  normal  0.386956 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2595  transcriptional regulator  48.89 
 
 		 124 aa  97.4  5e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2224  transcriptional regulator, HxlR family  48.89 
 
 		 124 aa  97.4  5e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.647927  normal  0.782754 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1377  MarR family transcriptional regulator  47.47 
 
 		 122 aa  97.1  8e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5208  hypothetical protein  48.35 
 
 		 114 aa  96.3  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0280  HxlR family transcriptional regulator  45.92 
 
 		 116 aa  96.7  1e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.900551 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3484  MarR family transcriptional regulator  44.79 
 
 		 109 aa  96.3  1e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.816245  normal  0.77191 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4895  HxlR family transcriptional regulator  48.35 
 
 		 115 aa  96.7  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1352  transcriptional regulator, HxlR family  48.96 
 
 		 112 aa  96.3  1e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000111257  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0036  hypothetical protein  48.35 
 
 		 114 aa  96.3  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000638982 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0998  HxlR family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 106 aa  96.3  1e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00396575 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3585  transcriptional regulator, HxlR family  47.87 
 
 		 108 aa  95.9  2e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000738633  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1352  putative transcriptional regulator  49.46 
 
 		 155 aa  95.9  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000297864  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1143  MarR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 120 aa  95.9  2e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.553828  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0178  hypothetical protein  44.21 
 
 		 114 aa  95.1  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1489  transcriptional regulator, HxlR family  44.44 
 
 		 130 aa  95.1  3e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.657133  normal  0.735424 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1166  HxlR family transcriptional regulator  46 
 
 		 131 aa  95.1  3e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329867 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9284  transcriptional regulator (MarR family protein)  43.56 
 
 		 122 aa  94.7  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5174  HxlR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 119 aa  94.7  4e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.187988  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5212  hypothetical protein  47.25 
 
 		 114 aa  94.4  4e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2474  transcriptional regulator, HxlR family  44.57 
 
 		 115 aa  94.4  4e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0952  HxlR family transcriptional regulator  45.74 
 
 		 117 aa  94.4  5e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.473433  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0456  transcriptional regulator, HxlR family  50.55 
 
 		 149 aa  94.4  5e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.208849  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0221  transcriptional regulator, HxlR family  50 
 
 		 106 aa  94  7e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012384  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2693  putative transcriptional regulator  47.37 
 
 		 235 aa  94  7e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.863177 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4102  transcriptional regulator, HxlR family  46.39 
 
 		 118 aa  93.6  8e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149147 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1564  HxlR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 119 aa  93.6  9e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0663317  normal  0.0831873 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6402  HxlR family transcriptional regulator  45.65 
 
 		 121 aa  93.6  9e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.299726 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3187  MarR family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 114 aa  93.2  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2005  transcriptional regulator family protein  45.65 
 
 		 144 aa  93.2  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3527  HxlR family transcriptional regulator  45.65 
 
 		 117 aa  92.8  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.502253 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3179  transcriptional regulator family protein  45.65 
 
 		 206 aa  92.8  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0560718  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01970  transcriptional regulator  45.65 
 
 		 140 aa  92.8  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3785  transcriptional regulator, HxlR family  45.26 
 
 		 118 aa  92.8  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.139955  normal  0.719008 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4370  HxlR family transcriptional regulator  45.65 
 
 		 117 aa  92.8  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3996  HxlR family transcriptional regulator  45.65 
 
 		 117 aa  92.8  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.208473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1870  transcriptional regulator family protein  45.65 
 
 		 144 aa  93.2  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.284748  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3428  hypothetical protein  44.68 
 
 		 114 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1227  putative transcriptional regulator  46.67 
 
 		 119 aa  93.2  1e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.916879  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0684  transcriptional regulator, HxlR family  43 
 
 		 121 aa  93.2  1e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0905  transcriptional regulator family protein  45.65 
 
 		 220 aa  92.8  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1542  transcriptional regulator  45.92 
 
 		 110 aa  93.2  1e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000282269  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2738  transcriptional regulator family protein  45.65 
 
 		 144 aa  93.2  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.115101  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3126  putative transcriptional regulator  45.65 
 
 		 144 aa  93.2  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3163  putative transcriptional regulator  45.65 
 
 		 144 aa  93.2  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0328  transcriptional regulator, HxlR family  48.31 
 
 		 120 aa  92.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.122093  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0862  transcriptional regulator, HxlR family  44.9 
 
 		 119 aa  92.4  2e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273669  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1702  transcriptional regulator, HxlR family  38.46 
 
 		 115 aa  92  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.371682  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>