More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2075 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2075  transcriptional regulator, HxlR family  100 
 
 		 136 aa  282  1.0000000000000001e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1690  transcriptional regulator, HxlR family  62.16 
 
 		 129 aa  144  4.0000000000000006e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2747  transcriptional regulator, HxlR family  60.17 
 
 		 129 aa  142  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.668985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3126  transcriptional regulator, HxlR family  58.93 
 
 		 122 aa  137  4.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.341142 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0941  transcriptional regulator, HxlR family  51.26 
 
 		 134 aa  130  6e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.824933  normal  0.442386 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0880  transcriptional regulator, HxlR family  51.38 
 
 		 118 aa  124  3e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2706  transcriptional regulator, HxlR family  50 
 
 		 131 aa  122  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1019  transcriptional regulator, HxlR family  48.08 
 
 		 116 aa  110  7.000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.126955  normal  0.402464 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3624  hypothetical protein  47.27 
 
 		 115 aa  107  4.0000000000000004e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5682  transcriptional regulator, HxlR family  50.96 
 
 		 128 aa  107  5e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.103189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2078  transcriptional regulator, HxlR family  45.05 
 
 		 141 aa  106  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.181775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4999  transcriptional regulator, HxlR family  44.76 
 
 		 132 aa  106  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.138614  normal  0.0407837 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0075  transcriptional regulator, HxlR family  46.09 
 
 		 129 aa  103  6e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2520  transcriptional regulator, HxlR family  49.53 
 
 		 117 aa  103  9e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.256332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2331  transcriptional regulator, HxlR family  44.55 
 
 		 122 aa  102  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.582171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3323  HxlR family transcriptional regulator  46.73 
 
 		 123 aa  102  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.364406  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4616  transcriptional regulator, HxlR family  48.08 
 
 		 114 aa  101  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.95176  normal  0.126247 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2692  transcriptional regulator, HxlR family  44.04 
 
 		 121 aa  99  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.260296 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3740  transcriptional regulator, HxlR family  40.35 
 
 		 127 aa  99.4  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4283  transcriptional regulator, HxlR family  38.39 
 
 		 123 aa  98.2  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.130583  normal  0.0318245 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2647  transcriptional regulator, HxlR family  50 
 
 		 116 aa  94  6e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0854787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4034  HxlR family transcriptional regulator  43.69 
 
 		 114 aa  93.6  8e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.721532  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3203  hypothetical protein  42.71 
 
 		 114 aa  92.8  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.135519  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5907  transcriptional regulator, HxlR family  39.42 
 
 		 112 aa  92.8  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3457  hypothetical protein  42.71 
 
 		 114 aa  92.8  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2289  hypothetical protein  39.09 
 
 		 112 aa  92.4  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.373425 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3110  MarR family transcriptional regulator  44.94 
 
 		 114 aa  90.9  5e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2811  transcriptional regulator, HxlR family  40.95 
 
 		 117 aa  90.9  5e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4933  hypothetical protein  44.94 
 
 		 114 aa  90.5  6e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4774  transciprtional regulator  44.94 
 
 		 114 aa  90.5  6e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4794  transciprtional regulator  44.94 
 
 		 114 aa  90.5  6e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4594  transcriptional regulator, HxlR family  41.9 
 
 		 113 aa  90.9  6e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5225  hypothetical protein  44.94 
 
 		 114 aa  90.5  6e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5311  hypothetical protein  44.94 
 
 		 114 aa  90.5  6e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3738  transcriptional regulator, HxlR family  41.18 
 
 		 131 aa  90.9  6e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5176  hypothetical protein  44.94 
 
 		 114 aa  90.5  6e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0230101 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1834  hypothetical protein  43.82 
 
 		 114 aa  90.1  8e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.118626  normal  0.386956 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3435  hypothetical protein  43.82 
 
 		 114 aa  90.1  9e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1562  transcriptional regulator, HxlR family  36.7 
 
 		 118 aa  89.4  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00937417  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0014  transcriptional regulator, HxlR family  41.51 
 
 		 121 aa  89.7  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000846639  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10173  YdeP  43.69 
 
 		 122 aa  88.6  2e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3989  HxlR family transcriptional regulator  42.48 
 
 		 125 aa  89  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4895  HxlR family transcriptional regulator  43.82 
 
 		 115 aa  88.2  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5208  hypothetical protein  43.82 
 
 		 114 aa  88.6  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1698  putative transcriptional regulator  47.13 
 
 		 113 aa  88.6  3e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.171254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0036  hypothetical protein  43.82 
 
 		 114 aa  88.6  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000638982 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5989  transcriptional regulator, HxlR family  41.11 
 
 		 133 aa  87.8  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7246  transcriptional regulator, HxlR family  41.18 
 
 		 116 aa  88.2  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00534813  normal  0.675501 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5212  hypothetical protein  43.82 
 
 		 114 aa  88.2  4e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0246  putative transcriptional regulator  36.67 
 
 		 160 aa  87.4  5e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1564  HxlR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 119 aa  87.4  5e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0663317  normal  0.0831873 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0379  transcriptional regulator  44.09 
 
 		 115 aa  87  8e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0341948  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1135  transcriptional regulator, HxlR family  40 
 
 		 111 aa  86.7  9e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3585  transcriptional regulator, HxlR family  37.5 
 
 		 108 aa  86.3  1e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000738633  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1063  transcriptional regulator  41.18 
 
 		 110 aa  86.7  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0576989  hitchhiker  0.000107529 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4258  transcriptional regulator, HxlR family  40.2 
 
 		 117 aa  86.7  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.495446  normal  0.515544 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1097  transcriptional regulator, HxlR family  40.86 
 
 		 112 aa  86.3  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5039  putative transcriptional regulatory protein  39.42 
 
 		 125 aa  86.7  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3895  HxlR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 120 aa  86.3  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000755308  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2595  transcriptional regulator  44.71 
 
 		 124 aa  85.9  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2224  transcriptional regulator, HxlR family  44.71 
 
 		 124 aa  85.9  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.647927  normal  0.782754 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0998  HxlR family transcriptional regulator  40.22 
 
 		 106 aa  85.9  2e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00396575 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3428  hypothetical protein  38.54 
 
 		 107 aa  85.5  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.157748  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3208  hypothetical protein  44.83 
 
 		 108 aa  84.7  4e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3186  MarR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 108 aa  84.7  4e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3187  MarR family transcriptional regulator  41.57 
 
 		 114 aa  84.7  4e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3115  MarR family transcriptional regulator  41.57 
 
 		 114 aa  84.7  4e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.451528  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3428  hypothetical protein  41.57 
 
 		 114 aa  84.7  4e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3461  hypothetical protein  44.83 
 
 		 108 aa  84.7  4e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.692347  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3209  hypothetical protein  41.57 
 
 		 113 aa  84.3  5e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0013  HxlR family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 126 aa  84.3  5e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3462  hypothetical protein  41.57 
 
 		 113 aa  84.3  5e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.457433  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3440  hypothetical protein  41.57 
 
 		 113 aa  84.3  5e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3427  hypothetical protein  44.83 
 
 		 108 aa  84  6e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3103  HxlR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 112 aa  84  7e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0015  transcriptional regulator, HxlR family  41.94 
 
 		 107 aa  83.6  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0933  transcriptional regulator, HxlR family  39.18 
 
 		 108 aa  83.6  9e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.973186 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1819  hypothetical protein  37.5 
 
 		 107 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.100816 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1262  transcriptional regulator, HxlR family  44.94 
 
 		 148 aa  82.8  0.000000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.84733 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6381  HxlR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 139 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.06337  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3438  hypothetical protein  37.5 
 
 		 107 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.166485  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3119  HxlR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 107 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0144533  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2778  transcriptional regulator  40.19 
 
 		 112 aa  82  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000060346 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2370  putative transcriptional regulator  38.71 
 
 		 121 aa  82.4  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.132848  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5177  HxlR family transcriptional regulator  42.53 
 
 		 118 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2547  transcriptional regulator, MarR family  40.19 
 
 		 112 aa  82  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0905  transcriptional regulator family protein  43.82 
 
 		 220 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0446  transcriptional regulator, HxlR family  37.74 
 
 		 135 aa  82.4  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3846  HxlR family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 115 aa  82  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.950825  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5072  transcriptional regulator, HxlR family  43.01 
 
 		 117 aa  81.6  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.550945 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2005  transcriptional regulator family protein  43.82 
 
 		 144 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3179  transcriptional regulator family protein  43.82 
 
 		 206 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0560718  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3455  hypothetical protein  37.5 
 
 		 107 aa  82  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.365377  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1815  HxlR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 125 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.589379 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2871  HxlR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 141 aa  82  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.30961 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2738  transcriptional regulator family protein  43.82 
 
 		 144 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.115101  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3126  putative transcriptional regulator  43.82 
 
 		 144 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3163  putative transcriptional regulator  43.82 
 
 		 144 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1870  transcriptional regulator family protein  43.82 
 
 		 144 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.284748  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1437  transcriptional regulator family protein  43.82 
 
 		 141 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>