More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_0611 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_0611  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 127 aa  258  2e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3490  HxlR family transcriptional regulator  46.72 
 
 		 124 aa  104  4e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.462296 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0280  HxlR family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 116 aa  101  4e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.900551 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0328  transcriptional regulator, HxlR family  48.74 
 
 		 120 aa  98.6  3e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.122093  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3527  HxlR family transcriptional regulator  48.04 
 
 		 117 aa  95.5  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.502253 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4370  HxlR family transcriptional regulator  48.04 
 
 		 117 aa  95.5  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6402  HxlR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 121 aa  95.9  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.299726 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3996  HxlR family transcriptional regulator  48.04 
 
 		 117 aa  95.5  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.208473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3895  HxlR family transcriptional regulator  47.57 
 
 		 120 aa  95.1  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000755308  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0348  HxlR family transcriptional regulator  46.46 
 
 		 107 aa  94  6e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0337  transcriptional regulator  47.71 
 
 		 128 aa  94  7e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0703  transcriptional regulator, HxlR family  48.35 
 
 		 134 aa  93.2  1e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.383651  normal  0.144185 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0808  HxlR family transcriptional regulator  48.6 
 
 		 159 aa  92.8  1e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.40472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5174  HxlR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 119 aa  90.5  7e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.187988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1752  hypothetical protein  49.5 
 
 		 112 aa  89.4  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0613542  normal  0.0473163 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1063  transcriptional regulator  44.79 
 
 		 110 aa  89  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0576989  hitchhiker  0.000107529 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1352  putative transcriptional regulator  39.32 
 
 		 155 aa  89.4  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000297864  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3119  HxlR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 107 aa  87.4  5e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0144533  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5176  hypothetical protein  46.24 
 
 		 114 aa  86.7  9e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0230101 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4933  hypothetical protein  46.24 
 
 		 114 aa  86.7  9e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4774  transciprtional regulator  46.24 
 
 		 114 aa  86.7  9e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4794  transciprtional regulator  46.24 
 
 		 114 aa  86.7  9e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5311  hypothetical protein  46.24 
 
 		 114 aa  86.7  9e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5225  hypothetical protein  46.24 
 
 		 114 aa  86.7  9e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3069  transcriptional regulator, HxlR family  50 
 
 		 137 aa  86.3  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0845928  normal  0.988142 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2974  transcriptional regulator, HxlR family  53.16 
 
 		 160 aa  86.3  1e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.607542 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1489  transcriptional regulator, HxlR family  45.05 
 
 		 130 aa  85.9  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.657133  normal  0.735424 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3428  hypothetical protein  41.94 
 
 		 107 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.157748  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4287  transcriptional regulator, HxlR family  47.78 
 
 		 119 aa  85.5  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.332291  normal  0.235494 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5208  hypothetical protein  46.24 
 
 		 114 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0036  hypothetical protein  46.24 
 
 		 114 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000638982 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0015  transcriptional regulator, HxlR family  41.35 
 
 		 107 aa  85.1  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2255  transcriptional regulator, HxlR family  45.16 
 
 		 159 aa  85.1  3e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.395748  normal  0.27377 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3438  hypothetical protein  40.86 
 
 		 107 aa  84.7  4e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.166485  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0862  transcriptional regulator, HxlR family  44.57 
 
 		 119 aa  84.3  4e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273669  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3129  MarR family transcriptional regulator  40.86 
 
 		 115 aa  84.7  4e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.576671  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3455  hypothetical protein  40.86 
 
 		 107 aa  84.7  4e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.365377  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1684  transcriptional regulator, HxlR family  44.33 
 
 		 119 aa  84.7  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0013  HxlR family transcriptional regulator  49.43 
 
 		 126 aa  84.7  4e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1488  transcriptional regulator, HxlR family  37.25 
 
 		 109 aa  84.3  5e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.696737 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1698  putative transcriptional regulator  55.29 
 
 		 113 aa  84.3  5e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.171254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1702  transcriptional regulator, HxlR family  44.33 
 
 		 115 aa  84.3  5e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.371682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1317  HxlR family transcriptional regulator  46.07 
 
 		 122 aa  84.3  5e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000449926  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2802  transcriptional regulator, HxlR family  44.09 
 
 		 127 aa  84.3  5e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0014  transcriptional regulator, HxlR family  48.24 
 
 		 121 aa  84  7e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000846639  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3041  transcriptional regulator, HxlR family  42.11 
 
 		 119 aa  84  7e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1819  hypothetical protein  40.86 
 
 		 107 aa  84  7e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.100816 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4895  HxlR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 115 aa  83.6  8e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5212  hypothetical protein  45.16 
 
 		 114 aa  83.6  8e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0653  HxlR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 133 aa  83.6  9e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.174756 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3439  hypothetical protein  54.43 
 
 		 108 aa  83.6  9e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3203  hypothetical protein  45.16 
 
 		 114 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.135519  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3208  hypothetical protein  48.35 
 
 		 108 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3223  hypothetical protein  41.94 
 
 		 107 aa  83.6  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.246071  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3186  MarR family transcriptional regulator  48.35 
 
 		 108 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3200  MarR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 107 aa  83.6  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0287258  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3110  MarR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 114 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0933  transcriptional regulator, HxlR family  45.05 
 
 		 108 aa  83.2  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.973186 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0684  transcriptional regulator, HxlR family  38.46 
 
 		 121 aa  83.2  0.000000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3435  hypothetical protein  45.16 
 
 		 114 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0163  HxlR family transcriptional regulator  47.57 
 
 		 144 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.379253  hitchhiker  0.00857335 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3457  hypothetical protein  45.16 
 
 		 114 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3461  hypothetical protein  48.35 
 
 		 108 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.692347  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3441  hypothetical protein  41.94 
 
 		 107 aa  83.6  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1661  HxlR family transcriptional regulator  46.99 
 
 		 114 aa  82.8  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000438417  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1292  transcriptional regulator, HxlR family  47.31 
 
 		 129 aa  82.8  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.109042  normal  0.938313 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1607  transcriptional regulator, HxlR family  43.01 
 
 		 113 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000104346  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1834  hypothetical protein  45.16 
 
 		 114 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.118626  normal  0.386956 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0210  hypothetical protein  43.16 
 
 		 131 aa  82.4  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.453071 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3427  hypothetical protein  49.43 
 
 		 108 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1135  transcriptional regulator, HxlR family  47.31 
 
 		 111 aa  82.8  0.000000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1405  HxlR family transcriptional regulator  44.57 
 
 		 105 aa  82.4  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1564  HxlR family transcriptional regulator  44.09 
 
 		 119 aa  82  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0663317  normal  0.0831873 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5264  transcriptional regulator, HxlR family  43.43 
 
 		 130 aa  82.4  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000676248 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3638  transcriptional regulator, HxlR family  49.44 
 
 		 129 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.386135  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2474  transcriptional regulator, HxlR family  45.54 
 
 		 115 aa  82  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5989  transcriptional regulator, HxlR family  43.82 
 
 		 133 aa  81.6  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01970  transcriptional regulator  46.15 
 
 		 140 aa  81.6  0.000000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4102  transcriptional regulator, HxlR family  46.24 
 
 		 118 aa  81.3  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149147 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5039  putative transcriptional regulatory protein  46.24 
 
 		 125 aa  80.9  0.000000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0952  HxlR family transcriptional regulator  43.01 
 
 		 117 aa  80.9  0.000000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.473433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3564  HxlR family transcriptional regulator  50.63 
 
 		 140 aa  80.9  0.000000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5668  transcriptional regulator, HxlR family  39.78 
 
 		 119 aa  80.5  0.000000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.433337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3484  MarR family transcriptional regulator  46.51 
 
 		 109 aa  80.5  0.000000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.816245  normal  0.77191 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0892  HxlR family transcriptional regulator  43.96 
 
 		 215 aa  80.5  0.000000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2778  transcriptional regulator  45.16 
 
 		 112 aa  80.5  0.000000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000060346 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3114  MarR family transcriptional regulator  53.16 
 
 		 108 aa  80.1  0.000000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.448387  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4332  transcriptional regulator, HxlR family  49.37 
 
 		 121 aa  79.3  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.101336 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4987  transcriptional regulator, HxlR family  45.98 
 
 		 125 aa  79.3  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.432063 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3332  hypothetical protein  41.9 
 
 		 126 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4746  HxlR family transcriptional regulator  40.37 
 
 		 116 aa  78.6  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3044  HxlR family transcriptional regulator  47.5 
 
 		 124 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000040463  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4243  transcriptional regulator, HxlR family  44.44 
 
 		 105 aa  79  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.333534  normal  0.800382 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4104  transcriptional regulator, HxlR family  48.84 
 
 		 119 aa  78.6  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.533713  normal  0.821475 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2977  transcriptional regulator, HxlR family  43.56 
 
 		 170 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.369685  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3325  transcriptional regulator, HxlR family  46.99 
 
 		 128 aa  78.2  0.00000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.196974  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3059  HxlR family transcriptional regulator  40.18 
 
 		 124 aa  78.2  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23135  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0633  HxlR family transcriptional regulator  48.86 
 
 		 114 aa  78.6  0.00000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.437406 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2087  transcriptional regulator  43.62 
 
 		 116 aa  78.2  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4065  transcriptional regulator  46.25 
 
 		 124 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.966493  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>