More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0328 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_0328  transcriptional regulator, HxlR family  100 
 
 		 120 aa  246  9e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.122093  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3490  HxlR family transcriptional regulator  75 
 
 		 124 aa  184  4e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.462296 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5174  HxlR family transcriptional regulator  76.7 
 
 		 119 aa  173  6e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.187988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0337  transcriptional regulator  67.24 
 
 		 128 aa  158  3e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4370  HxlR family transcriptional regulator  68.63 
 
 		 117 aa  155  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3996  HxlR family transcriptional regulator  68.63 
 
 		 117 aa  155  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.208473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3527  HxlR family transcriptional regulator  68.63 
 
 		 117 aa  155  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.502253 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6402  HxlR family transcriptional regulator  67.65 
 
 		 121 aa  155  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.299726 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0280  HxlR family transcriptional regulator  63.81 
 
 		 116 aa  154  3e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.900551 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0348  HxlR family transcriptional regulator  68.32 
 
 		 107 aa  154  4e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1752  hypothetical protein  57.84 
 
 		 112 aa  132  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0613542  normal  0.0473163 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2452  helix-turn-helix HxlR type  54.17 
 
 		 128 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2498  HxlR family transcriptional regulator  52 
 
 		 127 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1815  HxlR family transcriptional regulator  54.08 
 
 		 125 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.589379 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1527  transcriptional regulator, HxlR family  54.84 
 
 		 125 aa  107  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0577409  normal  0.0923704 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5288  transcriptional regulator, HxlR family  51.4 
 
 		 122 aa  107  7.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2802  transcriptional regulator, HxlR family  48.08 
 
 		 127 aa  106  1e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0703  transcriptional regulator, HxlR family  50.94 
 
 		 134 aa  106  1e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.383651  normal  0.144185 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0013  HxlR family transcriptional regulator  53.93 
 
 		 126 aa  105  2e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0862  transcriptional regulator, HxlR family  56.82 
 
 		 119 aa  105  2e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273669  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1607  transcriptional regulator, HxlR family  53.12 
 
 		 113 aa  105  3e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000104346  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3895  HxlR family transcriptional regulator  53.93 
 
 		 120 aa  103  7e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000755308  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1564  HxlR family transcriptional regulator  45.71 
 
 		 119 aa  102  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0663317  normal  0.0831873 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1661  HxlR family transcriptional regulator  52.08 
 
 		 114 aa  100  5e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000438417  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1698  putative transcriptional regulator  58.14 
 
 		 113 aa  100  5e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.171254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0015  transcriptional regulator, HxlR family  48.48 
 
 		 107 aa  100  7e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0952  HxlR family transcriptional regulator  49 
 
 		 117 aa  100  9e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.473433  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4933  hypothetical protein  51.65 
 
 		 114 aa  99.4  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4774  transciprtional regulator  51.65 
 
 		 114 aa  99.4  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4794  transciprtional regulator  51.65 
 
 		 114 aa  99.4  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1352  putative transcriptional regulator  54.12 
 
 		 155 aa  99.4  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000297864  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5311  hypothetical protein  51.65 
 
 		 114 aa  99.4  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1135  transcriptional regulator, HxlR family  48.91 
 
 		 111 aa  99.8  1e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5225  hypothetical protein  51.65 
 
 		 114 aa  99.4  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5176  hypothetical protein  51.65 
 
 		 114 aa  99.4  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0230101 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0808  HxlR family transcriptional regulator  54.12 
 
 		 159 aa  98.6  2e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.40472  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3110  MarR family transcriptional regulator  50.55 
 
 		 114 aa  98.6  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0611  ArsR family transcriptional regulator  48.74 
 
 		 127 aa  98.6  3e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1097  transcriptional regulator, HxlR family  52.81 
 
 		 134 aa  98.6  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.199182  normal  0.222478 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3435  hypothetical protein  50.55 
 
 		 114 aa  98.2  3e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1834  hypothetical protein  49.45 
 
 		 114 aa  98.2  4e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.118626  normal  0.386956 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3428  hypothetical protein  50.56 
 
 		 107 aa  97.8  4e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.157748  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3208  hypothetical protein  48.91 
 
 		 108 aa  97.8  5e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3186  MarR family transcriptional regulator  48.91 
 
 		 108 aa  97.8  5e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3427  hypothetical protein  50 
 
 		 108 aa  97.4  5e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3461  hypothetical protein  48.91 
 
 		 108 aa  97.8  5e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.692347  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0948  transcriptional regulator, HxlR family  51.69 
 
 		 151 aa  97.4  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1143  MarR family transcriptional regulator  45.05 
 
 		 120 aa  97.1  7e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.553828  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3203  hypothetical protein  49.45 
 
 		 114 aa  97.1  8e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.135519  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3457  hypothetical protein  49.45 
 
 		 114 aa  97.1  8e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1227  putative transcriptional regulator  54.35 
 
 		 119 aa  96.7  9e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.916879  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4895  HxlR family transcriptional regulator  50.55 
 
 		 115 aa  96.7  9e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5208  hypothetical protein  50.55 
 
 		 114 aa  96.3  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3223  hypothetical protein  50.56 
 
 		 107 aa  96.3  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.246071  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3200  MarR family transcriptional regulator  50.56 
 
 		 107 aa  96.3  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0287258  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5039  putative transcriptional regulatory protein  46.3 
 
 		 125 aa  96.3  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0036  hypothetical protein  50.55 
 
 		 114 aa  95.9  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000638982 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1819  hypothetical protein  49.44 
 
 		 107 aa  96.3  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.100816 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4102  transcriptional regulator, HxlR family  52.22 
 
 		 118 aa  96.7  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149147 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0373  putative transcriptional regulator  51.04 
 
 		 123 aa  96.3  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0376009  normal  0.449269 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0933  transcriptional regulator, HxlR family  47.06 
 
 		 108 aa  96.3  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.973186 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3441  hypothetical protein  50.56 
 
 		 107 aa  96.3  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2974  transcriptional regulator, HxlR family  50.59 
 
 		 160 aa  95.9  2e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.607542 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1088  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 		 116 aa  95.5  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3439  hypothetical protein  50 
 
 		 108 aa  95.9  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1541  putative transcriptional regulator  46.53 
 
 		 121 aa  95.9  2e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000091847  normal  0.207791 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2474  transcriptional regulator, HxlR family  48.42 
 
 		 115 aa  95.5  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01970  transcriptional regulator  48.04 
 
 		 140 aa  95.9  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0210  hypothetical protein  52.33 
 
 		 131 aa  95.1  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.453071 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3438  hypothetical protein  48.31 
 
 		 107 aa  95.1  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.166485  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2973  transcriptional regulator, HxlR family  56.67 
 
 		 116 aa  94.7  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.116721  normal  0.457372 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3027  transcriptional regulator  43.52 
 
 		 126 aa  95.1  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.710275  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1292  transcriptional regulator, HxlR family  48.42 
 
 		 129 aa  95.1  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.109042  normal  0.938313 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3455  hypothetical protein  48.31 
 
 		 107 aa  95.1  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.365377  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3119  HxlR family transcriptional regulator  50.56 
 
 		 107 aa  95.1  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0144533  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1405  HxlR family transcriptional regulator  50 
 
 		 105 aa  95.1  3e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3129  MarR family transcriptional regulator  48.31 
 
 		 115 aa  94.7  4e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.576671  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3325  transcriptional regulator, HxlR family  51.16 
 
 		 128 aa  94.7  4e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.196974  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3442  transcriptional regulator, HxlR family  51.09 
 
 		 119 aa  94.4  5e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000021737  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5212  hypothetical protein  49.45 
 
 		 114 aa  94.4  5e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2387  HxlR family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 115 aa  94  6e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.157796  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4104  transcriptional regulator, HxlR family  54.44 
 
 		 119 aa  94  6e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.533713  normal  0.821475 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3044  HxlR family transcriptional regulator  50.6 
 
 		 124 aa  93.6  8e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000040463  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3354  hypothetical protein  42.59 
 
 		 126 aa  92.8  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4399  hypothetical protein  49.4 
 
 		 124 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3133  hypothetical protein  42.59 
 
 		 126 aa  92.8  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.441436  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4217  hypothetical protein  49.4 
 
 		 124 aa  93.2  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2778  transcriptional regulator  45.05 
 
 		 112 aa  92.8  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000060346 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3120  transcriptional regulator  42.59 
 
 		 126 aa  93.2  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.118143  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4340  hypothetical protein  49.4 
 
 		 124 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.43956e-24 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4055  transcriptional regulator  49.4 
 
 		 124 aa  93.2  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.396916  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3059  HxlR family transcriptional regulator  49.44 
 
 		 124 aa  93.2  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23135  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4065  transcriptional regulator  49.4 
 
 		 124 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.966493  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3379  hypothetical protein  42.59 
 
 		 126 aa  92.8  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4543  hypothetical protein  49.4 
 
 		 124 aa  93.2  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.719807  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3332  hypothetical protein  42.59 
 
 		 126 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1899  hypothetical protein  42.59 
 
 		 126 aa  92.8  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3638  transcriptional regulator, HxlR family  45.37 
 
 		 129 aa  92.8  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.386135  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0799  hypothetical protein  49.4 
 
 		 124 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000413922  hitchhiker  1.6907100000000001e-18 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4451  hypothetical protein  49.4 
 
 		 124 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000232165  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>