More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5668 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5668  transcriptional regulator, HxlR family  100 
 
 		 119 aa  243  9e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.433337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4263  transcriptional regulator, HxlR family  56.03 
 
 		 140 aa  134  5e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.042978  normal  0.290046 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3848  HxlR family transcriptional regulator  55.24 
 
 		 121 aa  120  4e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.774801  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0879  transcriptional regulator, HxlR family  56.19 
 
 		 119 aa  120  5e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.399174  normal  0.958869 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0881  transcriptional regulator, HxlR family  55.24 
 
 		 122 aa  119  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2633  transcriptional regulator, HxlR family  54.29 
 
 		 121 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.895266  normal  0.749568 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5687  transcriptional regulator, HxlR family  49.52 
 
 		 124 aa  114  3.9999999999999997e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.643264 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6703  transcriptional regulator, HxlR family  50 
 
 		 133 aa  112  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1088  MarR family transcriptional regulator  47.42 
 
 		 116 aa  110  9e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1063  transcriptional regulator  52.58 
 
 		 110 aa  109  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0576989  hitchhiker  0.000107529 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4102  transcriptional regulator, HxlR family  47.47 
 
 		 118 aa  107  7.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149147 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1292  transcriptional regulator, HxlR family  44.76 
 
 		 129 aa  105  3e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.109042  normal  0.938313 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2531  transcriptional regulator, HxlR family  46.67 
 
 		 123 aa  103  7e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1834  hypothetical protein  45.45 
 
 		 114 aa  102  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.118626  normal  0.386956 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3110  MarR family transcriptional regulator  46.46 
 
 		 114 aa  103  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3435  hypothetical protein  46.46 
 
 		 114 aa  103  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3203  hypothetical protein  45.45 
 
 		 114 aa  102  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.135519  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3457  hypothetical protein  45.45 
 
 		 114 aa  102  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1352  putative transcriptional regulator  51.09 
 
 		 155 aa  101  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000297864  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3895  HxlR family transcriptional regulator  48.91 
 
 		 120 aa  101  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000755308  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4237  transcriptional regulator, HxlR family  48.57 
 
 		 125 aa  101  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.940949 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0252  transcriptional regulator, HxlR family  46.88 
 
 		 118 aa  101  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4895  HxlR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 115 aa  101  4e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5212  hypothetical protein  45.45 
 
 		 114 aa  101  4e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0013  HxlR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 126 aa  100  6e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3332  hypothetical protein  52.43 
 
 		 126 aa  100  6e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3428  hypothetical protein  49.47 
 
 		 107 aa  100  6e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.157748  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3638  transcriptional regulator, HxlR family  44.76 
 
 		 129 aa  100  7e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.386135  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5208  hypothetical protein  45.83 
 
 		 114 aa  100  8e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2255  transcriptional regulator, HxlR family  45.63 
 
 		 159 aa  100  8e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.395748  normal  0.27377 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5225  hypothetical protein  45.83 
 
 		 114 aa  100  9e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3223  hypothetical protein  48.42 
 
 		 107 aa  100  9e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.246071  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4933  hypothetical protein  45.83 
 
 		 114 aa  100  9e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3200  MarR family transcriptional regulator  48.42 
 
 		 107 aa  100  9e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0287258  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4774  transciprtional regulator  45.83 
 
 		 114 aa  100  9e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4794  transciprtional regulator  45.83 
 
 		 114 aa  100  9e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5311  hypothetical protein  45.83 
 
 		 114 aa  100  9e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5176  hypothetical protein  45.83 
 
 		 114 aa  100  9e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0230101 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3441  hypothetical protein  48.42 
 
 		 107 aa  100  9e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3059  HxlR family transcriptional regulator  48 
 
 		 124 aa  100  9e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23135  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5039  putative transcriptional regulatory protein  47.37 
 
 		 125 aa  100  9e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3119  HxlR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 107 aa  99.8  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0144533  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3133  hypothetical protein  51.46 
 
 		 126 aa  99.4  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.441436  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3120  transcriptional regulator  51.46 
 
 		 126 aa  99.4  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.118143  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3027  transcriptional regulator  51.46 
 
 		 126 aa  99.4  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.710275  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3379  hypothetical protein  51.46 
 
 		 126 aa  99.4  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1899  hypothetical protein  51.46 
 
 		 126 aa  99.4  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3354  hypothetical protein  51.46 
 
 		 126 aa  99.4  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0946  HxlR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 117 aa  99.4  1e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.26449  normal  0.613112 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1617  transcriptional regulator, HxlR family  41.58 
 
 		 117 aa  99.4  1e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.19292 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0036  hypothetical protein  45.83 
 
 		 114 aa  99.8  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000638982 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0178  hypothetical protein  43 
 
 		 114 aa  99.4  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3129  MarR family transcriptional regulator  48.42 
 
 		 115 aa  98.6  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.576671  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3455  hypothetical protein  48.42 
 
 		 107 aa  99.4  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.365377  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3357  hypothetical protein  51.46 
 
 		 129 aa  99.4  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221434  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2595  transcriptional regulator  46.94 
 
 		 124 aa  98.2  3e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0703  transcriptional regulator, HxlR family  48.39 
 
 		 134 aa  98.6  3e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.383651  normal  0.144185 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2224  transcriptional regulator, HxlR family  46.94 
 
 		 124 aa  98.2  3e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.647927  normal  0.782754 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2245  transcriptional regulator, HxlR family  44.34 
 
 		 128 aa  98.2  3e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1564  HxlR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 119 aa  98.6  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0663317  normal  0.0831873 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3438  hypothetical protein  47.37 
 
 		 107 aa  97.8  4e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.166485  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0373  putative transcriptional regulator  44.55 
 
 		 123 aa  97.8  4e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0376009  normal  0.449269 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17890  predicted transcriptional regulator  49.46 
 
 		 111 aa  97.8  4e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.382985 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2778  transcriptional regulator  46.32 
 
 		 112 aa  97.8  4e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000060346 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3418  putative transcriptional regulator  44.55 
 
 		 132 aa  97.4  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.190487 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3157  helix-turn-helix, HxlR type  42.86 
 
 		 130 aa  97.4  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.38389  normal  0.468508 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0998  HxlR family transcriptional regulator  43.52 
 
 		 106 aa  97.8  5e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00396575 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1109  HxlR family transcriptional regulator  42.57 
 
 		 116 aa  97.4  5e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.116925  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0379  transcriptional regulator  47.92 
 
 		 115 aa  97.4  6e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0341948  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2547  transcriptional regulator, MarR family  46.32 
 
 		 112 aa  97.4  6e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3427  hypothetical protein  48.91 
 
 		 108 aa  97.1  8e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4746  HxlR family transcriptional regulator  51.09 
 
 		 116 aa  97.1  8e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1698  putative transcriptional regulator  44.68 
 
 		 113 aa  96.3  1e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.171254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1607  transcriptional regulator, HxlR family  43.12 
 
 		 113 aa  96.3  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000104346  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1143  MarR family transcriptional regulator  42.27 
 
 		 120 aa  96.3  1e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.553828  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4399  hypothetical protein  46.32 
 
 		 124 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3208  hypothetical protein  48.91 
 
 		 108 aa  95.5  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4217  hypothetical protein  46.32 
 
 		 124 aa  95.5  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3186  MarR family transcriptional regulator  48.91 
 
 		 108 aa  95.5  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4055  transcriptional regulator  46.32 
 
 		 124 aa  95.5  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.396916  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4065  transcriptional regulator  46.32 
 
 		 124 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.966493  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1819  hypothetical protein  46.32 
 
 		 107 aa  95.9  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.100816 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4340  hypothetical protein  46.32 
 
 		 124 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.43956e-24 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3461  hypothetical protein  48.91 
 
 		 108 aa  95.5  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.692347  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4543  hypothetical protein  46.32 
 
 		 124 aa  95.5  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.719807  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0799  hypothetical protein  46.32 
 
 		 124 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000413922  hitchhiker  1.6907100000000001e-18 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4451  hypothetical protein  46.32 
 
 		 124 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000232165  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4437  hypothetical protein  46.32 
 
 		 124 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000169623  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0952  HxlR family transcriptional regulator  46.81 
 
 		 117 aa  95.5  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.473433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2387  HxlR family transcriptional regulator  46.32 
 
 		 115 aa  94.7  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.157796  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3442  transcriptional regulator, HxlR family  46.88 
 
 		 119 aa  95.1  3e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000021737  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3439  hypothetical protein  47.83 
 
 		 108 aa  95.1  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0808  HxlR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 159 aa  94.7  3e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.40472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5989  transcriptional regulator, HxlR family  43.88 
 
 		 133 aa  95.1  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3209  hypothetical protein  44.79 
 
 		 113 aa  94.7  4e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3115  MarR family transcriptional regulator  44.79 
 
 		 114 aa  94.7  4e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.451528  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1166  HxlR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 131 aa  94.7  4e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329867 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3462  hypothetical protein  44.79 
 
 		 113 aa  94.7  4e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.457433  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01970  transcriptional regulator  48.35 
 
 		 140 aa  94.7  4e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3440  hypothetical protein  44.79 
 
 		 113 aa  94.7  4e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>