More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4594 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4594  transcriptional regulator, HxlR family  100 
 
 		 113 aa  231  2.0000000000000002e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5907  transcriptional regulator, HxlR family  77.88 
 
 		 112 aa  189  1e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2289  hypothetical protein  66.37 
 
 		 112 aa  159  1e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.373425 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3103  HxlR family transcriptional regulator  65.09 
 
 		 112 aa  135  2e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3323  HxlR family transcriptional regulator  57.01 
 
 		 123 aa  124  3e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.364406  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2692  transcriptional regulator, HxlR family  51.4 
 
 		 121 aa  112  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.260296 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2520  transcriptional regulator, HxlR family  50.96 
 
 		 117 aa  111  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.256332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0880  transcriptional regulator, HxlR family  46.36 
 
 		 118 aa  105  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5682  transcriptional regulator, HxlR family  46.23 
 
 		 128 aa  103  8e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.103189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0941  transcriptional regulator, HxlR family  46.73 
 
 		 134 aa  102  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.824933  normal  0.442386 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4258  transcriptional regulator, HxlR family  39.42 
 
 		 117 aa  101  4e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.495446  normal  0.515544 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3624  hypothetical protein  42.99 
 
 		 115 aa  99.8  1e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2871  transcriptional regulator, HxlR family  40.95 
 
 		 117 aa  99.8  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.351583  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4999  transcriptional regulator, HxlR family  42.86 
 
 		 132 aa  98.2  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.138614  normal  0.0407837 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6707  transcriptional regulator, HxlR family  46.53 
 
 		 130 aa  98.2  4e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3846  HxlR family transcriptional regulator  42.72 
 
 		 115 aa  97.4  5e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.950825  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0075  transcriptional regulator, HxlR family  44.55 
 
 		 129 aa  97.4  6e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5131  transcriptional regulator, HxlR family  41.51 
 
 		 125 aa  95.1  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0956366  normal  0.235138 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1690  transcriptional regulator, HxlR family  42.31 
 
 		 129 aa  94.4  5e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0862  transcriptional regulator, HxlR family  43.69 
 
 		 119 aa  92.8  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273669  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2706  transcriptional regulator, HxlR family  43.52 
 
 		 131 aa  92.4  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4616  transcriptional regulator, HxlR family  40.74 
 
 		 114 aa  91.3  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.95176  normal  0.126247 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2075  transcriptional regulator, HxlR family  41.9 
 
 		 136 aa  90.9  6e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4104  transcriptional regulator, HxlR family  43.56 
 
 		 119 aa  90.1  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.533713  normal  0.821475 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3119  HxlR family transcriptional regulator  42.99 
 
 		 107 aa  88.6  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0144533  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2778  transcriptional regulator  46.67 
 
 		 112 aa  89  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000060346 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2547  transcriptional regulator, MarR family  46.67 
 
 		 112 aa  89.4  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3989  HxlR family transcriptional regulator  41.59 
 
 		 125 aa  89  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1562  transcriptional regulator, HxlR family  41.51 
 
 		 118 aa  89  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00937417  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4283  transcriptional regulator, HxlR family  42.06 
 
 		 123 aa  88.6  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.130583  normal  0.0318245 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3740  transcriptional regulator, HxlR family  46.15 
 
 		 127 aa  87.8  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2387  HxlR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 115 aa  87.8  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.157796  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0933  transcriptional regulator, HxlR family  41.41 
 
 		 108 aa  87.4  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.973186 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02250  predicted transcriptional regulator  47.83 
 
 		 110 aa  86.3  1e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3223  hypothetical protein  42.06 
 
 		 107 aa  86.3  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.246071  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3200  MarR family transcriptional regulator  42.06 
 
 		 107 aa  86.3  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0287258  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2078  transcriptional regulator, HxlR family  43.81 
 
 		 141 aa  86.7  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.181775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3441  hypothetical protein  42.06 
 
 		 107 aa  86.3  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4933  hypothetical protein  42.11 
 
 		 114 aa  84.7  4e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4774  transciprtional regulator  42.11 
 
 		 114 aa  84.7  4e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4794  transciprtional regulator  42.11 
 
 		 114 aa  84.7  4e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5225  hypothetical protein  42.11 
 
 		 114 aa  84.7  4e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5311  hypothetical protein  42.11 
 
 		 114 aa  84.7  4e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5176  hypothetical protein  42.11 
 
 		 114 aa  84.7  4e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0230101 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4895  HxlR family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 115 aa  84  6e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0290  transcriptional regulator protein-like protein  45 
 
 		 154 aa  84  7e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5212  hypothetical protein  41.84 
 
 		 114 aa  84  7e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5208  hypothetical protein  41.84 
 
 		 114 aa  83.6  8e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1819  hypothetical protein  42.06 
 
 		 107 aa  83.6  8e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.100816 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0036  hypothetical protein  41.84 
 
 		 114 aa  83.6  8e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000638982 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3455  hypothetical protein  41.12 
 
 		 107 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.365377  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2765  transcriptional regulator, HxlR family  44.09 
 
 		 125 aa  83.2  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.307556  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3481  transcriptional regulator, HxlR family  44.12 
 
 		 117 aa  83.2  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1135  transcriptional regulator, HxlR family  44.55 
 
 		 111 aa  82.8  0.000000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2370  putative transcriptional regulator  37.86 
 
 		 121 aa  83.2  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.132848  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3428  hypothetical protein  41.12 
 
 		 107 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.157748  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3438  hypothetical protein  41.12 
 
 		 107 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.166485  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3129  MarR family transcriptional regulator  41.12 
 
 		 115 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.576671  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3785  transcriptional regulator, HxlR family  41.49 
 
 		 118 aa  82.4  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.139955  normal  0.719008 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5989  transcriptional regulator, HxlR family  41.58 
 
 		 133 aa  82.4  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3293  putative transcriptional regulator  39.78 
 
 		 119 aa  82  0.000000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0763403 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1019  transcriptional regulator, HxlR family  40.82 
 
 		 116 aa  82  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.126955  normal  0.402464 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1661  HxlR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 114 aa  82  0.000000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000438417  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1752  hypothetical protein  43.48 
 
 		 112 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0613542  normal  0.0473163 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1063  transcriptional regulator  39.8 
 
 		 110 aa  81.3  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0576989  hitchhiker  0.000107529 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1097  transcriptional regulator, HxlR family  43.62 
 
 		 112 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1607  transcriptional regulator, HxlR family  36.79 
 
 		 113 aa  80.9  0.000000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000104346  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2747  transcriptional regulator, HxlR family  40.95 
 
 		 129 aa  80.9  0.000000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.668985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2973  transcriptional regulator, HxlR family  40.59 
 
 		 116 aa  80.9  0.000000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.116721  normal  0.457372 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0221  transcriptional regulator, HxlR family  39.05 
 
 		 106 aa  81.3  0.000000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012384  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4332  transcriptional regulator, HxlR family  38.14 
 
 		 121 aa  81.3  0.000000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.101336 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3435  hypothetical protein  42.11 
 
 		 114 aa  80.5  0.000000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3203  hypothetical protein  42.11 
 
 		 114 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.135519  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3457  hypothetical protein  42.11 
 
 		 114 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1769  transcriptional regulator superfamily  40.57 
 
 		 112 aa  80.5  0.000000000000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000531887  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4370  HxlR family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 117 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3527  HxlR family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 117 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.502253 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3996  HxlR family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 117 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.208473  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3110  MarR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 114 aa  80.5  0.000000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3738  transcriptional regulator, HxlR family  37.5 
 
 		 131 aa  80.1  0.000000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2224  transcriptional regulator, HxlR family  42.55 
 
 		 124 aa  79.7  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.647927  normal  0.782754 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2595  transcriptional regulator  42.55 
 
 		 124 aa  79.7  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1698  putative transcriptional regulator  40.21 
 
 		 113 aa  79.7  0.00000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.171254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1834  hypothetical protein  41.05 
 
 		 114 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.118626  normal  0.386956 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3638  transcriptional regulator, HxlR family  41.18 
 
 		 129 aa  79  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.386135  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3157  helix-turn-helix, HxlR type  36.94 
 
 		 130 aa  78.6  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.38389  normal  0.468508 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4975  HxlR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 112 aa  79.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5063  HxlR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 112 aa  79.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5356  HxlR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 112 aa  79.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7246  transcriptional regulator, HxlR family  45.05 
 
 		 116 aa  79.3  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00534813  normal  0.675501 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1317  HxlR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 122 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000449926  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2650  transcriptional regulator, HxlR family  38.46 
 
 		 130 aa  78.2  0.00000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.116917  normal  0.771114 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3115  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 114 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.451528  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3564  HxlR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 140 aa  78.2  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3209  hypothetical protein  40 
 
 		 113 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3440  hypothetical protein  40 
 
 		 113 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1471  transcriptional regulator, HxlR family  41.76 
 
 		 108 aa  77.4  0.00000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3462  hypothetical protein  40 
 
 		 113 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.457433  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0280  HxlR family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 116 aa  77.8  0.00000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.900551 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3428  hypothetical protein  40 
 
 		 114 aa  77.4  0.00000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>