More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5131 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5131  transcriptional regulator, HxlR family  100 
 
 		 125 aa  259  6.999999999999999e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0956366  normal  0.235138 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3846  HxlR family transcriptional regulator  69.23 
 
 		 115 aa  161  2.0000000000000002e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.950825  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2871  transcriptional regulator, HxlR family  69.23 
 
 		 117 aa  154  5.0000000000000005e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.351583  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4258  transcriptional regulator, HxlR family  58.65 
 
 		 117 aa  134  3.0000000000000003e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.495446  normal  0.515544 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4999  transcriptional regulator, HxlR family  50.93 
 
 		 132 aa  117  6e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.138614  normal  0.0407837 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2078  transcriptional regulator, HxlR family  50.94 
 
 		 141 aa  116  9e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.181775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1562  transcriptional regulator, HxlR family  46.36 
 
 		 118 aa  111  4.0000000000000004e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00937417  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3740  transcriptional regulator, HxlR family  48.04 
 
 		 127 aa  110  8.000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2692  transcriptional regulator, HxlR family  52 
 
 		 121 aa  107  4.0000000000000004e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.260296 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2520  transcriptional regulator, HxlR family  45.05 
 
 		 117 aa  105  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.256332  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2289  hypothetical protein  44.64 
 
 		 112 aa  101  4e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.373425 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0880  transcriptional regulator, HxlR family  47.96 
 
 		 118 aa  99.4  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4283  transcriptional regulator, HxlR family  47.62 
 
 		 123 aa  99  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.130583  normal  0.0318245 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0075  transcriptional regulator, HxlR family  38.05 
 
 		 129 aa  95.9  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3323  HxlR family transcriptional regulator  46.53 
 
 		 123 aa  95.9  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.364406  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4594  transcriptional regulator, HxlR family  41.51 
 
 		 113 aa  95.1  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1690  transcriptional regulator, HxlR family  40.87 
 
 		 129 aa  94.4  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5907  transcriptional regulator, HxlR family  43.4 
 
 		 112 aa  92.8  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0941  transcriptional regulator, HxlR family  47.47 
 
 		 134 aa  91.3  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.824933  normal  0.442386 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5682  transcriptional regulator, HxlR family  46 
 
 		 128 aa  90.9  5e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.103189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1019  transcriptional regulator, HxlR family  40.78 
 
 		 116 aa  89.4  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.126955  normal  0.402464 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3624  hypothetical protein  45.1 
 
 		 115 aa  89.4  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3738  transcriptional regulator, HxlR family  42.16 
 
 		 131 aa  87.8  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3989  HxlR family transcriptional regulator  43.27 
 
 		 125 aa  87  7e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3481  transcriptional regulator, HxlR family  42.42 
 
 		 117 aa  87  8e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2331  transcriptional regulator, HxlR family  43 
 
 		 122 aa  86.3  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.582171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3103  HxlR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 112 aa  84.7  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4616  transcriptional regulator, HxlR family  41.84 
 
 		 114 aa  84.3  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.95176  normal  0.126247 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2706  transcriptional regulator, HxlR family  43.16 
 
 		 131 aa  83.6  8e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2811  transcriptional regulator, HxlR family  41.18 
 
 		 117 aa  82.8  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2075  transcriptional regulator, HxlR family  37.84 
 
 		 136 aa  80.9  0.000000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4104  transcriptional regulator, HxlR family  36.63 
 
 		 119 aa  80.1  0.000000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.533713  normal  0.821475 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6707  transcriptional regulator, HxlR family  38.61 
 
 		 130 aa  79.3  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2747  transcriptional regulator, HxlR family  40.57 
 
 		 129 aa  79  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.668985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7246  transcriptional regulator, HxlR family  37.37 
 
 		 116 aa  77.4  0.00000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00534813  normal  0.675501 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4034  HxlR family transcriptional regulator  42 
 
 		 114 aa  77.8  0.00000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.721532  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3293  putative transcriptional regulator  38.78 
 
 		 119 aa  77  0.00000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0763403 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9284  transcriptional regulator (MarR family protein)  34.31 
 
 		 122 aa  76.6  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4895  HxlR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 115 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4933  hypothetical protein  32.99 
 
 		 114 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4774  transciprtional regulator  32.99 
 
 		 114 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4794  transciprtional regulator  32.99 
 
 		 114 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5225  hypothetical protein  32.99 
 
 		 114 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5212  hypothetical protein  34.02 
 
 		 114 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5311  hypothetical protein  32.99 
 
 		 114 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5176  hypothetical protein  32.99 
 
 		 114 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0230101 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3564  HxlR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 140 aa  74.7  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01970  transcriptional regulator  35 
 
 		 140 aa  73.9  0.0000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1876  HxlR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 122 aa  73.6  0.0000000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5208  hypothetical protein  32.99 
 
 		 114 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0036  hypothetical protein  32.99 
 
 		 114 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000638982 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3895  HxlR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 120 aa  73.2  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000755308  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4706  transcriptional regulator, HxlR family  37.11 
 
 		 143 aa  73.2  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0222658  normal  0.87312 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2054  transcriptional regulator, HxlR family  36.54 
 
 		 124 aa  72.4  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3100  HxlR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 107 aa  72.4  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2647  transcriptional regulator, HxlR family  38.78 
 
 		 116 aa  72.4  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0854787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3126  transcriptional regulator, HxlR family  40.2 
 
 		 122 aa  72  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.341142 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0862  transcriptional regulator, HxlR family  36.26 
 
 		 119 aa  71.6  0.000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273669  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2490  transcriptional regulator  36.46 
 
 		 120 aa  71.6  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0268874 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1471  transcriptional regulator, HxlR family  40.22 
 
 		 108 aa  71.2  0.000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1063  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 110 aa  71.2  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0576989  hitchhiker  0.000107529 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0945  MarR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 119 aa  71.2  0.000000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1527  transcriptional regulator, HxlR family  41.24 
 
 		 125 aa  71.2  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0577409  normal  0.0923704 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3203  hypothetical protein  34.34 
 
 		 114 aa  70.9  0.000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.135519  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3457  hypothetical protein  34.34 
 
 		 114 aa  70.9  0.000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3110  MarR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 114 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2973  transcriptional regulator, HxlR family  38.54 
 
 		 116 aa  70.5  0.000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.116721  normal  0.457372 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4332  transcriptional regulator, HxlR family  34.95 
 
 		 121 aa  70.1  0.000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.101336 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3208  hypothetical protein  31.91 
 
 		 108 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3186  MarR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 108 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0290  transcriptional regulator protein-like protein  37.5 
 
 		 154 aa  70.5  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3461  hypothetical protein  31.91 
 
 		 108 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.692347  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3435  hypothetical protein  34.34 
 
 		 114 aa  70.1  0.000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25590  predicted transcriptional regulator  33.66 
 
 		 129 aa  70.1  0.000000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.6055  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1834  hypothetical protein  33.33 
 
 		 114 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.118626  normal  0.386956 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3115  MarR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 114 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.451528  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3427  hypothetical protein  32.98 
 
 		 108 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1317  HxlR family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 122 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000449926  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1136  transcriptional regulator  41.05 
 
 		 108 aa  70.1  0.00000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000101059  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2126  helix-turn-helix HxlR type  31.63 
 
 		 129 aa  69.7  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.653298  normal  0.626696 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1179  HxlR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 137 aa  69.7  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.795487 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5039  putative transcriptional regulatory protein  33.33 
 
 		 125 aa  69.7  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0933  transcriptional regulator, HxlR family  36 
 
 		 108 aa  70.1  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.973186 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3209  hypothetical protein  32.99 
 
 		 113 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl051  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 101 aa  68.9  0.00000000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3440  hypothetical protein  32.99 
 
 		 113 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3069  transcriptional regulator, HxlR family  30.61 
 
 		 137 aa  69.3  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0845928  normal  0.988142 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3462  hypothetical protein  32.99 
 
 		 113 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.457433  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0273  transcriptional regulator, HxlR family  34.02 
 
 		 121 aa  69.3  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.394727  normal  0.0155741 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5177  HxlR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 118 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0266  helix-turn-helix HxlR type  36.04 
 
 		 130 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.661813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5548  transcriptional regulator, HxlR family  35.35 
 
 		 107 aa  68.6  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3282  transcriptional regulator, HxlR family  35.34 
 
 		 125 aa  68.2  0.00000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0851  transcriptional regulator, HxlR family  38.89 
 
 		 116 aa  68.2  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.973222 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0240  helix-turn-helix HxlR type  31.96 
 
 		 118 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.566878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0980  cinnamoyl ester hydrolase  40 
 
 		 108 aa  67.8  0.00000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.124883  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02523  hypothetical transcriptional regulator  37.5 
 
 		 119 aa  67.8  0.00000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.479975  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17890  predicted transcriptional regulator  34 
 
 		 111 aa  68.2  0.00000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.382985 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0168  helix-turn-helix HxlR type  31.96 
 
 		 118 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3785  transcriptional regulator, HxlR family  35.11 
 
 		 118 aa  68.2  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.139955  normal  0.719008 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>