More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2531 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2531  transcriptional regulator, HxlR family  100 
 
 		 123 aa  251  2.0000000000000002e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5687  transcriptional regulator, HxlR family  49.09 
 
 		 124 aa  123  8.000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.643264 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4263  transcriptional regulator, HxlR family  44.26 
 
 		 140 aa  117  7e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.042978  normal  0.290046 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2633  transcriptional regulator, HxlR family  47.79 
 
 		 121 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.895266  normal  0.749568 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0881  transcriptional regulator, HxlR family  48.62 
 
 		 122 aa  111  3e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0879  transcriptional regulator, HxlR family  46.79 
 
 		 119 aa  109  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.399174  normal  0.958869 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3848  HxlR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 121 aa  107  4.0000000000000004e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.774801  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4237  transcriptional regulator, HxlR family  46.85 
 
 		 125 aa  103  6e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.940949 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5668  transcriptional regulator, HxlR family  46.67 
 
 		 119 aa  103  7e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.433337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6703  transcriptional regulator, HxlR family  35.83 
 
 		 133 aa  91.3  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1782  transcriptional regulator, HxlR family  35.24 
 
 		 119 aa  86.3  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1135  transcriptional regulator, HxlR family  43.16 
 
 		 111 aa  81.3  0.000000000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5989  transcriptional regulator, HxlR family  36.36 
 
 		 133 aa  79.3  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0178  hypothetical protein  35.71 
 
 		 114 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0862  transcriptional regulator, HxlR family  40 
 
 		 119 aa  76.3  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273669  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5039  putative transcriptional regulatory protein  33.62 
 
 		 125 aa  75.1  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2255  transcriptional regulator, HxlR family  36.84 
 
 		 159 aa  75.1  0.0000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.395748  normal  0.27377 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2483  HxlR family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 116 aa  75.1  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0347086  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1489  transcriptional regulator, HxlR family  31.78 
 
 		 130 aa  74.3  0.0000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.657133  normal  0.735424 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1088  MarR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 116 aa  74.3  0.0000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1063  transcriptional regulator  35.05 
 
 		 110 aa  73.9  0.0000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0576989  hitchhiker  0.000107529 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2370  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 121 aa  73.6  0.0000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.132848  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1876  HxlR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 122 aa  73.9  0.0000000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6381  HxlR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 139 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.06337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0952  HxlR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 117 aa  72.8  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.473433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3895  HxlR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 120 aa  73.2  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000755308  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1292  transcriptional regulator, HxlR family  33.33 
 
 		 129 aa  72.8  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.109042  normal  0.938313 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3638  transcriptional regulator, HxlR family  32.08 
 
 		 129 aa  73.2  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.386135  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1097  transcriptional regulator, HxlR family  35.79 
 
 		 134 aa  72.8  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.199182  normal  0.222478 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2075  transcriptional regulator, HxlR family  35.77 
 
 		 136 aa  72.4  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3044  HxlR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 124 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000040463  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5429  transcriptional regulator, HxlR family  31.73 
 
 		 149 aa  72  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4102  transcriptional regulator, HxlR family  34.31 
 
 		 118 aa  72  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149147 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2595  transcriptional regulator  34.04 
 
 		 124 aa  71.6  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0373  putative transcriptional regulator  35.87 
 
 		 123 aa  71.6  0.000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0376009  normal  0.449269 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2224  transcriptional regulator, HxlR family  34.04 
 
 		 124 aa  71.6  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.647927  normal  0.782754 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5072  transcriptional regulator, HxlR family  35.78 
 
 		 117 aa  71.6  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.550945 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0948  transcriptional regulator, HxlR family  34.74 
 
 		 151 aa  71.2  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1352  putative transcriptional regulator  35.79 
 
 		 155 aa  71.2  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000297864  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2802  transcriptional regulator, HxlR family  32.11 
 
 		 127 aa  71.2  0.000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3157  helix-turn-helix, HxlR type  32.08 
 
 		 130 aa  71.2  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.38389  normal  0.468508 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1564  HxlR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 119 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0663317  normal  0.0831873 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3133  hypothetical protein  35.19 
 
 		 126 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.441436  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3027  transcriptional regulator  35.19 
 
 		 126 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.710275  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1097  transcriptional regulator, HxlR family  31.68 
 
 		 112 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3379  hypothetical protein  35.19 
 
 		 126 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3354  hypothetical protein  35.19 
 
 		 126 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3816  HxlR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 120 aa  70.5  0.000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0799  hypothetical protein  36.79 
 
 		 124 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000413922  hitchhiker  1.6907100000000001e-18 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4399  hypothetical protein  36.79 
 
 		 124 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4217  hypothetical protein  36.79 
 
 		 124 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4055  transcriptional regulator  36.79 
 
 		 124 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.396916  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4065  transcriptional regulator  36.79 
 
 		 124 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.966493  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4451  hypothetical protein  36.79 
 
 		 124 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000232165  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4543  hypothetical protein  36.79 
 
 		 124 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.719807  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1437  transcriptional regulator family protein  32.08 
 
 		 141 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4340  hypothetical protein  36.79 
 
 		 124 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.43956e-24 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4437  hypothetical protein  36.79 
 
 		 124 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000169623  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3120  transcriptional regulator  37.11 
 
 		 126 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.118143  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0290  transcriptional regulator protein-like protein  31.43 
 
 		 154 aa  69.7  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3332  hypothetical protein  37.14 
 
 		 126 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3357  hypothetical protein  35.45 
 
 		 129 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221434  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2474  transcriptional regulator, HxlR family  32.08 
 
 		 115 aa  69.3  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1109  HxlR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 116 aa  69.3  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.116925  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5176  hypothetical protein  35.35 
 
 		 114 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0230101 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4933  hypothetical protein  35.35 
 
 		 114 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4774  transciprtional regulator  35.35 
 
 		 114 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4794  transciprtional regulator  35.35 
 
 		 114 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5311  hypothetical protein  35.35 
 
 		 114 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1698  putative transcriptional regulator  35.48 
 
 		 113 aa  68.9  0.00000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.171254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1899  hypothetical protein  37.11 
 
 		 126 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1317  HxlR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 122 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000449926  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3059  HxlR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 124 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23135  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5225  hypothetical protein  35.35 
 
 		 114 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10173  YdeP  36.17 
 
 		 122 aa  68.6  0.00000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3418  putative transcriptional regulator  33.68 
 
 		 132 aa  68.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.190487 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2675  HxlR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 172 aa  68.6  0.00000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9284  transcriptional regulator (MarR family protein)  34.41 
 
 		 122 aa  67.8  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3163  putative transcriptional regulator  32.08 
 
 		 144 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2005  transcriptional regulator family protein  32.08 
 
 		 144 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3069  transcriptional regulator, HxlR family  35.23 
 
 		 137 aa  67.8  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0845928  normal  0.988142 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7105  transcriptional regulator protein-like protein  31.31 
 
 		 164 aa  67.8  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.248427  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0933  transcriptional regulator, HxlR family  34.02 
 
 		 108 aa  67.8  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.973186 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2738  transcriptional regulator family protein  32.08 
 
 		 144 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.115101  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3126  putative transcriptional regulator  32.08 
 
 		 144 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1870  transcriptional regulator family protein  32.08 
 
 		 144 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.284748  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01970  transcriptional regulator  32.35 
 
 		 140 aa  67.4  0.00000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5208  hypothetical protein  37.08 
 
 		 114 aa  67  0.00000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0456  transcriptional regulator, HxlR family  34.23 
 
 		 149 aa  67  0.00000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.208849  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1971  HxlR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 134 aa  67  0.00000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4999  transcriptional regulator, HxlR family  38.3 
 
 		 132 aa  67  0.00000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.138614  normal  0.0407837 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2765  transcriptional regulator, HxlR family  31.68 
 
 		 125 aa  67.4  0.00000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.307556  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0280  HxlR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 116 aa  67.4  0.00000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.900551 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4169  HxlR family transcriptional regulator  34 
 
 		 124 aa  67  0.00000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000193508  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2703  transcriptional regulator, HxlR family  31.43 
 
 		 118 aa  67  0.00000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5212  hypothetical protein  37.08 
 
 		 114 aa  67  0.00000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0036  hypothetical protein  37.08 
 
 		 114 aa  67  0.00000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000638982 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2974  transcriptional regulator, HxlR family  38.04 
 
 		 160 aa  67  0.00000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.607542 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0653  HxlR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 133 aa  67  0.00000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.174756 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1541  putative transcriptional regulator  31.58 
 
 		 121 aa  67  0.00000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000091847  normal  0.207791 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>