More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2871 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2871  transcriptional regulator, HxlR family  100 
 
 		 117 aa  241  1.9999999999999999e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.351583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3846  HxlR family transcriptional regulator  77.36 
 
 		 115 aa  177  4e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.950825  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4258  transcriptional regulator, HxlR family  65.81 
 
 		 117 aa  168  2e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.495446  normal  0.515544 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5131  transcriptional regulator, HxlR family  69.23 
 
 		 125 aa  154  5.0000000000000005e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0956366  normal  0.235138 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4999  transcriptional regulator, HxlR family  57.55 
 
 		 132 aa  124  5e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.138614  normal  0.0407837 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3323  HxlR family transcriptional regulator  47.86 
 
 		 123 aa  117  7e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.364406  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1562  transcriptional regulator, HxlR family  47.62 
 
 		 118 aa  114  6e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00937417  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2692  transcriptional regulator, HxlR family  47.17 
 
 		 121 aa  109  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.260296 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4283  transcriptional regulator, HxlR family  46.67 
 
 		 123 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.130583  normal  0.0318245 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2078  transcriptional regulator, HxlR family  48.08 
 
 		 141 aa  105  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.181775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0880  transcriptional regulator, HxlR family  43.48 
 
 		 118 aa  105  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0941  transcriptional regulator, HxlR family  49.09 
 
 		 134 aa  104  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.824933  normal  0.442386 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3740  transcriptional regulator, HxlR family  50 
 
 		 127 aa  103  6e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2520  transcriptional regulator, HxlR family  47.57 
 
 		 117 aa  103  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.256332  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2289  hypothetical protein  43.81 
 
 		 112 aa  102  2e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.373425 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3989  HxlR family transcriptional regulator  47.12 
 
 		 125 aa  100  8e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5907  transcriptional regulator, HxlR family  43.81 
 
 		 112 aa  100  8e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4594  transcriptional regulator, HxlR family  40.95 
 
 		 113 aa  99.8  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1019  transcriptional regulator, HxlR family  44.64 
 
 		 116 aa  99.8  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.126955  normal  0.402464 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3738  transcriptional regulator, HxlR family  43.43 
 
 		 131 aa  94.7  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3103  HxlR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 112 aa  93.6  7e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4034  HxlR family transcriptional regulator  43.27 
 
 		 114 aa  93.6  8e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.721532  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4616  transcriptional regulator, HxlR family  45.54 
 
 		 114 aa  93.2  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.95176  normal  0.126247 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3624  hypothetical protein  45.63 
 
 		 115 aa  92.8  1e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3481  transcriptional regulator, HxlR family  39.47 
 
 		 117 aa  92.4  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0075  transcriptional regulator, HxlR family  40.78 
 
 		 129 aa  91.3  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2811  transcriptional regulator, HxlR family  41.38 
 
 		 117 aa  90.9  6e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1690  transcriptional regulator, HxlR family  40.54 
 
 		 129 aa  90.5  7e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2706  transcriptional regulator, HxlR family  43.3 
 
 		 131 aa  90.5  7e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5682  transcriptional regulator, HxlR family  43.81 
 
 		 128 aa  90.1  9e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.103189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6707  transcriptional regulator, HxlR family  37.62 
 
 		 130 aa  89.7  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2331  transcriptional regulator, HxlR family  44.23 
 
 		 122 aa  88.2  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.582171  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2747  transcriptional regulator, HxlR family  40.78 
 
 		 129 aa  79  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.668985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7246  transcriptional regulator, HxlR family  40 
 
 		 116 aa  79  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00534813  normal  0.675501 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2075  transcriptional regulator, HxlR family  39.39 
 
 		 136 aa  78.6  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2126  helix-turn-helix HxlR type  35.71 
 
 		 129 aa  77.8  0.00000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.653298  normal  0.626696 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3126  transcriptional regulator, HxlR family  40 
 
 		 122 aa  75.9  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.341142 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2647  transcriptional regulator, HxlR family  39.58 
 
 		 116 aa  74.7  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0854787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2490  transcriptional regulator  37.86 
 
 		 120 aa  75.1  0.0000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0268874 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1377  MarR family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 122 aa  73.2  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4104  transcriptional regulator, HxlR family  36.26 
 
 		 119 aa  73.2  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.533713  normal  0.821475 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1527  transcriptional regulator, HxlR family  35.34 
 
 		 125 aa  72.4  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0577409  normal  0.0923704 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25590  predicted transcriptional regulator  35 
 
 		 129 aa  72  0.000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.6055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1876  HxlR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 122 aa  71.6  0.000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3293  putative transcriptional regulator  38.46 
 
 		 119 aa  71.2  0.000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0763403 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01970  transcriptional regulator  36.54 
 
 		 140 aa  71.6  0.000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0862  transcriptional regulator, HxlR family  32.97 
 
 		 119 aa  70.9  0.000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273669  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9284  transcriptional regulator (MarR family protein)  35.11 
 
 		 122 aa  70.9  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2973  transcriptional regulator, HxlR family  36.46 
 
 		 116 aa  70.9  0.000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.116721  normal  0.457372 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3564  HxlR family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 140 aa  70.5  0.000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4332  transcriptional regulator, HxlR family  37.36 
 
 		 121 aa  70.5  0.000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.101336 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3100  HxlR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 107 aa  70.5  0.000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2498  HxlR family transcriptional regulator  40.59 
 
 		 127 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3203  hypothetical protein  37.11 
 
 		 114 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.135519  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3457  hypothetical protein  37.11 
 
 		 114 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5177  HxlR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 118 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2224  transcriptional regulator, HxlR family  34.38 
 
 		 124 aa  69.3  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.647927  normal  0.782754 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3110  MarR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 114 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1063  transcriptional regulator  33.02 
 
 		 110 aa  69.3  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0576989  hitchhiker  0.000107529 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3435  hypothetical protein  37.11 
 
 		 114 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2595  transcriptional regulator  34.38 
 
 		 124 aa  69.3  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0379  transcriptional regulator  37.89 
 
 		 115 aa  69.3  0.00000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0341948  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1834  hypothetical protein  36.08 
 
 		 114 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.118626  normal  0.386956 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2054  transcriptional regulator, HxlR family  33 
 
 		 124 aa  68.6  0.00000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2547  transcriptional regulator, MarR family  34.02 
 
 		 112 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1607  transcriptional regulator, HxlR family  32.99 
 
 		 113 aa  67.8  0.00000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000104346  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3585  transcriptional regulator, HxlR family  36.63 
 
 		 108 aa  67.8  0.00000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000738633  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2778  transcriptional regulator  34.02 
 
 		 112 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000060346 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4933  hypothetical protein  34.65 
 
 		 114 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4774  transciprtional regulator  34.65 
 
 		 114 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4794  transciprtional regulator  34.65 
 
 		 114 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3119  HxlR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 107 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0144533  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5311  hypothetical protein  34.65 
 
 		 114 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5176  hypothetical protein  34.65 
 
 		 114 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0230101 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5225  hypothetical protein  34.65 
 
 		 114 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0266  helix-turn-helix HxlR type  33.64 
 
 		 130 aa  67.4  0.00000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.661813  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3552  HxlR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 125 aa  67  0.00000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.640344 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3115  MarR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 114 aa  67  0.00000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.451528  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5212  hypothetical protein  35.64 
 
 		 114 aa  67  0.00000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4706  transcriptional regulator, HxlR family  34.02 
 
 		 143 aa  67  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0222658  normal  0.87312 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0946  HxlR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 117 aa  67  0.00000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.26449  normal  0.613112 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1135  transcriptional regulator, HxlR family  36.84 
 
 		 111 aa  66.6  0.00000000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3441  hypothetical protein  33.68 
 
 		 107 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3209  hypothetical protein  36.08 
 
 		 113 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3223  hypothetical protein  33.68 
 
 		 107 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.246071  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0933  transcriptional regulator, HxlR family  32.98 
 
 		 108 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.973186 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3200  MarR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 107 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0287258  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3428  hypothetical protein  34.74 
 
 		 107 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.157748  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3638  transcriptional regulator, HxlR family  36.73 
 
 		 129 aa  66.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.386135  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3462  hypothetical protein  36.08 
 
 		 113 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.457433  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1698  putative transcriptional regulator  32.71 
 
 		 113 aa  66.6  0.0000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.171254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3440  hypothetical protein  36.08 
 
 		 113 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0207  HxlR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 123 aa  66.2  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2245  transcriptional regulator, HxlR family  33.33 
 
 		 128 aa  66.2  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1769  transcriptional regulator superfamily  34.38 
 
 		 112 aa  66.2  0.0000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000531887  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5208  hypothetical protein  34.65 
 
 		 114 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3129  MarR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 115 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.576671  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3455  hypothetical protein  33.68 
 
 		 107 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.365377  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06336  hypothetical protein  35.64 
 
 		 122 aa  65.9  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3895  HxlR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 120 aa  65.5  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000755308  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>